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对 1350 例神经内分泌肿瘤进行分析可识别出多种...
结果：总体而言，在 1350 例病例中，有 1295 例 (96%) 被确认存在药物治疗相关改变。在 149/243 例胰腺病例 (61%) 和 488/1015 (48%) 非胰腺 NET 中发现 MGMT 表达低或缺失 (IHC 为 0 或 1+)，MGMT 是烷化剂敏感性的生物标志物。在 927/1193 例 NET (78%) 中发现 RRM1 是吉西他滨敏感性的生物标志物，RRM1 表达低或缺失 (IHC 为 0 或 1+)，在 950/1187 例 NET (80%) 中发现胸苷合酶 TS 是氟嘧啶敏感性的生物标志物，TS 表达低或缺失。肿瘤测序表明，BRAF（6/446（3 例为 V600E、2 例为 G596R、1 例为 K601E）、CTNNB1（3/223）、KIT（4/357）、EGFR（1/245）、FGFR2（2/224）、GNAS（1/224）、HRAS（2/192）、PIK3CA（10/418）、RB1（4/222）VHL（2/203）、KRAS（23/472）、NRAS（2/349）和 APC（14/224）存在致癌突变，EGFR（46/688）和 MET（4/306）存在扩增。在有记录的病例中，以基于机制的生物标志物为指导的治疗产生了持久的反应：一例患有 KIT 突变的转移性 NET 患者对伊马替尼治疗后部分缓解（PR）>1 年，对于 MGMT 低 / TS 低的患者，则使用链脲佐菌素或替莫唑胺加氟嘧啶化疗进行治疗，从而支持 NET 靶标分析的临床相关性。结论：尽管单个生物标志物的频率较低，但对大量 NET（n=1350）进行全面的多平台分析，在 90% 以上的患者中确定了临床相关靶标。鉴于 NET 化疗的使用率越来越高，我们的研究结果为未来临床试验评估基于生物标志物的 NET 治疗的疗效提供了基础。
逐步相关
摘要背景：具有胆囊癌 (GBC) 风险因素的患者致癌的潜在基因改变仍存在争议，尤其是在胰胆管合流异常 (PBM) 患者中。本研究旨在使用新一代测序 (NGS) 阐明 GBC 风险因素与基因改变之间的关联。方法：我们回顾性分析了 64 例确诊为 GBC (n = 26)、PBM [患有 GBC (n = 8)、不患有 GBC (n = 20)] 和慢性胆囊炎患者的切除组织，作为对照组 (n = 10)。从肿瘤及其周围组织中提取 DNA，通过激光捕获显微切割技术精确分离。通过 NGS 检测 50 个癌症相关基因的基因改变，并与临床信息（包括 PBM 状态）进行比较。结果：GBC组织中最常见的基因变异为TP53（50%），其次是EGFR（20.6%）、RB1（17.6%）和ERBB2（17.6%）。20例（58.8%）检测到可通过分子靶向药物靶向的基因变异。对基因变异及危险因素进行统计分析发现，合并PBM的GBC患者TP53变异率高于非PBM患者（p=0.038），对照组上皮、非GBC的PBM患者上皮、合并PBM的GBC患者瘤周黏膜及合并PBM的GBC患者肿瘤组织中TP53突变率分别为10%、10%、38%和75%（p<0.01）。结论：TP53变异比KRAS变异更能导致PBM患者的癌变。
小细胞肺癌的靶向治疗和生物标志物
小细胞肺癌 (SCLC) 是一种恶性肿瘤，其特征是生长迅速、早期转移和获得性治疗耐药。大多数 SCLC 患者处于广泛期 (ES) 疾病，即首次诊断时转移性疾病已超出半胸腔范围。SCLC 一直被认为是“药物开发的坟墓”，直到最近，化疗仍然是一线和二线治疗的标准治疗方法。与 NSCLC 相比，确定 SCLC 的治疗靶点一直很困难，部分原因是驱动突变主要是功能丧失，涉及肿瘤抑制基因 RB1 和 TP53 或目前无法靶向（例如 MYC 家族成员的扩增）。最近对 SCLC 细胞系、患者样本和代表性小鼠模型的基因表达谱分析已导致 SCLC 的四种主要亚型被提出，这些亚型以四种关键转录调节因子（ASCL1、NEUROD1、POU2F3 和 YAP1）的差异表达为特征。由于该领域研究人员的持续努力，我们对 SCLC 生物学的理解最近确实有了显著提高，但治疗方案仍然令人沮丧。虽然免疫疗法试验的最新结果令人鼓舞，但大多数患者对目前的治疗方案表现出原发性或快速获得性耐药性，这突出表明需要提高疗效并扩大目前治疗策略的范围。在这篇评论文章中，我们将讨论 SCLC 治疗的最新进展，重点关注当前对信号通路的理解、免疫疗法和靶向疗法的作用以及 SCLC 治疗反应的新兴生物标志物。
IDH wildType胶质母细胞瘤的纵向多模式分析揭示了预后不同的治疗反应的分子进化和细胞表型
抽象背景。尽管在IDH-WildType胶质母细胞瘤的生物学上取得了进步，但它仍然是一种毁灭性的疾病，中位生存期不到2年。然而，对当前护理标准治疗方案的异质反应的分子基础包括最大安全切除，辅助辐射和替莫唑胺化学疗法的分子基础仍然未知。方法。对106名患者的配对初始和复发性胶质母细胞瘤试样进行了全面的组织病理学，基因组和表观依赖氏症评估，以研究分子进化和细胞表型，这些分子进化和细胞表型。结果。虽然TERT启动子突变和CDKN2A纯合缺失是通过初始肿瘤和复发性肿瘤共享的神经胶质作用期间的早期事件，但大多数其他复发性遗传改变（例如，EGFR，PTEN，PTEN和NF1）通常是私有的，属于初始或反复发生的肿瘤，表明后期在后球后期的摄取。此外，胶质母细胞瘤表现出异质的表观基因组进化，亚群在全球性高甲基化，低甲基化或保持稳定的情况下变得越来越稳定。进行肉瘤转化的胶质母细胞瘤的复发时间较短，并且在NF1，TP53和RB1改变以及间质表观遗传学类中显着富集。在替莫唑胺治疗后出现体细胞超突变的患者与疾病复发和长时间的总生存期间的间隔明显更长，并且在MGMT启动子区域的4个特定CpG位点上增加了甲基化，这与这种超孕期的发展显着相关。最后，开发了347个关键CpG位点的DNA甲基化水平变化的表观基因组进化特征，与临床结局显着相关。结论。胶质母细胞瘤经历异质的遗传，表观遗传和细胞进化，其基础是预后不同的治疗反应。
对CDK4/6抑制剂生物标志物的搜索已被不适当的增殖分析所阻碍
CDK4/6抑制剂阻止了G1中的细胞周期，并与激素治疗结合使用，以治疗晚期HR+/Her-乳腺癌。迫切需要更有效地在乳腺癌中使用这些药物，并促进它们在其他肿瘤类型中的使用，迫切需要预测可以预测反应的生物标志物。我们在这里证明，由于依赖基于ATP的增殖分析，旨在识别最敏感的肿瘤类型和基因型旨在识别最敏感的肿瘤类型和基因型。当CDK4/6抑制后，细胞在G1中停滞时，它们的大小继续生长，产生更多的线粒体和ATP。这种细胞过度生长使用基于代谢的ATP测定法掩盖了有效的停滞，而不是使用基于DNA的测定法。通过使用不同的测定类型比较肿瘤细胞，我们证明了先前被鉴定为最响应式细胞类型的淋巴瘤线，只是在G1停滞期间没有过多生长，因此似乎做出了最好的反应。同样，CDK4/6抑制剂Abemaciclib似乎比palbociclib更好地抑制增殖，但这也是因为它也抑制细胞的过度生长，从而抑制细胞的过度生长。DIPMAP分析先前的筛选数据仅使用可靠的测定类型，证明了palbociclib敏感性与对细胞周期蛋白D1，CDK4和CDK6敲除/敲低的敏感性有关，并且耐药性与对Cyclin E1，CDK2和SKP2敲除/敲除的敏感性有关。此外，palbociclib-敏感性的潜在生物标志物是细胞周期蛋白D1（CCND1）和RB1的表达增加，以及Cyclin E1（CCNE1）和CDKN2A的表达降低。使用来自代谢测定的类似数据分析DEPMAP时，这些关联都不存在。这加强了使用适当的增殖测定法对广泛的细胞类型评估CDK4/6抑制剂和可能其他抗癌药物的重要性。这将有助于更好地为临床试验提供信息，并确定急需的反应生物标志物。
了解谱系可塑性是 EGFR 突变型非小细胞肺癌靶向治疗失败的途径
表皮生长因子受体基因 (EGFR) 的体细胞变异会导致激酶信号异常激活，大约 15% 的非小细胞肺癌 (NSCLC) 会出现这种情况。确诊为 EGFR 突变型 NSCLC 的患者对 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂 (EGFR TKI) 有良好的初始临床反应，但肿瘤复发很常见并且发展很快。过去十年，人们对 EGFR TKI 获得性耐药机制进行了广泛研究。在理解治疗失败的两种主要途径方面取得了巨大进展：EGFR 基因的其他基因组变异和替代激酶信号激活（所谓的“旁路激活”）。多种旨在克服这些 EGFR TKI 耐药模式的药物已获得 FDA 批准或正在临床开发中。表型转化是一种不太常见且不太清楚的 EGFR TKI 耐药机制，尚待临床解决。在获得性 EGFR TKI 耐药性的情况下，表型转化包括上皮-间质转化 (EMT)、肺腺癌 (LUAD) 向鳞状细胞癌 (SCC) 或小细胞肺癌 (SCLC) 的转化。SCLC 转化或神经内分泌分化与 TP53 和 RB1 信号失活有关。然而，允许谱系转换的确切机制需要进一步研究。最近的报告表明，LUAD 和 SCLC 具有共同的细胞起源，并且在适当的条件下会发生转分化。目前，EGFR 突变型 SCLC 的治疗靶向选择仅限于传统的基因毒性化疗。同样，EMT 相关耐药性的基础尚不清楚。EMT 是一个复杂的过程，其特征是一系列中间状态，上皮和间质因子的表达各不相同。在获得性 EGFR TKI 耐药性的情况下，EMT 经常与旁路激活同时发生，因此很难确定 EMT 对治疗失败的确切贡献。EMT 相关耐药性的可逆性表明其表观遗传起源，并在疾病进展过程中发生其他调整，例如基因改变和旁路激活。本综述将讨论与表型转化相关的 EGFR TKI 耐药性的机制基础，以及在 EGFR 突变型 NSCLC 中解决此类靶向治疗耐药性的挑战和机遇。
Milademetan 是治疗默克尔细胞癌的高效 MDM2 抑制剂
简介 肿瘤抑制蛋白 p53 在癌细胞周期中起着至关重要的作用 (1, 2)。大约 50% 的癌症都存在 TP53 基因突变 (2, 3)。在具有 WT p53 的细胞中，由于细胞应激或 DNA 损伤而激活 p53 会导致许多 p53 靶基因的转录激活，从而导致细胞周期停滞、凋亡或衰老 (1, 2, 4)。细胞中的 WT p53 水平受负反馈回路调节。激活的 p53 与 MDM2 基因中的 p53 反应元件结合，导致 MDM2 表达增加。MDM2 蛋白是一种 E3 泛素连接酶，反过来又与 p53 结合并泛素化，导致其被蛋白酶体降解 (5–9)。因此，MDM2 是 p53 的重要调节因子，可以成为具有 WT p53 的癌症的有效治疗靶点。多年来，人们一直对通过药物抑制 MDM2 来稳定 p53 感兴趣，尤其是对于伴有 MDM2 扩增的癌症，包括脂肪肉瘤、尤文氏肉瘤、骨肉瘤和白血病 (2, 10–12)。目前有几种针对 MDM2-p53 相互作用的 MDM2 抑制剂正在临床试验中用于治疗这些癌症 (2)，尽管没有一种抑制剂获得 FDA 批准用于任何治疗用途。默克尔细胞癌 (MCC) 是一种高度侵袭性的皮肤神经内分泌癌，发病率很高 (13–15)。MCC 经常转移到淋巴结和远处器官，包括肝脏、骨骼、胰腺、肺和脑 (13–15)。MCC 有两种不同的病因。克隆整合的默克尔细胞多瘤病毒 (MCPyV) 存在于病毒阳性的 MCC (MCCP) 中。这些肿瘤的肿瘤突变负荷较低，具有接近正常的二倍体基因组 (14–20)。相反，病毒阴性 MCC (MCCN) 肿瘤是由慢性紫外线照射引起的，导致高突变负荷和强烈的紫外线突变特征 (14–20)。尽管病因不同，但两种形式的 MCC 都表现出相似的组织学、侵袭性表型和对治疗的反应，表明它们扰乱了相似的致癌途径。虽然 MCCN 通常含有 TP53 和视网膜母细胞瘤肿瘤抑制因子 (RB1) 的功能丧失突变，但 MCCP 通常含有 WT p53 和视网膜母细胞瘤 (RB) 蛋白 (14、15、20–22)。大约 80% 的 MCC 肿瘤是 MCCP，其中大多数具有 WT p53 (16、18、20、23–26)。
Amy E. Brouillette L3
方法：通过回顾性电子健康记录和文献综述进行的小细胞乳腺癌（SCBC）患者的病例报告。结果：一名50岁的妇女出现了右乳房。成像显示3.3 cm的质量，美国引导活检显示出高度的神经内分泌癌，没有ER，PR和HER2标记。分期研究没有显示任何遥远的转移。患者进行了右乳房切除术，并进行了哨兵淋巴结活检，该活检证实了高度小细胞癌的0.7 cm中间变体，在胸部的上部和侧向区域具有广泛的淋巴浸润，在8个轴突淋巴结中有4个，患有转移性癌症。在种系基因检测中未发现突变。肿瘤分子分析显示RB1和TP53突变。她接受了卡铂/紫杉醇/pembrolizumab的辅助治疗，然后接受阿霉素/环磷酰胺/pembrolizumab的辅助治疗，然后进行术后切除术和维持pembrolizumab。在治疗结束时，成像没有显示出复发的证据，也未检测到循环肿瘤DNA。诊断后二十三个月，她仍然没有复发的证据。小细胞癌最常见于肺部，但也可能起源于肺外部位。肺外小细胞癌是侵略性且非常罕见的癌症。宫颈和胃肠道是最常见的部位。即使在肺外小细胞癌中，SCBC也很少见，不到原发性乳腺癌的1％。总体生存率约为5年，并且与阶段密切相关。由于其频率，SCBC没有既定的治疗方案。当前的管理依赖于用于小细胞肺癌（SCLC）的适应疗法，其中包括手术，放射和化学疗法。SCLC的标准化疗方案通常涉及4-6个依托泊剂周期与铂基药物结合使用。研究表明，顺铂/紫杉醇和顺铂/依托泊苷在SCLC治疗中的疗效可比。最近，据报道，与杜瓦卢马布的合并可改善有限疾病SCLC的总生存率。但是，包括SCBC在内的肺外小细胞癌的治疗是基于病例报告中的有限证据，并从SCLC指南中推断出来。另一种方法是根据基于ER，PR和HER2状态的乳腺癌指南来治疗SCBC。对于早期TNBC，最有效的方案包括与pembrolizumab结合卡铂/紫杉醇的化学免疫性疗法，然后是阿霉素/环磷酰胺。结论：此案例报告说明了SCBC临床管理中的临床表现和挑战。SCBC和三重阴性乳腺癌具有相似的组织学和生物学特征。作为铂和免疫疗法现在是SCLC和TNBC管理的组成部分。因此，使用最有效的原发性TNBC治疗代表原代三阴性SCBC的可行治疗选择。这些结果可能会告知未来的SCBC治疗指南，以考虑ER，PR和HER2以及其他分子和生物学标志物在确定化学疗法方法时。
197（CDK2 抑制剂）
正在进行的试验：一项首次人体 1a/b 期剂量递增/扩展研究，评估 BG-68501/ETX- 197（CDK2 抑制剂）作为单一疗法或与氟维司群联合治疗 HR+/HER2- 乳腺癌和其他晚期实体瘤患者的效果 作者：Minal Barve、1 Jennifer Man、2 Bruno Fang、3 Alexander Philipovskiy、4 Brian A. Van Tine、5 Rohit Joshi、6 Marion Carrigan、7 Alejandra Ragone、7 Hao Zheng、7 Yang Liu、8 Sally Baron Hay 9 附属机构：1 美国德克萨斯州达拉斯玛丽克劳利癌症研究中心；2 澳大利亚新南威尔士州布莱克敦布莱克敦癌症和血液学中心；3 美国新泽西州东布伦瑞克 Astera 癌症护理中心； 4 佛罗里达癌症专家和研究所/莎拉坎农研究所，美国佛罗里达州玛丽湖；5 华盛顿大学医学院，美国密苏里州圣路易斯；6 南澳大利亚州癌症研究中心，澳大利亚南澳大利亚州阿德莱德；7 百济神州美国公司，美国加利福尼亚州圣马特奥；8 百济神州（上海）有限公司，中国上海；9 悉尼大学，澳大利亚新南威尔士州悉尼 摘要背景：细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 2 可通过在 G1/S 和 S/G2 转换期间与细胞周期蛋白 E 或细胞周期蛋白 A 相互作用来调节细胞周期。CDK2 活性升高是 HR+/HER2- 乳腺癌 (BC) 对 CDK4/6 抑制的关键耐药机制。其他基因组改变，例如 RB1 的缺失，可导致其他实体瘤产生耐药性，包括高级别浆液性卵巢癌、胃癌、小细胞肺癌 (SCLC) 和子宫内膜癌。 CCNE1 扩增或细胞周期蛋白 E 过表达可能赋予对 CDK2 抑制的敏感性。BG-68501/ETX-197 是一种强效、选择性的 CDK2 抑制剂，临床前证据表明其在生化和细胞测定中具有强效活性，在癌症异种移植模型中具有显著的抗肿瘤活性，并且对 CDK2 的选择性优于其他 CDK 家族成员。方法：本研究是一项首次在人体中进行的 1a/b 期、开放标签、多中心研究，旨在评估 BG-68501/ETX-197 在晚期、不可切除或转移性实体瘤患者（包括 HR+/HER2- BC）中的安全性、耐受性、PK、药效学和初步抗肿瘤活性。在剂量递增阶段（1a 期），连续队列将接受剂量递增的 BG-68501/ETX- 197 单药治疗或与氟维司群联合治疗；此外，安全性扩展队列将接受推荐剂量的 BG-68501/ETX-197 治疗，以供进一步评估。在剂量扩展阶段（1b 期），HR+/HER2- BC、铂类难治性或耐药性浆液性卵巢癌、输卵管癌、原发性腹膜癌 (PROC)、广泛期 SCLC (ES-SCLC) 或 CCNE1 扩增晚期实体瘤患者将接受 BG-68501/ETX-197 单药口服治疗或与氟维司群联合治疗。资格标准包括年龄≥18 岁、经组织学或细胞学确诊为可能与 CDK2 依赖性相关的晚期或转移性实体瘤的患者，这些患者已接受过≥1 线局部晚期或转移性疾病治疗，并且之前接受过内分泌治疗，并且在辅助治疗或局部晚期或转移性环境中接受过 CDK4/6 抑制剂治疗 HR+/HER2- BC，或之前接受过所有其他晚期实体瘤的标准治疗。对于剂量递增阶段（第 1a 阶段），主要目标是评估 BG-68501/ETX- 197 单药治疗或与氟维司群联合治疗的安全性和耐受性，并确定最大耐受剂量、最大给药剂量和推荐扩增剂量 (RDFE)；次要目标是评估研究者按照 RECIST v1.1 评估的初步抗肿瘤活性（ORR、缓解持续时间 [DoR]、至缓解时间 [TTR]、疾病控制率 [DCR] 和临床受益率 [CBR]）和 PK。对于剂量扩展阶段（1b 期），主要目标是评估 BG-68501/ETX-197 与氟维司群联合治疗 HR+/HER2- 晚期或转移性 BC 患者的抗肿瘤活性 (ORR)，以及 BG-68501/ETX-197 单药治疗 PROC、ES-SCLC 和其他伴有 CCNE1 扩增的晚期或转移性实体瘤患者的抗肿瘤活性 (ORR)；次要目标是进一步评估 BG-68501/ETX- 197 单独用于治疗前述晚期实体瘤或与氟维司群联合用于治疗