诱导型 CRISPR/Cas9 可在 Synechocystis sp. PCC 6803 中进行多路复用和快速分离的单目标基因组编辑 Ivana Cengic a、Inés C. Cañadas b、Nigel P. Minton b、Elton P. Hudson a * a 瑞典皇家理工学院化学、生物技术和健康工程科学学院、生命科学实验室,斯德哥尔摩,瑞典 b BBSRC/EPSRC 合成生物学研究中心 (SBRC)、诺丁汉大学生命科学学院,诺丁汉,NG7 2RD,英国 * 通讯作者:huds@kth.se 摘要 建立各种合成生物学工具对于开发用于生物技术的蓝藻至关重要,尤其是那些允许以时间高效的方式进行精确和无标记基因组编辑的工具。这里我们描述了一个核糖开关诱导的 CRISPR/Cas9 系统,该系统包含在一个单一的复制载体上,用于模型蓝藻 Synechocystis sp. PCC 6803。茶碱反应性核糖开关可以严格控制 Cas9 表达,从而能够将 CRISPR/Cas9 载体可靠地转化为 Synechocystis 。CRISPR/Cas9 的诱导介导了各种类型的基因组编辑,特别是不同大小的删除和插入。编辑效率因目标和预期编辑而异;较小的编辑总体上表现更好,例如,将 FLAG 标签插入 rbcL 时达到 100%。重要的是,本文描述的单载体 CRISPR/Cas9 系统还被证明可以在 Synechocystis 中同时介导多达三个目标的多重编辑。所有单靶和几个双靶突变体在第一轮诱导后也完全分离,增加了该系统的实用性。此外,由镍单独诱导并包含在 CRISPR/Cas9 载体本身上的载体固化系统将固化效率提高了大约 4 倍,使最终的突变体真正成为无标记的。关键词:CRISPR、Cas9、蓝藻、可诱导、核糖开关、多重引言
ulva是一个绿色宏观属,具有丰富的物种多样性和全球分布。虽然当前对ULVA多样性的知识集中在温带地区,但热带和亚热带地区的遗传和形态数据却很少,并且物种丰富度并未明确定义。该属以其绽放形成的能力而闻名,可以引起绿色潮汐,从而造成严重的环境和经济损害。在过去的二十年中,Ulva spp的几个重要盛开。已经发生在新喀里多尼亚,需要进一步研究以识别所涉及的物种。由于对新喀里多尼亚的ULVA多样性的了解是有限的,因此对Ulva spp的更新。该地区的库存至关重要。Based on Ulva specimens collected throughout New Caledonia (Grande Terre, Isle of Pines and Loyalty Islands), we (1) reassessed species diversity using species delimitation methods, (2) analysed morpho-anatomical characters to identify species and/or enrich their diagnosis, and (3) reconstructed a multilocus phylogeny (ITS, rbcL, tufA) of the genus.我们在我们的数据集中发现了21种二级假设(SSH),从中,有5个成功分配给了U. lactuca,U。Ohnoi,U.Tepida,U.Tepida,U.Meridionalis和U. Taeniata。十个SSH被定义为我们提供的分类学描述的新物种,另外六个SSH是单身人士,需要数据富集以更好地解释。我们的串联多焦点矩阵包括61种ULVA物种。在新喀里多尼亚发现了15种,并得到适度的支持。在新喀里多尼亚发现了十种新物种。在新喀里多尼亚发现的ULVA物种中,已知有7种是开花的,这突出了对严格调节和定期监测水质的需求,尤其是在暴露于强大的营养输入的地区,这些物种可以形成绿色的潮汐。重点介绍了新喀里多尼亚的Ulva多样性重新评估了15种。土著物种在新喀里多尼亚引起了最近的绿色潮流。
太阳陈1,2,3,玛塔·霍卡4,菲利普·戴维5,Yaqi Sun 2,Fei Zhou 3,Tracy Lawson 5,Peter J. Nixon 4,Yongjun Lin 3,lu-niw Liu 2,6 * 1 Guangdong guangdong guangdong guangdong省级利用和药物保存和北部北部的省级北部。 512000,中国2分子与综合生物学研究所,利物浦大学,利物浦大学,利物浦L69 7ZB,英国3号国家遗传改善的国家主要实验室和国家植物基因研究中心,瓦兹胡农农业大学,武汉,瓦汉430070,430070,430070 2AZ,英国5日生命科学学院,埃塞克斯大学,科尔切斯特CO4 4SQ,英国6海洋生命科学学院和中国海洋深海洋多球和地球系统的边境科学中心,中国海洋大学266003,中国 *通讯 *通信:luning.luning.luiu@luning@liverpool.ac.ac.ac.uk(l.-n.-n.l.-n.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l.l>摘要尽管Rubisco是全球最丰富的酶,但由于其营业率低和区分CO 2和O 2的能力有限,碳固定效率低下,尤其是在高O 2条件下。为了解决这些局限性,包括蓝细菌和藻类在内的浮游植物已经进化了CO 2浓缩机制(CCM),这些机制涉及在特定结构内将Rubisco划分的rubisco,例如在藻类或藻类中的cyanobacteria或Pyrenacoids中的羧基助理。工程植物的叶绿体建立了类似的结构来分隔Rubisco,这引起了人们对改善作物植物中光合作用和碳同化的兴趣。在这里,我们提出了一种方法,可以通过遗传融合的超纤维纤维构成超级纤维绿色荧光蛋白(SFGFP)在烟草中有效地诱导内源性rubisco的凝结(Nicotiana tabacum)叶绿体。通过利用SFGFP的固有寡聚特征,我们成功地创建了类似pyrenoid的Rubisco冷凝物,这些冷凝物在叶绿体中显示动态的,类似液体的特性,而不会影响Rubisco组装和催化功能。转基因烟草植物与野生型植物相比表现出可比的自养生长速率和环境空气中的完整生命周期。我们的研究提供了一种有希望的策略,可以通过相分离调节植物叶绿体中的内源性Rubisco组装和空间组织,这为生成合成细胞器样结构的基础为碳固定的碳固定结构(例如羧化合物和吡啶样),以优化光合效率。关键字:Rubisco;碳固定;光合作用;叶绿体工程;相位分离;蛋白质冷凝;植物生物技术