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序列建模和设计从分子到基因组量表，
纳米孔信号分析能够检测天然DNA和RNA测序的核苷酸修饰，从而在没有其他文库准备的情况下提供了准确的遗传/转录组和表观遗传信息。目前，只能直接对一组有限的修改（例如5-甲基胞霉素），而大多数其他则需要探索方法，这些方法通常以纳米孔信号与核苷酸参考的比对开始。我们提出了Uncalled4，这是一种用于纳米孔信号对准，分析和可视化的工具包。uncalled4具有有效的带信号对准算法，BAM信号对准文件格式，用于比较信号对准方法的统计数据以及基于K-MER的孔模型的可重复的DE NROVE训练方法，揭示了ONT尚未访问的途径的可能错误。我们在七个人类细胞系中的RNA 6-甲基趋化（M6A）检测应用于RNA 6-甲基丹宁（M6A），使用M6ANET鉴定的修饰比Nanopolish多26％，其中包括M6A已知在癌症中具有含义的几种基因。uncalled4可在github.com/skovaka/uncalled4上开放源4。
RNase 4（NEB＃M1284）MRNA 5´CAP结构的DNA探针指导分析| neb nebnext UltraExpress FS DNA库准备套件E3340手册 化学品安全技术说明书 使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌 君主质粒小型套件T1010手册 新英格兰Biolabs分析证书 胜任的细胞 基因组编辑 Authenticase M0689手册 R＆D和对... 的制造支持 新英格兰Biolabs分析证书 Authenticase M0689手册 裂解靠近DNA片段的末端（线性化矢量） Nebnext Ultra DNA库Prep套件，用于Illumina E7370手册 腺病毒2 Nebnext Ultra II DNA库Prep套件，用于Illumina，用于Illumina（独特的双索引UMI适配器DNA）E7645 E7645 E7103手动 NEBNEXT微生物组DNA富集试剂盒E2612手册 DNA组装与合成生物学 DNA组装与合成生物学 通过双链DNA片段的单链DNA寡桥构建SGRNA-CAS9表达载体 nebnext®快速DNA库预备组件454 Monarch MAG病毒DNA/RNA提取套件T4010手册 新英格兰Biolabs分析证书 T4 DNA连接酶（M0202）CHN 的安全数据表 翠鸟柔性自动隔离病毒DNA/RNA的方案| neb 基因编辑 φx174
已测试至少20 nt。探针可以用3´或5´生物素/Desthiobiotin亲和力组设计，用于链霉亲和素富集（NEB＃S1421）。为了获得最佳结果，受保护的DNA：RNA杂交区应为4或5个核苷酸
整合多尺度网络模拟，用于用宠物重新利用精确药物
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年6月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.25.600722 doi：Biorxiv Preprint
使用RNA生物标志物在结核分枝杆菌中加快药物易感性测试
科学和C服务细菌疾病 - 人类的传染病，科学疾病，朱丽叶·维特斯曼斯特拉特（Juliette wytsmanttrat），布鲁塞尔（Brussels），1050年，比利时B国家转诊和结核病的国家转诊，科学人，朱丽叶（Socientan），朱丽叶（Socient）里尔，CNRS，Inserm，Institute Pasteur de Lille，U1019 -UMR 9017-中心 - 里尔，里尔，59000，59000，法国D大学感染和免疫中心。里尔，CNRS，Inserm，Chu Lille，Institut Pasteur de Lille，US 41- UMS 2014 -PLBS，Lille，59000，法国E，MIT和哈佛大学，Main Street，Main Street 415，Cambridge，Cambridge，MA，MA，MA，02142，美国，美国，美国，MASSACHUSETS 4121142142 for Interventional Studies, Scienti fi c Direction Infectious Diseases in Humans, Sciensano, Rue Juliette Wytsmanstraat 14, Brussels, 1050, Belgium h Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, 55 Fruit Street, Boston, MA, 02114, USA i Laboratory of Microbiology, Parasitology and Hygiene, Faculty of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences, University of Antwerp, Universiteitsbaan 212, Antwerp, 2610, Belgium j Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 6047, Unit for Integrated Mycobacterial Pathogenomics, Paris, 75015, France k Division of Molecular Biology and Human Genetics, SAMRC Centre for Tuberculosis Research, DST/NRF生物医学结核病卓越中心研究，医学和健康科学学院，斯特伦博斯大学，泰格伯格，泰格伯格，7505，南非，l Sciensano，Sciensano，Sciensano，Juliette wytsmanttsmantsmanttraat 14，Brusstrait，Brussirenty，Belgium Mycobciiguim Mycobci，Mycobcii，Mycobcii，热带医学研究所，国家埃斯特拉特（Nationalestraat）155，安特卫普（Antwerp），2000年，比利时n分枝杆菌培养物收集比利时比利时比利时协调的微生物藏品，《国家埃斯特拉特155》，安特卫普，2000年，比利时，比利时
DNA指导的哺乳动物RNA聚合酶II
。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年6月1日。; https：//doi.org/10.1101/2024.06.01.596947 doi：biorxiv Preprint
T4 DNA连接酶（M0202）CHN
用户为绑定和洗涤步骤提供所需的翠鸟柔性塑料，其中包括96个深层井板（2.0毫升），以及用于洗脱步骤的96个微板（200μl）。还需要一个深孔梳子梳子，并用作磁杆的盖子，A
高SARS-COV-2 RNAEMIA与糖尿病和死亡率的危害病患者的死亡率
总结，有人提出，在严重的Covid-19患者的呼吸恶化期间，病毒复制的作用比炎症较重要。使用基于液滴的数字PCR（DDPCR）来精确量化血浆SARS-COV-2病毒载荷（SARS-COV-2 RNAEMIA），我们研究了血浆病毒载量，合并症和122个批判性疾病病毒性疾病的病毒载量和死亡率之间的关系之间的关系。SARS-COV-2 rnaemia，范围从70至213,152份。在46例患者（38％）中观察到高（> 1000份/ml）或非常高的SARS-COV-2 rnaemia（> 10,000份/ml）SARS-COV-2 rnaemia，其中26例是糖尿病患者。糖尿病与较高的SARS-COV-2 rnaemia独立相关。在多变量逻辑回归模型中，SARS-COV-2 RNAEMIA与第60天的死亡率密切相关。在199例患有高rNAEMIA的重症患者中，可能会考虑抗病毒疗法的早期开始。
CyFIP2 RNA编辑对肌动蛋白调节，轴突生长和旋转生成的功能影响
Luca La Via 1, Elona Ndoj 1, Matteo Bertoli 1, Veronica Mutti 1, Giulia Carini 1, Alice Filippini 1.2, Federica Bono 1, Chiara Fiorentini 1, Giovanni Ribaudo 1, Alessandra Gianonelli 1, Giuseppe Borsani 1 Isabella Russo 1.2, Alessandro Baron 1.3
通过调节DGAT2
噬菌体（噬菌体）构成了地球上最丰富和遗传多样的实体。细菌与估计全球总数10³为病毒体的相互作用显着塑造了人类健康和环境生态系统（1）。噬菌体与其细菌宿主之间的生态相互作用的规模驱动了一种遗传武器种族，从而不断改变分子水平的微生物寿命（2）。在大型时间尺度上快速发展而产生的多样性为人类健康创新（例如噬菌体疗法）提供了基础，以及生物技术创新的基础，例如群集定期散布的短期短滴定重复序列（CRISPR）和CRISPR与CRISPPR相关（CAS）蛋白质系统（3-5）。然而，具有巨大的遗传多样性是伟大的未知数 - 对绝大多数噬菌体中的基因含量已知。与细菌对应物相比，噬菌体基因组编码具有已知或预测功能的基因的小部分，这构成了生物圈中最大的遗传暗物质（未知功能基因）之一（6）。尽管有可能使用经典的遗传技术将一些暗物质带到光线下，但仍需要更高的实验方法来简化和加快噬菌体基因组的遗传遗传含量的表征和加快表征。
