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研究论文 小麦 RNA 编辑位点的全基因组调查和功能分析
小麦是一种重要的谷物，全球一半人口都食用小麦。小麦面临环境压力，人们使用了不同的技术（CRISPR、基因沉默、GWAS 等）来提高其产量，但 RNA 编辑 (RES) 在小麦中尚未得到充分探索。RNA 编辑在控制环境压力方面具有特殊作用。对不同类型的小麦基因型中的 RES 进行了全基因组鉴定和功能表征。我们通过 RNA 测序分析采用了六种小麦基因型来实现 RES。研究结果表明，RNA 编辑事件均匀发生在所有染色体上。RNA 编辑位点随机分布，在小麦基因型中检测到 10-12 种类型的 RES。在耐旱基因型中检测到的 RES 数量较多。在六种小麦基因型中还鉴定了 A-to-I RNA 编辑（2952、2977、1916、2576、3422 和 3459）位点。基因本体分析后发现，大多数基因参与了分子过程。还检查了小麦中的 PPR（五肽重复序列）、OZ1（细胞器锌指序列）和 MORF/RIP 基因表达水平。正常生长条件使这三个不同基因家族的基因表达出现差异，这意味着不同基因型的正常生长条件可以改变 RNA 编辑事件并影响基因表达水平。而 PPR 基因的表达没有变化。我们使用变异效应预测器（VEP）来注释 RNA 编辑位点，Local White 在蛋白质的 CDS 区域具有最高的 RES。这些发现将有助于预测其他作物的 RES，并有助于小麦抗旱性的发育。
改进的 gRNA 二级结构允许编辑抵抗 CRISPR-Cas9 切割的靶位
CRISPR-Cas9 介导的基因组编辑的第一步是切割与 CRISPR 向导 RNA (gRNA) 中所谓的间隔序列互补的目标 DNA 序列。然而，一些 DNA 序列对 CRISPR-Cas9 切割具有抵抗性，这至少部分是由于 gRNA 折叠错误造成的。为了解决这个问题，我们设计了 gRNA，使其恒定部分具有高度稳定的发夹结构，并通过化学修饰进一步增强了它们的稳定性。“基因组编辑优化锁定设计”(GOLD)-gRNA 将基因组编辑效率提高了约 1000 倍（从 0.08% 到 80.5%），其他不同靶标的平均效率提高了 7.4 倍。我们预计，无论间隔序列组成如何，这种改进的 gRNA 都将实现高效编辑，并且在所需的基因组位点难以编辑时将特别有用。
霍洛伊矿石纳米管的载体能力，用于靶向神经红蛋白基因mRNA的反义PNA的细胞内递送
通过多米尼科·蒙特萨诺（Domenico Montesano）49，80131 Naples，意大利B 891，BB生物学，化学和药物科学和技术系（RUISCEF） -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive，Coral Gables 33146-0431，佛罗里达州佛罗里达州G，美国分子医学和医学生物技术部，通过塞尔吉奥·潘西尼（Sergio Pansini）5，80131 naples，意大利h意大利化学科学系，Viale Andrea Doria 6，95125 CATANIA，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，通过多米尼科·蒙特萨诺（Domenico Montesano）49，80131 Naples，意大利B 891，BB生物学，化学和药物科学和技术系（RUISCEF） -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive，Coral Gables 33146-0431，佛罗里达州佛罗里达州G，美国分子医学和医学生物技术部，通过塞尔吉奥·潘西尼（Sergio Pansini）5，80131 naples，意大利h意大利化学科学系，Viale Andrea Doria 6，95125 CATANIA，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，通过多米尼科·蒙特萨诺（Domenico Montesano）49，80131 Naples，意大利B 891，BB生物学，化学和药物科学和技术系（RUISCEF） -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive，Coral Gables 33146-0431，佛罗里达州佛罗里达州G，美国分子医学和医学生物技术部，通过塞尔吉奥·潘西尼（Sergio Pansini）5，80131 naples，意大利h意大利化学科学系，Viale Andrea Doria 6，95125 CATANIA，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，通过多米尼科·蒙特萨诺（Domenico Montesano）49，80131 Naples，意大利B 891，BB生物学，化学和药物科学和技术系（RUISCEF） -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive，Coral Gables 33146-0431，佛罗里达州佛罗里达州G，美国分子医学和医学生物技术部，通过塞尔吉奥·潘西尼（Sergio Pansini）5，80131 naples，意大利h意大利化学科学系，Viale Andrea Doria 6，95125 CATANIA，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，通过多米尼科·蒙特萨诺（Domenico Montesano）49，80131 Naples，意大利B 891，BB生物学，化学和药物科学和技术系（RUISCEF） -Cnr, Ugo La Malfa 153, Palermo 90146, Italy D University of Granada, Department of Pharmacy and Pharmaceutical Technology, Faculty of Pharmacy, 18071 Granada, Spain and Andalusian Institute of Earth Sciences, Csic-Ugr, 18100 Armilla, Granada, Spain Fo Laboratory for Molecular Photonics, Department of Chemistry, University of Miami, 1301 Memorial Drive，Coral Gables 33146-0431，佛罗里达州佛罗里达州G，美国分子医学和医学生物技术部，通过塞尔吉奥·潘西尼（Sergio Pansini）5，80131 naples，意大利h意大利化学科学系，Viale Andrea Doria 6，95125 CATANIA，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，意大利，
单细胞 RNA 测序在类风湿关节炎中的应用
单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 是一种相对较新的技术，它通过描述单个细胞之间的转录组差异，提供了前所未有的细胞异质性和功能详细视图。这将允许在生理和病理过程中映射细胞类型特异性信号，从而在现有的许多离散簇之间建立高度特异性的细胞信号网络模型。因此，该技术提供了一种强大的方法来剖析导致自身免疫性疾病（包括类风湿性关节炎 (RA)）的细胞和分子机制。scRNA-seq 可以提供有关 RA 独特细胞状态和转变的宝贵见解，有可能开发新的药物靶点。然而，一些挑战仍然限制了它的主流应用，包括成本较高、对低丰度转录本的灵敏度较低以及与批量或传统 RNA 测序相比相对复杂的数据分析工作流程。这篇小评论探讨了 scRNA-seq 在 RA 研究中新兴的应用，强调了其在产生重要见解方面的作用，这些见解有助于为创新和更有效的治疗策略铺平道路。
核苷改性的mRNA疫苗可防止肠病毒...
肠病毒（EVS）被分类为Picornaviridae家族中肠病毒属的成员。这些非发育的单链RNA病毒具有封装在病毒衣壳中的基因组，形成直径约为20-30 nm的对称二十面体颗粒（1，2）。肠内病毒属包括12种肠病毒物种（A-L）和3种鼻病毒物种（RV A-C）。属于肠病毒的肠病毒A71（EV-A71）通过粪便途径传输物种（2，3）。ev-A71于1969年在美国加利福尼亚州的无菌性脑膜炎的婴儿的粪便标本中首次分离出来（4）。从那时起，EV-A71的许多爆发和流行病已在全球范围内报道（5-8），自1990年代后期以来，亚太地区的出现了显着的事件（9）。EV-A71主要影响五年以下的儿童，是手，脚和口腔疾病（HFMD）的主要病因之一，通常在1 - 2周内作为一种自我限制疾病解决。但是，在严重的情况下，EV-A71会引起神经系统并发症，导致预后不良甚至死亡，对婴儿和幼儿构成重大健康威胁。因此，EV-A71被认为是脊髓灰质炎病毒后最显着的神经肠病毒（10-12）。EV-A71基因组长约为7,500个核苷酸，编码四种结构蛋白（VP1至VP4）和7种非结构性蛋白质（2A至2C至2C和3A至3D）。结构蛋白VP1至VP4首先结合形成杂种，六十个brotemer组装成一个封装病毒基因组的病毒式衣壳中（13）。暴露在衣壳的表面上，而VP4则位于内部（13，14）。VP1是由297个氨基酸组成的最免疫主导结构蛋白，并包含主要中和表位。它在EV-A71生命周期期间的病毒吸附，渗透和脱落中起着至关重要的作用，使其成为分子研究和疫苗发育的主要目标（15-17）。目前，尚无针对EV-A71的特定药物，因此支持治疗是与EV-A71相关疾病的主要治疗方法。疫苗接种是预防EV-A71的最有效，最有效的策略。最近对EV-A71疫苗的研究主要集中在灭活的疫苗（18、19），病毒样颗粒（VLP）（20-22），活疫苗（23、24）和亚基疫苗（25、26）。其中，只有灭活的EV-A71疫苗已经完成了人类的临床试验，而其他候选者仍在临床前动物评估中（27）。在2015年至2017年之间，中国食品药品监督管理局（CFDA）批准了针对EV-A71 C4子基因型的三种灭活疫苗的商业化（28-30）。III期临床试验表明，所有三种疫苗都有效地降低了与EV-A71相关的HFMD（27）。然而，灭活的疫苗面临挑战，包括高生产成本，长期发育时间表以及潜在的免疫原性，这可能导致细胞免疫反应的刺激不足（22）。作为一种有希望的多功能疫苗平台，基于mRNA的疫苗适用于传染病和癌症。此外，越来越多的证据表明，与共同循环的EV-A71菌株的突变以及造成了快速病毒进化的突变，对灭活疫苗构成了潜在的挑战（31，32）。他们提供了几个优势，包括较短的发育周期，强大的免疫原性，有利的安全性和对突变的适应性（33，34）。RNA分子修饰和
RNA 疗法的创新发展和新兴技术
a 英国牛津大学医学科学部儿科系；b 瑞典哥德堡阿斯利康公司寡核苷酸化学、发现科学、生物制药研发部；c 加拿大安大略省麦克马斯特大学化学与化学生物学系；d 英国伦敦 MiNA 治疗学、翻译与创新中心；e 瑞士苏黎世联邦理工学院化学与应用生物科学系制药科学研究所；f 英国伦敦 Sixfold 生物科学、翻译与创新中心；g 瑞典卡罗琳斯卡医学院生物科学与营养系；h 瑞典哥德堡阿斯利康公司机械与结构生物学、发现科学、生物制药研发部；i 德国维尔茨堡亥姆霍兹 RNA 感染研究中心（Hzi）亥姆霍兹感染研究中心（Hiri）； j RNA 生物学组，维尔茨堡大学分子感染生物学研究所，德国维尔茨堡
（Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan）
一个淡水鳗（Anguilla spp。）被分类在Anguillidae家族中，并将其包括在Catadromous组中。这项研究旨在确定线粒体DNA的COI基因序列，分析遗传距离和系统发育学，并表征Kuari River Bengkulu中淡水鳗鱼栖息地的物理和化学参数。这项研究是从2020年11月至2021年4月进行的。条形码EEL物种中使用的方法是使用PCR（聚合酶链反应）的DNA分离，DNA扩增，电泳和MTDNA中COI基因区域的测序。在35个循环中，从PCR的结果中获得了COI mtDNA基因片段30秒。对EEL样品AM3和AM4的BLASTN分析与Anguilla Marmorata的相似性最高为99.82％-100％，而样品AB2-AB5表示，与Anguilla Bengalensis的标识最高99.84％-100％。系统发育物种表明Anguilla Marmorata和Anguilla Bengalensis形成了两个不同的亚群体。Bengkulu Kuari河的水品质是温度26.5-27.5°C，pH 7.1-8.7，溶解氧6.19-9.54 mg l-1，亮度21-47 cm，ammonia，ammonia 0.16-0.41 mg l-1，总碱性20–52 mg l-1，33-1，TDS 33-1，TDS M. 0.3-0.4 PPT和水速度0.5-0.8 ms-1。通过将COI基因的DNA序列与GenBank中的现有数据库进行比较，DNA条形码中的COI基因非常适合用于鉴定Anguilla SPP物种。