Amplification of DNA for: • Sequencing • Genotyping • Cloning • Pathogen detection Advantages • Increased dynamic range of detection • No post-PCR processing • Higher sensitivity and specificity • Closed system reduces the risk of contamination • An increase in reporter fluorescent signal is directly proportional to the number of amplicons generated • Shorter turnaround time • No post-PCR processing
Roni Robbins 是一位屡获殊荣的记者、编辑,也是《Hands of Gold》一书的作者。这是她第二次担任 AJC 的自由撰稿人,http://www.ronirobbins.com。
报道人:CATHY J. JOHNSON MESSINA,RMR,FPR 注册优秀记者 佛罗里达州专业记者 会员:NCRA、FCRA、STAR
2 全校范围的估计(包括所有 NIH 研究)基于 NIH 拨款资金从 2023 年的 8580 万美元增加到 2030 年的 1.139 亿美元至 1.518 亿美元。(来源:NIH RePorter)这些估计是基于与其他拥有较新医学院的机构的同行对标。Tripp Umbach 将 NIH 在全州范围内花费的研究资金乘以 2.3,以实现经济影响预测。
图1。比例计量CRISPR-CAS12A系统。基于双通道FRET的CRISPR-CAS12A记者系统的示意图。电流(顶部)报告基因系统依赖于荧光团 - 猝灭记者,该记者包括黑暗(非辐射)淬火以防止发射和单个通道读数来检测裂解的报告基因。提出的读取系统而不是使用可见光的淬火。虽然报告荧光团保持与猝灭剂的结合,但报告基因系统形成一个fret对,并在可见的淬灭的发射波长中发出光。在CAS12A裂解时,报告荧光团发射通道中的信号增加,而淬火发射通道中的信号降低。因此,被分析的信号是报告荧光团发射通道与减少淬灭发射通道的比率。
使用Proteome Discoverer 3.2软件和Sequest®HT搜索算法进行数据分析。肽的修饰包括用于HELA的氨基甲基甲基化(C)的动态修饰,用于蛋白质混合物的羧甲基化(C),TMTPRO标签(N-末端,K)和MET氧化。FDR阈值在渗透剂节点中设置为1%,以识别肽和蛋白质鉴定的高置信度。在报告基因离子量化器节点中指定了11 ppm的记者离子峰积分耐受性,并使用新的集成的报告频道控制通道范围的范围范围范围进行了剥离和非剥离的控制通道,对剥离和非置换通道组的归一化进行了归一化。
检测设置 在第二个案例研究中,我们开发了一种 CBA,使用重组 HEK-Blue™ 报告细胞来检测针对药物的 NAbs,这是一种与细胞因子结合的融合抗体。HEK-Blue™ 报告细胞系统由 HEK293 细胞组成,这些细胞经过基因改造,可表达细胞因子特异性受体和主要信号蛋白,从而获得完全活跃的信号通路(图 2. A)。细胞因子激活受体会触发下游信号传导和分泌性胚胎碱性磷酸酶 (SEAP) 报告基因的表达。细胞上清液中分泌的 SEAP 量可以用 SEAP 检测培养基(比色酶测定)测量,并且与细胞因子活性成正比,与抗细胞因子 NAbs 的浓度成反比
研究成果概要(中文):CRISPR-Cas9 是一种多功能技术,可应用于医疗。在 DNA 双链断裂后的修复途径中,与模板 DNA 同源重组 (HDR) 的修复有助于精确编辑,但同时,涉及碱基缺失或插入的 NHEJ 也以高频率发生。我使用 Traffic Light Reporter 系统进行了基于细胞的 HDR 增强因子筛选,该系统可以同时检测具有 HDR 和 NHEJ 的细胞,并确定了与 NHEJ 衍生细胞相比,HDR 衍生细胞中表达较高的几个基因。对这些基因的进一步基因本体分析表明,它们与 DNA 修复和细胞周期有关。
抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)是一种抗体作用机理,通过该抗体,病毒感染或其他疾病的细胞针对细胞介导的免疫系统(例如天然杀伤细胞)的成分来破坏。ADCC报告基因生物测定是一种生物发光的记者测定,用于在ADCC作用机理(MOA)测定中量化通过治疗抗体药物在途径激活途径激活的生物学活性。可以使用ADCC生物测定效应器单元,传播模型(A – C)(Cat。G7102)进行ADCC记者生物测定,此处描述了该模型,该模型允许在独特的购买协议下进行单元格库和传播。该测定方法结合了一种简单的添加混合阅读格式和优化的协议,以提供较低的可变性和高精度的生物测定。这些性能特征使生物测定法适合在抗体药物研究,开发和制造批次释放中应用。