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IBM Rational Rhapsody 案例研究
协作不是火箭科学；它只不过是确保每个人都使用相同的信息。但是，正如这家国防承包商的火箭科学家所证明的那样，协作至关重要。导弹开发商部署了一个基于模型的系统工程平台，作为广泛分布的设计和工程团队分析和传达其各种导弹系统的软件、机械和电气要求的一种手段。使用仿真和可执行建模，这些工程师和设计师现在能够定义、测试和验证每个导弹系统的所有复杂要求，使他们能够在开发阶段更早地纠正错误并加速整个开发生命周期。现在，每个开发阶段都已记录在案，每个设计团队都可以访问，从而缩短了上市时间，消除了冗余并降低了开发成本。
IBM Rational Rhapsody 案例研究
协作并非火箭科学；它只不过是确保每个人都使用相同的信息。然而，正如这家国防承包商的火箭科学家所证实的那样，协作至关重要。导弹开发商部署了一个基于模型的系统工程平台，作为广泛分布的设计和工程团队分析和传达其各种导弹系统的软件、机械和电气要求的一种手段。使用仿真和可执行建模，这些工程师和设计师现在能够定义、测试和验证每个导弹系统的所有复杂要求，使他们能够在开发阶段更早地纠正错误并加速整个开发生命周期。现在，每个开发阶段都已记录在案，每个设计团队都可以访问，从而缩短了上市时间，消除了冗余并降低了开发成本。
BD Rhapsody HT单细胞分析系统
在BD Biosciences，我们以优秀的产品和技术支持为荣。我们所有的产品都得到了我们> 50年的单细胞专业知识和支持资源的支持。将多年的集体知识与多样化的研究和临床实验室经验相结合，我们的应用和现场服务团队提供了及时，专业的应用和工具支持。他们可以解决广泛应用程序中与工具，软件和试剂有关的问题。可以在需要时将专家派往您的网站以进行定期预防性维护。
Rhapsody™系统-TCR/BCR接下来，目标mRNA，...
用BD®ABSEQ和样品TAG抗体染色细胞以及细胞的分配和裂解后，将cDNA用作为模板的转录本的3'和5'端在BD Rhapsody™增强细胞捕获珠上编码。然后，使用两步的嵌套扩增从这些孔cDNA库中扩增 mRNA，TCR和BCR库，其中TCR和BCR库进行了其他随机启动，以捕获互补性确定区域（CDR）1、2和3，以及框架区域（FR）1-4。bd®Abseq和样品标签库是从珠子变性的上清液中放大的。
BD Rhapsody™系统单细胞ATAC-SEQ库准备协议
核分离：核分离方案取决于样品类型。有关详细信息，请参见Nuclei隔离（第13页）。标记：在批量的原位标记过程中，将核暴露于包含标记酶的标记混合物中。该酶靶向可访问的基因组区域（开放染色质区域），切割DNA并同时将预加载的衔接序列连接到每个DNA片段的末端。有关取代详细信息，请参见标签（第13页）。单细胞捕获：在微孔中执行细胞裂解。基因组DNA序列是通过夹板 - 橄榄键键的TSO链捕获的。
引用：Hampsey E，Meszaros M，Skirrow C等。狂想曲方案：一项纵向观察研究，研究语音PEN
摘要简介神经退行性和精神病障碍（NPDS）赋予了巨大的健康负担，随着人口的年龄增长。新的，远程提供的诊断评估可以通过分析语音来检测早期NPD的诊断评估可以实现较早的干预措施，而错过的诊断较少。应建立在具有NPD的人中远程收集语音数据的可行性。方法和分析本研究将评估从三个NPD队列中的个体遥遥收集的语音数据的可行性：神经退行性认知疾病（n = 50），其他神经退行性疾病（n = 50）（n = 50）（n = 50）和情感障碍（n = 50）（n = 50）（n = 50）（n = 50），以及匹配的对照（n = 75）。参与者将完成音频录制的语音任务以及一般和队列特异性症状量表。语音任务的电池将有多种目的，例如测量执行控制的各个要素（例如，注意力和短期记忆）以及语音质量的测量。参与者将在4周期间远程自我管理的语音任务和跟进症状量表。主要目的是评估使用自我管理的语音任务在广泛的NPD中远程收集连续叙事语音的可行性。此外，该研究还评估了声学和语言模式是否可以通过二进制分类器的接收器操作特征曲线的敏感性，特异性，Cohen的Kappa和区域来预测诊断组，从而衡量了诊断组。分析的声学特征包括Mel频率CEPSTRUM系数，强度频率，强度和响度，而基于文本的特征（例如单词数量，名词和代词率和思想密度）也将使用。伦理和传播该研究获得了卫生研究局与健康与护理研究威尔士的伦理批准（REC参考：21/PR/0070）。将通过在学术期刊，相关会议和
BD Rhapsodytm单细胞多组合演示...
与BD Rhapsody TM HT Xpress系统一起，我们的测定组合有助于您在生物学发现中实现新的高度。如果您有兴趣使用系统生成数据，请联系asif.qaseem@bd.com来计划您的实验。
成员（Matsushima's Lab。）教师教授兼董事长Kouji Matsushima，医学博士，博士
导致细胞社会的变化。为了克服这一局限性，在这个项目中，我们通过使用基于BD Rhapsody的新型单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）方法来分析单细胞水平的发炎组织 - tas-seq。（Shichino等人2022，Commun。 Biol .1：602）。 就基因敏感性，检测细胞群体的检测和细胞 - 细胞相互作用的敏感性而言， tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。 通过使用这项技术，我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型，我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记，C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质（Ogawa等人。 2022，生物化学。 生物。 res。 社区。 599：113-119）。 此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如 bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如 10x铬）和基于板的系统（例如 smart-seq2）。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。 现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠2022，Commun。Biol .1：602）。tas-seq比其他主要的SCRNA-SEQ技术优于其他主要的SCRNA-SEQ技术。通过使用这项技术，我们分析了二氧化硅诱导的肺纤维化模型，我们发现C1Q是肺间隙巨噬细胞的特定标记，C1Q充当了硅胶诱导的肺纤维化中的纤维化介质（Ogawa等人。2022，生物化学。生物。res。社区。599：113-119）。 此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。 tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如 bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如 10x铬）和基于板的系统（例如 smart-seq2）。 tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。 现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。 此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠599：113-119）。此外，我们开发了Tas-Seq，Tas-Seq2的更新版本，其中基因检测灵敏度及其实用性得到了增强。tas-seq2不仅可以应用于基于纳米韦尔的系统（例如bd rhapsody），但也要基于液滴的系统（例如10x铬）和基于板的系统（例如smart-seq2）。tas-seq2在小鼠脾脏和人类冷冻的PBMC样品中，比原始10x Chroumimum V3（10x Tas-Seq2）的基因比原始10x chroumimus V3（10x Tas-Seq2）高1.5-2倍。现在，我们正在开发用于高分辨率空间转录组学立体声的Tas-Seq2，用于分析固定细胞，并将其细胞吞吐量增加10-100倍。此外，我们正在收集人间质肺病患者，纤维化大鼠肺和鼠我们还建立了博来霉素诱导的肺纤维化模型的时间顺序scrna-seq数据中细胞 - 细胞通信的时间网络分析，并通过使用遗传修饰的小鼠来验证集线器细胞和相关的细胞外分子，并验证分子的作用。我们还建立了体内器官系统，该系统概括了博来霉素诱导的肺损伤的反应，并发现离体系统还可以诱导与鼠模型中无法观察到的与人类IPF相关的细胞集。
UCLA基因组学技术中心和生物信息学中心
库构造：批量测序：rnaseq rnaseq用rRNA耗竭☐miRNaseq☐chipseq☐chipseq physeq（wgbs）☐甲基甲基（RRBS）☐人wes☐人wes☐小鼠wes☐小鼠wes☐小鼠☐ tcr tcr☐bcr☐fb☐ATAC☐多组件（3'GEX+ATAC）☐ffpe/固定/固定☐bd Rhapsody☐ HD：☐人类全转录分析（WTA）☐小鼠全转录分析（WTA）10x Xenium：☐新鲜的10x Xenium ffpe 10x 10x xenium（用户需要提供面板。): Please specify: ________________________ GeoMx DSP: ☐ Dry Run ☐ hWTA ☐ mWTA ☐ hCTA ☐ Protein Panel (Specify):____ ☐ Other (please specify): ____ CosMx SMI: ☐ Human Universal Panel (1000 genes) ☐ Human Immuno-Oncology (100 genes) ☐ Mouse Neuro Panel (1000 genes) ☐ Human免疫肿瘤蛋白面板（64个蛋白质）☐其他（请指定）：____ stereoseq：stereoseq（1 cm x 1 cm）如果您需要定制的细胞染色抗体，请指定染色的名称和稀释因子：
人类红系细胞相关基因表达模式
红系细胞在免疫调节和免疫抑制中的作用是现代免疫学的新兴课题之一，由于不同组织和不同物种的红系细胞表达不同的免疫调节分子，因此仍需要进一步阐明。在本研究中，我们利用 BD Rhapsody 的最先进的单细胞靶向蛋白质组学和转录组学以及通过 NanoString Sprint Pro 进行的癌症相关基因拷贝数变异分析，对来自成年健康捐赠者和成年急性淋巴细胞白血病患者的人骨髓红系细胞进行了彻底的研究。我们发现人类骨髓红系细胞表达 ARG1、LGALS1、LGALS3、LGALS9 和 C10orf54 (VISTA) 免疫抑制基因、CXCL5、CXCL8 和 VEGFA 细胞因子基因，以及参与抗菌免疫和 MHC II 类抗原呈递的基因。我们还发现 ARG1 基因表达仅限于单个红细胞簇，我们将其称为 ARG1 阳性正色红细胞，而晚期红细胞在急性淋巴细胞白血病的情况下会失去 S100A9 并获得 MZB1 基因表达。这些发现表明，即使没有任何转分化刺激（如癌症），稳定状态的红细胞生成骨髓红细胞也会表达髓系特征基因。