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从澳大利亚野生动植物的壁虱中揭开微生物的多样性
摘要：tick虫和tick虫病原体对人类和动物的健康和福利构成了显着威胁。我们对澳大利亚野生动植物壁虱携带的病原体的了解是有限的。这项研究旨在表征来自澳大利亚维多利亚州六个地点的各种野生动植物物种的壁虱和壁虱传播微生物。在形态和分子表征（靶向16S rRNA和细胞色素C氧化酶I）之后，对基于微流体的实时PCR筛选进行了tick DNA提取物（n = 140），以检测微生物和立克斯群 - 体现 - 体积实时QPCRS。鉴定了五种ixodid tick虫，包括aponomma auruginans，ixodes（i。）Antechini，I。Kohlsi，I。Tasmani和I. Trichosuri。塔斯马尼二的16S rRNA序列的系统发育分析揭示了两个子映射，表明潜在的隐性物种。微流体实时PCR检测到七种不同的微生物作为单个（13/45个壁虱）或多种感染（27/45）。检测到的最常见的微生物是Apicomplexa（84.4％，38/45），其次是立克sp。（55.6％，25/45），Theileria sp。（22.2％10/45），Bartonella sp。（17.8％，8/45），coxiella -like sp。（6.7％，3/45），hepatozoon sp。（2.2％，1/45）和Ehrlichia sp。（2.2％，1/45）。对四个立克基因座的系统发育分析表明，本文检测到的立克氏菌分离株可能属于一种新型的立克氏症。这项研究表明，澳大利亚野生动植物的壁虱具有多种微生物。鉴于直接和间接的人类 - 野生动物 - 生物互动，需要采用一种健康方法来连续监视与tick相关的病原体/微生物，以最大程度地减少对动物和人类健康的相关威胁。
系统评价和元A
摘要：在非洲，由于包括Anaplasma，Ehrlichia，Rickettsia和Coxiella物种在内的壁虱传播病原体，tick虫仍然是改善牲畜行业的主要障碍。在这里进行了全身审查和荟萃分析，并强调了这些tick传播病原体在非洲壁虱中的分布和流行。在五个电子数据库中搜索了相关出版物，并使用包含/排除标准选择，分别在定性和定量分析中包括138和78篇论文。大多数研究都集中在罗克 - 埃特西亚（Ricktsia Africae）（38个研究），其次是埃里希氏症反刍动物（27项研究），Coxiella burnetii（20项研究）和Anaplasma缘缘（17项研究）。使用随机效应模型进行比例的荟萃分析。对于立克spp获得了最高的患病率。(18.39%; 95% CI: 14.23–22.85%), R. africae (13.47%; 95% CI: 2.76–28.69%), R. conorii (11.28%; 95% CI: 1.77–25.89%), A. marginale (12.75%; 95% CI: 4.06–24.35%), E. ruminantium （6.37％； 95％CI：3.97–9.16％）和E. Canis（4.3％； 95％CI：0.04–12.66％）。C. burnetii的患病率较低（0％； 95％CI：0-0.25％），Coxiella spp的患病率更高。（27.02％； 95％CI：10.83–46.03％）和类似Coxiella的内共生体（70.47％； 95％CI：27-99.82％）。识别了tick属，tick物种，乡村和其他变量的影响，并强调了心脏水中rhipicephalus tick的流行病学；每种立克属物种的属性，用于不同的tick属； A. Marginale，R。非洲和Coxiella的主体分布在tick虫中的内共生体和非洲硬滴答中的C. burnetii分布较低。
IBMP套件Biomol Rickettsiosi IU-IVD-018修订版06IBMP套件Biomol Rickettsiosi IU-IVD-018修订版06
除了内源性内源性（CI）（RNASEP）外，分别 PANR8。 检测立克人士立克sii的核酸的存在。 和内部对照是通过在多重反应中使用每个分子靶标（荧光标记寡核苷酸）的特定水解探针进行的。 通过准备两种反应混合物的多重QPCR来进行测试，以检测病原体。 在反应1中，搜索Panr8靶标（立克属）。 和rnasep（CI）。 在反应2中搜索RRI6（Rickettsia Rickettsii）和rnasep（CI）。 被调查的分子靶标的典型格式放大曲线的产生证明了样品可检测结果的反应。 对被调查的分子靶标的不可检测结果的样品应仅具有CI的扩增。 ci扩增表明反应（试剂和操作员）的正确运行，并反映了从样品中提取的DNA的质量。 如果未检测到CI，则样品必须再次提取其遗传物质。 该套件具有合成阳性（CP）生物安全（不为操作员或环境提供生物学风险），这应该对包括CI在内的所有被调查的分子靶标有可检测的结果。 该试剂盒还具有负面对照（CN），可评估环境和实验条件，并且应该对所有调查的目标都无法检测到结果。 未验证产品以进行定量分析。PANR8。检测立克人士立克sii的核酸的存在。和内部对照是通过在多重反应中使用每个分子靶标（荧光标记寡核苷酸）的特定水解探针进行的。通过准备两种反应混合物的多重QPCR来进行测试，以检测病原体。在反应1中，搜索Panr8靶标（立克属）。和rnasep（CI）。在反应2中搜索RRI6（Rickettsia Rickettsii）和rnasep（CI）。被调查的分子靶标的典型格式放大曲线的产生证明了样品可检测结果的反应。对被调查的分子靶标的不可检测结果的样品应仅具有CI的扩增。ci扩增表明反应（试剂和操作员）的正确运行，并反映了从样品中提取的DNA的质量。如果未检测到CI，则样品必须再次提取其遗传物质。该套件具有合成阳性（CP）生物安全（不为操作员或环境提供生物学风险），这应该对包括CI在内的所有被调查的分子靶标有可检测的结果。该试剂盒还具有负面对照（CN），可评估环境和实验条件，并且应该对所有调查的目标都无法检测到结果。未验证产品以进行定量分析。该套件是用于进行定性分析的，即仅评估每个分子靶标的存在或不存在。经过验证的产品，可与以下热环相处：7500快速和7500实时PCR系统（Applied Biosystems）。
tick和tick传播疾病
墨西哥湾海岸tick虫，Amblyomma Maculatum，居住在美国东南部与墨西哥，墨西哥湾和其他中美洲国家接壤的美国。最近，其美国范围已向亚利桑那州和东北部延伸至纽约州和康涅狄格州。这是立克帕克里（Rickettsia Parkeri）和赫帕托津（Hepatozoon Americanum）的矢量。该壁虱物种已成为研究tick/人力体相互作用的模型。为了提高我们对大曲霉的基本生物学的了解，我们在这里报告了该tick的基因组草案，并对其蛋白质组进行了广泛的功能分类。单个雄性tick的DNA用作基因组来源，10倍基因组学方案确定了28,460个脚手架，其脚手架具有相等或大于10 kb，总计1.98 GB。N50脚手架的大小为19,849 kb。Braker管道用于在组装的A. maculatum基因组上找到蛋白质编码基因边界，发现237,921 CD。在修剪和分类可转座元件，细菌污染物和截短的基因后，将一组25,702个注释并分类为核心基因产物。BUSCO分析显示83.4％的完整Buscos。提供了超链接的电子表格，可以浏览单个基因产品及其匹配到几个数据库。
非洲丝状病毒载体的总微生物组，Culex Quinquefasciatus：对人类致病性MI
culex quinquefasciatus蚊子是西尼罗河病毒，登革热病毒和裂谷谷发烧病毒等人畜共患病原体的重要媒介。尽管它们在病原体传播中的作用，但对非洲这些蚊子的全面微生物组研究受到限制，大多数研究都集中在其中肠微生物组上。这项研究通过分析非洲CX的总微生物组来解决这一差距。使用元基因组下一代测序（MNGS）的Quinquefasciatus。该研究产生了71,817和29,908读，读取了CX。Quinquefasciatus和微生物分别识别146个不同的微生物。细菌是最普遍的，所有微生物的占85.6％（125/146），其次是病毒（8.2％，12/146），真菌（4.8％，7/146）和其他真核生物生物（1.4％，2/146）。经常检测到的属包括Rickettsia sp。，Wolbachia sp。，Erwinia sp。，肠球菌Sp。，Pantoea sp。和Providencia sp。Providencia rettgeri，CX的Wolbachia内共生体。Quinque fasciatus和Rickettsia tabaci的内共生体是最丰富的物种之一。值得注意的是，大约7.4％的鉴定微生物是已知的人类病原体。本研究提供了CX的微生物组的概述。quinquefasciatus，突出了共生，共生和致病性微生物，其中一些可能对微生物操纵策略控制蚊子和蚊子 - 传播病原体有用。
BioSafety手册-EHS.UCI.edu
The UCI Biosafety Manual applies to all UCI faculty, staff, hosted visitors, students, participating guests and volunteers, contract laborers, supplemental personnel and employees of firms working at locations where UCI has management control of specific biohazards, including: • All infectious agents (bacteria, fungi, parasites, prions, rickettsia, viruses, etc.)可能导致人类疾病或引起重大的环境或农业影响。•人类，灵长类动物细胞或细胞培养•重组和合成核酸•转基因植物，昆虫或动物•人类基因治疗研究•已知的动物和动物产物是人畜共患病的储层UCI支持UCI支持的研究，利用BSL-1，BSL-2，BSL-2和BSL-3的研究和BSL-3容纳和工作习惯。UCI没有BSL-4实验室。本生物安全手册不涵盖以下位置：•UCI医学中心医学院临床位置； •UCI医疗中心医院和诊所直接涵盖医院许可证。
订购样本，通过 MHS Genesis 发送至海军医学研究司令部 (NMRC) 海军传染病诊断实验室 (NIDDL)
- Sars-Cov-2 PCR（辅助测试名称：2019 年新型冠状病毒或 COVID-19） - RSV PCR - 登革热/比丘恩 RT-PCR - 寨卡 RT-PCR - 流感 A/H799 - MERS RT-PCR（辅助测试：中东呼吸综合征 RT-PCR） - 非天花 Pcr（辅助测试名称：非天花正痘病毒）GG - 寨卡病毒 Igm - NGDs 战士面板（埃博拉病毒、马尔堡病毒、炭疽杆菌冠状病毒 Hku1、冠状病毒 NL63、冠状病毒 OC43、严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (Sars-Cov-2)、人类偏肺病毒、人类鼻病毒/肠道病毒、流感 a 病毒、流感 a
将样本转送至海军医学研究司令部 (NMRC)
- Sars-Cov-2 PCR（辅助测试名称：2019 年新型冠状病毒或 COVID-19） - RSV PCR - 登革热/比丘恩 RT-PCR - 寨卡 RT-PCR - 流感 A/H799 - MERS RT-PCR（辅助测试：中东呼吸综合征 RT-PCR） - 非天花 Pcr（辅助测试名称：非天花正痘病毒）GG - 寨卡病毒 Igm - NGDs 战士面板（埃博拉病毒、马尔堡病毒、炭疽杆菌冠状病毒 Hku1、冠状病毒 NL63、严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (Sars-Cov-2)、人鼻病毒、流感 A/H1、流感 a 病毒 A/H3、流感 a 病毒 A/H1-2009、流感 b
塞尔维亚 COVID-19 紧急应对项目 ...
病毒学、疫苗和血清研究所 1. 背景 塞尔维亚共和国已从国际复兴开发银行 (IBRD) 获得一笔 9200 万欧元等值贷款，用于塞尔维亚紧急 COVID-19 应对项目 (SECRP) 的费用，贷款编号为 9120-YF。SECRP 的目标是应对 COVID-19 带来的威胁，并加强塞尔维亚的国家卫生系统，做好公共卫生防范。在“托尔拉克”病毒学、疫苗和血清研究所建立一座带有 BSL-3 实验室的新诊断实验室大楼的目的是加强该研究所的能力。BSL-3 实验室将满足处理需要这种生物安全级别的病原体的要求，例如黄热病病毒、西尼罗河病毒、东部马脑炎病毒、SARS-CoV-2 和 MERS-CoV，以及不同的细菌、真菌和立克次体病原体。 “托尔拉克”研究所的新诊断实验室大楼（BSL-3）将不用于动物研究。塞尔维亚共和国打算将部分贷款用于提供咨询服务，以制定职业健康与安全计划，并在“托尔拉克”病毒学、疫苗和血清研究所建造新的诊断大楼（BSL-3 实验室）期间协调职业健康与安全措施。为此，将选择一名个人顾问（以下简称“顾问”）来实施本职责范围内所列的活动。
项目“ div>传播的garrapats和微生物
tick是强迫性毒性节肢动物，在世界所有地区，寄生虫的陆地脊椎动物。 div>在阿根廷，大约15种tick虫（Rhypicephalus，Amblyomma，Haemaphysalis和ixodes）经常会寄生牛，马，山羊和犬类等家畜。 div>此外，它们具有传播医学和兽医重要性的致病微生物的潜在能力，其中包括Anaplasma，Ehrlichia和Rickettsia的细菌以及Babesia属和Rangelia属的原生动物类型（Nava等。2017）。 div>在这项工作中，我们建议确定寄生于家养和人类动物的壁虱物种，以及与这些载体相关的潜在致病微生物在阿根廷萨尔塔省里瓦达维亚部的家庭生产单位（UPF）中。 div>同样，另一个目标是拧紧tick传输的病原体的分子诊断技术，以便将诊断实验室接近该地区。 div>将选择30个生产性家庭单位作为收集地点，以研究犬，牛，马和山羊的寄生虫虫的特定和季节性动态财富，以及自由生活。 div>如所述和颈静脉或抗抗血管头皮的狗中，将通过颈静脉的穿刺和牛静脉的穿刺来获得山羊和牛的血液样本。 div>tick将通过描述和形态键进行分类（Nava等，2017），并与存放在Inta Rafaela收藏中的参考资料相比；测序将用于