摘要 目的 开发和验证一个有效且用户友好的人工智能平台,该平台基于一些无偏临床变量,结合先进的 CT 自动分析,用于 COVID-19 患者的风险分层。材料与方法 总共回顾性地纳入了第一波疫情(2020 年 2 月 16 日至 4 月 29 日)期间 16 家医院收治的 1575 名连续 COVID-19 成人,这些患者在入院后 72 小时内接受了胸部 CT 检查。总共初步收集了 107 个变量;从 CT 中提取了 64 个。结果是生存率。采用严格的 AI 模型选择框架进行模型选择和自动 CT 数据提取。比较了模型性能的 AUC。使用 Microsoft PowerApps 环境开发了一个 Web 移动界面。该平台已在第 2 波(2020 年 10 月 14 日至 12 月 31 日)期间前瞻性招募的 213 名 COVID-19 成年人身上进行了外部验证。结果 最终队列包括 1125 名患者(292 名非幸存者,26%)和 24 个变量。Logistic 在完整变量集上表现出最佳性能(AUC = 0.839 ± 0.009),就像在包含一组有限的 13 个和 5 个变量的模型中一样(AUC = 0.840 ± 0.0093 和 AUC = 0.834 ± 0.007)。对于非劣效性能,选择 5 个变量模型(年龄、性别、饱和度、通气良好的肺实质和心胸血管钙化)作为最终模型,并完全自动化提取 CT 衍生参数。全自动模型在第 1 波上显示 AUC = 0.842(95% CI:0.816–0.867),并用于构建 0-100 量表风险评分(AI-SCoRE)。在第 2 波上确认了预测性能(AUC 0.808;95% CI:0.7402–0.8766)。结论 AI-SCoRE 是一种有效可靠的平台,可基于一些无偏临床数据和 CT 自动分析对 COVID-19 患者进行自动风险分层。
。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是制作
摘要:背景:对SARS-COV-2的免疫反应对于防止再感染或减轻疾病严重程度至关重要。到目前为止,已经对T-Cells的长期保护或自然感染引起了长期保护。但是,它仍然吸引了相当大的科学兴趣。本流行病学研究的目的是定义来自普通人群的特定未接种疫苗的个体中T细胞免疫反应的水平,并具有先验确认的COVID-19感染,而没有可测量的IgG抗体水平。方法:我们从2021年9月至2022年9月从Covid-19恢复的连续未接种疫苗的人的病历进行了回顾性描述性分析,该数据从2021年9月至2022年9月到达Attica地区的一个大型私人医疗中心,以便根据自己的主动性进行SARS-COV-2 T-t-cell Imnunity响应进行检查。感染后三个时期的T细胞反应分析分为三个时期:A组:最多6个月; B组:6-12个月; C组:> 12个月。通过执行T点,估计了针对尖峰(S)和Nucleocapsid(N)结构蛋白的SARS-COV-2 T细胞响应。covid测试方法。通过SARS-COV-2 IgG II QUIAS分析(Abbott Diagnostics)测量 SARS-COV-2 IgG抗体水平。结果:研究中总共包括182名受试者,其中85名女性(46.7%)和97名男性(53.3%)男性,范围为19至91岁(平均50.84±17.2岁)。在检查日期以前的6个月内已感染了59个(32.4%)(A组),在一段时间内> 6个月内感染了69个(37.9%),<1年(B组)和54(29.7%)在检查日期内感染了超过1年(C组)(C组)。在这三组中,据报道,A组的47/58(81%),B组B组61/69(88.4%)和C组C组47/58(88.4%)的阳性T细胞反应(88.4%)(CHI Square,P = 0.27)。T细胞反应,B组的61/69(88.4%)和C组C组的36/54(66.7%)(CHI Square,P = 0.02)。S抗原的中位数斑点细胞(SFC)的计数为18(从0-160),19组为19(范围为0-130),在B组中为0-130(从0-160),C组中的0-160(范围为0-160)(KRUSKAL – WALLIS测试,P = 0.11; PAIMWISE比较; Pairwise比较:A – B组:A – B,P = 0.95 c = 0.95; c,P = 0.89; p = 0. c,P = 0. c,p = 0. 0. c = 0. p = 0. 0. c = 0. p =0。 0.11)。n抗原的中位数为A组为14.5(范围从0到116),B组为24(从0-168),1组为1(范围为C组为0-112)(Kruskal -Wallis测试,P = 0.01; P = 0.01; pairwise比较; pairwise比较:A – B组,P = 0.02 = 0.02; 0.03)。结论:我们的数据表明,尽管无法检测到的体液元素,但SARS-COV-2自然感染后的保护性适应性T细胞免疫可能会持续12个月以上。
严重的急性呼吸道综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)大流行已经大大加快了病毒感染和疫苗接种研究的进展。直到2021年11月,有四种SARS-COV-2疫苗已在欧盟获得营销授权,其中两种是基于mRNA的,两个基于病毒矢量技术。多项研究表明,关于预防SARS-COV-2有症状感染和严重的冠状病毒病2019(COVID-19)疾病疗法的mRNA和病毒载体疫苗的良好效率(1-7)。免疫分析提供了针对SARS-COV-2的体液和T细胞反应的证据(8-18)。然而,进一步的研究表明,在某些亚群中,尤其是在因自身免疫性疾病或癌症引起的免疫抑制疗法的患者中,对SARS-COV-2疫苗接种的免疫反应减少甚至缺乏免疫学反应。不幸的是,由于免疫疗法,同一患者有严重的Covid-19疾病病程的风险。免疫抑制治疗用于多发性硬化症(PWMS)的人进行疾病改良。已显示两类MS药物会损害对mRNA和病毒载体疫苗接种的免疫反应。首先,已显示出可预防淋巴结淋巴结淋巴细胞的链球菌1-磷酸受体(S1PR)调节剂,已被证明会损害对SARS-COV-2疫苗接种的体液和T细胞反应(19-21)。第二,单克隆抗CD20抗体的治疗有限的患者能够对SARS-COV-2疫苗进行足够的体液反应能力(22-27)。2021年12月,基于蛋白质的SARS-COV-2疫苗NVX-COV2373在欧盟获得了有条件的营销授权。我们旨在澄清NVX-COV2373是否可以诱导SARS-COV-2特定t-和
1 Prasanna 公共卫生学院,马尼帕尔高等教育学院,Eshwar Nagar,马尼帕尔,乌杜皮,卡纳塔克邦 - 576104,印度 2 印度公共卫生研究所甘地讷格尔,空军站总部对面,Lekawada,甘地讷格尔,古吉拉特邦 - 382042,印度 3 印度公共卫生研究所 - 德里,地块编号 47,第 44 区,机构区,古尔冈 - 122002,印度 4 外科分部,ICAR-印度兽医研究所,Izatnagar,Bareilly-243 122,北方邦,印度 5 兽医微生物学和免疫学系,北方邦兽医学院 Pandit Deen Dayal Upadhyaya Pashu Chikitsa Vigyan Vishwavidyalaya Evam Go Anusandhan Sansthan (DUVASU),印度马图拉 - 281001,印度。6 印度兽医研究所 ICAR 病理学部,伊扎特纳加尔,巴雷利 - 243 122,北方邦,印度 收稿日期 – 2020 年 10 月 5 日;修订日期 – 2020 年 10 月 20 日;接受日期 – 2020 年 10 月 28 日 在线发布日期 2020 年 10 月 30 日 DOI:http://dx.doi.org/10.18006/2020.8(Spl-1-SARS-CoV-2).S103.S113
SARS-COV-2使用宿主细胞膜受体血管紧张素转化酶2(ACE2)锚定其尖峰蛋白,并由宿主膜膜蛋白酶促进膜融合蛋白。最近的研究表明,跨膜丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)是一种蛋白酶,该蛋白酶在先前的冠状病毒感染中相似,严重的急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸道综合征(MER)和中东呼吸道综合征(MERS),负责SARS-Cov-2-Cov-2-Cov-2型宿主的蛋白质,启用了Enaber Face face face facike ofer face facie face face face face face facike fir facie fir face facike ofer face face face face facike od sy facike fir。tmprss2在包括胃肠道,呼吸和遗传系统在内的不同部位的上皮细胞中表达。(SARS-COV-2的E感染部位与ACE2和TMPRSS2的共表达位点相关。此外,感染率的年龄,性别和合并症相关的变化与这些组中TMPRSS2的表达速率相关。(ESE发现提供了有效的理由,认为抑制TMPRSS2可以在降低病毒的细胞进入,最终影响感染率和病例严重性时具有有益的影响。使用常规和计算方法,正在进行一些药物开发研究,以开发蛋白酶的潜在抑制剂。在应用这种疗法之前,必须完全了解TMPRSS2的生物学作用。
SARS-CoV-2 是一种正义单链 RNA 病毒,导致了 COVID-19 大流行。目前尚不清楚人类宿主细胞中的病毒是否以及在多大程度上经历了 RNA 编辑,这是一种主要的 RNA 修饰机制。在这里,我们对来自多个 COVID-19 患者支气管肺泡灌洗液样本的宏转录组数据进行了可靠的生物信息学分析,揭示了 SARS-CoV-2 中相当数量的 A-to-I RNA 编辑候选位点。我们通过评估 RNA 编辑特有的四个特征来确认这些候选位点上 A-to-I RNA 编辑信号的富集:推断的 RNA 编辑位点表现出 (i) 由基于 ADAR1 CLIP-seq 数据构建的深度学习模型预测的更强的 ADAR1 结合亲和力,(ii) ADAR1 抑制的人肺细胞中的编辑水平降低,(iii) 局部聚类模式,和 (iv) 更高的 RNA 二级结构倾向。我们的研究结果对于了解 SARS-CoV-2 的进化以及 COVID-19 研究(例如系统发育分析和疫苗开发)具有重要意义。
随着 2020 年严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 在全球大流行的开始,围绕某些用于治疗炎症性疾病(例如类风湿性关节炎、脊柱关节病、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮和炎症性肠病)以控制冠状病毒症状的疾病修饰药物的研究活动日益增多。在上述情况下,许多人正在长期接受治疗,使用包括羟氯喹、肿瘤坏死因子 α (TNF α ) 抑制剂药物、其他生物制剂(例如 IL-6 单克隆抗体)和 Janus 激酶抑制剂(包括巴瑞替尼和托法替尼)等药物,这些药物用于控制各自自身免疫疾病中的炎症反应。有新数据表明,免疫调节药物可以保护患者减少 SARS-CoV-2 的某些特征并改善康复。此外,重要的是要了解接受上述免疫调节剂治疗的受试者的 SARS-CoV-2 感染是否较轻(因为他们被认为从免疫调节治疗中获得了一定的保护),或者他们是否会出现与非免疫功能低下患者相似的感染。在 Covid-19 感染的情况下,负责任地建议患者是否应该继续接受免疫调节治疗,这是一个巨大的未满足的临床需求。在本文中,我们将讨论使用免疫调节药物治疗 SARS-CoV-2 的潜在治疗方案,以及在病情的哪个阶段这些方案可能有益。全球冠状病毒大流行期间的可行治疗方案是一个急需且非常活跃的研究领域。
1 土耳其尼代奥梅尔·哈利斯德米尔大学医学院妇产科系 2 土耳其内夫谢希尔卡帕多奇亚大学健康科学学院助产学系 3 土耳其尼代奥梅尔·哈利斯德米尔大学医学院医学生物化学系 4 土耳其尼代奥梅尔·哈利斯德米尔大学培训与研究医院医学生物化学系 5 土耳其尼代奥梅尔·哈利斯德米尔大学医学院组织学与胚胎学系 6 土耳其马尔丁阿图克鲁大学健康科学学院助产学系 7 土耳其马尔丁 Mehmet Emin Ayag 私人诊所妇产科诊所 8 土耳其开塞利 Yahyali 州立医院妇产科诊所 9 马尔丁 Savur Prof.博士土耳其马尔丁阿齐兹桑卡尔地区州立医院
1。世界卫生组织。谁冠状病毒(Covid-19)Dash-董事会。2024年4月5日访问。http://covid19.who.int/ 2。Zheng C,Shao W,Chen X,Zhang B,Wang G,Zhang W. Covid -19疫苗的真正世界有效性:文献综述和元分析。 int j Infect dis。 2022; 114:252- 260。 3。 fernández-de -de -las -peñasC。长covid:当前定义。 感染。 2022; 50:285 -286。 4。 Soriano JB,Murthy S,Marshall JC,Relan P,Diaz JV,后者临床案例定义工作组 - COVID -19条件。 通过Delphi共识对后COVID -19条件的临床案例定义。 柳叶刀感染。 2022; 22:e102 -e107。 5。 Chen C,Haupert SR,Zimmermann L,Shi X,Fritsche LG,Mukherjee B. 2019年冠状病毒后的全球患病率(COVID-19)或长期covid:元分析和系统综述。 J感染。 2022; 226:1593 -1607。 6。 Han Q,Zheng B,Daines L,Sheikh A. 长期的covid -19的后遗症:一年的系统综述和元分析,遵循有关后症状后症状的研究。 病原体。 2022; 11:269。 7。 fernandez -de -las -peñasC,Notarte KI,Macasaet R等。 在SARS-COV-2感染两年后,普通人群中的covid症状持续存在:系统审查和元分析。 J感染。 2024; 88:77- 88。 8。 Rahmati M,Udeh R,Yon DK等。Zheng C,Shao W,Chen X,Zhang B,Wang G,Zhang W. Covid -19疫苗的真正世界有效性:文献综述和元分析。int j Infect dis。2022; 114:252- 260。3。fernández-de -de -las -peñasC。长covid:当前定义。感染。2022; 50:285 -286。4。Soriano JB,Murthy S,Marshall JC,Relan P,Diaz JV,后者临床案例定义工作组 - COVID -19条件。通过Delphi共识对后COVID -19条件的临床案例定义。柳叶刀感染。2022; 22:e102 -e107。5。Chen C,Haupert SR,Zimmermann L,Shi X,Fritsche LG,Mukherjee B.2019年冠状病毒后的全球患病率(COVID-19)或长期covid:元分析和系统综述。J感染。2022; 226:1593 -1607。6。Han Q,Zheng B,Daines L,Sheikh A. 长期的covid -19的后遗症:一年的系统综述和元分析,遵循有关后症状后症状的研究。 病原体。 2022; 11:269。 7。 fernandez -de -las -peñasC,Notarte KI,Macasaet R等。 在SARS-COV-2感染两年后,普通人群中的covid症状持续存在:系统审查和元分析。 J感染。 2024; 88:77- 88。 8。 Rahmati M,Udeh R,Yon DK等。Han Q,Zheng B,Daines L,Sheikh A.长期的covid -19的后遗症:一年的系统综述和元分析,遵循有关后症状后症状的研究。病原体。2022; 11:269。7。fernandez -de -las -peñasC,Notarte KI,Macasaet R等。在SARS-COV-2感染两年后,普通人群中的covid症状持续存在:系统审查和元分析。J感染。2024; 88:77- 88。8。Rahmati M,Udeh R,Yon DK等。对SARS -COV -2感染后的Covid -19 2-年度长期后遗症的系统综述和元分析:神经,身体和心理学科学的行动呼吁。J Med Virol。2023; 95:e28852。9。Amdal CD,PE M,Falk RS等。活跃的Covid -19或Covid -19患者的生活质量问题(包括症状),包括症状,包括症状;系统文献综述。Qual Life Res。2021; 30:3367 -3381。10。tene L,Bergroth T,Eisenberg A,David SSB,ChodickG。风险因素,健康结果,医疗服务利用以及长期共同患者的直接医疗费用。int j Infect dis。2023; 128:3 -10。11。Hayes LD,Ingram J,Sculthorpe NF。SARS -COV -2的100多个持续症状(长covid):范围审查。前药。2021; 8:750378。12。fernández-de -de -las -peñasC,Raveendran AV,Giordano R,Arendt -Nielsen L. Long Covid或Covid -19条件 - 19条状态:过去,现在和未来的研究指导。微生物。2023; 11:2959。13。Chen B,Julg B,Mohandas S,Bradfute SB。恢复机械途径工作组。长期相互兴趣的病毒持久性,重新激活和机械性。Elife。 2023; 12:e86015。 14。 Proal AD,Vanelzakker MB,Aleman S等。 sars -cov -2储存库,在covid -19后急性后遗症(PASC)。 nat免疫。 2023; 24:1616- 1627。 15。 Clin Chem Lab Med。Elife。2023; 12:e86015。14。Proal AD,Vanelzakker MB,Aleman S等。sars -cov -2储存库,在covid -19后急性后遗症(PASC)。nat免疫。2023; 24:1616- 1627。15。Clin Chem Lab Med。fernandez -the -page C,Torres J,Macase R等。在Covid -19的幸存者中存在SARS -2 RNA:2024; 62:1044 -1052。