XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemSARS
DNA 糖基化酶 NEIL2 在 SARS 期间具有保护作用……
SARS-CoV-2 感染引起的宿主先天免疫反应加剧，不仅导致 COVID-19 患者的组织损伤和多器官衰竭，还会诱导宿主基因组损伤并激活 DNA 损伤反应途径。为了测试个体受损的 DNA 修复能力是否会调节 COVID-19 感染的严重程度，我们分析了公开的患者数据集中的 DNA 修复基因表达，并观察到严重感染的 COVID-19 患者肺中的 DNA 糖基化酶 NEIL2 水平较低。在感染患者、仓鼠和表达 ACE2 受体的人类 A549 (A549-ACE2) 细胞中进一步验证了 NEIL2 水平较低的这一观察结果。此外，与模拟处理的细胞相比，在 A549-ACE2 细胞中递送重组 NEIL2 会导致促炎基因和病毒 E 基因表达降低，并且病毒后代的产量降低。从机制上看，NEIL2 与 SARS-CoV-2 基因组 RNA 的 5'-UTR 协同结合，从而阻止病毒蛋白的合成。总之，这些数据强烈表明，维持基础 NEIL2 水平对于宿主对病毒感染和疾病的保护性反应至关重要。
使用量子监督的机器学习分析SARS COV-2患者数据
大脑中内源性活性的模式反映了神经元空间的随机探索，该探索受神经元的基础组装组织的约束。然而，仍然有待证明的是，神经元及其组装动力学之间的这种相互作用确实可以产生全脑数据统计。在这里，我们在斑马鱼幼虫中同时记录了约40，000个神经元的活性，并表明神经元组装相互作用的数据驱动网络模型可以准确地重现其自发活性的平均活性和成对的统计统计量。该模型是组成限制的玻尔兹曼机器，揭示了约200个神经组件，它组成了神经生理电路，其各种组合形成了连续的大脑状态。从中，我们从数学上得出了区域间连通性矩阵，该矩阵在各个动物之间是保守的，并且与结构连通性很好地相关。这种基于组装的新型神经动力学的生成模型可以实现生理结合的扰动实验。
重组腺病毒疫苗保护恒河猴免受 SARS 冠状病毒的攻击
此版本的版权所有者于 2020 年 2 月 21 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.02.17.951939 doi: bioRxiv preprint
将抗病毒药物与 BET 抑制剂联合使用有利于对抗 SARS‐CoV‐2 感染
和对 SARS-CoV-2 生命周期至关重要的病毒蛋白，并证明了溴结构域和末端外结构域蛋白 2 和 4 (BRD2/BRD4) 与 SARS-CoV-2 的 E 蛋白相互作用。另一项利用 CRISPRi 筛选的研究表明，BRD2 抑制会下调血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 表达，并通过下调干扰素刺激基因 (ISG) 来控制 COVID-19 患者的过度活跃免疫反应。6 此外，Gilham 等人报道，溴结构域和末端外结构域蛋白家族 (BET) 抑制剂阿帕贝龙 (RVX-208) 通过降低 ACE2 表达来阻断 SARS-CoV-2 感染，7 而 Qiao 等人表明，使用 BET 抑制剂对雄激素受体的转录抑制也会导致 SARS-CoV-2 感染减少。8
发现了一种新型三氟甲基重氮嗪抑制剂...
摘要：SARS -COV -2 M PRO是一种类似胰蛋白酶的半胱氨酸蛋白酶，在SARS -COV -2的复制和感染中起着相关的作用，SARS -COV -2是冠状病毒，负责COVID -19。M PRO的结合位点的特征是存在催化Cys145，该催化Cys145具有酶的水解活性。因此，迄今为止已提出了几种m pro抑制剂，以与1900型大流行作斗争。在我们的工作中，我们设计，合成和生物学评估了MPD112，这是一种新型的SARS -COV -2 M Pro的抑制剂，该抑制剂携带三氟甲基重氮蛋白部分。MPD112。此外，对PL Pro的抑制测定表明缺乏抑制作用，从而确保了M Pro的化合物的选择性。此外，在酶的结合位点停靠了靶化合物MPD112，以预测硅中已建立的分子间相互作用。mPD112，以评估其对人类细胞活力的影响，表现出良好的耐受性，证明了三氟甲基重任氮杂氨酸部分在SARS -COV -COV -COV -COV -2 M PRONINES的设计和开发中的生物学相容性和活性。
工程CRISPR/CAS12A启用快速SARS-COV-2检测
致谢：我们感谢Jain Lab的成员提供有用的建议和讨论。我们感谢佛罗里达大学，UF健康癌症中心和临床和转化科学研究所存储库的支持。我们还要感谢David Ostrov博士和Cuong Nguyen博士的支持，并获得了患者样本并进行讨论。 最后，我们感谢惠特尼·斯托佩尔（Whitney Stoppel）博士和她在化学工程系的实验室和佛罗里达大学森林基因组学集团的Chrisopher Dervinis博士使用冻干剂。 通过BEI资源，NIAID，NIH：中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-COV），EMC/2012，NR-45843获得以下试剂。来自Urbani，Urbani，NR-52346的定量PCR（QPCR）控制RNA；来自人类冠状病毒（HCOV）的基因组RNA，NL63，NR-44105；来自SARS相关冠状病毒2的基因组RNA，孤立的香港/VM20001061/2020，NR-52388。 以下试剂是由疾病控制和预防中心沉积的，并通过BEI资源，NIAID，NIH：与SARS相关冠状病毒2，分离的USA-WA1/ 2020，NR-52285的BEI资源：基因组RNA。来自热灭活SARS相关的冠状病毒2，分离株USA-WA1/2020，NR 52347的定量PCR（QPCR）对照RNA；与SARS相关的冠状病毒2，分离的USA-WA1/2020，热灭活，NR-52286。 通过Bei Resources，NIAID，NIH：与SARS相关的冠状病毒2，Inalaly Italy-Inmi1，NR-52498分离出Maria R. Capobianchi博士的基因组RNA。我们还要感谢David Ostrov博士和Cuong Nguyen博士的支持，并获得了患者样本并进行讨论。最后，我们感谢惠特尼·斯托佩尔（Whitney Stoppel）博士和她在化学工程系的实验室和佛罗里达大学森林基因组学集团的Chrisopher Dervinis博士使用冻干剂。通过BEI资源，NIAID，NIH：中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-COV），EMC/2012，NR-45843获得以下试剂。来自Urbani，Urbani，NR-52346的定量PCR（QPCR）控制RNA；来自人类冠状病毒（HCOV）的基因组RNA，NL63，NR-44105；来自SARS相关冠状病毒2的基因组RNA，孤立的香港/VM20001061/2020，NR-52388。以下试剂是由疾病控制和预防中心沉积的，并通过BEI资源，NIAID，NIH：与SARS相关冠状病毒2，分离的USA-WA1/ 2020，NR-52285的BEI资源：基因组RNA。来自热灭活SARS相关的冠状病毒2，分离株USA-WA1/2020，NR 52347的定量PCR（QPCR）对照RNA；与SARS相关的冠状病毒2，分离的USA-WA1/2020，热灭活，NR-52286。通过Bei Resources，NIAID，NIH：与SARS相关的冠状病毒2，Inalaly Italy-Inmi1，NR-52498分离出Maria R. Capobianchi博士的基因组RNA。
体外转录的机械模型，结合了焦磷酸镁结晶的作用
图5代表延长的绿色荧光蛋白（EGFP），SARS -2 COV -2 SPIKE蛋白受体结合结构域（RBD）和CAS9模型验证的各种组合：IVT长度的多个DNA序列的IVT产量（Rosa等，2022）。关于模型预测的阴影区域是95％的预测间隔（SI第4节）。数据点上的误差线是根据Rosa等人的整个数据集估计的标准偏差的95％置信区间。（2022）。ivt，体外转录。Rosa等人使用的 DNA序列。 是延长的绿色荧光蛋白（EGFP），SARS -CV -2尖峰蛋白受体结合结构域（RBD）和Cas9基因的组合。DNA序列。是延长的绿色荧光蛋白（EGFP），SARS -CV -2尖峰蛋白受体结合结构域（RBD）和Cas9基因的组合。
针对严重急性呼吸综合症的抗病毒药物...
摘要到目前为止，已经进行了许多分析，以发明严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS -COV -2）的适当治疗靶标。在本综述中描述了治疗病毒的类别和策略，并提及一些特定的药物。，saikosaponin具有对非结构蛋白15和SARS -COV -2的尖峰糖蛋白的亲和力。The nucleotide inhibitors such as sofosbuvir, ribavirin, galidesivir, remdesivir, favipiravir, cefuroxime, tenofovir, and hydroxychloroquine (HCHL), setrobuvir, YAK, and IDX‑184 were found to be effective in binding to SARS‑CoV‑2 RNA‑dependent RNA polymerase.来自抗疟疾和抗炎类别，氯喹及其衍生物HCHL已经获得了美国食品和药物管理局的批准，用于紧急治疗SARS -COV -COV -COV -2感染。其他药物，例如抗病毒类别下的favipiravir和lopinavir/ritonavir，血管紧张素转化的酶2（肾素 - 血管紧张素系统抑制剂），remdesivir（remdesivir），rna Polymerase抑制剂（RNA Polymerase抑制剂）的基于抗体类别的抗病毒症，抗抗病毒症，是抗病毒剂，是抗病毒症，是抗生物学的，文学发表。此外，用相关靶标对药物重新定位候选者的评估对于病毒缓解也很重要。
抗严重急性呼吸综合征的抗病毒药物......
摘要 到目前为止，已经进行了大量分析以发明严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS‑CoV‑2) 的适当治疗靶点。本综述描述了该病毒的种类和治疗策略，并提到了一些特定药物。其中，柴胡皂苷对 SARS‑CoV‑2 的非结构蛋白 15 和刺突糖蛋白具有亲和力。发现核苷酸抑制剂如索非布韦、利巴韦林、加利地西韦、瑞德西韦、法匹拉韦、头孢呋辛、替诺福韦和羟氯喹 (HCHL)、塞曲布韦、YAK 和 IDX‑184 可有效结合 SARS‑CoV‑2 RNA 依赖性 RNA 聚合酶。在抗疟和抗炎类药物中，氯喹及其衍生物 HCHL 已被美国食品和药物管理局批准用于 SARS‑CoV‑2 感染的紧急治疗。根据之前发表的文献，我们已指出其他药物，如抗病毒类药物法匹拉韦和洛匹那韦/利托那韦、抗病毒类药物血管紧张素转换酶 2（肾素-血管紧张素系统抑制剂）、抗病毒类药物瑞德西韦（RNA 聚合酶抑制剂）、抗炎类药物千金藤素等。此外，对具有相关靶点的药物重新定位候选药物进行评估对于病毒缓解也具有重要意义。