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World File Search SystemSETBP1
setBP1单倍症障碍
Referents • Coe BP, Witherspone K, Rosenfeld JA, of BW, Vulto-from Silfwood AT, BoscoP, Friend C, Bono S, True-Hower-Hoics A, Pfundt R, Crumm N, Carvill N, Carvill GL, Li D, Amall GL, Lead Brown N, Lockhart PJ, Scheffer IE, Alberti A, Shaw M, Pettinato R, Tervo R，Lurd N，Reafter MR，Torchia BS，O＆＃x27; Roak BJ，Fcheera M，Hehir-Kwa，Mercea J，The Free BB，Free BB，Freeer BB，Freeer BB，Freeer BB，Romano C，Romano C，Eicher EE。进行罚款分析或复制NUMBR变化标识指定基因相关的白色发育延迟器。natgenet。2014年10月； 46（10）：1063-71。 doi：10,1038/ng.3092。EPUB 2014年9月14日。PubMed引用（htps：//pubmed.ncbi.ncbi.nlm.gv/25217958）或PubMed Central上的免费文章（//wwww..nl.nl.nl.nl.nl.ncb.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.nl.gv.gv/pmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmc417294/） Nishizawa T，Dea AN，Miny P，YamamotoT。通过SetBP1Haploss Sendim Causs综合征降低表达。J Med。2011 feb; 48（2）：117-22。 doi：10,1136/jmg.2010,084582。Epub 2010年10月30日。引用PubMed（htps：//pubmed.ncbi.ncbi.nlm.nlm.gv/21037274）•Brivasen RO，Srivastava S，C，C，C，Rossca G，Rossa G，Rossa M，Rossa M，Rossa M，Rossa M，Rossa M，Borner RA。 MMK，当S，Fisherse，Bon Bw的摩根。临床描述或SETBP1单盘式典型。EUR J HUM GENET。 2021年8月; 29（8）：1198-1205。 doi：10。EUR J HUM GENET。2021年8月; 29（8）：1198-1205。 doi：10。
TRUSIGHT ONCOLOGY 500 (TSO500) DNA 面板基因列表
ARID2 CDK4 EPHA7 FLI1 HNF1A MAGI2* NOTCH3* PPP2R2A SETBP1 TMPRSS2
crispr/cas9基因编辑在血压茎中clolls clollal clollal竞争，用于GATA2 Defenscy Remero-Moya*，Oskar
CRISPR/Cas9 Gene Editing in Hematopoietic Stem Cells to Model Clonal Competition in vivo and in vitro for GATA2 Deficiency Damia Romero-Moya*, Oskar Marin-Bejar, Maximiliano Distefano, Joan Pera, Jessica Gonzales, Arnau Iglesias, Marcin Wlordaski, Anna Bigas, Alessandra Giorgetti.再生医学计划，D'EnvessiveAcióbiomèdicade Bellvitge（IDIBELL），医院te llobregat，西班牙GATA2缺乏症已被确定为儿童骨髓质发育综合综合症（MDS）和儿童急性骨髓性白血病的常见遗传性原因。受影响家庭中的外观和表现力通常是可变的，这表明需要合作因素触发疾病。MDS驱动基因中的体细胞突变（SETBP1，ASXL1）已被鉴定出GATA2-MDS。触发GATA2载体中白血病进展的分子机制仍然未知。特别是这些问题仍然没有解决：1）GATA2种系突变本身是否足以触发MDS/AML 2）SETBP1和ASXL1突变是否诱导恶性转化。由于缺乏忠实的人类疾病模型，解决这些问题非常困难。在这里，我研究了单独携带GATA2突变的体外/体内工程脐带血CD34+细胞，或与NSG小鼠中的SETBP1/ASXL1突变结合使用，以评估植入能力和克隆进化。具体来说，CRISPR/CAS9/RAAV6用于在CD34+细胞（单个）中引入R398W突变，或与SETBP1和ASXL1突变（多路复用）一起引入R398W突变。在所有条件下，主要和次要移植都显示出相似的多核构成。有趣的是，遗传研究表明，在多重条件下主要扩展的克隆携带了SETBP1+ASXL1突变，而仅丢失了GATA2突变的克隆。为了研究转录组水平的突变的影响，SCRNASEQ正在进行中。体外数据证实，携带GATA2 R398W突变的细胞具有损害的克隆能力和增殖，从而概括了MDS患者表型。总而言之，我们通过针对CD34+细胞的CRISPR/CAS9开发了人类的克隆竞争模型。我们的发现强烈表明，GATA2 R398W突变不足以增加细胞适应性，这表明遗传，表观遗传学，利基和压力因子的合作是触发疾病所必需的。
分析提供获得的疾病（血液学）
leukemiutringbenmärg/blod mylood面板*（ABL1，ANKRD26，ASXL1，ATRX，BCOR，BCOR，BCORL1，BRAF，CALR，CALR，CBL，CBL，CBL，CBL，CDKN2A，CDKN2A，CEBPA，CEBPA，CEBPA，CSF3R，CSF3R，CSF3R，CUX1，DDX41，DDX41，DNMT3A fbxw7, FLT3, GATA1, GATA2, GNAS, HRAS, Idh1, Idh2, Ikzf1, jak2, jak3, kdm6a, kit, kraas, kmt2a, mpl, myd88, NF1, Notch1 (INKLUSIVE 3´UTR), NPM1, NRAS, PDGFRA, PHF6, PPM1D, Pten, Ptpn11, Rad21, Runx1, Samd9, SAMDL9, Setbp1, SF3B1, SMC1A, SMC3, SRSF2, Stag2, Stat3, Stat5B, Tet2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2, BTK, plcg2, terc) Div>
表观基因组分析显示，GATA2缺乏症中异常的DNA甲基化特征
GATA2表达是一种复杂的多系统疾病，患有骨髓增生综合征（MDS）和急性髓样白血病（AML）具有高风险，并且寿命几乎完全完整。1,2 GATA2载体表现出高度可变的表达性，一些人在早期发作MD中发育，而其他人则在整个生命中仍然无症状。尽管不存在预后生物标志物，但合作遗传和表观遗传驱动因素可能会塑造疾病的进程。3尽管在一组白血病驱动基因（即Stag2，setBP1，ASXL1和ETV6）中鉴定出复发的体细胞突变的进展，但了解GATA22携带者中与白血病相关的molecu Lar机制存在重大差距。4此外，DNA甲基化改变有助于在成人PA和AML的成年PA含量中发生白血病克隆和异常高甲基化的启动和扩展。5,6迄今为止，尚未进行GATA2患者的基因组宽DNA甲基分析。在这项研究中，招募了7家西班牙医院的20个临床注释的GATA2载体（表1；在线SUP培养图S1）。诊断时中位年龄为36（范围6-75）。主要初始表现为MDS（n = 12，55％），其次是免疫效率（n = 3，15％）和AML（n = 2，10％）。在细胞遗传学上，三个患者中的三体术在两个患者中进行了复杂的核型，而有11例患者的核型正常（在线补充图S1A-F）。基于DNA的可用性，因此在17 GATA2载体的总外周血（Pb）或骨髓（BM）中进行了乳酸突变。因此，在71％（12/17）测试的患者中鉴定了髓样恶性基因中的乳酸突变（在线补充图S1F）。该分析证实了GATA2缺乏效率中获得的体细胞突变的异质性，stag2，asxl1和setBP1作为经常影响的基因。，我们获得了通过使用矿体内甲基化史诗850 K平台（Illumina）进行完全遗传表征的患者的全球DNA甲基化pro纤维。我们为八个BM（P1，P3，P5，P6，P10，P11，P11，P12，P13）和八个PB样品（P1，P1，P4，P7，P7，P8，P9，P9，P13，P13，P16和P17）的LED DNA进行了比较，并与12（5 pb和7 BM）的队列进行了比较（5 pb和7 bm）老年人（Hefleped Donor）（hded donor）（高维数据可视化表明，GATA2患者的射击性紧密聚集在一起，并从HD隔离。属于同一家族的无症状载体P1，P1，P16和P17（分别为6、40和75岁）被包含在HD组上（图1A）。此外，我们将HD与无症状
儿童言语障碍的遗传病因
言语的儿童失语（CAS）是原型严重的儿童言语障碍，其特征是运动编程和计划置换。遗传因素对CAS病因产生了实质性贡献，在三分之一病例中鉴定出单基因的致病变异，这意味着迄今为止有20个单个基因。在这里，我们旨在确定与CAS确定的70个无关的概率中的分子因果关系。我们进行了三重奏基因组测序。我们的生物信息学分析检查了单核苷酸，indel，拷贝数，结构和短串联重复变体。我们优先考虑从头开始产生的适当变体或基于计算机预测中会损害的遗传。我们确定了18/70（26％）概率的高置信变体，几乎使CAS的当前候选基因数量翻了一番。在18种变体中，有3个影响了SETBP1，SETD1A和DDX3X，因此确定了它们在CAS中的作用，而其余15个则发生在以前与该疾病不相关的基因中。从头出现了15个变体，三个变体继承。我们为儿童语音障碍的生物学提供了进一步的新见解，强调了CAS中染色质组织和基因调节的作用，并确认与CAS相关的基因在大脑发育过程中得到了共表达。与其他具有重大新变异负担的神经发育障碍相比，我们的发现证实了诊断产量可比甚至更高的诊断产量。数据还支持越来越明显的基因之间的重叠，这些基因赋予了一系列神经发育疾病的风险。了解CAS的病因基础对于结束诊断性的奥德赛至关重要，并确保受影响的个体有望进行精确的医学试验。
儿童言语障碍的遗传病因
言语的儿童失语（CAS）是原型严重的儿童言语障碍，其特征是运动编程和计划置换。遗传因素对CAS病因产生了实质性贡献，在三分之一病例中鉴定出单基因的致病变异，这意味着迄今为止有20个单个基因。在这里，我们旨在确定与CAS确定的70个无关的概率中的分子因果关系。我们进行了三重奏基因组测序。我们的生物信息学分析检查了单核苷酸，indel，拷贝数，结构和短串联重复变体。我们优先考虑从头开始产生的适当变体或基于计算机预测中会损害的遗传。我们确定了18/70（26％）概率的高置信变体，几乎使CAS的当前候选基因数量翻了一番。在18种变体中，有3个影响了SETBP1，SETD1A和DDX3X，因此确定了它们在CAS中的作用，而其余15个则发生在以前与该疾病不相关的基因中。从头出现了15个变体，三个变体继承。我们对儿童语音障碍的生物学提供了进一步的新见解，突出了CAS中染色质组织和基因调节的作用，并确认与CAS相关的基因在大脑发育过程中被共表达。与其他具有重大新变异负担的神经发育障碍相比，我们的发现证实了诊断产量可比甚至更高的诊断率。数据还支持越来越明显的基因之间的重叠，这些基因赋予了一系列神经发育疾病的风险。了解CAS的病因基础对于结束诊断性的奥德赛至关重要，并确保受影响的个体有望进行精确的医学试验。
5月21日，星期二
p29。Isabelle Becker Megakaryocytes通过Rhoa Boston儿童医院和哈佛医学院P30的下游分泌自噬释放TGFβ1。Joyeeta Chakraborty化学基因植物，以定义Runx介导的转录调节电路Albert Einstein医学院P31。SETBP1中的Samantha Tauchmann突变增加了粒细胞谱系的输出，并激活与增殖相关基因骑士癌症研究所p32的转录。estelle carminita骨髓重塑和促炎性巨核细胞在波士顿儿童医院P33的慢性肾脏病鼠模型中。Nadia Carlesso上调造血干细胞中应力反应途径和镰状细胞疾病中的骨髓生态位。贝克曼研究所P34。sanika gupte中性粒细胞衍生的Sema4a是一种非细胞自动构成的骨髓骨膜自动调节剂，可保留髓样偏置的HSC的干性。弗雷德·哈钦森癌症研究中心P35。Daniel E. Kennedy DNMT3A功能丧失突变会损害感染期间贝勒医学院p36期间免疫记忆和先天细胞效应功能的发展。Alana M. Franceski芯片相关的外在因素，塑造健康的造血干细胞O'Neal综合癌症中心p37。Emily Tsao通过STAU1损失的转录后调节有助于DEL（20q）无序的造血性造血中心玛格丽特玛格丽特癌症中心和多伦多大学P38的造血细胞分化缺陷。patrick Stelmach突变特异性表型DNMT3A突变干细胞在克隆造血中心德国癌症研究中心Alexander Marr BRD4抑制作用在TET2突变的克隆造血的鼠模型中消除了炎症和自我更新。Alexander Marr BRD4抑制作用在TET2突变的克隆造血的鼠模型中消除了炎症和自我更新。