There are no restriction sites for the following enzymes: AarI(x), Acc65I, AcuI, AfeI, AgeI, AlwI, AlwNI, ApaI, AscI, AsiSI, AvrII, BamHI, BanII, BclI, BglI, BglII, BlpI, BmgBI, BmrI, BmtI, BsaI, BsaXI, BsgI, BsmBI, BspDI, BspEI, BsrFI, BsrGI, BstBI, BstEII, BstYI, BstZ17I, Bsu36I, ClaI, DpnI, DpnI, EagI, EcoN, EcoO1 FseI, FspAI(x), HindIII, I-CeeI, I-SceI, CPNI,MBOI,MSCI,NEI,NCOI,NDEI,NGOMIV,NHEI,NENI,NSSII,NSSII,NSPI,PFLI,PFLI,PMMI,PMLI,PMLI,P; PMLI,P; PMLI,P; PMLI,PPUTMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,P; PSPOME,PSPXI,PVI,PVII,RSRII,SACI,SALI,SALI,SANDI(X),SAU3AI,SBFI,SFII,SFII,SFII,SGRI,SGRI,SGRI,SMAI,SMAI,SMAI,SNABI,SPEI,SPEI,SPEI,SPHI,SPHI,SPHI,SRFMI(SRFMI(X)
There are no restriction sites for the following enzymes: AarI(x), Acc65I, AcuI, AfeI, AgeI, AlwI, AlwNI, ApaI, AscI, AsiSI, AvrII, BamHI, BanII, BclI, BglI, BglII, BlpI, BmgBI, BmrI, BmtI, BsaI, BsaXI, BsgI, BsmBI, BspDI, BspEI, BsrFI, BsrGI, BstBI, BstEII, BstYI, BstZ17I, Bsu36I, ClaI, DpnI, DpnI, EagI, EcoN, EcoO1 FseI, FspAI(x), HindIII, I-CeeI, I-SceI, CPNI,MBOI,MSCI,NEI,NCOI,NDEI,NGOMIV,NHEI,NENI,NSSII,NSSII,NSPI,PFLI,PFLI,PMMI,PMLI,PMLI,P; PMLI,P; PMLI,P; PMLI,PPUTMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,PPHMI,P; PSPOME,PSPXI,PVI,PVII,RSRII,SACI,SALI,SALI,SANDI(X),SAU3AI,SBFI,SFII,SFII,SFII,SGRI,SGRI,SGRI,SMAI,SMAI,SMAI,SNABI,SPEI,SPEI,SPEI,SPHI,SPHI,SPHI,SRFMI(SRFMI(X)
摘要:由专门的蛋白质形成的突触蛋白-DNA复合物在DNA上桥接两个或更多远处的蛋白质,与各种遗传过程至关重要。然而,蛋白质搜索这些位点及其如何将它们结合在一起的分子机制尚不清楚。我们以前的研究直接可视化了SFII使用的搜索途径,我们确定了两种途径,即DNA螺纹和站点结合的传输途径,特定于突触DNA-蛋白系统的现场搜索过程。为了研究这些位点搜索途径背后的分子机制,我们将SFII的复合物与与不同瞬态状态相对应的各种DNA底物组装在一起,并使用单分子荧光方法测量了其稳定性。这些组件对应于特定特异性(突触),非特异性非特异性(非特异性)和特定的非特异性(突触前)SFII-DNA状态。出乎意料的是,已经发现了与特异性和非特异性DNA底物组装的突触前复合物的稳定性升高。解释了这些令人惊讶的观察,一种理论方法描述了这些复合物的组装并将预测与实验进行比较。该理论通过利用熵参数来解释这种效果,根据该论点,在部分解离之后,非特异性DNA模板具有重新启动的多种可能性,从而有效地提高了稳定性。与特定和非特异性DNA的SFII复合物的稳定性差异解释了在延时AFM实验中发现的突触蛋白-DNA复合物的搜索过程中螺纹和部位结合的转移途径的利用。
高粱 (Sorghum bicolor (L.) Moench) 是世界主要的农业生产谷物作物之一,在干旱地区具有特殊重要性。然而,与其他谷物不同,高粱的营养价值较低,这是由于其种子储存蛋白 (kafirins) 对蛋白酶消化具有抗性等原因造成的。提高高粱营养价值的有效方法之一是获得部分或完全抑制 kafirins 合成或改变 kafirins 氨基酸组成的突变体。利用基因组编辑可以通过在 α- 和 γ-kafirin 基因的核苷酸序列中引入突变来解决此问题。在本研究中,选择了基因组靶基序 (23 bp 序列) 以将突变引入高粱的 α- 和 γ-KAFIRIN 基因。使用在线工具 CRISPROR 和 CHOPCHOP 进行 gRNA 的设计。为 α-KAFIRIN (k1C5) 和 γ-KAFIRIN (gKAF1) 基因选择了两个最合适的靶标。在 BsaI (Eco31I) 位点将相应序列插入通用载体 pSH121。通过 DNA 测序验证克隆过程。使用 SfiI 限制位点将所得构建体亚克隆到兼容的二元载体 B479p7oUZm-LH 中。通过使用 MluI 和 SfiI 切割位点的限制分析确认二元载体的正确组装。通过电穿孔将创建的四个载体 (1C - 4C) 转移到农杆菌菌株 AGL0 中。目前,该载体系列用于使用未成熟胚外植体对高粱进行稳定转化。