胚胎干细胞通过形成细菌层具有多能力的潜力和自我恢复能力,从而为胚胎发生提供了主要贡献。这些干细胞多能的保留取决于转录因子的表达/水平,即SOX2,OCT4和NANOG。在器官发生过程中,分子的表达变化也会影响这些干细胞失去多能性并转向谱系选择。随着分化的进展,包括口腔鳞状细胞在内的体细胞的维持也取决于转录因子的差异表达。最近,许多实验性和观察性研究记录了各种人类癌症的致癌作用的重要贡献。在这篇综述中,我们试图总结说明这些主要多能调节剂在口服癌变阶段的推定作用的证据,即口服鳞状细胞癌的起始,进展和预后。
特异性和评论SOX基因组成了与哺乳动物性鉴定基因相关的基因家族。这些基因类似地包含编码HMG-box域的序列,该序列负责序列特异性的DNA结合活性。SOX基因编码推定的转录调节因子与细胞命运在发育过程中的决策和控制多种发育过程中的决策。SOX9在正常骨骼发育中起重要作用。它可以通过充当这些基因的转录因子来调节其他基因的表达。
膀胱癌(BCA)是第二常见的泌尿外科恶性肿瘤,但是当今用于检测和监测BCA的技术经常是侵入性和/或具有不足的敏感性和特异性。因此,必须创建一个既敏感又准确的非侵入性测试,以诊断BCA。这项研究介绍并验证了基于尿液样本的BCA诊断中H4C6 / SOX1-OT基因甲基化的诊断性能,通过设计研究的两个部分:病例对照研究和前瞻性验证研究。In the case-control study, the methylation test of H4C6 / SOX1-OT achieved a sensitivity/specificity/positive predictive value (PPV)/negative predictive value (NPV) of 87.9%(95%CI, 79.4%–93.3%)/90.4%(95%CI, 80.7%–95.7%)/92.6%(95%CI, 84.8% - 96.7%)/ 84.6%(95%CI,74.3%–91.5%)(Kappa值77.6%)。对低级,高级,TA-T1和T2-T4的敏感性为85%(17/20),88.6%(70/79),85.4%(41/48)和92.6%(25/27)。统计分析表明,测试的诊断敏感性不受性别,年龄,肿瘤等级或肿瘤阶段的影响(p> 0.05)。在前瞻性验证研究中,H4C6/SOX1-OT甲基化测试产生了总体敏感性/特异性/PPV/NPV为84.8%(95%CI,67.3%–94.3%)/90.0%(95%CI,95%CI,75.4%–96.7%)/87.5%CI(95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95%CI,95% 70.1%–95.9%)/84.6%(95%CI,73.0%-95.4%)(Kappa值为75.0%),指示38.4%的省膀胱镜检查。这些发现突出了尿液DNA中H4C6 / SOX1-OT甲基化的潜力,这是一种有前途的分子诊断工具,用于检测BCA,尤其是对于早期肿瘤,这可能会减少对膀胱镜检查的需求。
特异性和评论SOX基因组成了与哺乳动物性鉴定基因相关的基因家族。这些基因类似地包含编码HMG-box域的序列,该序列负责序列特异性的DNA结合活性。SOX基因编码推定的转录调节因子与细胞命运在发育过程中的决策和控制多种发育过程中的决策。SOX9在正常骨骼发育中起重要作用。它可以通过充当这些基因的转录因子来调节其他基因的表达。
理由:败血症诱导的心肌病(SIC)是一种迅速发展的疾病,在没有有效的治疗干预的情况下预后不良。心肌细胞凋亡是导致SIC心脏功能障碍的关键因素。目前,对此机制的研究尚不清楚。方法:我们进行了LPS诱导的原代小鼠心肌模型和小鼠SIC建模。通过mRNA-Seq,我们发现SIC小鼠心脏组织中明显的凋亡。 进一步的共聚焦显微镜和免疫沉淀结果证实,PTX3是心肌细胞凋亡的重要参与者。 然后,我们使用芯片和双酸酶报告基因测定法确认SOX18对PTX3产生转录抑制作用。 M6A-SEQ和RNA稳定性测定确认,RBM15/YTHDF2介导/识别的M6A修饰是SIC中Sox18变化的关键因素。 结果:我们的实验表明,SIC中异常升高的PTX3在介导流体吞噬作用中起关键作用。 在生理条件下,PTX3转录被SOX18抑制。 然而,在败血性心肌病期间,SOX18稳定性受到RBM15/YTHDF2介导的M6A修饰的损害,从而导致PTX3水平升高,并随后诱导心肌细胞凋亡。 结论:总而言之,我们已经描述了SIC中的RBM15/YTHDF2-SOX18-PTX3轴。 它为SIC中心肌细胞凋亡的治疗提供了一种新方法,以改善预后。通过mRNA-Seq,我们发现SIC小鼠心脏组织中明显的凋亡。进一步的共聚焦显微镜和免疫沉淀结果证实,PTX3是心肌细胞凋亡的重要参与者。然后,我们使用芯片和双酸酶报告基因测定法确认SOX18对PTX3产生转录抑制作用。M6A-SEQ和RNA稳定性测定确认,RBM15/YTHDF2介导/识别的M6A修饰是SIC中Sox18变化的关键因素。结果:我们的实验表明,SIC中异常升高的PTX3在介导流体吞噬作用中起关键作用。在生理条件下,PTX3转录被SOX18抑制。然而,在败血性心肌病期间,SOX18稳定性受到RBM15/YTHDF2介导的M6A修饰的损害,从而导致PTX3水平升高,并随后诱导心肌细胞凋亡。结论:总而言之,我们已经描述了SIC中的RBM15/YTHDF2-SOX18-PTX3轴。它为SIC中心肌细胞凋亡的治疗提供了一种新方法,以改善预后。
• 明确定义审计的目标和范围。审计人工智能系统的哪些具体方面?审计旨在回答哪些关键问题?例如,审计的重点是公平性、可解释性还是安全性?您是在审计整个人工智能系统还是特定组件? • 确定要审计的人工智能系统的用途、架构和组件。这包括了解人工智能系统的类型(例如,机器学习、深度学习)、使用的数据、采用的算法和预期输出。 • 了解人工智能系统的运行环境,包括其预期用途、目标用户和潜在影响。例如,用于医疗诊断的人工智能系统与用于营销的人工智能系统将具有不同的道德考虑和风险因素。
卵巢癌仍然是最致命的妇科恶性肿瘤,主要是因为其化疗耐药性和高复发率。越来越多的证据表明,SOX2 异常表达与卵巢癌患者的化疗耐药性和不良预后有关。在本研究中,我们旨在阐明卵巢癌细胞中 SOX2 异常表达的机制。通过检查多种卵巢癌细胞系和一组临床肿瘤样本,我们观察到卵巢癌细胞系和肿瘤中 SOX2 广泛过表达。为了确定导致卵巢癌细胞中 SOX2 过表达的信号通路,我们筛选了一组针对 30 种主要细胞激酶的小分子激酶抑制剂。在确定的热门药物中,AKT 抑制剂是其中之一。我们证明,抑制或敲低 AKT1 可大幅下调 SOX2 蛋白水平,损害 SOX2 阳性卵巢癌细胞的生长和干细胞特性,并显著提高 SOX2 阳性卵巢癌细胞对铂类药物的敏感性。从机制上讲,我们发现 AKT1 主要通过增强其蛋白质稳定性来驱动 SOX2 过表达,并通过在 T116 位点磷酸化 SOX2 来实现这一点。总之,我们的研究揭示了卵巢癌中驱动 SOX2 过表达的潜在机制,并强调了药理学抑制 AKT1 是一种潜在的治疗策略,可提高 SOX2 阳性卵巢癌对铂类药物的敏感性。
癌细胞可塑性是三阴性乳腺癌 (TNBC) 化疗和靶向治疗失败的重要原因。治疗诱导的肿瘤细胞可塑性和相关耐药性的分子机制在很大程度上是未知的。使用全基因组 CRISPR-Cas9 筛选,我们研究了用 γ 分泌酶抑制剂 (GSI) 治疗的 NOTCH 驱动的 TNBC 的逃逸机制,并确定 SOX2 是 Notch 抑制耐药性的靶点。我们描述了 Notch 信号和 SOX2 之间的一种新型相互抑制反馈机制。具体而言,Notch 信号通过其 HEY 家族的靶基因抑制 SOX2 表达,而 SOX2 通过与 RBPJ 直接相互作用抑制 Notch 信号。这种机制形成了不同的细胞状态,其中 NOTCH 阳性 TNBC 更像上皮细胞,而 SOX2 表达与上皮-间质转化相关,诱导癌症干细胞特征和 GSI 耐药性。为了抵消单药治疗引起的肿瘤复发,我们分别评估了 GSI-紫杉醇和达沙替尼-紫杉醇联合治疗对 NOTCH 抑制剂敏感和耐药的 TNBC 异种移植的效果。这些独特的预防组合和二线治疗方案依赖于 TNBC 中的 NOTCH1 和 SOX2 表达,能够诱导肿瘤生长控制并减少转移负担。
细胞可塑性导致肿瘤内异质性和表型转换,从而能够适应转移性微环境并对疗法产生耐药性。肿瘤细胞可塑性的潜在机制仍不清楚。SOX10 是一种神经嵴谱系转录因子,在黑色素瘤中异质表达。SOX10 的缺失会降低增殖,导致侵袭性,包括间充质基因和细胞外基质的表达,并促进对 BRAF 和/或 MEK 抑制剂的耐受性。我们发现细胞凋亡蛋白 1/2 (cIAP1/2) 抑制剂类可在 SOX10 缺陷细胞中选择性诱导细胞死亡。靶向治疗选择 SOX10 敲除细胞,强调其药物耐受性。将 cIAP1/2 抑制剂与 BRAF/MEK 抑制剂联合使用可延缓黑色素瘤在体内获得性耐药性的发生。这些数据表明,SOX10 介导皮肤黑色素瘤的表型转换,从而产生靶向抑制剂耐受状态,这可能是获得耐药性的前奏。此外,我们提供了一种选择性消除 SOX10 缺陷细胞的治疗策略。
确定重复的SOX因子功能差异的分子基础,控制斑马鱼Simaran Johal 1,Randa Elsayed 2,Kristen A. Panfilio 1,3,4,Andrew C. Nelson 1* 1* 1.生命科学学院,吉布特山校园,沃里克大学,考文垂,Cv4 7al,英国2。Warwick医学院,Gibbet Hill校园,沃里克大学,考文垂,Cv4 7al,英国3。 霍恩海姆大学生物学研究所分子遗传学系。 30,70599德国斯图加特4。 动物学研究所:发育生物学,科隆大学,苏黎世大学,苏黎世大学47b,50674德国科隆 *通讯作者电子邮件:a.nelson.1@warwick.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac(acn)摘要内科胰腺。 这些器官的放置和图案依赖于左右的组织者 - 斑马鱼中称为库普弗囊泡(KV)。 转录因子Sox32和Sox17是斑马鱼Soxf亚科的成员。 Sox32和Sox17来自Teleost血统中祖先Sox17的重复。 SOX32在早期胚胎中诱导SOX17的表达,是内胚层和KV祖细胞规范所必需的。 斑马鱼Sox17与KV形态发生有关。 在哺乳动物中,Sox17对于内胚层形成至关重要,可以诱导内胚层祖细胞身份。 因此,表型证据表明斑马鱼Sox32和Sox17与哺乳动物Sox17之间的功能相似性。Warwick医学院,Gibbet Hill校园,沃里克大学,考文垂,Cv4 7al,英国3。霍恩海姆大学生物学研究所分子遗传学系。30,70599德国斯图加特4。动物学研究所:发育生物学,科隆大学,苏黎世大学,苏黎世大学47b,50674德国科隆 *通讯作者电子邮件:a.nelson.1@warwick.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac.ac(acn)摘要内科胰腺。这些器官的放置和图案依赖于左右的组织者 - 斑马鱼中称为库普弗囊泡(KV)。转录因子Sox32和Sox17是斑马鱼Soxf亚科的成员。Sox32和Sox17来自Teleost血统中祖先Sox17的重复。SOX32在早期胚胎中诱导SOX17的表达,是内胚层和KV祖细胞规范所必需的。斑马鱼Sox17与KV形态发生有关。在哺乳动物中,Sox17对于内胚层形成至关重要,可以诱导内胚层祖细胞身份。表型证据表明斑马鱼Sox32和Sox17与哺乳动物Sox17之间的功能相似性。我们试图探索斑马鱼早期胚胎中这些蛋白质之间的功能差异和潜在的相似性。我们的结果表明,与Sox32不同,人类Sox17不能在斑马鱼中诱导内胚层规范。此外,使用混合蛋白功能分析,我们表明SOX32内胚层基因调节网络的特异性与其HMG域与旁产皮sox17的进化差异有关。此外,Sox32和Sox17的C末端区域的变化是其在介导差异基因调节程序中的不同目标特异性和差异的基础。最后,我们确定C末端结构域中的特定保守肽对于SOX17在建立正确的器官不对称性中的作用至关重要。总体而言,我们的结果为脊椎动物内胚层发育,左右模式以及SOXF转录因子功能的演变提供了新的见解。