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World File Search SystemSPARCC
isaac rudnick
Robotics软件开发平台独立设计，开发和测试了连续感知机器人控制和通信平台（SPARCC平台），以促进Python和Arduino之间的串行通信和控制，并简化了Harper Robotic平台Vassar College的研究和教育项目。这种可扩展的系统支持对PWM伺服器，步进驱动程序和传感器的控制，并在Python中具有模块化类，并在Arduino C ++代码中使用相应的标头。设计用于易于扩展，允许将新组件与两端的最小代码更改集成在一起。设置已配置为最佳速度和可靠性。在此处查看源代码。白板绘制机器人独立设计，开发和测试的矢量图，这是一种机器人绘图系统，可在白板或类似表面上绘制图像。这个开源项目包括软件和硬件组件。它使用上面显示的SPARCC平台作为基础。Python接口读取SVG文件，自动缩放和定位图像，并将简化的绘图命令发送到Arduino。考虑到易于组装和配置，VectorPlotter包括用于硬件设置和软件配置的简单指南，以确保任何人都可以重新创建项目。在此处查看源代码。
粪便菌群与炎症性肠病的肠外表现有关
摘要简介：大部分炎症性肠病患者（IBD）经历了胃肠道外IBD相关的炎症状况，称为肠外表现（EIM），进一步降低了生活质量，在极端情况下，可能会危及生命。EIMS的发病机理仍然未知，尽管肠道菌群改变是IBD患者的众所周知的特征，但其与EIMS的关系仍然很少研究。这项研究旨在比较有没有EIM的IBD患者的肠道菌群。方法：该研究中总共包括131名IBD患者，其中86例具有EIMS（IBD-EIM）史，而45例没有（IBD-C）。粪便样品接受了16S rRNA测序。放大序列变体（ASV）映射到SILVA数据库。比较了IBD-EIM和IBD-C之间的多样性指数和距离矩阵。使用自定义多重模型统计分析方法鉴定了差异丰富的ASV，并使用稀疏相关性（SPARCC）（SPARCC）鉴定了共同相关细菌的模块，并且与患者EIM状态有关。结果：IBD患者和EIMS患者表现出疾病活性增加，体重指数，粪便钙骨蛋白钙蛋白酶水平升高以及循环单核细胞和中性粒细胞。微生物学上，IBD-EIM比IBD-C（Mann-Whitney's Test，p = .01）和独特的粪便微生物群组成（方差的置换多变量分析；加权Unifrac，r 2 = 0.018，p = .01）。共有26个ASV在IBD-EIM和IBD-C之间表现出不同的相对丰度，包括减少的Agathobacter和Blautia和IBD-Eim组中的Eggerthella lenta增加。SPARCC分析确定了27个细菌共同关联模块，其中3个与EIM（逻辑回归，p <.05）呈负相关，其中包括重要的健康相关细菌，例如Agathobacter和Agathobacter和Faecalibacterium。结论：EIMS IBD患者的粪便菌群与没有EIM的IBD患者不同，对于EIM发病机理可能很重要。
聚合物复合材料中的金属 - 有机框架纳米片...
fi g u r e 2在O. Moubata微生物群落中的假单胞菌的组装模式。假单胞菌的局部连接在：（a）OMMG和（b）OMSG中。模块内和模块之间的连接，四个组的Zi-pi图：（c）OMMG和（d）OMSG。在存在下以及假单胞菌在O. Moubata Mg中的伪莫诺纳斯（Pseudomonas）删除后的子网络：（e）OMMG WP和（f）OMMG WOP。（g）Venn图显示了O. Moubata -mg（M1 -M2）中模块组成的比较。（h）可以用于OMMG（WP-WOP）。在存在下以及假单胞菌在O. Moubata -sg中删除的M1和M2的子网络：（i）OMSG WP和（J）OMSG WOP。（k）Venn图显示了O. Moubata -SG（M1 -M2）中模块组成的比较。（L）对于OMSG（WP-WOP）。在子网络中，节点代表细菌分类单元，边缘中的颜色代表强（蓝色）或负（红色）相关性（SPARCC> 0.75或<-0.75）。
运动员：一项病例对照研究
现在通常会理解人类肠道菌群对健康和疾病的影响。因此，微生物组研究对体育社区产生了兴趣，希望改善健康并优化绩效也就不足为奇了。比较研究发现，与久坐的对照相比，新的物种或途径更富含精英。还确定了，特定于运动水平的微生物组特征。 但是，结果仍然没有定论，并表明需要进一步评估。 在这项病例对照研究中，我们测试了两个运动人群（即 strength athletes, endur- ance athletes) and a non-athletic, but physically active, control group across two acute exer- cise bouts, separated by a 2-week period, that measured explosive and high intensity fitness level (repeated 30-s all-out Wingate test (WT)) and cardiorespiratory fitness level (Bruce Treadmill Test). 尽管我们没有确定基线时α和β多样性的任何组差异或微生物组成分的显着差异丰度，但鉴定出的三分之一的物种是每组独有的。 纵向样本（运动前和运动后）分析显示，在WT期间，强度组的Alistipes Communis和88种在Bruce测试期间具有显着的组间差异。 SPARCC识别的双歧杆菌长杆菌和双歧杆菌青少年，具有益生菌特性的短链脂肪酸生产者，物种与vo 2 max密切相关。 我们的结果证实，个体的健康状况与关于微生物组健康的假设一致。，特定于运动水平的微生物组特征。但是，结果仍然没有定论，并表明需要进一步评估。在这项病例对照研究中，我们测试了两个运动人群（即strength athletes, endur- ance athletes) and a non-athletic, but physically active, control group across two acute exer- cise bouts, separated by a 2-week period, that measured explosive and high intensity fitness level (repeated 30-s all-out Wingate test (WT)) and cardiorespiratory fitness level (Bruce Treadmill Test).尽管我们没有确定基线时α和β多样性的任何组差异或微生物组成分的显着差异丰度，但鉴定出的三分之一的物种是每组独有的。纵向样本（运动前和运动后）分析显示，在WT期间，强度组的Alistipes Communis和88种在Bruce测试期间具有显着的组间差异。SPARCC识别的双歧杆菌长杆菌和双歧杆菌青少年，具有益生菌特性的短链脂肪酸生产者，物种与vo 2 max密切相关。我们的结果证实，个体的健康状况与关于微生物组健康的假设一致。最终，我们确定了几个基线丰度不同的分类单元和基于个人的最大值，平均功率和最大功率参数进行比较时，具有不同的基线丰度和持久的变化。此外，我们的发现表明，微生物组的特征与以前在精英运动员中确定的更好的表现相关。
运动员：一项病例对照研究
现在通常会理解人类肠道菌群对健康和疾病的影响。因此，微生物组研究对体育社区产生了兴趣，希望改善健康并优化绩效也就不足为奇了。比较研究发现，与久坐的对照相比，新的物种或途径更富含精英。还确定了，特定于运动水平的微生物组特征。 但是，结果仍然没有定论，并表明需要进一步评估。 在这项病例对照研究中，我们测试了两个运动人群（即 strength athletes, endur- ance athletes) and a non-athletic, but physically active, control group across two acute exer- cise bouts, separated by a 2-week period, that measured explosive and high intensity fitness level (repeated 30-s all-out Wingate test (WT)) and cardiorespiratory fitness level (Bruce Treadmill Test). 尽管我们没有确定基线时α和β多样性的任何组差异或微生物组成分的显着差异丰度，但鉴定出的三分之一的物种是每组独有的。 纵向样本（运动前和运动后）分析显示，在WT期间，强度组的Alistipes Communis和88种在Bruce测试期间具有显着的组间差异。 SPARCC识别的双歧杆菌长杆菌和双歧杆菌青少年，具有益生菌特性的短链脂肪酸生产者，物种与vo 2 max密切相关。 我们的结果证实，个体的健康状况与关于微生物组健康的假设一致。，特定于运动水平的微生物组特征。但是，结果仍然没有定论，并表明需要进一步评估。在这项病例对照研究中，我们测试了两个运动人群（即strength athletes, endur- ance athletes) and a non-athletic, but physically active, control group across two acute exer- cise bouts, separated by a 2-week period, that measured explosive and high intensity fitness level (repeated 30-s all-out Wingate test (WT)) and cardiorespiratory fitness level (Bruce Treadmill Test).尽管我们没有确定基线时α和β多样性的任何组差异或微生物组成分的显着差异丰度，但鉴定出的三分之一的物种是每组独有的。纵向样本（运动前和运动后）分析显示，在WT期间，强度组的Alistipes Communis和88种在Bruce测试期间具有显着的组间差异。SPARCC识别的双歧杆菌长杆菌和双歧杆菌青少年，具有益生菌特性的短链脂肪酸生产者，物种与vo 2 max密切相关。我们的结果证实，个体的健康状况与关于微生物组健康的假设一致。最终，我们确定了几个基线丰度不同的分类单元和基于个人的最大值，平均功率和最大功率参数进行比较时，具有不同的基线丰度和持久的变化。此外，我们的发现表明，微生物组的特征与以前在精英运动员中确定的更好的表现相关。