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两个机构的故事——加州理工学院与亨廷顿的关系
Benzer 当时曾接受过加州理工学院常驻果蝇专家 Edward Lewis（现为托马斯·亨特·摩根生物学名誉教授）的果蝇技术培训，但他对此有不同的看法。果蝇产量高，易于饲养，而且不难饲养。此外，对于这种简单的生物来说，它们的行为方式相当丰富。直到 Benzer 和他的学生开始用诱变剂培养他们的标本，并研究从测试中散落出来的大量奇怪和退化的后代时，他才意识到这一点。当时的挑战是研究导致衰老的这些行为异常以及神经功能障碍，以及研究特定神经系统基因突变导致的这些功能障碍。Benzer 和他的合作者开发了实验和分析技术来完成精确的分析，正如 Crafoord 所说，“他和他的许多同事创造了一个新的非常成功的研究领域。”
使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌
组合片段的序列和所得的吸光度光谱用于开发计算模型，以预测片段的进一步组合，从而导致其他新型颜色。用适配器（TwistBioscience®，South San Francisco，CA）重新排序基因片段，以进行扩增，并使用Q5®热启动High Fidelity 2X Master Mix（NEB＃M0494）在50 µL反应中放大了PCR，并使用Spri®Beads清洁，并在100 µL水中洗净。使用Opentrons OT-2，将包含目的地矢量的主混合物和15 µL Nebridge Golden Gate组件套件（BSAI-HFV2）的组件组件组装在4°C温度模块上，然后通过涡旋将其混合在甲板上。然后，液体处理程序在没有温度控制的情况下将主混合物分布在96孔板上。使用OT-2，在3小时以上（总计576个零件）的过程中，将每个组件的6个零件移动。然后将板密封，并进行37°C的30个循环1分钟16°C 1分钟，然后在60°C的最终持有5分钟。2 µL转化为20 µL T7 Express Compation E.Coli。5 µL的稀释或浓缩转化铺在LB KAN上，并在37°C下生长过夜。菌落生长后，将它们从孵化器中取出，并允许在台式上开发颜色过夜，然后在4°C的冰箱中发育。
使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌
组合片段的序列和所得的吸光度光谱用于开发计算模型，以预测片段的进一步组合，从而导致其他新型颜色。用适配器（TwistBioscience®，South San Francisco，CA）重新排序基因片段，以进行扩增，并使用Q5®热启动High Fidelity 2X Master Mix（NEB＃M0494）在50 µL反应中放大了PCR，并使用Spri®Beads清洁，并在100 µL水中洗净。使用Opentrons OT-2，将包含目的地矢量的主混合物和15 µL Nebridge Golden Gate组件套件（BSAI-HFV2）的组件组件组装在4°C温度模块上，然后通过涡旋将其混合在甲板上。然后，液体处理程序在没有温度控制的情况下将主混合物分布在96孔板上。使用OT-2，在3小时以上（总计576个零件）的过程中，将每个组件的6个零件移动。然后将板密封，并进行37°C的30个循环1分钟16°C 1分钟，然后在60°C的最终持有5分钟。2 µL转化为20 µL T7 Express Compation E.Coli。5 µL的稀释或浓缩转化铺在LB KAN上，并在37°C下生长过夜。菌落生长后，将它们从孵化器中取出，并允许在台式上开发颜色过夜，然后在4°C的冰箱中发育。
化学品安全技术说明书
组合片段的序列和所得的吸光度光谱用于开发计算模型，以预测片段的进一步组合，从而导致其他新型颜色。用适配器（TwistBioscience®，South San Francisco，CA）重新排序基因片段，以进行扩增，并使用Q5®热启动High Fidelity 2X Master Mix（NEB＃M0494）在50 µL反应中放大了PCR，并使用Spri®Beads清洁，并在100 µL水中洗净。使用Opentrons OT-2，将包含目的地矢量的主混合物和15 µL Nebridge Golden Gate组件套件（BSAI-HFV2）的组件组件组装在4°C温度模块上，然后通过涡旋将其混合在甲板上。然后，液体处理程序在没有温度控制的情况下将主混合物分布在96孔板上。使用OT-2，在3小时以上（总计576个零件）的过程中，将每个组件的6个零件移动。然后将板密封，并进行37°C的30个循环1分钟16°C 1分钟，然后在60°C的最终持有5分钟。2 µL转化为20 µL T7 Express Compation E.Coli。5 µL的稀释或浓缩转化铺在LB KAN上，并在37°C下生长过夜。菌落生长后，将它们从孵化器中取出，并允许在台式上开发颜色过夜，然后在4°C的冰箱中发育。
热碱性裂解GDNA从福尔马林固定的档案组织提取
福尔马林对自然史标本和组织病理学材料的固定历史上一直被视为成功基因组分析的障碍。然而，专门定制的提取方法的开发是与重度交联的档案构成抗衡的，将数百万先前被忽视的标本重新连接为可行的分子资产。在这里，我们提出了一种易于遵循的方案，用于筛选档案湿标本，用于分子活力和随后的基因组DNA提取，适合测序。该协议始于对标本降解和保存介质条件的非破坏性评估，使博物馆策展人和研究人员都可以选择在短阅读DNA测序期间最有可能产生可接受的比例（20-60％）的内源性DNA的标本。提取方案在缓冲液中使用热碱性裂解（0.1M NaOH，1％SDS，pH 13），同时裂解组织并脱离组织。为了最大程度地提高DNA恢复，苯酚：氯仿提取与小碎片优化的Spri Bead清洁结合。适用于保存完好的档案组织，该方案可以产生每50 mg组织的1-2μgDNA，其平均碎片大小通常在50-150 bp的范围内，该尺寸适合恢复足以恢复足够的基因组DNA，足以重建完整的线粒体基因组并获得高达25X核基因组的覆盖率。我们提供了向参考基因组读取映射的指导，并讨论了依靠小片段进行SNP基因分型和从头基因组组装的局限性。该协议为历史标本的更广泛的遗传和系统发育分析打开了大门，有助于更深入地了解进化趋势和适应性，以响应不断变化的环境。
生物有机化学
糖尿病是一种代谢性疾病，其特征是高血糖，可以通过α-葡萄糖苷酶（α -GLU）（α -GLU）和α-淀粉酶（α -AMY）的含量来抵消，负责碳水化合物水解的酶。近几十年来，许多天然化合物及其生物启发的类似物已被研究为α -GLU和α -amy抑制剂。然而，没有研究用于评估Neolignan obovatol（1）对α -Glu和α -amy抑制作用。在这项工作中，我们报告了1和新类似物库的合成。这些化合物的合成是通过基于以下方法实施方法来实现的：苯酚烯丙基化，claisen/cope重排，甲基化，Ullmann偶联，脱甲基化，苯酚氧化和迈克尔型添加。obovatol（1）和十个类似物的体外抑制活性对α -glu和α -amy。我们的研究强调，天然发生的1和4个Neolignan类似物（11、22、26和27）比低糖症药物acarbose（α -amy：34.6 µm;α -Glu：α-Glu：248.3 µm）更有效抑制剂，其IC 5O值为6.2-23.6 µM -MAN -MY -MAN -MAN -MY tody -thy39。 -glu。对接进行了验证验证了抑制结果，突出了合成的新尼亚尼亚人和两种酶之间的最佳兼容性。同时循环二分色谱法检测到与研究的新木剂相互作用引起的α -GLU的构象变化。最后，在人类结肠癌细胞系（HCT-116）测试了研究化合物的体外细胞毒性。通过荧光测量和α -Glu和α -amy抑制作用的动力学的详细研究也表明，1、11、22、26和27对α -GLU具有最大的亲和力，对α -amy具有1、11和27。表面等离子体共振成像（SPRI）测量结果证实，在所研究的化合物中，Neolignan 27对这两种酶具有更大的亲和力，从而证实了动力学和荧光猝灭所获得的结果。所有这些结果表明，这些基于Obovatol的Neolignan类似物构成了追求新型降血糖药物的有希望的候选人。
分子亚型和晚期前列腺癌
大多数前列腺癌患者被诊断出仅适用于Pros Tatan的疾病。对他们来说，有治疗方法，例如手术或辐射。但是，当疾病传播时，转移性时，治疗景观变得更加复杂。这里没有治疗方法。它强调了针对临床上建立的新型疗法的新疗法的需求，也需要针对带有Potenti al的微型转移来生长。在平行文章中，今天提供的治疗方案将出现，甚至还会出现。重要的是要找出在哪种单词和组合中以及在哪个阶段应进行不同的治疗方法，所有这些都旨在优化效率和最小化副作用。希望能够根据所谓的迎面式药物来提供个性化治疗，以促进肿瘤/元增长的机制。近年来，现代技术已实现了对先天性遗传变异和变化（mutatio降低）的详细分子调查。一些遗传变化正在增加患前列腺癌的风险，而另一些遗传变化可能有助于发展不同程度的侵略性和疾病的亚类型。不幸的是，不能预测这些亚型可以给出NOM已建立的诊断变量。为了做出更精确的预测，需要特定的生物标记。分子变化，可以在DNA，RNA和蛋白质水平上鉴定出充当生物标志物的潜力。仍然只有几个生物标志物，已经到达了诊所，而许多生物标志物在研究中进行了研究，并已被证明可以为目前用于评估风险并做出治疗决定的临床变量提供其他信息。那是什么生物标志物，如何最好地应用于临床实践？