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认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
microRNA-124在创伤性脑损伤中的作用
创伤性脑损伤（TBI）是由于该疾病有效预防和治疗策略的有限可用性，是全球死亡率的重要原因。有效的分子生物标志物可能有助于确定预后并促进TBI的治疗效率。microRNA-124（miR-124）在大脑中最丰富地表达，并通过调节细胞凋亡和增殖的病理过程在多种疾病中发挥不同的生物学作用。最近，越来越多的证据证明了miR-124和TBI之间的关联，但仍然缺乏相关文献来总结有关该主题的当前证据。基于这篇综述，我们发现miR-124是细胞凋亡和增殖的调节因素，并且与TBI的病理生理发展也有密切相关。miR-124通过与多种生物分子和信号通路相互作用，例如JNK，VAMP-3，RELA/APOE，PDE4B/MTOR，MDK/TLR4/NFR4/NF-κB，DAPK1/NR2B，JAK/JAK/STAT3，PI3K/akt，RAS，RAS，RAS/erk/erk/erk/erk/erk/erk/er，已经确定了上调miR-124在促进TBI恢复方面的潜在受益。miRNA纳米载体系统技术的进步为miR-124成为TBI的新型治疗靶标提供了一个机会。然而，miR-124在TBI中作用的基本机制需要进一步研究。此外，还需要全面的大规模研究来评估miR-124作为TBI的治疗靶点的临床意义。
去泛素酶在心脏病中的作用
缩写：AAC：腹主动脉肿块； CVB3：Coxsackie病毒B3； CYLD：囊肿症； DCM：扩张的心肌病； DM：糖尿病； DUSP1：双重特异性磷酸酶1； EGFR：表皮生长因子受体； ER：内质网； FSTL1：卵泡样蛋白1； GPX4：谷胱甘肽过氧化物酶4； HAUSP：疱疹病毒相关的泛素特异性蛋白酶； HIF-1α：低氧诱导因子-1α； I/R：缺血再灌注； JAMMS：JAB1/MPN/MOV34金属蛋白酶； KDM3A：赖氨酸特异性脱甲基酶3a; mettl3：类似甲基转移酶的3; MI：心肌梗塞； MIDYS：MIDYS家庭主题与含有新颖的配音家庭的泛素互动； MJD：Machado Joseph病蛋白； NAD +：烟酰胺腺嘌呤二核苷酸； OTU：卵巢肿瘤相关的蛋白酶；耳鼻蛋白：具有线性链接特异性的OTU去泛素酶； PAC：肺动脉连接； RHD：风湿性心脏病； RVH：右心肥大； SERCA2A：SARCO/内质网Ca2 + -ATPase； sirt：sirtuin; Slim1：骨骼肌lim蛋白1； STAT3：转录3的信号换能器和激活因子； T2DM：type2糖尿病； TAC：跨动脉缩空； TAK1：转化生长因子激活的激酶1； UCHS：泛素C末端水解酶； USP：泛素特异性蛋白酶； YB-1：Y-box结合蛋白-1。
ajtr0143403.pdf
摘要：背景：类风湿关节炎（RA）是一种常见的自身免疫性疾病。鸡屎藤（Lour.）Merr 是中国海南省一种常见的民间偏方，用于祛除与 RA 相关的风湿。方法：利用网络药理学提取鸡屎藤中的活性成分。利用活性成分的潜在靶点确定激活途径，并在 RA 成纤维样滑膜细胞（HFLS-RA）中验证鸡屎藤提取物的体外作用。结果：我们利用超高效液相色谱（UHPLC）-四极杆飞行时间（QTOF）-质谱（MS）鉴定出 27 种活性成分。在具有高连接性的主要靶基因中，IL-1β、PI3K、TNF 和 JAK2 已知在 RA 发展中起关键作用。鉴定出鸡屎藤提取物中的活性化合物与 Janus 激酶 JAK 2 之间存在高亲和力相互作用，后者是 JAK 信号转导和转录激活因子 (STAT) 信号通路的关键成分。在 HFLS-RA 细胞中，鸡屎藤提取物处理降低了 IL-6 、IL-1β 和 IL-17 的 mRNA 水平。鸡屎藤提取物处理还显著抑制了 JAK 2 和 STAT3 的磷酸化，从而调节细胞增殖。结论：基于这些结果，我们确认鸡屎藤具有作为治疗和预防食品的潜力，并通过调节和抑制 JAK-STAT 通路激活来控制 RA 中的炎症反应。
JAK/STAT 信号传导：实体恶性肿瘤中的分子靶点、治疗机会和靶向抑制剂的局限性
JAK/STAT 信号通路是多种细胞过程的重要调节信号级联之一，这些过程由各种类型的配体（例如生长因子、激素和细胞因子）启动。JAK/STAT 信号调节的生理过程包括免疫调节、细胞增殖、细胞存活、凋亡以及髓系和非髓系细胞的造血。据报道，JAK/STAT 信号失调在各种免疫疾病、血液系统和其他实体恶性肿瘤中都存在，这是通过受体、下游介质和相关转录因子（例如 STAT）中的各种致癌激活突变引起的。在癌症背景下探索时，STAT 通常具有双重作用。虽然 STAT 家族的几个成员与恶性肿瘤有关，但包括 STAT3 和 STAT5 在内的一些成员与肿瘤的发生和发展有关。其他 STAT 成员（如 STAT1 和 STAT2）通过进化保守的程序对抗肿瘤防御和维持有效和长期的免疫反应至关重要。JAK/STAT 信号传导的影响以及 STAT 在肿瘤细胞存活、增殖和侵袭中的持续激活使 JAK/STAT 通路成为药物开发和癌症治疗的理想靶点。因此，了解实体恶性肿瘤发病机制中复杂的 JAK/STAT 信号传导需要进行广泛的研究。更好地了解 JAK 和 STAT 的功能冗余作用可能为改进对正常细胞有害的现有癌症疗法和确定实体恶性肿瘤治疗干预的新靶点提供理论依据。
麦卢卡蜂蜜在临床前模型中抑制人类乳腺癌进展
摘要：麦卢卡蜂蜜 (MH) 在多种人类癌症的临床前模型中表现出潜在的抗肿瘤活性。体外用 0.3 至 5.0% (w/v) 浓度范围的 MH 进行处理可显著抑制人乳腺癌 MCF- 7 细胞的增殖，且这种抑制作用呈剂量依赖性，但 MH 在 MDA-MB-231 乳腺癌细胞中的抗增殖作用不太明显。在 2.5% w/v 浓度下，还对非恶性人乳腺上皮细胞 (HMEC) 进行了 MH 的影响测试，结果发现 MH 降低了 MCF-7 细胞的增殖，但没有降低 HMEC 的增殖。值得注意的是，MH 的抗肿瘤活性与用抗雌激素他莫昔芬治疗 MCF-7 细胞的活性范围相当。此外，MH 治疗在体外刺激了 MCF-7 细胞的凋亡，大多数细胞表现出与 PARP 激活相关的急性和显著水平的凋亡。另外，MH 的作用诱导了 AMPK 的激活和 AKT/mTOR 下游信号传导的抑制。用增加浓度的 MH 处理 MCF7 细胞以剂量依赖性方式诱导 AMPK 磷酸化，同时抑制 AKT 和 mTOR 下游效应蛋白 S6 的磷酸化。此外，MH 在体外降低了磷酸化的 STAT3 水平，这可能与 MH 和 AMPK 介导的抗炎特性相关。此外，在体内，单独施用 MH 显着抑制了裸鼠中已建立的 MCF-7 肿瘤的生长 84%，导致肿瘤体积明显减少。我们的研究结果强调需要进一步研究天然化合物（如 MH）的抗肿瘤功效和潜在的化学预防用途，并研究这些作用背后的分子途径。
三重阴性乳腺癌干细胞途径中的药物靶标识别：使用布尔网络对基因调节途径的计算研究
抽象的三阴性乳腺癌（TNBC）是一种侵略性的乳腺癌形式，与年龄的年龄相关，转移的倾向更大，临床结果较差。IT占新诊断的乳腺癌病例的10％至20％，并不成比例地影响非裔美国人种族的个人。虽然TNBC对化学疗法敏感，但也容易复发。这是因为化学疗法成功地靶向原发性TNBC肿瘤细胞，但通常无法靶向TNBC干细胞的亚群。TNBC干细胞显示出癌性特征，例如细胞周期进展，生存，增殖，凋亡抑制和上皮 - 间质转变。研究了TNBC干细胞的癌症启动行为，我们使用布尔网络（BN）研究了它们的潜在信号通路。bns可有效捕获信号通路中发生的因果相互作用。我们从途径文献中建立了BN，并用它来评估11种靶向抑制性药物在抑制癌症促进基因方面的效果。我们在通路具有单个或多个突变时模拟了BN，一次最多三个突变。我们的发现表明STAT3，GLI和NF-κB是最佳抑制靶标。这些基因是途径中癌症基因的已知调节因子，因此我们的模型与现有的生物学文献一致。因此，抑制这三个基因具有预防TNBC复发的潜力。此外，我们的研究发现，随着途径中突变的增加，药物效率降低。此外，我们注意到药物的组合比单一药物更好。
μMAP光焦性标记启用小分子结合位点映射
摘要：配体结合模式的表征是药物发现过程中的关键步骤，在表型筛选引起的运动中尤其重要，在表型筛选中，蛋白质靶标和结合模式一开始就未知。阐明目标结合区域通常是通过X射线晶体学或光亲和力标记（PAL）方法实现的；但是，这些方法带来了重大挑战。X射线晶体学是一种支柱技术，它彻底改变了药物发现，但是在许多情况下，结构表征具有挑战性或不可能。PAL还通过肽和氨基酸级分辨率启用了结合位点映射；但是，化学计量激活模式可能导致居民结合口袋的信号和覆盖率较差。此外，每个PAL探针都可以具有其自身的碎片模式，从而使质谱法分析变得复杂。在这里，我们为蛋白质结合位点的映射建立了强大而一般的光催化方法，我们将其定义为鉴定与配体结合袋的残基。利用催化激活模式，我们在靶蛋白结合位点的接近度中获得了一组标记的氨基酸。我们使用这种方法在体外绘制六个蛋白质靶标的结合位点，包括几种激酶和分子胶靶标，然后研究STAT3抑制剂MM-206的结合位点，这是一种未知晶体结构的配体。最后，我们证明了活细胞中药物结合位点的成功映射。这些结果将μMAP建立为生成氨基酸和肽级目标参与数据的有力方法。
HSP90 抑制剂 Ganetespib 在癌症治疗中的作用
摘要：热休克蛋白在癌症中上调，保护多种客户蛋白免于降解。因此，它们通过减少细胞凋亡和增强细胞存活和增殖，促进肿瘤发生和癌症转移。这些客户蛋白包括雌激素受体 (ER)、表皮生长因子受体 (EGFR)、胰岛素样生长因子-1 受体 (IGF-1R)、人表皮生长因子受体 2 (HER-2) 和细胞因子受体。这些客户蛋白降解的减少会激活不同的信号通路，例如 PI3K/Akt/NF- κ B、Raf/MEK/ERK 和 JAK/STAT3 通路。这些通路促成了癌症的特征，例如生长信号的自给自足、对抗生长信号的不敏感性、逃避细胞凋亡、持续的血管生成、组织侵袭和转移以及无限的复制能力。然而，与其他 HSP90 抑制剂相比，ganetespib 的副作用较小，因此被认为是一种有前途的癌症治疗策略。Ganetespib 是一种潜在的癌症治疗方法，在针对肺癌、前列腺癌和白血病等各种癌症的临床前测试中显示出良好的前景。它还对乳腺癌、非小细胞肺癌、胃癌和急性髓细胞白血病表现出很强的活性。研究发现，ganetespib 可导致这些癌细胞凋亡和生长停滞，目前正进行 II 期临床试验，将其作为转移性乳腺癌的一线疗法进行测试。在这篇综述中，我们将根据最近的研究重点介绍 ganetespib 的作用机制及其在治疗癌症中的作用。
Raf激酶抑制剂对肿瘤转移的调控...
摘要 针对转移信号通路（例如受体酪氨酸激酶 (RTK) 触发的通路）的靶向治疗在预防肿瘤进展方面具有良好的前景。然而，基于 RTK 的靶向治疗经常遭受耐药性，因为多种生长因子受体共同表达可能会引发补偿性次级信号传导和治疗后获得性突变。一种替代策略是操纵 RTK 信号的常见负调节剂。其中，Raf 激酶抑制蛋白 (RKIP) 是本文的重点。RKIP 可以与 Raf-1 结合，从而抑制下游丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 级联。RKIP 还负向调节其他转移信号分子，包括 NF- κ B、STAT3 和 NOTCH1。一般而言，RKIP 通过结合和阻断上述通路上游关键分子的活性来实现此任务。一种新的 RKIP 相关信号传导涉及活性氧 (ROS)。在我们最近的报告中，我们发现 PKC δ 介导的 ROS 生成可能通过肿瘤启动子 12-O-十四烷酰-佛波醇-13-乙酸酯引发的 HSP60 氧化来干扰 RKIP 与热休克蛋白 60 (HSP60)/MAPK 复合物的结合。RKIP 的离开可能在两个方面影响下游 MAPK。一是触发与 MAPK 偶联的 HSP60 从 Mt→胞质溶胶转位。二是改变 HSP60 的构象，有利于胞质溶胶中上游激酶更有效地激活相关的 MAPK。值得研究的是，能够产生 ROS 的各种 RTK 是否可以通过以相同的方式影响 RKIP 来驱动转移信号。