c生物工程,生物材料和纳米医学(Ciber-BBN)的生物医学研究网络中心,Calle Monforte de Lemos 3-5,马德里,西班牙leo.salgado@csic.es leo.salgado@csic.es基于石墨烯基于求解的溶液基因菲尔德型现场效应晶体管(GSGFET)(GSGFFET)(图。1)在生物医学技术中变得重要。为其应用是对石墨烯 - 电解质界面行为的更好了解[1]。此接口可能会受到几个因素的影响,从而修改最终设备的性能。在第一种方法中,可以将其建模为电容(C INT),该电容与晶体管通道面积成反比[2]。这将其直接观察限制在某些尺寸以下,这主要是由于对连接轨道的寄生作用。在这里,我们已经制造了不同尺寸(50x50,100x100和300x300μm)的独立GSGFET,以测量电化学阻抗光谱谱(EIS),以直接评估界面互动的界面电容,以及通过频率响应的频率效应,通过分析(通过分析频率)进行频率效应(通过分析频率)(通过分析)进行了频率(通过分析)。即使我们期望在频率上具有恒定的电容性行为,EIS结果显示出两个不同的电容响应,由电阻过渡隔开(图2和3)。另外,对于GM结果也观察到了相同的行为,由于这两个不同的耦合能力,即使在较小的GSGFET处,在相同的频率下,有两个不同的收益出现在相同的频率下,在较小的GSGFET下,EIS受寄生效应的限制。最后,在两种方法中,都观察到频率过渡取决于pH(图4),促使以下假设:这种现象可以与GSGFET的SIO 2底物的末端组相互作用。所有这些结果证明,GM频率响应的采用是表征小型制造设备中C INT的有价值工具。使用这种方法获得的数据将非常有用,对于鉴定制造干扰物和改进用于分析GSGFET获得的生物学数据的校准方法。参考文献[1] R. Garcia-Cortadella et al。,Small,16(2020)1906640 [2] E. Masvidal-Codina等人,Nature Mater。,18(2019)280-288个数字
分类(Yorczyk等,2015; Kim等,2019),主要与ACMG AMP准则准则允许的主观性和不确定性程度有关。他们建议在解释过程中使用28个标准来区分:良性(可能是良性)的意义(VUS),可能是致病性和致病性变体。但是,仅在临床实践中获得这些标准的一部分,并且必须使用带注释的变体集合。为提供这样的资源,已经制定了各种倡议,包括Clinvar(Landrum等,2016),Clingen(Savatt等,2018),Varsome(Kopanos等,2019)和Intervar(Li and Wang,2017)。这些从专家和各种资源中收集数据,并可以为未报告的变体提供解释。然而,此自动化过程有时可能会产生不适当的结果,并且应谨慎查看数据。,如果我们专注于分类证据,一方面,最具挑战性的标准之一是PM1“位于突变的热点和/或关键和完善的功能域(例如,酶的活性位点),没有良性变化”,这是在报告的病例中使用的约10%(Amendola等人,2016年)。要提取此信息,自动化系统主要依赖Uniprot(Uniprot联盟。2017)和“ dbnsfp31a_interpro”,该数据库是DBNSFP(Liu等,2011; Liu等,2016)和Interpro(Mitchell等,2019)的域信息数据库,可在蛋白质家族,域,域和功能性点上包含有关蛋白质家族和功能性的信息。已经使用保守域数据库(CDD)(Marchler-Bauer等,2015)制定了其他计划,例如Subrvis分数(Gussow等,2016),旨在评估基因子区域对变体的不耐受性。通常,PM1标准与突变簇的功能区域的广泛视图相关联。然而,很难使用,因为这种聚类的定义不足和理解,如其在Vasome中的各种解释所示(Kopanos等人,2019年)和Intervar(Li and Wang,2017)。它也可能受到基因非人类疾病的兴趣和分类的变异次数的高度偏见。另一方面,最常用的证据是PM2/BA1/BS1“人口数据库中缺失的变异或等位基因频率太高,对于该疾病而言,据报道约有50%的病例(Amendola等人,2016年)。该标准的假设非常简单:如果已报告了普通人群频率高的变体,则不能是一种罕见的致病变异,否则该疾病的频率将更高;如果从未报道过变体,或者频率很低,则可能是一种罕见的致病变异。这些信息从大尺度基因组/外显子组测序项目中很大,大多数人从侏儒(Koch,2020年)或人口数据库中收集了这些信息,例如阿巴拉姆(巴西人人口)(Naslavsky等人)(Naslavsky等人,更大的Midder Midder eali Milder Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide Elide eLDEL,202)人口)(Scott等,2016)。然而,人类进化不允许变异的基因组饱和,其中一些在遗传漂移引起的人群中非常罕见(Bach,2019)。的确,如果人口足够大,几代人几代人的失踪率很可能会导致其消失,而只有少数几代人将在人群中固定。因此,尽管人们认识到,从人类中出现了每一代人的50至100个变种,但这些事件中的大多数在进化过程中都丢失了,这解释了为什么我们的基因组中不存在所有中性替代。另一种观点是基于一个简单的假设,即78亿活着人类中每一个中的50至100从头变体都应该产生与生命兼容的每种核苷酸变化