偏离心形和心脏健康状况不佳是养殖大西洋鲑鱼的重复关注。形态分析已经改善了我们对鲑鱼心形态的理解,但是通常通过测量长度,比率和角度来手动对形态逻辑心脏变异进行评估。心脏形状的手动评估是乏味的,耗时的,并且不是很标准化。它还需要培训和对齐人员才能获得可靠的结果。考虑到这些挑战,我们旨在使用用于计算机视觉的深度学习模型来自动化此过程,以衡量心脏的形态变化。在这里,我们开发了一种用于诊断工具的算法,以检测养殖大西洋鲑鱼中心脏形态的变化,我们认为与手动过程相比,我们可以以更客观,可再现和可靠的方式评估心脏形态变化。这项研究得出的知识可能代表了理解和最终减少养殖鲑鱼心脏异常的关键步骤,这对于改善鱼类健康和福利并确保水产养殖的可持续增长至关重要。
粘液菌四链硫酸毛乳子是一种广泛扩散的内寄生虫,在鲑鱼鱼中引起寿命肾脏疾病(PKD)。我们开发了一条在硅管道中,以将苔藓味的苔藓植物的转录物与天然脊椎动物宿主的肾脏组织分开,布朗鳟鱼(Salmo trutta)。严格的过滤后,我们构建了一个部分转录组组件T. Bryosalmonae,包含3427个转录本。基于对组装寄生虫转录组和大西洋鲑鱼(Salmo Salar)蛋白质组的同源限制搜索,我们确定了四个蛋白质靶标(内糖糖果酰胺酶,豆科蛋白酶,碳酸性赤铁酶2,胰腺性性硬脂酶2,胰腺脂肪酶相关蛋白2),抗脂肪酶相关的药物2)抗肿瘤。这些蛋白质在寄生虫生物和蠕虫中的早期工作表明,所鉴定的抗寄生虫靶标也代表了针对苔藓乳豆乳杆菌的有前途的化学治疗候选,并加强了已知抑制剂可以在进化较远的生物中有效的观点。此外,我们在中度和严重感染的鱼之间鉴定了差异表达的苔藓乳绿os子基因,这表明寄生虫负荷低的鱼类中苔藓乳豆乳杆菌的孢子虫阶段增加了。总而言之,这项研究为在T. bryosalmonae中的未来基因组研究铺平了道路,并代表了开发针对PKD有效药物的重要一步。
溪鳟 ( Salvelinus fontinalis ) 和大西洋鲑 ( Salmo salar ) 是康涅狄格州仅有的本土鲑鱼物种。在 18 世纪早期殖民定居期间,这两个物种的种群数量都大幅下降(鲑鱼灭绝了 5 ),原因是景观改变,包括砍伐成熟森林和安装水坝以磨坊、灌溉、饮用水供应和发电 6 。在 19 世纪后期,人们尝试通过大规模的重新放养工作来恢复溪鳟鱼的数量。在这两种本地鲑鱼中,只有溪鳟鱼拥有自我维持的种群。非本地的褐鳟鱼 ( Salmo trutta ) 是唯一在康涅狄格州的河流和溪流中建立了自我维持种群的鲑鱼。随着时间的推移,已在多个地点和水域记录了野生虹鳟鱼 ( Oncorhynchus mykiss ) 的繁殖;然而,到目前为止,关于自给自足的人口的记录却很少,目前还不知道存在这样的记录。
基于单倍型的摘要统计数据 - 例如IHS(Voight等人2006),NSL(Ferrer-Admetlla等人 2014),XP-EHH(Sabeti等人。 2007)和XP-NSL(Szpiech等人 2021) - 在进化基因组学研究中司空见惯,以确定种群中的最新和持续的阳性选择(例如, Colonna等。 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2006),NSL(Ferrer-Admetlla等人2014),XP-EHH(Sabeti等人。 2007)和XP-NSL(Szpiech等人 2021) - 在进化基因组学研究中司空见惯,以确定种群中的最新和持续的阳性选择(例如, Colonna等。 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2014),XP-EHH(Sabeti等人。2007)和XP-NSL(Szpiech等人2021) - 在进化基因组学研究中司空见惯,以确定种群中的最新和持续的阳性选择(例如,Colonna等。2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2014,Zoledziewska等。2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2015,Ne´de´lec等。2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2016,Crawford等。2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2017,Meier等。2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2018,Lu等。2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021)。 当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。 这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。 这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人 2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2019,Zhang等。2020,Salmo´n等。2021)。当适应性等位基因扫描一个人群时,它留下了长期高频单倍型和等位基因附近遗传多样性低的特征模式。这些统计数据旨在通过总结单倍型纯合性的衰减来捕获这些信号,这是一个距离被推定的区域(IHS和NSL)或两个种群(XP-EHH和XP-NSL)之间的距离。这些基于单倍型的统计数据非常有力地检测最近的阳性选择(Colonna等人2014,Zoledziewska等。 2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2014,Zoledziewska等。2015,Ne´de´lec等。 2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2015,Ne´de´lec等。2016,Crawford等。 2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2016,Crawford等。2017,Meier等。 2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2017,Meier等。2018,Lu等。 2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。 2021)。 此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2018,Lu等。2019,Zhang等。 2020,Salmo´n等。 2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。2019,Zhang等。2020,Salmo´n等。2021),并且两个人群版本甚至可以在很大的参数空间上进行成对的FST扫描(Szpiech等人。2021)。此外,基于单倍型的方法也已证明对背景选择是可靠的(Fagny等人。2014,Schrider 2020)。 然而,这些统计数据中的每一个都认为单倍型相是已知或据估计的。 作为非模型生物的基因组测序数据的产生正在变得常规(Ellegren 2014),有很多很大的机会来研究整个生命之树的最新适应性(例如, Campagna和Toews 2022)。 但是,这些生物/种群通常没有特征良好的人口历史或重组率2014,Schrider 2020)。然而,这些统计数据中的每一个都认为单倍型相是已知或据估计的。作为非模型生物的基因组测序数据的产生正在变得常规(Ellegren 2014),有很多很大的机会来研究整个生命之树的最新适应性(例如,Campagna和Toews 2022)。但是,这些生物/种群通常没有特征良好的人口历史或重组率
成立于1965年,中央库特尼地区区(RDCK)是一个地方政府,估计为60,000名居民提供服务。克雷斯顿镇是九个成员市政当局之一,包括卡斯尔加,卡斯洛,纳库斯普,纳尔森,纳尔逊,新丹佛,萨尔莫,西尔莫,西尔弗顿和斯洛坎。除了这些城市外,该地区还包括11个选举区。该镇与这些RDCK选举区一起参加了大量共享服务,从Creston Valley Public Library到Arrow Creek Water System,再到Creston&District Community Complex等等。此外,这些合作伙伴共同研究各种计划和项目,以提高整个Creston Valley的生活质量。
Nile tilapia Oreochromis niloticus 18 16 1 1 Atlantic salmon Salmo salar 7 3 2 2 Common carp Cyprinus carpio 4 2 2 Farmed carp Rohita 1 1 White crucian carp Carassius auratus 1 1 Mozambique Tilapia Oreochromis mossambicus 1 1 Gibel carp Carassius gibelio 2 Olive flounder Paralichthys olivaceus 2 2 Loach Paramisgurnus dabryanus 1 1 Channel catfish Ictalurus punctatus 7 2 1 2 1 1 Southern catfish Pelteobagrus fulvidraco 2 1 1 Starfish Acipenser ruthenus 2 1 1 Tiger pufferfish Takifugu pes 1 1 Red sea bream Pagrus major 1 1 Blunt snout sea bream Megalobrama amblycephala 1 1 Rainbow trout Oncorhynchus mykiss 1 1 Redhead cichlid Old melanura 1 1 Royal farlowella Sturisoma panamanese 1 1 Oyster Crassostrea gigas 1 1 Insects
简介 4. 船舶沉没不会导致船舶所有权终止;它仍然是船主的财产和责任。国防部拥有全球 5,700 多艘 1870 年后国防沉船和军用货物的清单。据信,其中相当一部分仍含有石油和弹药,如果它们逃逸,可能会造成重大环境损害和/或安全问题。此外,许多国防沉船和商业沉船都含有潜在危险的国防部军用货物。因此,对这些沉船和货物进行环保和负责任的管理势在必行。 5. 国防部通过打捞和海事作业 (SALMO) 的沉船管理计划 (WMP) 负责 5,700 多艘国防沉船和军用货物。如果没有完善的环境管理,这些沉船会对环境构成威胁,尤其是对海洋生物,因为沉船可能含有大量石油、弹药和其他可能对海洋和人类生命造成危害的物质。本宣传单介绍了国防沉船事故带来的风险,并详细介绍了国防管理这些风险的方法。目的是:
摘要:水产养殖为世界食品市场提供了大量有价值的蛋白质。利用基因组编辑方法可以获得高产的水产养殖鱼类,主要问题是选择目标基因以获得理想的表型。本文综述了五种主要水产养殖鲑科和鲤科物种,例如虹鳟鱼 ( Onchorhynchus mykiss )、大西洋鲑鱼 ( Salmo salar )、鲤鱼 ( Cyprinus carpio )、金鱼 ( Carassius auratus )、银鲫 ( Carassius gibelio ) 和模型鱼斑马鱼 ( Danio rerio ) ,对控制身体发育、生长、色素沉着和性别决定的基因进行基因组编辑的研究。在研究的基因中,最适合水产养殖的是 mstnba 、 pomc 和 acvr2 ,敲除这些基因可增强肌肉生长;runx2b ,其突变体不会在肌隔中形成骨骼; lepr ,其功能缺失使鱼生长迅速; fads2 、 ∆ 6abc/5Mt 和 ∆ 6bcMt ,影响鱼肉中脂肪酸的组成; dnd mettl3 和 wnt4a ,其突变体不育;以及疾病易感基因 prmt7 、 gab3 、 gcJAM-A 和 cxcr3.2 。获得仅由大型雌性组成的鲤鱼种群的方案有望用于水产养殖。固定化和未着色的斑马鱼系对实验室用途很有吸引力。
摘要:开发了一种采用 Percoll™ 梯度离心法从大西洋鲑 Salmo salar 的体肌组织中纯化 Kudoa thyrsites 孢子的方法。然后用高度纯化的孢子免疫近交系 BALB/c 小鼠,以衍生分泌 Kudoa 特异性单克隆抗体 (mAb) 的杂交瘤。通过免疫荧光显微镜和流式细胞术对 mAb 进行分析表明,几种 mAb 对 K. thyrsites 孢子表面的抗原具有特异性,而其他 mAb 与 K. thyrsites、K. paniformis 和 K. crumena 孢子的极性荚膜或极性细丝发生反应。使用表面结合 mAb 对孢子裂解物进行免疫印迹,结果显示 46 至 >220 kDa 的宽条带,而针对极性荚膜和极性细丝抗原的特异性 mAb 检测到不同分子量的更清晰条带,具体取决于 Kudoa 物种。K. thyrsites 孢子表面抗原的主要表位被证明是碳水化合物,这是由其对无水三氟甲烷磺酸处理的敏感性和对蛋白酶 K 处理的抗性决定的。使用 K. thyrsites 特异性 mAb 对分离的、完整的、透化的疟原虫和含有疟原虫的体细胞肌肉组织薄切片进行免疫荧光显微镜检查,发现在产生孢子的疟原虫和受感染的大西洋鲑鱼肉中都有孢子的强烈标记。通过免疫印迹法检测到的孢子只有 100 个,表明这些 mAb 具有用于开发基于现场的诊断测试的潜力。
气候变化对溪流沉积物,水文和温度动态的深远影响将加剧许多物种对栖息地条件的影响,尤其是那些依靠低蠕虫区域的早期生命阶段的栖息地条件,例如砾石散发型鱼类。Due to the complex and interactive nature of multiple stressor effects, we employed large-scale outdoor mesocosms to systemically test how the reproductive success of three gravel-spawning fish species brown trout ( Salmo trutta ), nase, ( Chrondrostoma nasus ) and Danube salmon ( Hucho hucho ) was affected by individual and combined effects of warming ( + 3 – 4 ◦ C), fine sediment (increase以<0.85毫米x 22%)和低流量(八倍排出)。细沉积物对所有三种物种的出现率和煎炸长度最大,在棕鳟中将出现率降低到零,Nase的9%,多瑙河鲑鱼中的出现速率降低了4%。通过细沉积物造成的出现死亡率明显地通过了,这表明由于缺氧引起的负面影响严重加剧了昆虫。变暖仅作为单个压力源具有较小的作用,但是低流量会降低春季产卵物种Nase和多瑙河鲑鱼的出现速率,分别达到8和50%。在包括细沉积物在内的联合处理中,即使在塞浦路斯物种Nase中,这三种物种的出现成功也反应良好,这在压力源之间在孵化成功方面几乎没有互动效应。变暖和细腻的沉积物也导致了炸薯条的早期出现,这意味着有可用的食品资源有异步的风险。这项研究极大地表明,气候变化对砾石卵鱼物种的再生成功产生有害影响,而与分类学或生态特征无关。