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蛋白质集合通过变异自动编码器潜在空间采样
摘要：映射有助于功能的蛋白质构象的整体，可以用小分子药物来靶向，这仍然是一个重大的挑战。在这里，我们探讨了变异自动编码器的使用来减少蛋白质结构合奏生成问题中维度的挑战。我们将高维蛋白质结构数据转换为连续的，低维的表示，在以结构质量度量为导向的空间中进行搜索，然后使用由采样的结构信息引导的Rosettafold来生成3D结构。我们使用这种方法为癌症相关的蛋白质K-RAS生成合奏，在可用的K-Ras晶体结构的子集上训练VAE和MD模拟快照，并评估接近与训练中与晶体结构接近的取样程度。我们发现，我们的潜在空间采样程序迅速生成具有高结构质量的合奏，并且能够在固定晶体结构的1Å内进行采样，其一致性高于MD模拟或Alphafold2预测。采样结构充分概括了固定的K-RAS结构中的隐性口袋，以允许小分子对接。
对Wasserstein Gans和F-Gans的探索| CS231N
生成对抗网（GAN）[4]被提议为计算机视觉领域中的生成建模框架。gan从训练数据样本中学习了概率分布，因此从Random Noises生成了新图像。此“学习和生成”机制建立在对手上，一个分类器作为判别模型，以确定是否直接从数据中采样图像还是由发电机生成，也是另一个具有从随机噪声生成图像的代理组件。损失功能鼓励发电机使歧视器将生成的图像分类为实际数据。正如CS231N讲座中所讨论的那样，由于生成模型的本质是检测现有数据中的概率密度，然后对Vanilla Gan及其变体产生，因此这些gan犯罪者的最终输出的最终输出被模型为输入图像的可能性，是从数据中采样的实际图像，而不是生成的。这在以前的工作中被证明是有效的。但是，我们可以考虑其他方法，其中之一是Wasserstein-Gan（Wgan），它不训练歧视者（评论家）作为分类器输出
相对于连续尺度空间的近似属性，用于高斯导数算子的混合离散
本文基于与归一化采样的高斯核或综合高斯内核的卷积，对高斯衍生物的两种混合离散方法的性质进行了分析。研究这些离散方法的动机是，在相同规模水平上需要多个阶的多个空间衍生物时，与基于更直接的衍生近似值相比，它们基于基于更直接的衍生近似值而具有更高的效率相比，它们基于具有较高的衍生性速率，以示例性衍生性衍生性不能衍生性不能进行。我们根据定量绩效指标来表征这些混合离散方法的特性，同意它们所暗示的空间平滑量，以及它们从量表 - 流动特征探测器的相对一致性以及从自动量表选择中获得的量表的相对一致性，从尺度上的量表与尺度相关的量度相差很大，该尺度的范围与尺度的相差相差，该尺度的尺度是有效的。理论以及不同类型的离散方法之间。在设计和解释以非常精细的水平运行的规模空间算法的实验结果时，提出的结果旨在作为指导。
hag鱼基因组和脊椎动物的进化
在分析离散时间采样的数据时，即使基础路径是连续的，也会在采样时间序列的轨迹中遇到连续的不连续性。另一方面，由连续随机过程有限采样引起的不连续性与样本路径中的实际不连续性引起的区别是主要问题之一。类似的线索导致我们提出了一个问题：是否可以提供一个模型，将数据集中的任何随机变化视为跳跃事件，而不管给定时间序列是分类为扩散还是跳跃 - 扩散过程？为了解决这个问题，我们编写了一个新的随机动力学方程，其中包括一个漂移术语和具有不同分布式大小的泊松跳跃过程的组合。在本文中，我们首先以最简单的形式介绍了此方程，包括漂移术语和跳跃过程，并表明这种跳跃方程能够描述扩散过程的离散时间演变。之后，我们通过考虑方程中的更多跳跃过程来扩展建模，该过程可用于模拟具有各种分布式振幅的复杂系统。在每个步骤中，我们还显示建模所需的所有未知函数和参数都可以从测量的时间序列中获得非参数获得。
保真度衰减和在随机量子电路中积累的误差
本文研究了随机量子电路中的保真度衰减，重点是掉期操作。所考虑的模型交织了具有任意排列的2量门的层。作者分析了通过故障掉期门的组合实现的2 Quibit门和故障排列的效果。为了易于分析，该模型由可解决的模型替代，其中置换量用π→𝑅π𝑅取代，以从HAAR随机分布中取样。
产妇暴露于空气污染后产生产后...
摘要：新兴证据表明，吸入颗粒物（PM）可能对肝功能有直接不利影响。早期生活是对空气污染影响的特别脆弱的时期。在此基础上，我们测试了在子宫内暴露于住宅PM中是否对发育中的肝脏有影响。在妊娠天13.5、15.5和17.5和17.5日，从室内施用100 µg PM从住宅屋顶空间（〜5 mg/kg）采样100 µg PM。在两周大时对幼崽进行安乐死，并收集肝组织以分析肝代谢（糖原储存和脂质水平），细胞反应（氧化应激，炎症和纤维化）以及遗传毒性，并使用生物化学分析的范围，组织学分析，组织学，组织学，Elisa和QPCR。在检查肝代谢和细胞反应时，我们没有观察到环境采样PM对发育中的肝脏的明显影响。但是，我们确实发现了肝脏基因组DNA损伤的证据，以响应子宫暴露于PM。此效果取决于PM样品。这些数据表明，在中期怀孕期间，子宫内PM暴露在现实世界中，对产后肝脏发育的影响有限。
面对面：梭状回面部区域的计算模型与有争议的面部刺激之间的对立
数百项研究已经描述了梭状回面部区域 (FFA) 的反应特性，但我们尚未揭示其表征背后的计算机制。一个方法论上的挑战是，不同的计算模型对随机抽样的面部做出的预测可能难以区分。这项 fMRI 研究采用了合成的争议性面部刺激，旨在引出六个候选神经网络模型对 FFA 中面部表征的不同预测。我们展示了对一位参与者进行四次扫描的初步数据。争议性面孔揭示了各模型在预测 FFA 表征相异矩阵 (RDM) 的能力方面存在许多显著差异，而随机抽样的面部无法实现模型之间的可靠裁决。经过逆向渲染（将面部图像映射到 3D 面部模型的潜在空间）训练的神经网络优于具有相同架构但经过识别、分类或自动编码训练的替代模型。我们的研究结果支持了这样的观点：面部识别涉及反映面部物理结构的表现形式，并证明了需要通过神经成像实验来优化有争议的刺激来裁决脑计算模型。
技术区-V 地下水调查
• TA-V 地下水受到硝酸盐和三氯乙烯 (TCE) 污染，浓度高于美国环境保护署饮用水最高污染物水平 (MCL)。 • 硝酸盐和 TCE 源自 20 世纪 60 年代至 1992 年期间 TA-V 排放的工业和化粪池废水。硝酸盐也可能自然产生。 • 除 TAV-MW17 外，监测井每半年或每年采样一次，以检测硝酸盐和 TCE（关注成分），每年采样一次，以检测废物特性参数。