1。预期的用途检测和分离革兰氏阴性肠病原体,尤其是人类临床标本和其他标本中的志贺氏菌和沙门氏菌。革兰氏阴性肠病原体(尤其是志贺氏菌和沙门氏菌)的Shalmella shigella琼脂/XLD琼脂。沙门氏菌琼脂/XLD琼脂的功能是支持症状患者的诊断,表明革兰氏阴性肠病原体,尤其是Shigella属和沙门氏菌的病原体潜在感染。沙门氏菌是食物中毒的一些最常见的病因。这些微生物的致病性从一种血清变化到另一种血清,并且在同一亚种中可能会有所不同。一些血清造成了侵入性疾病,但也有一些造成自限性食物中毒的血清疾病。沙门氏菌肠subsp的最孤立的血清。肠道是S. enteritidis,S。Typhimurium,S。Virchow,S。Hadar或S. iftantis。Shigella属包括四种:S。dysenteriae,s。Flexneri,S。Boydii和S. Sonnei。所有物种都是强制性的病原体,并引起细菌痢疾。2。手术沙门氏菌琼脂的原理胆汁盐,孔雀石绿色和柠檬酸钠的存在抑制了除沙门氏菌和志贺氏菌以外的革兰氏阳性微生物和肠杆菌的生长。由于添加乳糖,肠杆菌的分化是可能的。乳糖发酵细菌会产生酸并形成红色菌落,这是由于中性红色的pH指示剂。相反,乳糖非发酵微生物形成无色菌落。柠檬酸铁是硫化氢产生的指标。沙门氏菌产生硫代硫酸盐还原酶,该酶释放出存在于硫代硫酸钠中的硫化物分子。这些分子与氢离子结合,形成H 2 S,与柠檬酸铵反应。这种反应导致形成沉淀物,可见在细菌菌落中心的黑点。XLD琼脂酵母提取物是培养基中养分的来源。脱氧胆酸钠的存在抑制了革兰氏阳性细菌的生长。由于三个指示系统,细菌的分化是可能的: - 乳糖,木糖和蔗糖与苯酚红(这是pH指示剂) - - 盐酸l-赖氨酸盐和苯酚红色, - 硫代硫酸钠和柠檬酸铁硫酸盐。木糖的发酵降低了培养基的pH值,并使其从红色变为黄色。包括沙门氏菌在内的大多数肠道病原体能够发酵木糖,从而导致培养基的酸化。由于志贺氏菌的细菌是乳糖的非发酵,因此不会产生酸,因此会形成红色菌落。赖氨酸允许将沙门氏菌细菌与其他非致病细菌区分开。一旦木糖耗尽,沙门氏菌细菌在脱羧过程中利用L-赖氨酸,这将培养基的pH水平改变为碱。为防止赖氨酸阳性大肠菌群,乳糖和蔗糖的类似pH水平的类似回归,以产生多余的酸。氯化钠保持渗透平衡。柠檬酸铵是硫化氢生产的指标。沙门氏菌产生硫代硫酸盐还原酶,该酶释放出存在于硫代硫酸钠中的硫化物分子。这些分子与氢离子结合形成H 2 s,与柠檬酸铁反应形成沉淀物,可见在细菌菌落中的黑色中心。产生H 2 S的非致病细菌不脱羧L-赖氨酸。因此,它们产生的酸反应阻止了菌落的变化。
抗生素敏感性测试是一种测试细菌对抗生素反应的方法。这项研究旨在确定抗生素针对微生物活性的有效性。使用两种方法,即扩散方法和稀释方法进行灵敏度测试。使用纸盘(Kirby-bauer)对大肠杆菌和Shigella Sonnei细菌与阿莫西林,新霉素和磺酰胺抗生素进行扩散法进行了扩散法。所需的数据是抑制区的直径。结果表明,大肠杆菌对阿莫西林敏感,但对磺酰胺和新霉素有抵抗力。同时,Shigella Sonnei对阿莫西林,新霉素和磺胺酰胺具有抵抗力。此外,使用液体稀释法测试了稀释法以测试阿莫西林对大肠杆菌细菌的效力。所需的数据是带有液体培养基的测试管,没有显示浊度。结果表明,阿莫西林对大肠杆菌的最小抑制浓度为0.25%。基于使用扩散和稀释方法的抗生素敏感性测试的结果,可以得出结论,阿莫西林对大肠杆菌细菌具有很高的有效性,最小抑制浓度为0.25%,而志贺氏菌对抗生素的耐药性具有抗性。
• 针对成人、旅行者和军事人员的基于 CHIM 的监管审批策略 • 针对中低收入国家婴幼儿使用的传统基于疗效的监管审批途径 • 完全整合的志贺氏菌疫苗监管审批途径 • 有条件营销授权,以加快非 Gavi 国家婴幼儿使用志贺氏菌疫苗的审批时间
摘要:成簇的、规则间隔的、短回文重复序列 (CRISPR) 和 Cas9 RNA 引导核酸酶的发现为选择性杀死特定种群或物种的细菌提供了前所未有的机会。然而,由于 cas 9 基因构建体无法高效地递送到细菌细胞中,因此 CRISPR-Cas9 在体内清除细菌感染的应用受到了阻碍。在这里,我们使用广宿主范围的 P1 衍生噬菌粒将 CRISPR-Cas9 染色体靶向系统递送到大肠杆菌和引起痢疾的福氏志贺氏菌中,以实现对目标细菌细胞的 DNA 序列特异性杀死。我们表明,辅助 P1 噬菌体 DNA 包装位点 (pac) 的基因改造可显著提高包装噬菌粒的纯度,并改善 Cas9 介导的福氏志贺氏菌细胞的杀灭作用。我们进一步证明,P1 噬菌体颗粒可以使用斑马鱼幼虫感染模型将染色体靶向 cas9 噬菌粒递送到 S. flexneri 体内,从而显著减少细菌负荷并促进宿主存活。我们的研究强调了将基于 P1 噬菌体的递送与 CRISPR 染色体靶向系统相结合以实现 DNA 序列特异性细胞致死率和有效清除细菌感染的潜力。关键词:福氏志贺氏菌、P1 噬菌体、CRISPR-Cas9、抗菌、噬菌粒 ■ 简介
摘要 志贺氏菌是一种革兰氏阴性细菌,可侵入人体肠道上皮。由此引起的感染志贺氏菌病是最致命的细菌性腹泻病。有关决定志贺氏菌病理生理的基因(包括染色体和毒力质粒)的大部分信息都是通过经典反向遗传学获得的。然而,流行的诱变技术的技术限制使得单次反应中只能产生少量突变体,从而阻碍了大规模的志贺氏菌靶向诱变和随后的表型评估。我们采用了一种 CRISPR-Cas 依赖性方法,其中切口酶 Cas9 和胞苷脱氨酶融合在单向导 RNA(sgRNA)的引导下引入靶向 C ! T 转换,导致内部终止密码子和翻译过早终止。在使用 mCherry 荧光报告基因的原理验证实验中,我们能够在大肠杆菌和志贺氏菌中生成功能丧失突变体,效率高达 100%。使用改进的波动分析,我们确定在优化条件下,由 Cas9 脱氨酶融合引入的非靶向突变的频率与自发突变在同一范围内,这使我们的方法成为细菌诱变的安全选择。此外,我们对该方法进行了编程,以突变已充分表征的染色体和质粒携带的志贺氏菌基因,并发现突变体的表型与已报道的基因缺失突变体的表型相似,在表型水平上没有明显的极性效应。该方法可用于 96 孔板格式,以提高通量并在几天内生成一系列靶向功能丧失突变体。
志贺氏菌是全球中度至重度腹泻的主要原因,也是中低收入国家 5 岁以下儿童腹泻相关死亡的主要原因。针对志贺氏菌病的疫苗需求量很大。SF2a-TT15 是一种合成的碳水化合物结合疫苗,可对抗志贺氏菌 2a (SF2a),经证实对成年志愿者安全且具有强免疫原性。本文表明,10 µg 寡糖 (OS) 疫苗剂量的 SF2a-TT15 可在接种疫苗后 2 年和 3 年随访的大多数志愿者中诱导持续的免疫反应,且免疫反应强度和功能均保持良好。接种疫苗 3 个月后确定的任一体液参数的高水平以及特异性 IgG 记忆 B 细胞的数量是免疫反应持久性的良好预测指标。这项研究首次检验了志贺氏菌候选疫苗诱导的抗体功能和记忆 B 细胞反应的长期持久性。
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志贺氏菌是继轮状病毒之后,五岁以下儿童中第二大致命性腹泻病,在发展中国家发病率和死亡率都很高。目前,尚无广泛使用的疫苗,而且多药耐药性水平的不断提高使得志贺氏菌成为疫苗开发的重中之重。使用 GMMA 技术开发的针对宋内志贺氏菌 (1790GAHB) 的单组分候选疫苗含有脂多糖 (LPS) 的 O 抗原 (OAg) 部分作为活性部分。该疫苗在早期临床试验中耐受性良好且具有免疫原性。在法国的一项 1 期安慰剂对照剂量递增试验 (NCT02017899) 中,健康成人接种了三剂五种不同疫苗制剂(0.06/1、0.3/5、1.5/25、3/50、6/100 µg OAg/蛋白质)。在原研究之后 2 - 3 年进行的 1 期扩展试验 (NCT03089879) 中,在初次接种系列之前抗体水平无法检测到的已接种过疫苗的个体接受了 1790GAHB 加强剂量 (1.5/25 µg OAg/蛋白质)。对照组是接种了一剂 1790GAHB 的未接种过疫苗的参与者。当前的分析使用针对检测人血清优化的高通量发光血清杀菌活性 (SBA) 检测法评估了从两项研究中收集的血清的功能性。在接种疫苗者中检测到了具有补体介导的杀菌活性的抗体,但在安慰剂接受者中未检测到。SBA 滴度随着 OAg 剂量的增加而增加,在初次接种至少 1.5/25 µg OAg/蛋白质后,反应持续长达六个月。加强剂量在大多数已接种过疫苗的参与者中诱导了 SBA 滴度的大幅增加。观察到 SBA 滴度与抗 S. sonnei LPS 血清免疫球蛋白 G 水平之间的相关性。结果表明,GMMA 是一种有前途的 OAg 递送系统,可用于产生功能性抗体反应和持久的免疫记忆。
Members of the Shigellosis Incident Management Team • AMR infection control clinical lead : Eimear Brannigan • HIV Ireland/MPOWER : Adam Shanley • Gay Health Network: Padraig Burke • Area Public Health : Peter Barrett, Anne Sheahan, Gabriel Fitzpatrick, Christopher Carroll, Mary Ward, Fiona Cianci, Christopher Ibanga, Niall Conroy, Sarah Doyle,Mary O Mahony,Mai Mannix,Aine McNamara,Catherine Conlon,Margaret O'Sullivan•HSE Communications:Anita Butt,Maurice Kelly•HSE公共卫生:国家卫生保护办公室:国家健康保护办公室:Derval Igoe,Paul McKeown,Paul McKeown•HPSC:Greg Martin; Mary Archibald, Mark Campbell, Christina Dillon, Martha Neary, Angeline McIntyre, Kate O'Donnell, Aoife Colgan, Patricia Garvey • National Clinical Lead, Sexual Health, Medical Director Sexual Health and Crisis Pregnancy Programme : Fiona Lyons • National Salmonella Listeriosis and Shigella Reference Laboratory : Martin Cormican, Elaine McGrath, Mark McGuire, Wendy Brennan, Dimitar Nashev,Joanne King,Niall Delappe,Christina Clarke