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多种细菌可以使用饮食营养物质或通过微生物交叉进食相互作用来定位动物肠道。对宿主衍生的营养物质在实现肠道细菌定植中的作用知之甚少。在这里,我们检查了蜜蜂(Apis Mellifera)和核心肠道微生物群Snodgrassella alvi之间进化古代共生中的代谢相互作用。这种蛋白菌无法代谢糖,但是在纯糖饮食的情况下将蜂蜜蜜蜂肠道化。使用比较代谢组学,13个C-跟踪剂和纳米级离子质谱法(纳米SIMS),我们在体内表明,S。alvi在宿主衍生的有机酸上生长,包括柠檬酸盐,甘油酸盐,甘油酸盐,3-羟基-3-羟基-3-羟基-3-甲基细胞酸盐,并在宿主中被派生为宿主,该宿主是托管的。s。alvi还通过将kynurenine转化为炭疽菌来调节肠道中的色氨酸代谢。这些结果表明,阿尔维(S. alvi)适用于蜜蜂肠道中的特定代谢生态位,该蜜蜂肠道取决于宿主衍生的营养资源。