抽象的背景炎症效率为继发性脑损伤和有限的组织再生是脑内出血后有利预后的障碍(ICH)。作为炎症和脂质代谢的调节剂,肝脏X受体(LXR)具有改变小胶质细胞/巨噬细胞(M/ M)表型的潜力,并通过促进胆固醇外排和从吞噬细胞中促进胆固醇外排和回收来帮助组织修复。为支持潜在的临床翻译,在实验性ICH中检查了增强的LXR信号传导的好处。方法用LXR激动剂GW3965或媒介物处理胶原酶诱导的ICH小鼠。 在多个时间点进行了行为测试。 使用T2加权,扩散张量成像和动态对比增强的MRI序列评估病变和血肿的体积以及其他大脑参数。 染色固定的脑冷冻切片,并应用共聚焦显微镜检测LXR下游基因,M/M表型,脂质/胆固醇含有含有脂肪的吞噬细胞,少突胶质细胞谱系细胞和神经干细胞。 还使用了 Western印迹和实时QPCR。 CX3CR1 CRER:ROSA26 IDTR小鼠用于M/m-消耗实验。 结果GW3965治疗减少了病变体积和白质损伤,并促进了血肿清除。 处理过的小鼠上调LXR下游基因,包括ABCA1和载脂蛋白E,并降低了M/M的密度,显然从促炎性介绍性介绍性介绍性介绍性介绍性白介素-1β +转移到精氨酸酶1 + CD206 +调节性表型。 在GW3965小鼠中观察到较少的胆固醇晶体或髓素碎片吞噬细胞。方法用LXR激动剂GW3965或媒介物处理胶原酶诱导的ICH小鼠。在多个时间点进行了行为测试。使用T2加权,扩散张量成像和动态对比增强的MRI序列评估病变和血肿的体积以及其他大脑参数。染色固定的脑冷冻切片,并应用共聚焦显微镜检测LXR下游基因,M/M表型,脂质/胆固醇含有含有脂肪的吞噬细胞,少突胶质细胞谱系细胞和神经干细胞。Western印迹和实时QPCR。CX3CR1 CRER:ROSA26 IDTR小鼠用于M/m-消耗实验。结果GW3965治疗减少了病变体积和白质损伤,并促进了血肿清除。处理过的小鼠上调LXR下游基因,包括ABCA1和载脂蛋白E,并降低了M/M的密度,显然从促炎性介绍性介绍性介绍性介绍性介绍性白介素-1β +转移到精氨酸酶1 + CD206 +调节性表型。较少的胆固醇晶体或髓素碎片吞噬细胞。lxr激活增加了围绕围场区域中OLIG2 +PDGFRα +前体的数量和OLIG2 + CC1 +成熟的少突胶质细胞的数量,并且病变和脑膜下区域中的SOX2 +或Nestin +神经干细胞的升高。MRI结果支持GW3965的更好的病变恢复,这通过返回到功能性rotarod活性的预元值来证实。GW3965的治疗作用被CX3CR1 CRER中的M/M耗竭消除:ROSA26 IDTR小鼠。使用GW3965减少脑损伤的结论LXR激动剂,促进了m/m的有益特性,并促进了胆固醇回收的促进组织修复通讯。
动脉粥样硬化性心血管疾病 (ASCVD) 仍然是全球最大的死亡原因 2 。血脂异常是与 ASCVD 发展有关的一个关键的可改变的因果风险因素。最近,G 蛋白偶联受体家族的成员 G 蛋白偶联受体 146 (GPR146) 被证明是血浆胆固醇的调节剂 3,4 。GPR146 在小鼠体内的肝脏抑制已显示出良好的特性,它对高胆固醇血症和动脉粥样硬化具有保护作用,这种作用独立于低密度脂蛋白受体 (LDLR) 通路 3 。为了更好地理解所涉及的生物学机制,我们开发了一种先进的基因工程人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 模型,该模型因 GPR146 而无效。 GPR146 -/- 细胞系 (ITXi001-A-1) 源自我们实验室先前从尿液祖细胞 (ITXi001-A) 1 中重新编程的对照 hiPSC 的基因组版本。基因组版本使用 Alt-R™ CRISPR-Cas9 系统 (Integrated DNA Technologies) 进行,针对两个等位基因上的 GPR146 外显子 2。ITXi001-A-1 是通过挑选单个菌落建立的,其基因型通过 PCR 筛选 (图 1A - 上图和下图) 并通过 Sanger 测序确认 (图 1B)。我们进一步表明,GPR146 基因的遗传版本不会诱导基因组的脱靶版本(筛选 10 个预测位点 - (补充文件 3A)),也不会诱导 ITXi001-A-1 细胞的基因组完整性(分析 24 个拷贝数变异)(补充文件 1)。我们验证了 ITXi001-A-1 细胞不含支原体(补充文件 3B),并且它们与最初采集的尿液细胞来自同一个体(16 个 STR 的亲子鉴定 - 补充文件 2)。总体而言,ITXi001-A-1 细胞呈现:I- 与 ITXi001-A 细胞相比具有相似的形态(图 1C)II- 多能性标志物的阳性表达(通过 OCT3/4 和 TRA-1–60 的免疫荧光染色检测)(图 1D)。 III- 多能性细胞表面标志表达阳性(流式细胞术检测 SSEA-4 和 TRA1-60)(图 1E)。IV- 多能性标志物的表达水平与 ITXi001-A 细胞相同(NANOG、POU5F1 和 SOX2 - 通过 RT-qPCR 测量)(图 1F)。V- 具有优异的分化为中胚层、内胚层和外胚层的能力(通过 SOX17 和 FOXA2(中胚层);T(TBXT) 和 HAND1(内胚层)以及 PAX6 和 SOX1(外胚层)的 RT-qPCR 评估,与 ITXi001-A 细胞相似)(图 1G)。
a,示意图,显示了MCMBP介导的组装,并将MCM3-7导出到核中,该核能形成新生的MCM,用MCM2作为恢复前复合物,并调节DNA复制叉速度。nls表示核定位信号。b,从顶端到基础位置的MCMBP的时空表达,从E12.5到E15.5。c,蛋白质印迹分析显示了皮质发育产前和产后阶段的MCMCBP表达模式。d,在P3处的CKO小鼠和同窝对照的代表性图像。红色星星指示CKO鼠标。e,(左图)MCMBP +/ +的背视图; EMX1-CRE和MCMBP FL/FL; EMX1-CRE(CKO)P4大脑。(右图)与同窝对照(CTRL)相比,CKO中的皮质区域显着降低。(平均,两尾未配对的t检验,ctrl:n = 7,cko:n = 5)。f,(左图)MCMBP +/ +和CKO P4脑的DAPI染色冠状切片。与同窝对照(CTRL)相比,CKO的皮质板厚度显着降低了皮质板厚度。(平均,两尾未配对的t检验,ctrl:n = 7,cko:n = 5)。g,MCMBP +/ +的P4脑中的层标记物BRN2,TBR1,LHX2和TLE4的免疫染色; EMX1-CRE和CKO。h,与同窝对照组(CTRL)相比,CKO的上层神经元显着降低。(均值,两尾未配对的t检验,BRN2,TBR1,CTRL:n = 8,cko:n = 5,lhx2,tle4,ctrl:n = 4,cko:cko:n = 4)。i,蛋白质印迹分析显示了E15.5,E16.5和P4 Cortex中MCMCBP表达的下调。(平均,两尾未配对的t检验,ctrl:n = 3,cko:n = 3)。J,MCMBP +/ +中的顶祖细胞标记物SOX2和中间祖细胞标记的免疫染色; EMX1-CRE和CKO从E12.5到E16.5。K,SOX2+细胞数分析表明,在E12.5处CTRL和CKO之间没有差异。但是,由于E13.5,Sox2+细胞显着降低并持续到E16.5。(mean, two-tailed unpaired t-test, E12.5, ctrl: n=5, cKO: n=4, E13.5, ctrl: n=4, cKO: n=3, E14.5, ctrl: n=5, cKO: n=5, E15.5, ctrl: n=6, cKO: n=4, E16.5, ctrl: n=6, CKO:n = 4)。l,EOMES+细胞数分析表明,在E12.5和E13.5处CTRL和CKO之间没有差异。但是,Eomes+细胞从E14.5显着降低到E16.5。(mean, two-tailed unpaired t-test, E12.5, ctrl: n=3, cKO: n=3, E13.5, ctrl: n=4, cKO: n=4, E14.5, ctrl: n=4, cKO: n=4, E15.5, ctrl: n=4, cKO: n=3, E16.5, ctrl: n=4, CKO:n = 3)。
自 1961 年首次发现骨髓来源的多能干细胞以来,干细胞研究取得了长足进步 [ 1 ]。干细胞是一种独特的细胞,能够通过有丝分裂不断复制,从而形成更多的细胞。该过程会产生两种不同的细胞类型:一种会进化为特定细胞类型,另一种则保留自我更新的能力 [ 2 ]。干细胞大致可分为三类:诱导多能干细胞 (iPSC)、胚胎干细胞 (ESC) 和成体干细胞 (ASC) [ 3 ]。由于 iPSC 和 ESC 能够转化为三个胚层:外胚层、中胚层和内胚层,因此它们被归类为多能干细胞 (PSC)。2006 年,Kazutoshi Takahashi 和 Shinya Yamanaka 通过使用病毒载体引入 Oct4、Sox2、Klf4 和 c-Myc 等特定转录因子,成功将小鼠体细胞转化为 iPSC [ 4 ]。此后,人们使用各种方法将不同类型的小鼠和人类体细胞重新编程为 iPSC [ 5 ]。这种重新编程人类细胞的创新方法引起了科学和医学领域的极大兴趣。iPSC 作为多能细胞来源,为人类 ESC 提供了一种替代方案。诱导多能干细胞的一个显著优势是它们来源于可以非侵入性获得的体细胞。这些细胞携带个体的遗传特征,可以降低免疫排斥的风险 [ 6 ]。现代医学领域对基于 iPSC 的疗法的关注度正在提高。它们在疾病建模、药物筛选和再生医学中的应用正在呈指数级增长 [ 7 ]。iPSC 因其自我更新能力和分化为所有人体细胞类型的能力而在疾病建模中发挥着关键作用。这使得它们成为创建各种疾病模型以供研究的理想选择 [ 8 – 10 ]。患者特异性 iPSC 在制定有针对性的治疗策略和药物开发方面特别有价值。此外,来自正常细胞和患病细胞的 iPSC 可以分化为神经元、肝细胞、心肌细胞等,以评估毒性和副作用,这是治疗分子开发的关键因素 [11]。在再生医学中,iPSC 用于修复或再生受损或退化的组织。这是通过在实验室中从 iPSC 创建器官组织并将其移植到受伤区域来实现的。这种疗法有望用于治疗造血系统疾病、肌肉骨骼损伤、脊髓损伤和肝损伤等疾病 [ 12 – 14 ]。已经开发出各种用于创建 iPSC 的技术,例如使用逆转录病毒或慢病毒进行基因转导和化学诱导。然而,生成 iPSC 的过程通常很慢且效率不高,啮齿动物细胞需要大约 1-2 周,人类细胞需要 3-4 周,成功率通常较低。此外,通过检查菌落形态来评估 iPSC 的质量容易出现人为错误,这是一个重大挑战,在进行进一步的实验或治疗用途之前必须解决这一问题。尽管在提高 iPSC 培养的效率和速度方面取得了进展,但该过程仍然耗费资源,因此需要开发自动化系统以最大限度地减少错误并增强 iPSC 分析。最近,人工智能 (AI) 技术,包括机器学习 (ML) 和深度学习 (DL),已被用于增强再生疗法。这些 AI 驱动方法的实施可以改进
口腔癌负责世界各地的许多死亡,因为它导致了由于治疗失败而导致的复发和转移。常规处理破坏了分化的肿瘤细胞,但肿瘤干细胞种群具有抗性并重新填充肿瘤。Wnt/β-catenin信号传导参与肿瘤干细胞的维持,生存,自我更新和分化及其信号传导,可以通过表观遗传修饰来调节。该项目的目的是确定控制Wnt/β-catenin信号通路及其靶标涉及的表观遗传变化,并研究道路参与肿瘤干细胞积累和口服癌细胞系的化学性。研究了三种野生口服癌菌株(Cal27 wt; SCC9 WT; SCC25 wt)和顺铂耐药性(Cal27 CISR; SCC9 CISR; SCC25 CISR)及其肿瘤干细胞群(CTT+)和非肿瘤干(CTT-temor(CTTT-))。QPCR分析,以评估基因表达和蛋白质印迹以进行蛋白质水平评估。通过细胞可行性测试确定IC50剂量的抑制剂。球体流量和鉴定的CTT+的形成细胞术。染色质免疫沉淀以识别道路的表观遗传调节。Xenoenxe检验用于研究Wnt/β-catenin途径作为治疗靶标的潜力。我们观察到表观遗传机调节基因的表达增加,例如BRD7,EZH2,KDM4C和MLL1和CTNNB1基因,该基因在抗顺铂菌株中编码β-catenin的ctNNB1基因。Wnt/β-catenin途径基因(如APC和GSK3β)在3种化学主义菌株中减少,下游FGF18和MMP7基因增加。CTT+的种群表现出参与组蛋白甲基化的基因的更大表达。β-catenin和甲基化的H3K27ME3和H3K9ME2组蛋白在顺铂抗性菌株和CTT+中也增加了。EZH2(UNC1999)和β-catenin抑制剂(ICG-001和FH535)的抑制剂降低了CTT+的群体,并降低了化学谱系中CTT+的群体,并降低了β-catenin和Ezh2蛋白。H3K27ME3用抑制剂处理后也降低了它。UNC1999治疗增加了上游APC和GSK3β基因的表达,并且对ICG-001,FH535和UNC1999的处理可有效降低CTT+中下游MMP7基因。FH535显示出降低CTT+种群的有效性,尤其是与顺铂和UNC1999结合使用时。β-catenin抑制剂单一疗法或与顺铂和UNC1999结合降低了CTT+躯干表型。在肿瘤组织中施用FH535,FH535+顺铂和UNC1999+FH535之后,肿瘤生长降低,肿瘤β-catenin,Ezh2,H3K27Me3和肿瘤干细胞标记肿瘤降低。通过化学谱系和CTT+CTT+种群中的染色质免疫沉淀,我们确定EZH2与该地区
摘要:全球互联网基础架构的稳定性和可靠性在很大程度上依赖边界网关协议(BGP),这是一种重要的协议,可促进各种自主系统之间的路由信息交换,从而确保全球无缝连接。但是,BGP固有地具有对异常路由行为的敏感性,可能导致严重的连通性破坏。尽管做出了广泛的努力,但准确地检测并有效缓解了这种异常,这仍然是艰难的挑战。为了解决这些问题,本文提出了一种新型的统计方法,该方法采用了某些约束的中值绝对偏差,以主动检测BGP中的异常情况。通过应用高级分析技术,该研究为早期检测异常(例如Internet蠕虫,配置错误和链接故障)提供了强大的方法。这种创新方法已在经验上得到了验证,在识别这些破坏时,准确率为90%,精度为95%。这种高度的精度和准确性不仅确认了采用的统计方法的有效性,而且还标志着增强全球互联网基础架构的稳定性和可靠性的重要一步。
