拉曼光谱法(RS)是一种众所周知的技术,它广泛用于物理化学,材料物理,生物学,工程甚至行星探索的广泛领域。rs已成为表征材料的化学成分和分子结构的主要工具之一。有关缺陷性质,材料的结晶或无定形特征以及该技术的大量信息。在本期中,原始论文和评论文章尤其有望表明RS在诸如以下主题中的兴趣: - 控制材料的制备,例如薄膜,纳米和微结构材料,以及提高其质量; - 掺入点缺陷的探测和缺陷结构的研究; - 与相变的联系(共存阶段,相变); - 属性的增强(机械,电子,光学等)通过更好地了解结构。此问题可以概述该重要工具在物理和化学不同领域中的各种应用。
在现代世界中,口腔的各种炎症性疾病已广泛,特别是牙周炎[1,2]。牙周炎和植入周围炎的主要原因是口腔微生物的组织感染。病理过程中已知的潜在参与者之一是链球菌,在几乎100%的病例中,它们在牙周口袋中被检测到[3-6]。同时,即使使用现代方法,链球菌仍然是识别微生物的最困难之一。当前,一种积极使用的物理方法来诊断包括链球菌在内的微生物,是基质辅助的激光解吸/电离时间 - 质谱质谱法(MALDI-TOFMS)。没有任何有关微生物识别的新技术,没有问题,而Maldi Tofms也是如此。是在具有基因型/蛋白质相似性的那些微型机构中无法进行准确的分歧,并且在数据库中没有可靠的数据[7]。在这方面,紧急任务是检测链球菌的物种鉴定。作为识别链球菌的替代方法,可以使用在生物医学实践中广泛应用的拉曼光谱法(RS)的方法[8]。rs允许分析分子的振动模式,并可以区分相似的分子,这使人们希望解决鉴定紧密相关的细菌物种的问题。鉴于链球菌作为各种局部疾病的致病药物的作用越来越大,需要在此方向上进行进一步的研究。以前,其他作者进行了类似的研究,但它集中在肺炎球菌的物种鉴定上,作为广义感染(肺炎和脑膜炎)的主要病因[9]。该研究的目的是对三种密切相关的链球菌链球菌,口腔链球菌和肺炎链球菌肺炎链球菌的菌株进行频谱研究,并使用拉曼光谱法对周期性诊断的细菌菌株进行快速评估。
摘要目的:评估自身免疫性脑炎儿童(AE)儿童的临床谱,治疗和结果。研究设计:描述性研究。研究的地点和持续时间:2017年1月至2021年1月,巴基斯坦卡拉奇Aga Khan大学医院儿科学系。方法论:审查了诊断为AE的儿童的病历,以了解临床特征,治疗细节和结果。基于修改后的兰金量表(MRS)得分在3个月的随访中,将结果定义为良好(0-2)或较差(3-6)。报告性统计数据,并使用逻辑回归来评估与结果相关的预后因素。结果:使用AE鉴定33例患者。13(39.3%)是抗体阳性。抗N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDAR)抗体。行为异常(87.8%),癫痫发作(81.8%),运动障碍(66.6%),精神病症状(63.6%)和Mutism(33.3%)是突出的症状。三十(91%)患者接受了第一线免疫疗法。在14例(48.2%)患者中看到了良好的结果。单变量分析表明,绒毛膜患者的预后差的几率为2.5(95%的置置间隔[CI] 0.37-16.88,p = 0.34)。此外,脑脊液升高(CSF)蛋白的优势比(OR)为8.6(CI 0.88-84.83,p = 0.064)和阳性CSF抗体的抗体为3.7(CI 0.79-17.72,P = 0.095)。死亡率。结论:在出现行为症状和舞蹈的儿童中,需要一个非常低的阈值来诊断AE。尽管CHOREA,CSF蛋白升高和CSF阳性抗体的患者的预后不良差异较高,但P值并未显着。
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图4:模型解释的形状结果。a)分形的第一个折叠的形状输出具有数据集。(b)BINNED功能数据集的第一个折叠的形状输出。shap值表示特征对模型输出的影响,正值表示对正类别的分类产生影响,而负值则表示相反。颜色映射指示该特征如何影响模型决策,例如,如果该功能具有高值和高的外形值,则此功能的增加是正类别的特征。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年3月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.03.20.533577 doi:Biorxiv Preprint
对于那些需要线性代数介绍的人来说,与本书兼容的观点包含在吉尔·斯特朗(Gil Strang)的“线性代数介绍”中。有关线性代数的更高级主题,我建议罗杰·霍恩(Roger Horn)和查尔斯·约翰逊(Charles Johnson)的“矩阵分析”及其“矩阵分析中的主题”。对于与图形相关的物理系统的处理,我建议Gil Strang的“应用数学概论”,Sydney H. Gould的“特征值问题的变异方法”,以及Levin,Peres和Wilmer撰写的“特征值问题的变异方法”以及“ Markov Chains and Mighting Times”。
抽象的计算光谱已成为希望获得实验光谱定性和定量解释的研究人员的关键工具。在过去的十年中,实验与理论之间的相互作用增加创造了一个积极的反馈回路,该回路激发了两个领域的发展。特别是,计算的精度提高已导致它们成为分析电磁频谱光谱镜的必不可少的工具。对于短波长技术,例如核心孔(X射线)光谱镜,其流行率在现代X射线设施出现之后增加了,包括第三代同步激素和X射线自由电子激光器。基于建立的波功能或密度功能方法的计算继续主导文献中光谱分析的大部分,但机器学习算法的新兴发展正在开始为这些传统技术提供新的机会,以快速,准确,价格合理的“黑色盒子”接近这些传统技术。此局部评论叙述了计算X射线光谱的数据驱动/机器学习方法的最新进展。我们讨论了当前可用方法的成就和局限性,并回顾了这些技术必须扩大计算和实验X射线光谱研究的范围和范围的潜力。
摘要常染色体显性症(AD)高IGE综合征(HIE)的抽象患者患有一系列表现形式,包括复发细菌和真菌感染,严重的特应性和骨骼异常。这种情况通常是由单相关的显性阴性(DN)STAT3变体引起的。在2020年,我们描述了来自八名具有DN IL6st变体的八种幼虫的患者,导致了一种新形式的AD HIE。这些变体编码了截短的GP130受体,具有完整的细胞外和跨膜结构域,但缺乏细胞内回收基序和四个STAT3结合残基,导致无法循环和激活STAT3。我们在这里报告了三个无关的HIS-AD家庭中IL6ST的两个新的DN变体。这些变体的生化和临床影响与先前报道的变体的生化和临床影响不同。p。(Ser731Val f s*8)变体,在来自两个家族的7例患者中鉴定出来,缺乏回收基序和所有STAT3结合残基,但其在细胞表面的水平仅略有升高,并且它的基础是轻度生物学表型,具有可变的临床表达性。p。(arg768*)在单个患者中鉴定出的变体缺乏回收基序和三个最远端的STAT3结合残基。这种变体在细胞表面积聚,并构成严重的生物学和临床表型。p。(Ser731Val f s*8)变体表明,在细胞表面上以接近正常水平表达的DN GP130可以是异质临床表现的基础,范围从轻度到重度。p。(arg768*)变体表明,截短的GP130蛋白保留了一种STAT3结合残基可以是严重HIE的基础。
摘要:神经退行性疾病是无法治愈的,异质性和依赖年龄的疾病,挑战现代医学。A deeper understanding of the pathogenesis underlying neu- rodegenerative diseases is necessary to solve the unmet need for new diagnostic biomarkers and disease-modifying therapy and reduce these diseases' burden.特定的,翻译后的模式(PTMS)在神经变性中起着重要作用。Due to its proximity to the brain parenchyma, cerebrospinal fluid (CSF) has long been used as an indirect way to measure changes in the brain.质谱法(MS)分析的神经退行性疾病,重点是PTM,在生物标志物发现的背景下,已经改善并打开了场地,用于分析更复杂的矩阵,例如脑组织和血液。值得注意的是,磷酸化的tau蛋白,截短的α-突触核蛋白,APP和TDP -43,以及许多其他修饰,以MS的广泛特征。巨大的潜力是用于临床应用的特定病理PTM签名。本综述着重于参与神经退行性疾病的PTM模型蛋白质,并突出了基于MS的生物标志物发现中最重要和最新的突破。