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利用设计 PPR 蛋白构建多功能、可编程的 RNA 结合蛋白及其在哺乳动物细胞剪接控制中的应用
摘要：RNA 在基因表达中发挥着许多重要作用，并参与各种人类疾病。尽管基因组编辑技术已经建立，但与基于核苷酸的 RNA 操作技术（如 siRNA 和 RNA 靶向 CRISPR/Cas）相比，操纵特定细胞 RNA 分子的序列特异性 RNA 结合蛋白的工程化尚不成熟。在这里，我们展示了一种使用含五肽重复 (PPR) 基序的蛋白质的多功能 RNA 操作技术。首先，我们开发了一种基于 PPR 的设计序列特异性 RNA 结合蛋白的快速构建和评估方法。该系统已经能够稳定构建数十种针对长 18 nt RNA 的功能性设计 PPR 蛋白，该蛋白针对哺乳动物转录组中的单个特定 RNA。此外，设计 PPR 蛋白的细胞功能首次通过控制报告基因或内源性 CHK1 mRNA 的可变剪接得到证明。我们的研究结果展示了一种使用 PPR 蛋白的多功能蛋白质 RNA 操作技术，该技术有助于理解未知的 RNA 功能和创建基因回路，并有可能用于未来的治疗。
标题：剪接调节剂损害 DNA 损伤反应...
附属机构：1 丹娜—法伯癌症研究所肿瘤内科系，美国马萨诸塞州波士顿 02215。2 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，美国马萨诸塞州剑桥 02142，美国马萨诸塞州剑桥 02142。3 哈佛医学院布拉瓦尼克研究所生物化学和分子药理学系，美国马萨诸塞州波士顿 02115。4 哈佛医学院路德维希中心，美国马萨诸塞州波士顿 02115。5 纪念斯隆凯特琳癌症中心人类肿瘤学和发病机制项目，美国纽约州纽约 10021。6 迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心医学系血液学分部，美国佛罗里达州迈阿密 33136。7 H3 Biomedicine, Inc.，美国马萨诸塞州剑桥 300 Technology Square 02139。 8 丹娜法伯癌症研究所病理学系；美国马萨诸塞州波士顿 02215。
剪接概述：转录后修改
许多想帮助您对理解充满信心的人。如果您的课程有学习助手或助教，则应与他们联系以查看您想了解更多有关的概念。当您不理解主题时，您的教授也是一个很好的资源。您也可以与同龄人一起学习，也可以通过LRC获得学术支持。如果您想帮助确定如何获得所需的支持，请随时通过lrc@ucdenver.edu与Cu Denver学习资源中心联系，或在学习Commons大楼的前台停留。6。进一步的学习机会：
剪接背景：转录是使用...
DNA一次从3'末端到5'末端读取一个底座。对于每个读取的碱基，核苷酸都配对以生长RNA链。这一直持续到转录终止为止。在原核生物中，该新的RNA转录本可用于翻译。在真核生物中，这种新制成的RNA链称为前MRNA转录本。在可以用于翻译之前，必须进行转录后修改以使其成为成熟的mRNA转录本。在阅读之前，停止并回答以下思想问题以测试您的当前知识：前MRNA转录本与成熟的mRNA转录本有何不同（要具体）？
大豆结瘤过程中线粒体的差异RNA编辑和内含子剪接
摘要：大豆固氮消耗大量能量，导致根瘤和未接种根的能量代谢和线粒体活动存在显著差异。尽管线粒体转录本的 C 到 U RNA 编辑和内含子剪接在植物物种中很常见，但它们与根瘤功能的关系尚不清楚。在本研究中，我们进行了 RNA 测序以比较大豆根瘤和根中线粒体基因的转录本谱和 RNA 编辑。在线粒体转录本上共鉴定出 631 个 RNA 编辑位点，其中 12% 或 74 个位点在从根瘤、剥离根和未接种根中分离的转录本中存在差异编辑。这 74 个差异编辑位点中有 8 个位于 matR 转录本上，其中 RNA 编辑程度在根瘤样本中最高。还检查了线粒体内含子剪接的程度。根瘤和剥离根中几个内含子的剪接效率高于未接种根。这些包括 nad1 内含子 2 / 3 / 4、nad4 内含子 3、nad5 内含子 2 / 3、cox2 内含子 1 和 ccmFc 内含子 1。在根瘤中还观察到 nad4 内含子 1 的更高剪接效率、更高的 NAD4 蛋白丰度以及超复合物 I + III 2 的减少，尽管这些观察结果之间的因果关系需要进一步研究。
利用纳米技术纠正疾病潜在剪接缺陷的创新治疗和给药方法
前 mRNA 的选择性剪接对细胞和组织特异性蛋白质表达模式的多样性有很大影响。全球转录组分析表明，90% 以上的人类多外显子基因都是选择性剪接的。剪接过程的改变会导致错误剪接事件，从而导致遗传疾病和病理，包括各种神经系统疾病、癌症和肌营养不良症。近几十年来，研究有助于阐明调节选择性剪接的机制，在某些情况下，还揭示了这些机制的失调如何导致疾病。由此产生的知识使我们能够设计出新的治疗策略来纠正剪接衍生的病理。在这篇综述中，我们主要关注针对剪接的治疗方法，并重点介绍基于纳米技术的基因传递应用，以解决核酸疗法面临的挑战和障碍。
