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RNA的开发和特定疾病调节... 血浆中成纤维细胞生长因子与颈动脉斑块新生血管形成：一项初步研究 低肌肉质量指数与拉丁美洲人群中的2型糖尿病风险有关：横断面研究 西班牙裔，黑人和白人的邻里障碍和2型糖尿病差异 神经炎症中的先天淋巴样细胞 对代偿性心力衰竭的门诊管理的护理系统 dual-... 上定量参数的诊断值 足球杂耍学习对执行功能和大脑功能连接的影响 补充藏红花对糖尿病血糖结果的影响：系统评价和荟萃分析 I型干扰素信号传导，认知和神经退行性19：在机械致病模型上更新，对阿尔茨海默氏病的影响
替代剪接是一个复杂的基因调节过程，它通过重新安排未成熟前MRNA转录本的内含子和外显子和外显子来区分自身。这个过程在增强基因组的转录组和蛋白质组学多样性中起着至关重要的作用。替代剪接已成为一种关键机制，该机制是在心脏发育和心血管疾病发展过程中的复杂生物学过程的关键机制。在相关生理过程中，在重要基因的调节中以协同或拮抗的方式涉及多个替代剪接因子。值得注意的是，圆形RNA直到最近才引起了其特异性表达模式和调节功能的关注。这种兴趣的复兴促使对该主题进行了重新评估。在这里，我们概述了我们当前对替代剪接机制的理解以及替代剪接因子在心血管发育中的替代剪接因子的调节作用，以及不同心血管疾病的病理学过程，包括心肌病，心肌梗死，心力衰竭，心脏失败，心脏失败，心脏失败和动脉粥样硬化。
“一种用于研究替代方案的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具......
“一种用于研究可变剪接的 CRISPR-dCas13 RNA 编辑工具” Yaiza Núñez-Álvarez 1§*、Tristan Espie--Caullet 1,2,6§、Géraldine Buhagiar 2,6、Ane Rubio-Zulaika 3、Josune Alonso-Marañón 3、Elvira Perez-Luna 2,6、Lorea Blazquez 3-5、Reini F. Luco 1,2,6 * 1. 蒙彼利埃大学人类遗传学研究所，CNRS UMR9002，法国蒙彼利埃。 2. 巴黎萨克雷研究大学居里研究所，CNRS UMR3348，91401 奥赛，法国。 3. 西班牙Biogipuzkoa健康研究所神经科学系，20014圣塞瓦斯蒂安 4. 西班牙巴斯克科学基金会Ikerbasque，48009毕尔巴鄂5. CIBERNED，ISCIII（CIBER，西班牙科学与创新部卡洛斯三世研究所），28031 马德里，西班牙 6. 由抗癌联盟支持的团队。 § 这些作者贡献相同* 通讯作者：：ynunez@biotech-foods.com 和 reini.luco@curie.fr 摘要 可变剪接允许从同一基因产生多个转录本，从而使蛋白质库多样化，并在编码基因组有限的情况下获得新的功能。它可以影响多种生物过程，包括疾病。然而，由于在生理背景下剖析每个剪接异构体的精确作用的局限性，其重要性长期以来一直被低估。此外，识别关键调控元件以纠正有害的剪接异构体也同样具有挑战性，这增加了解决可变剪接在细胞生物学中的作用的难度。在这项工作中，我们利用 dCasRx（一种靶向 CRISPR-dCas13 直系同源物的催化无活性 RNA），以经济高效的方式有效地切换内源转录物的可变剪接模式，而不会影响整体基因表达水平。此外，我们展示了 dCasRx 剪接编辑系统的一个新应用，用于识别特定剪接事件的关键调控 RNA 元素。通过这种方法，我们正在扩展 RNA 工具包，以更好地了解可变剪接的调控机制及其在各种生物过程（包括病理状况）中的生理影响。关键词 可变剪接； CRISPR-dCas13，dCasRx；剪接编辑；顺式调节 RNA 元件、RNA 基序。
通过RBM39降解靶向剪接体会导致高风险神经母细胞瘤模型的出色响应
异常的替代前MRNA剪接在MYC驱动的癌症中起关键作用，因此可能代表了治疗性脆弱性。在这里，我们表明神经母细胞瘤是一种以剪接失调和剪接依赖性为特征的MYC驱动的癌症，需要剪接因子RBM39才能存活。indisulam是一种“分子胶”，其选择性地将RBM39募集到CRL4-DCAF15 E3 E3泛素连接酶以用于蛋白酶体降解，对神经母细胞瘤具有高效的有效性，导致在多种高风险疾病模型中导致无效的无毒性毒性，导致显着反应。遗传耗竭或Indisulam介导的RBM39降解可引起明显的全基因组剪接异常和细胞死亡。从机械上讲，DCAF15对RBM39和高级表达的依赖性决定了神经母细胞瘤对indisulam的精致灵敏度。我们的数据表明，通过精确抑制神经母细胞瘤的脆弱性RBM39来靶向失调的剪接体是一种有效的治疗策略。
MCB4304-Syllabus-2024 Summer
第9周第12章及以后：转录因子，增强剂等。Signal Transduction Chapter 14: Posttranslational modifications RNA processing I, RNA splicing, Introns, Exons Week 10 Chapter 15: RNA processing II CAP, Polyadenylation Chapter 16: Translation Initiation Week 11 Chapter 17: Translation Elongation, Termination Chapter 18: Translation Ribosome Week 12 Chapter 20: DNA replication I: Mechanism, Enzymology, Mutation, and Repair Chapter 21: DNA replication II Detailed机制，终止考试8月3日，请遵循时间表（对于章节，讲座视频，考试等）如画布上发布的。此教学大纲只是提供了课程的概述。
分子生物科学研究所
番茄（Solanum lycopersicum）是全球最重要的作物之一，但其生产力越来越受到全球变暖引起的热应激的威胁。了解番茄热应激反应背后的机制对于制定面对气候变化时增强其韧性的策略至关重要。热应激反应的关键方面是编码热休克蛋白（HSP）的基因的激活，该基因充当分子伴侣，以防止蛋白质折叠和有毒骨料形成。这一过程以及许多其他与热耐碳相关的基因的转录是由热应力转录因子（HSF）驱动的。前mRNA剪接是调节基因表达的重要机制，许多基因响应热应激而进行了替代剪接。然而，在高温下调节替代剪接的机制以及剪接因子在耐热性中的贡献仍然很少了解。丝氨酸/精氨酸（SR）蛋白的成员不仅在植物中，而且在哺乳动物中也被视为替代剪接的核心调节剂。我们的小组最近表明，RS2Z35和RS2Z36是热应激期间替代剪接的重要调节剂。我们已经鉴定出SR46A，这是一种具有两个RS结构域的SR样蛋白，HS高度诱导了热应激敏感性替代剪接的另一个重要调节剂。CRISPR/CAS9介导的突变导致几种基因的表达改变，包括许多HSF和降低热耐耐受性。RNA-seq数据分析确定了在热应激响应的不同阶段中由SR46A调节的差异表达和剪接基因。有趣的是，与RS2Z蛋白相比，SR46A调节了不同的HSF集，因为SR46A的敲除可增强内含子保留率，而与敲除RS2Z基因敲除所致的剪接相反。这些发现提供了对应激适应为基础的分子机制的新见解，并将SR46A识别为番茄替代剪接的核心调节。
修复CRISPR引导的RNA断裂启用站点 -
。STHCSM的RNA裂解在每个切割位点生成2'，3'> P和5'-OH，我们假设RTCB的连接酶活性参与了图中确定的RNA修复。1（中间）。b）用抗RTCB或抗ACTB（加载对照）抗体的蛋白质印迹，用（+）或没有（ - ）RTCB耗竭的293T细胞的裂解物进行抗体。参见图中的未编写图像。S2。c）PARK7成绩单针对5
博士生职位（f/m/d）
邀请申请在Würzburg大学的分子感染生物学研究所的贝斯组中的博士生职位。我们的研究小组于去年9月成立，并将远期遗传学与生物化学结合使用，以了解RNA剪接调节和剪接体组装的初始步骤。剪接是转录后处理的重要步骤。破坏剪接的突变通常会产生有害后果，从而导致从神经肌肉疾病到癌症的广泛疾病。我们的研究小组的目标是对剪接及其在细胞内的调节获得详细的机械理解，不仅了解基本真核生物学，而且了解人类疾病。特别是我们专注于了解剪接站点选择的发生方式以及与剪接体组装的相互作用。剪接体是一种高度复杂的分子机，它将从150多种蛋白质和5个小核RNA中从头开始，以催化其催化。令人着迷的不仅是如何调节该组件，而且是剪接体如何处理其非常多样化的底物池。学生将通过使用多种技术（包括RNA-Seq方法和分子生物学方法）（例如接近标签，IP-MS）和生物化学。资格：
博士生：植物RNA生物学
Wachter组研究了植物中替代RNA剪接的机制和功能（https：//mps-imp.biologie.uni-mainz.de/）。在这个博士学位项目中，将在4R研究生计划“ R-loop调节鲁棒性和弹性”的背景下检查R环与替代剪接之间的可能联系。r环是RNA-DNA杂交结构，以前的研究表明它们参与了基因表达的调节，包括替代剪接。该项目将使用最新技术（例如下一代测序）来检查这些过程的耦合。此外，将研究其可能的机械链接，例如通过分析可以解决R环的酶活性改变的CRISPR/CAS突变体。
DNA 病毒（巴尔的摩 I 类和 II 类）
• 基因组约为 8 kbp • 它们产生两个同向转录本，其差异剪接产生 8-9 种蛋白质 • 转录可从至少两个启动子开始（P 97、P 670）。第一个是早期基因的启动子，第二个是晚期基因的启动子。 • 来自不同启动子的转录本使用不同的终止子（pAE）• 转录本：• P 97 -pAE 导致蛋白质 E6、7、1、5 的剪接和合成。• P 670 -pALs 导致蛋白质 E4、L1 和 L2 的剪接和合成。 • LCR（长控制区）序列包含与启动子相关的增强子。 • E2 蛋白的完整形式作为启动子（特别是早期启动子）的转录激活剂发挥作用，并与 E1 一起诱导复制（在 LCR 中）。