阿尔茨海默氏病(AD)的发病机理取决于环境和可遗传的因素,其分子病因仍然不清楚。在这里,我们提出了对后期发作的零星AD和唐氏综合症(DSAD)的空间转录组(ST)和单核转录组调查。研究DSAD提供了一个机会,可以增强我们对AD转录组的理解,并可能弥合遗传小鼠模型和零星AD之间的差距。我们确定了可能是皮质层依次限定病理积累的转录组变化。空间共表达网络分析揭示了短暂性和区域限制的疾病过程,包括在皮质上层层中失调的神经胶质炎症程序,与AD遗传风险和淀粉样蛋白相关的过程有关。细胞 - 细胞通信分析在信号网络失调中进一步上下文化了该基因程序。最后,我们从淀粉样蛋白AD鼠标模型中生成了ST数据,以识别具有构象上下文的淀粉样蛋白淀粉样蛋白 - 淀粉样蛋白转录组的变化。
摘要:有人提出,成人大脑的功能特征(所有这些都是在生命早期形成的)可能会影响大脑对阿尔茨海默病 (AD) 的易感性。我们之前对衰老加速的 OXYS 大鼠(一种散发性 AD 模型)的研究结果支持这一假设。在这里,为了阐明大脑成熟过程中出现的异常的分子遗传性质,我们分析了 OXYS 大鼠和 Wistar(对照)大鼠在大脑成熟的关键时期(P3 和 P10 岁;P:出生后天数)的前额皮质 (PFC) 和海马的转录组(RNA-seq 数据)。我们在两个大脑结构中发现了 1000 多个差异表达基因;功能分析表明神经元接触形成效率降低,这大概主要是由于线粒体功能缺陷所致。接下来,我们比较了从婴儿期到 AD 样病变进展阶段(共五个年龄段)大鼠 PFC 和海马中差异表达的基因。三种基因( Thoc3 、 Exosc8 和 Smpd4 )在整个生命周期中均在 OXYS 大鼠的两个脑区中表现出过度表达。因此,婴儿期 OXYS 大鼠脑中神经网络形成效率的降低可能是导致其出现 AD 样病变的原因。
1 医院大学癌症研究中心(CUCC)肿瘤科“Dr. José Eleuterio Gonz 是一名女同性恋者”,纽约大学,Av.弗朗西斯科·I·马德罗和大道Gonzalitos s/n,Mitras Centro,蒙特雷 64460,墨西哥; orlando.solisc@gmail.com (操作系统-客户端); hazyadee@gmail.com(HFR-G.); juanfglz@hotmail.com(J.F.G.-G.); ferchoalcorta9@gmail.com(F.A.-N.); dianics83@gmail.com (DCP-I.); vidal_oscar@hotmail.com (OV-G.) 2 纽约大学生物系,Av. Pedro de Alba s/n,Universitaria Ciudad,圣尼古拉斯德洛斯加尔萨,蒙特雷 66450,墨西哥; monicavv2@gmail.com(MPV-V.); karencamarillo01@gmail.com (KPC-C.) 3 纽约大学充实学院,Av.博士José Eleuterio Gonz 拥有 1500 cc,Mitras Centro,蒙特雷 64460,墨西哥; ricardocerda_mx@yahoo.com.mx 4 德克萨斯大学里奥格兰德河谷分校分子科学系,麦卡伦,TX 78502,美国; genaro.ramirezcorrea@utrgv.edu 5 约翰霍普金斯大学医学院儿科系、心脏病学系,美国马里兰州巴尔的摩 21205 * 通讯地址:maria.garzarg@uanl.edu.mx;电话:+52-818-333-8111
引言帕金森氏病(PD)是一种具有复杂病因的多因素疾病。最大的全基因组关联研究(GWAS)包括37,688例病例,18,618例代理案例(未受影响的第一级亲戚)和140万个来自欧洲血统的控制,以及在78个基因组区域中确定的90个独立风险信号;其中38个是新颖的信号1。尽管有这些进展,但PD GWAS目前受到规模的限制,关注欧洲人群以及与临床表型数据的集成有限。基于2019 GWAS数据的功率计算表明,加入额外的〜99,000个案例将使效应大小较小的变体有助于多基因风险(p-值切断:1.35×10 - 3),以达到全基因组范围内的意义。因此,将PD GWA扩展到至少这种大小将导致识别额外的风险基因座并改善PD的遗传预测。可以使用双研究或统计遗传学方法来估计PD的遗传力,并被认为在欧洲人群中占22%至40%。已知的基因组广泛的基因座目前解释了PD 1的遗传力的16%。使用多基因风险评分分析(包括未达到基因组宽重要的基因座)表明,可能有大量的基因座导致尚未定义的PD风险。我们的功率分析表明,将需要99,000个PD病例以80%的功率定义基因座,次要等位基因频率为0.21,并且与当前的最新分析相似。在PD中观察到的表型的变异性可能具有遗传基础2 - 4。对基因型和临床结果之间关联的了解将使临床医生能够为患者提供更准确的预后。了解负责特定PD特征的基因到表型路径将提供一个机会,以开发针对表型的治疗
摘要:尽管经过了数十年的深入研究,但阿尔茨海默病 (AD) 的疾病改良治疗方法仍然非常需要。除了广泛分析的 tau 和淀粉样蛋白病理级联之外,还有两种有希望的研究途径最终可能确定 AD 的新药物靶点,这些研究途径基于对这种疾病的恢复力和易感性机制的更好理解。我们认为,大脑中的胰岛素样生长因子 I (IGF-I) 活性为 AD 的恢复力和易感性机制提供了共同的基础。我们推测,保留的大脑 IGF-I 活性有助于恢复 AD 病理,因为这种生长因子干预了被认为与 AD 有关的所有主要病理级联,包括代谢障碍、蛋白质稳态改变和炎症,这三种被认为是最重要的。相反,许多 AD 风险因素(如年老、2 型糖尿病、饮食不均衡、久坐不动的生活、社交、中风、压力和教育程度低)都存在 IGF-I 活性紊乱,而载脂蛋白 (Apo) E4 基因型和创伤性脑损伤也可能受到脑 IGF-I 活性的影响。因此,在分析这些过程时应考虑 IGF-I 活性,而保持 IGF-I 活性将有助于预防 AD 病理进展。因此,我们需要在所有这些条件下确定 IGF-I 活性并开发一种保持它的方法。然而,确定脑 IGF-I 活性不能仅仅基于这种神经营养因子的体液或组织水平,需要开发新的基于功能的评估方法。
图1在疾病的早期和晚期阶段,具有不同SCJD亚型患者的代表性扩散加权图像。(第一行)具有MM1亚型的患者的早期DWI,该患者在左顶叶皮层(包括前后节)和前额叶皮质丝带中表现出高强度。不同的MM1患者的晚期DWI显示出左脑半球的大多数皮质的不对称参与,与尾状头部,左扣带回和左岛群体结合。(第二行)患有MM2C亚型的患者的早期DWI,在左侧顶叶皮层中出现超强度,包括前神经。不同MV2C患者的晚期DWI显示皮质色带不对称受累;纹状体和丘脑被幸免。(第三行)患有VV1亚型的患者的早期DWI,在左顶皮层中表现高强度,左扣带回和绝缘。不同VV1患者的晚期DWI表现出大脑皮层和右纹状体的广泛不对称受累。thalami和大多数左脑皮质都幸免了。(第四行)MV2K亚型患者的早期DWI,他在纹状体的纹状体和微妙的双侧超强度中表现出了不对称的高强度。不同的MV2K患者的晚期DWI表现出纹状体和整个丘脑中不对称的高强度,以及左额叶皮层和岛菌的轻度参与。顶层皮质幸免。(最后一行)患有VV2亚型患者的早期DWI,在尾状的头部和壳质的前部出现了不对称的DWI高强度,以及丘脑中非常微妙的高强度。具有VV2的不同患者的晚期DWI显示了纹状体和丘脑的广泛超强度,以及左回扣和前额叶皮层。scjd,零星的克鲁特兹菲尔特 - 贾科布疾病; DWI,扩散加权成像。
摘要:包括散发性(SALS)和家族性(FALS)病例的肌萎缩性侧索硬化症(ALS)是一种毁灭性的神经退行性疾病,其特征是运动神经元的进行性变性,导致肌肉萎缩和各种临床表现。但是,尚不清楚影响该疾病的复杂基本机制。另一方面,由于缺乏生物标志物和治疗靶标,该疾病也没有良好的预后。因此,在这项研究中,通过生物信息学分析,使用GEO GSE41414数据集分析了受sals影响的肌肉组织,鉴定了397个差异表达的基因(DEGS)。功能分析显示,与肌肉发育相关的320个上调的DEG和77个与能量代谢相关的下调DEG。蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析确定了20个枢纽基因,包括EIF4A1,HNRNPR和NDUFA4。此外,miRNA靶基因网络揭示了17种与HUB基因相关的miRNA,HSA-MIR-206,HSA-MIR-133B和HSA-MIR-100-5P先前与ALS有关。这项研究通过将获得的信息与全面的文献综述相关联,为ALS提供了新的潜在生物标志物和治疗靶标,从而提供了研究其在ALS中作用的新潜在目标。
摘要 散发性克雅氏病 (sCJD) 是一种传染性脑蛋白病。目前主要有五种临床病理亚型 (sCJD-MM(V)1、-MM(V)2C、-MV2K、-VV1 和 -VV2)。组织病理学证据表明,朊病毒聚集体和海绵状病变的定位因亚型而异。确定是否存在可检测成像异常的初始部位(震中)以及病变扩散的顺序将有助于疾病的早期诊断、患者分期、管理和临床试验招募。扩散磁共振成像 (MRI) 是检测海绵状变性最常用和最敏感的测试。本研究旨在使用弥散加权图像 (DWI) 在已知最大的经尸检证实的 sCJD 患者横断面数据集中首次在体内识别脑内亚型依赖性震中和病变传播。我们使用基于事件的建模(一种成熟的数据驱动技术)通过横断面 DWI 估计病变传播。1 名不知诊断的神经放射科医生对 594 名经尸检诊断的受试者(448 名 sCJD 患者)的 12 个大脑区域的 DWI 异常进行评分。我们使用基于事件的模型重建了五种纯亚型中病变传播的顺序。151 名患者的随访数据验证了估计的序列。结果表明,病变传播的中心和顺序是亚型特异性的。两种最常见的亚型(-MM1 和 -VV2)显示出相反的 DWI 异常出现顺序:分别从新皮质到皮质下区域,反之亦然。楔前叶也是 -MM2 和 -VV1 中最有可能的中心,尽管与 -MM1 不同,在扣带回和岛叶皮质中也检测到了早期异常信号。-MV2K 中复制了表征 -VV2 的病变传播尾部-喙部序列。这些数据驱动模型结合起来,提供了前所未有的动态洞察,可以洞察病理过程开始和传播时亚型特异性中心,这也可能增强早期诊断并实现 sCJD 的疾病分期。
1 npdpsc> 20,000 124,692正否推定零星可能的可能2 npdpsc> 20,000 53,476阳性是阳性是偶发性的3 npdpsc> 20,000> 20,000> 20,000> 160,000> 160,000否否否否假定偶发性的可能4 npdpsc 11,625 88,341 sporite sporitce sporite sporite sporite sporite sporite 5 npdps sporite 5 npdd spordite 5 npddpd spordient dictite 5 npdd sporadic sporadient 5 npddd sporadient sporadic sporadic sporadient 5 No Presumed sporadic Probable 6 NPDPSC >20,000 >160,000 Positive Yes Sporadic Definite 7 NPDPSC 11,561 58,190 Positive Yes Familial Definite 8 NPDPSC 2,821 26,658 Positive Yes Sporadic Definite 9 NPDPSC >20,000 >160,000 Positive Yes Sporadic Definite 10 NPDPSC 14,414 47,858 Positive Yes Sporadic Definite 11 None N/A N/A N/A Yes Sporadic Definite 12 NPDPSC >20,000 115,296 Positive No Presumed sporadic Probable 13 None N/A N/A N/A No Presumed familial Probable 14 NPDPSC 8,202 34,341 Positive Yes Sporadic Definite 15 NPDPSC >20,000 106,795 Positive Yes Sporadic Definite *rt-Quic(实时Quaking引起的转换)于2015年4月在NPDPSC上发售。它是在阳性14-3-3蛋白或T-TAU下进行反射测试的,值为500 pg/ml或更高2015-2019。rt-quic在2019年1月开始对所有样品进行。CJD偶发,家族,医源性和变体CJD案例定义的案例定义请参见:http://wwwww.cdc.gov/prions/prions clions cjd/cjd/cjd/cjd/cjd/cjd/ccriteria.http://
越来越多的证据表明,表观遗传学在调节所有类型主动脉瘤的发病机制中也起着关键作用。众所周知,表观遗传因素会调节基因表达。这种机制似乎很有趣,尤其是了解遗传易感性和遗传因素与主动脉瘤和散发性动脉瘤复杂病理生理学的关系;事实上,后者是遗传因素和可改变的生活方式因素(即营养、吸烟、感染、吸毒、饮酒、久坐的生活方式等)密切相互作用的结果。表观遗传因素包括 DNA 甲基化、翻译后组蛋白修饰和非编码 RNA。在这里,我们的注意力集中在 miRNA 在综合征型和散发型胸主动脉瘤中的作用。它们既可以作为生物标志物,也可以作为新治疗策略的靶点。
