antoea物种在陆地和水生环境中都是无处不在的细菌,并且已经在动物,昆虫和人类中分离出来,尽管31种公认的物种(1)中的大多数都与植物相关(2)。先前在人类感染中报道的pantoea物种包括P. groclomer- Ans,P。ananatis,P。Brenneri,P。Calida,P。Comcpicua,P。dispersa,P。Eucrina和P. septica; P. groclomerans是最常见的(2)。P。Stewartii是Stewart在甜玉米和玉米中的枯萎病因,于1890年代后期首次被发现。研究人员根据宿主范围提出了2个亚种,基于宿主范围:Stewartii和Indologenes(3)。与Stewartii的亚种不同,亚种元素对玉米是非致病性的,而是在其他具有农艺意义的农作物中引起疾病,例如Foxtail Mil-Let-Let,Pearl Millet和洋葱。由于这种生物体(尤其是Stewartii的亚种)对经济上关键的作物构成风险,因此许多国家将P. stewartii归类为隔离有机体(4,5)。
摘要:亚马逊雨林是物种数量和众多的近卫生关系中的超多样性生态系统。为了表征占主导地位和经济重要的亚马逊物种,巴西坚果树(Bertholletia Excelsa Bonpl。),在基因组水平上,从单个个体的叶子中引发了高覆盖的长阅读测序数据。基因组组装揭示了一个意外的发现:两个可以分配给染色体的圆形重叠群和pantoea stewartii菌株的质粒。比较基因组学表明,该菌株属于独立元素亚种,并与从新热带棕榈bactris gasipaes kunth的患病叶片中分离出的其他菌株高度同步。对致病性相关基因的研究揭示了质粒中没有整个III型分泌系统基因簇,质粒否则与已知在Dracaena Sanderiana Mast中引起疾病的分离物的质粒高度相似。相反,检测到与植物生长有关的几种基因,包括参与吲哚-3-乙酸(IAA)产生的基因,磷酸盐溶解和辅助载体的生物合成。总而言之,我们报告了未经培养的Stewartii亚种的基因组。与巴西坚果树相关的植物菌株,并可能是植物生长的细菌。
无花果果实是生物活性化合物的重要来源,例如类黄酮,苯甲醛,生物碱,萜类化合物和苯酚,它们是抗菌无花果果实作为类黄酮的来源,具有抗生素活性,与内部生物学植物的作用不可分割,使得内属菌丝的作用不可分割。研究包括内生细菌在内的微生物的多样性并不容易,因为环境中有99%的微生物是不可培养的物种,因此需要进行分析,能够研究而没有称为宏观概念的内生细菌的多样性。这项研究的目的是确定在这些内生细菌中有用的无花果水果和预测基因中内生细菌的多样性。研究方法指的是无花果组织DNA提取,16S rRNA基因扩增,电泳,下一代测序和使用操作分类学单元进行分析的研究方法。The results of species-level endophytic bacterial diversity obtained on Fig fruit (Ficus carica L.) varieties Gren Yordan are Weissella ghanensis, Weissella paramesenteroides, Ralstonia pickettii, Leuconostoc citreum, Pantoea stewartii, Gluconobacter cerinus, Lactococcus lactis.