葡萄树干疾病(GTD)给全球葡萄行业造成严重的经济损失(Fontaine等,2016b; Mondello等,2018a)。休闲药包括各种分类学上的真菌(Gramaje等,2018; Mondello等人,2018b),可以单独或一起影响植物。除了在叶子和簇上引起外部症状外,这些病原体还会引起内部木材变色。症状表达中不可预测的不连续性是这些疾病的特征(Mugnai等,1999)。GTD包括影响成年和年轻葡萄藤的一系列疾病。esca复合物,杂化磷酸盐死亡和尤特巴死亡被认为是成年葡萄藤的主要GTD(Claverie等,2020)。ESCA复合物与许多系统发育多样的真菌有关(Mugnai等,1999),包括ascomycota和basidiomycota。与ESCA相关的comycetes包括血管病原体phaeomoniella chlamydospora和phaeoacremonium最低限度(Syn。pm。Aleophilum)(u rbez-Torres等,2014)和其他phaeoacremonium。Wood-decay basidiomycetes include Fomitiporia mediterranea in Europe ( Moretti et al., 2021 ), and other pathogens belonging to the genera Fomitiporella, Fomitiporia, Inocutis, Inonotus, Stereum , and Phellinus in non-European countries ( Cloete et al., 2011 ; White et al., 2011 );这些真菌已从受感染的葡萄树干中分离出来,但是它们在疾病病因学中的作用尚未完全了解(Surico等,2006; Bertsch等,2013; Gramaje等,2018),并且在近年来被重新考虑。botryosphaeria dieback是由20种以上的杂化磷酶科引起的,包括dothidea N. Luteum,N。Rib,Eliplodia Serita和D. Mutila(Van Niekerk等,2004; Taylor等,2005;ÚRbez-Torres and Gubler,2009; Amponsah et al。 2013)。eutypa dieback是由eutypa lata和其他diatrypaceai特殊的特殊的(Trouillas and Gubler,2010; Luque等,2012)。这些病原体可以单独从受影响的木材中回收,也可以与其他真菌(例如PA)相结合。衣原体,下午。Aleophilum,Sphaeropsis Mariorum和Diaporthempelina(PéRros等,1999)。GTD症状是多缩的,包括马刺和手臂的死亡,木材的变色或内部条纹,扇形木材坏死和白色腐烂;由于植物可以同时受到多种真菌的影响,因此在其中GTD中,某些症状可能重叠(Gramaje等,2018)。木材变色和de骨是由多种结构和生理变化引起的,由真菌产生的纤维素分解和木质素溶酶,由于凝胶和牙龈由联邦木质部分泌的凝胶和牙龈引起的血管闭塞细胞或木质部实质细胞的坏死,导致真菌毒素(Bertsch等,2013; Claverie等,2020)。所有这些变化都会导致木质部伏特定功能的木质部发生变化,从而导致水和养分运动(Mugnai等,1999; Sparapano等,2000; Andol和Andol et et al。,2011)。最近报道了(Mondello等,2018b),详细描述了与不同GTD的症状。叶子从未分离出GTD真菌(Bertsch等,2013),也显示了多种症状,也已经描述过这些症状(Mugnai等,1999;Amborabé等,2001; Mondello et al。,2018b);木材和木质部血管改变,真菌毒素和继发代谢物的沉积均有助于
植物已经发展出复杂的防御机制,以避免入侵潜在的病原体。尽管如此,改编的病原体部署效应子蛋白来操纵宿主的敏感性(S)基因,使植物防御能力无效。通过细菌病原体利用的植物基因的识别和突变对于产生具有持久和广谱耐药性的农作物很重要。由于潜在的多效性,突变体基因在抗性作物中的繁殖受到限制。新的基因组编辑技术为S基因的修饰开辟了新的可能性。在这篇综述中,我们着重于通过细菌操纵的S基因,并提出了其识别和精确修饰的方法。最后,我们提出编码转运蛋白的基因代表了一组新的S基因。
1 免疫学-疫苗学,传染病和寄生虫病系,动物与健康基础与应用研究(FARAH),列日大学兽医学院,B-4000 列日,比利时 2 斑马鱼发育与疾病模型实验室,GIGA-疾病分子生物学,列日大学,B-4000 列日,比利时 3 MRC-格拉斯哥大学病毒研究中心,格拉斯哥 G61 1QH,英国 4 UMR-I 02 环境应激与水环境生物监测(SEBIO),UFR 精确与自然科学,兰斯香槟阿登大学,CEDEX 2,51687 兰斯,法国 5 香农理工大学生物科学研究所, N37 HD68 阿斯隆,韦斯特米斯郡,爱尔兰 * 通信地址:owen.donohoe@uliege.be (OD);a.vdplasschen@uliege.be (AV);电话:+32-4-366-43-79 (OD);+32-486-45-13-53 (AV) † 这些作者对本文的贡献相同。
各种病原体严重威胁到番茄的产量和质量。理解植物病原体相互作用的进步揭示了抗药性(R)和易感性(S)基因在确定植物免疫中的复杂作用。虽然R基因具有靶向的病原体耐药性,但它们通常容易受到病原体的进化。相反,S基因为通过靶向基因编辑发展广谱和耐用的阻力提供了有希望的途径。基于CRISPR/CAS的技术的最新突破已经彻底改变了对植物基因组的操纵,从而实现了S基因的精确修饰,以增强番茄疾病的耐药性,而不会损害生长或质量。然而,由于复杂的植物病原体相互作用和当前的技术局限性,该技术的全部潜力的利用是具有挑战性的。本评论强调了使用基因编辑工具剖析和设计番茄基因以提高免疫力的关键进展。我们讨论了S基因如何影响病原体的进入,免疫抑制和营养获取,以及其目标编辑如何赋予细菌,真菌和病毒病原体的抗性。此外,我们解决了与生长防御权衡取舍相关的挑战,并提出了诸如荷尔蒙途径调制和精确的监管编辑之类的策略,以克服这些限制。这篇综述强调了基于CRISPR的方法来改变番茄育种的潜力,为在全球粮食安全挑战升级的情况下,为可持续生产抗病品种铺平了道路。
郑山(Div>):美国孟菲斯丹尼·托马斯(Danny Thomas Place)262,美国孟菲斯(Memphis),美国田纳西州38105,圣裘德儿童研究医院应用生物信息学研究中心高级生物信息学研究科学家;电子邮件:cheng.zhong.shan@gmail.com
金黄色葡萄球菌(金黄色葡萄球菌)是一种显着的人类病原体,特别是在患有潜在疾病的患者中。它配备了各种毒力因子,可实现定殖和侵入性疾病。表现的范围很广,从超级皮肤感染到威胁生命的疾病,例如肺炎和败血症。是医疗保健相关感染的主要原因,非常需要理解葡萄球菌免疫和防御机制。经常患有病理感染易感性的先天免疫误差(IEI)患者,但是,并非所有人都容易发生金黄色葡萄球菌感染。因此,金黄色葡萄球菌感染的频率或严重程度增强可以作为特定潜在免疫学障碍的临床指标。此外,对金黄色葡萄球菌敏感的患者的免疫功能的分析为了解葡萄球菌毒力和宿主免疫倾向之间的复杂相互作用提供了独特的机会。虽然众所周知,定量和定性正常中性粒细胞的重要性是对特异性细胞因子(例如功能白介素(IL)-6信号传导)的作用的认识。这篇评论鉴于其对金黄色葡萄球菌的敏感性,对著名的IEI进行了分类,并讨论了相关的相关病理机制。了解易感人群的金黄色葡萄球菌感染中的宿主病原体互动可以为更有效的管理和预防治疗方案铺平道路。最终,增强对此外,这些见解可能有助于确定应该对基础IEI进行筛选的患者。
1 研究与创新中心,Fondazione Edmund Mach,Via E. Mach 1, 38098 San Michele all'Adige,意大利;carlotta.pirrello@unipd.it(CP);giulia.malacarne@fmach.it(GM);marco.moretto@fmach.it(MM);lenzi.luisa@gmail.com(LL);michele.perazzolli@fmach.it(MP);stefania.pilati@fmach.it(SP); claudio.moser@fmach.it (CM) 2 乌迪内大学农业、食品、环境与动物科学系,Via delle Scienze 206, 33100 Udine, 意大利 3 特伦托大学农业食品环境中心(C3A),Via E. Mach 1, 38098 San Michele all'Adige,意大利 4 SciENZA Biotechnologies BV,Sciencepark 904, 1098 XH Amsterdam,荷兰;T.Zeilmaker@enzazaden.nl 5 植物-微生物相互作用,乌得勒支大学生物学系,Padualaan 8, 3584 CH Utrecht,荷兰; g.vandenackerveken@uu.nl * 通讯地址:lisa.giacomelli@fmach.it † 现地址:意大利帕多瓦大学农学、食品、自然资源、动物和环境系,Agripolis 校区,V.le dell'Università 16,35020 Legnaro。‡ 这些作者对本研究的贡献相同。
图1牙周发炎表面积(PISA)改良和未改进的组的临床特征。(a)在29例2型糖尿病患者中显示PISA的直方图显示双峰分布,将患者分为PISA改良(<5.0 mm 2)和未改良(≥5.0mm 2)组。(b)PISA改良和未改进的组之间牙周指标变化的差异 * P <0.05,** P <0.01。(c)在PISA改良和未改进的组之间血糖控制治疗之前的临床指标值中可以观察到显着差异。* P <0.05。(d)可以观察到PISA的PISA变化与PISA改良组的全身指标之间的正相关性。abi,踝臂压力指数; ACAC,乙酸; BHB,β-羟基丁酸; BOP,探测出血; Cal,临床依恋水平; CPI,C肽指数; CVRR,R-R间隔变化系数; FPG,禁食等离子体葡萄糖; Imp,PISA改良的小组; NS,不重要; PLI,斑块指数; PISA/牙齿,牙周发炎的表面积/残留牙齿的数量; PPD,探测口袋深度; Unimp,PISA未经改进的组。
从船舶和乘客安全的角度来看,对客船运行脆弱性和事故敏感性进行持续监测和评估至关重要。尽管现有的脆弱性监测解决方案主要源于水密门操作,但文献中缺少事故敏感性评估和监测的综合框架。因此,本文提供了一种简单的方法,利用根植于与人类表现相关的第一原理的坚实基础的启发式方法。所提出的方法可以评估在公海和沿海航行中运行的船舶的事故敏感性。所提出的框架基于可观察和相关因素,已知这些因素会影响导航员的表现,从而影响事故概率。所开发模型的框架布局和参数基于海事和航空领域的文献调查、从海事专家那里获得的知识以及使用内部开发的船舶相遇模拟器进行的广泛模拟。随后,该模型应用于选定的案例研究,涉及两种不同的船舶类型,即大型游轮和 RoPax 船。本文所介绍的案例研究的结果表明,所分析的船舶在大多数时间的事故敏感性可忽略不计(87%),而 1% 的案例被标记为非常高的事故敏感性。剩余的 12% 分布在事故敏感性的低、中和高值之间。结果与之前在同一领域进行但采用不同方法的研究一致。所提出的解决方案可用作船上决策支持工具,评估操作事故的敏感性和脆弱性,从而提高船员的态势感知能力。此外,它还可以应用于历史数据,允许船舶航行安全诊断和实施适当的对策。