(a)SMARCA2和SMARCA4是SWI/SNF复合物的核心催化亚基,它们通过重塑染色质在控制基因表达中起着重要作用。Smarca4在多种癌症中突变,而缺乏Smarca4的癌细胞可以高度依赖Smarca2的生存。因此,使用选择性smarca2降解器在Smarca4删除的癌症中靶向Smarca2会诱导合成的致死性,同时避免Smarca4野生型正常细胞。 (b)具有SMARCA4破坏突变或低表达的细胞系显示较高的SMARCA2基因依赖性评分,表明靶向Smarca2和Smarca4缺陷的合成致死关系; (c)不同类型癌症中SMARCA4突变的百分比。数据集来自混合研究(2021年8月从CBIOPORTAL提取的数据); (d)除了破坏突变(“ Smarca4蛋白的丧失”)之外,一些肿瘤在其ATP结合位点或DNA结合位点附近表达Smarca4热点错义突变,从而可能改变Smarca4的生物学功能。正在研究表达这种突变的癌细胞的敏感性。
BRG1/BRM(SMARCA4/SMARCA2)是SWI/SNF复合物的关键组成部分,在调节控制细胞命运和身份的转录程序中至关重要。肿瘤细胞异常上调BRG1水平,劫持了“茎特征”。此外,BRG1已被证明会影响免疫细胞极化,驱动与T细胞耗尽和免疫抑制细胞状态相关的程序。我们的小组先前证明,FHD-286和抗PD-1抗体的组合在来自各个谱系的合成小鼠模型中是协同的,并且将肿瘤微环境(TME)实质上转移到了更肿瘤的杀伤状态(Ichikawa,K. 2022,SITC)。FHD-286在1期剂量升级(FHD-286-001,NCT04879017)中评估,转移性卵生黑色素瘤(MUM)是一种对标准免疫检查点疗法的缓解率较低的肿瘤(MUM),以及高水平的免疫抑制细胞抑制。因此,我们努力确定是否有证据表明在转移性紫veal瘤患者中,从我们的1期剂量升级中取出的样品中外周血和TME转移的生物学变化。
摘要 增强子-启动子环路模型长期以来一直主导着基因调控领域,其中增强子通过物理接触激活其靶基因。然而,由于存在替代机制的证据以及缺乏系统验证(主要是由于缺乏合适的实验技术),该模型的普遍性受到了质疑。在本研究中,我们提出了一种新的基于 MNase 的邻近连接方法,称为 MChIP-C,该方法可以在基因组范围内以单核小体分辨率测量蛋白质介导的染色质相互作用。通过应用 MChIP-C 研究 K562 细胞中以 H3K4me3 启动子为中心的相互作用,我们发现与基于限制性内切酶的 C 方法相比,它具有大大提高的分辨率和灵敏度。这使我们能够将 EP300 组蛋白乙酰转移酶和 SWI/SNF 重塑复合物确定为建立和/或维持增强子-启动子相互作用的潜在候选者。最后,利用已发表的 CRISPRi 筛选数据,我们发现大多数经过功能验证的增强子确实与其同源启动子发生物理相互作用,支持增强子-启动子环路模型。
基于基因型的癌症治疗,即用高选择性分子靶向致癌突变改变的信号通路,对癌症治疗大有裨益,因为这些靶向药物通常可导致显著的临床反应并且毒性降低。但并非所有癌症驱动突变都可以用药治疗。例如,肿瘤抑制基因的功能丧失改变就不是直接靶向的。影响 SWI/SNF 染色质重塑/肿瘤抑制基因复合物各种亚基的突变,例如编码两种互斥的 ATPase 之一的 SMARCA4,存在于约 25% 的人类癌症中。SMARCA4 的旁系同源物 SMARCA2 很少发生突变,但在肿瘤中常常发生表观遗传沉默。SMARCA4/2 同时丧失是卵巢癌和肺癌亚组的特征,与非常差的预后有关。除了肿瘤抑制基因缺失之外,一些激活性致癌突变(如 KRAS 中的突变)已被证明很难靶向。尽管 RAS 抑制剂 sotorasib 最近获批用于治疗反应率低于 50% 的 KRAS G12C 肺癌,但它对其他 KRAS 突变无效。因此,需要替代治疗方案来靶向这些仍然难以治疗的癌症。
缩写:AD,阿尔茨海默氏症的痴呆症;柏林高级神经影像中心BCAN; CAM(-ICU),混乱评估方法(重症监护室); CI,置信区间; CSF,脑脊液;达特尔(Dartel),通过凸起的谎言代数来分配解剖学登记; DF,自由度; DSM,精神障碍的诊断和统计手册; “ G”,全球认知成分; GPT,凹槽的Pegboard测试; ISPOCD,术后认知功能障碍的国际研究; mprage,磁化制备的快速采集梯度回声; MRI,磁共振成像; MMSE,迷你委员会检查; NUDESC,护理ir妄筛查量表;或优势比; PAL,配对的助理学习测试; (P)BFC,(后)基底前脑胆碱能系统; PCA,主成分分析; PD,帕金森氏病;豆荚,术后del妄; POCD,术后认知功能障碍; ROI,感兴趣的地区; SRT,简单的反应任务; SWI,易感性加权成像; TE,回声时间; TMT-B,越野测试,B部分; TR,重复时间; VRM,言语识别记忆。
引入子宫壁上的胚胎植入是哺乳动物繁殖的关键步骤(1)。在人类中,每月周期的自然出生最大繁殖力约为30%。在GES的前20周中,超过40%至50%的概念损失了,大约75%的未成功怀孕是由于植入失败而导致的(2)。成功需要在主管胚胎胚泡和接受性子宫之间进行同步。在孕酮(P 4)和雌激素(E 2)(3,4)的控制下,子宫内膜上皮和基质的增殖和基质的增殖和分化受到了时间限制的“植入窗口”(3,4)。子宫上皮 - 核串扰涉及内分泌,少细胞蛋白和近去分花相互作用,这对于成功植入至关重要(1,3)。发育程序由染色质调节剂精确控制,这些调节剂通过基因组的表观遗传修饰来维持特定的基因表达。然而,基因的染色质重塑和时空表达的细节,这些基因指导适当的上皮巨质相互作用以确保子宫接受能力在很大程度上没有探索。作为开关/蔗糖不可发酵(SWI/SNF)染色质复合物PBAF PBAF的关键亚基,Polybromo-1-(PBRM1)编码梵天相关的基因1-相关(BRG1- AS-社会化)因子180(BAF180)(BAF180)(BAF180),该(A)(BAF180),该(A)目标
脑微出血是低信号的、小的、圆形或卵圆形的病变 [1, 2];在具有梯度回波、T2* 或磁敏感加权 (SWI) 成像的磁共振成像 (MRI) 上可见 [3, 4, 5]。脑微出血的评估主要通过目视检查进行,使用经过验证的评分量表,例如微出血解剖评分量表 (MARS)[6] 或脑观察者微出血量表 (BOMBS)[7]。在过去十年中,在深度学习技术在医学图像分析中兴起之前 [8],已经开发出用于辅助脑微出血检测的半自动化工具。这些包括基于统一分割 [9]、支持向量机 [10] 或径向对称变换 [11, 12, 13] 的技术。近年来,由于深度学习技术的巨大进步,全自动微出血检测方法的数量大幅增加[14、15、16、17、18]。在本文中,我们探索使用 nnU-Net[19] 作为微出血分割的全自动工具。这种基于深度学习的自配置语义分割方法在许多国际生物医学分割竞赛中表现出色[20],但尚未应用于脑微出血检测和分割任务。
基因id名称ENSMUSG0000000018796酰基-COA合成型长链家族成员1(ACSL1)ENSMUSG0000000000209994 PININ(PNN)ENSMUSG000000000026987溴模块附近的溴模域,与锌指域相邻,2B(BAZ2B)ENSMUSMUSG00310101010101010101010101010101010101010101010101010101010101010101010101010101010101010010染色体(USP9X)ENSMUSG0000000026207 SPEG COMPLEX基因座(SPEG)ENSMUSG00000000000039197腺苷激酶(ADK)Ensmusg0000000098812 MicroRNA 7578(miR7578) Ensmusg0000000031871 cadherin 5(CDH5)Ensmusg0000000033365 Importin 13(IPO13)Ensmusg000000000020464 polyribonucleotide核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸转移剂1(PNPT1) Ensmusg0000000037058聚腺苷结合蛋白相互作用蛋白2(PAIP2)Ensmusg00000000000042719 N(Alpha) - 乙基转移酶25,NATB辅助亚基(NaA25) ENSMUSG0000000022214 DDB1和CUL4相关因子11(DCAF11)Ensmusg0000000000000014426有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶激酶激酶4(MAP3K4)ENSMUSG000000000028626,IX型,Alpha 2pp collpha 2ppe(Col9aa2) (KLF6)ENSMUSG00000052798核孔蛋白107(NUP107)ENSMUSG000000000031446 CULLIN 4A(CUL4A)ENSMUSG0000000026926肽酶(线粒体处理 ENSMUSG00000072612 predicted gene 10382 (Gm10382) ENSMUSG00000045868 GTPase, very large interferon inducible 1 (Gvin1) ENSMUSG00000031715 SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of
9:30-9:40 通过 ATX020 抑制 KIF18A,可通过与染色体不稳定性发生的合成致死相互作用导致有丝分裂停滞和强大的抗肿瘤活性* Maureen Lynes,Accent Therapeutics,马萨诸塞州列克星敦 9:40-9:45 讨论/问答 9:45-9:55 Nimbolide 靶向 RNF114 诱导 PARP1 的捕获和 BRCA 突变癌症中的合成致死* Yonghao Yu,哥伦比亚大学瓦格洛斯内科与外科医学院,纽约,纽约 9:55-10:00 讨论/问答休息 上午 10:00-10:30 | Grand Salon Opera Foyer 不符合 CME 资格 全体会议 2:合成致死机制 上午 10:30-12:30 | Grand Salon Opera AB 会议主席:Zuzana Tothova,Dana-Farber 癌症研究所,马萨诸塞州波士顿 CME 合格 10:30-10:50 黏连蛋白突变型髓系恶性肿瘤的治疗脆弱性 Zuzana Tothova 10:50-11:00 讨论/问答 11:00-11:20 SWI/SNF 突变型癌症的合成致死率 Charles W.M.Roberts,圣犹大儿童研究医院,田纳西州孟菲斯 11:20-11:30 讨论/问答 11:30-11:50 RAP1GDS1 的长异构体是 RAS 驱动的肺腺癌中的合成脆弱性 E. Alejandro Sweet-Cordero,加利福尼亚大学旧金山分校,加利福尼亚州旧金山
昆士兰州双胞胎青少年大脑项目,一项对青少年脑发育的纵向研究Lachlan T. Strike 1,Narelle K. Hansell 1,Kai-Hsiang Chuang 1,2,Jessica L. Miller 1,Greig I. de Zubicaray 3,Paul M. Thompson 4,Paul M. Thompson 4,Paul M. Thompson 4,Katie L. McMargaret 5,Margaret 5,Margaret 5,Margaret < 昆士兰大学昆士兰州脑研究所,布里斯班,昆士兰州4072,澳大利亚2。 昆士兰州大学高级成像中心,布里斯班,QLD 4072,澳大利亚3。 昆士兰技术大学卫生学院心理学与咨询学院,澳大利亚昆士兰州库尔文·格罗夫(Kelvin Grove),澳大利亚4059 4. 成像遗传学中心,Mark&Mary Stevens神经影像学研究所,凯克医学院,南加州大学,美国洛杉矶,美国5。 昆士兰科技大学生物医学技术中心,昆士兰州布里斯班,昆士班,澳大利亚4000,澳大利亚通讯作者:Lachlan T. Strike(L.Strike1@uq.edu.au),我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)数据集(QTAB)数据集和详细的方法论,我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)。 QTAB数据集包含多模式神经影像学,以及在两个会话中收集的青少年双胞胎中收集的认知和心理健康数据(会议1:n = 422,年龄9-14岁;会议2:n = 304,10 - 10 - 6年)。 MRI方案由T1加权(MP2RAGE),T2加权,FLAIR,高分辨率TSE,SWI,静止状态fMRI,DWI和ASL扫描组成。 在第2节中添加了两个fMRI任务:情感冲突任务和一个被动的电影观看任务。 在扫描仪之外,我们使用标准化测试评估了认知功能。昆士兰大学昆士兰州脑研究所,布里斯班,昆士兰州4072,澳大利亚2。昆士兰州大学高级成像中心,布里斯班,QLD 4072,澳大利亚3。昆士兰技术大学卫生学院心理学与咨询学院,澳大利亚昆士兰州库尔文·格罗夫(Kelvin Grove),澳大利亚4059 4.成像遗传学中心,Mark&Mary Stevens神经影像学研究所,凯克医学院,南加州大学,美国洛杉矶,美国5。昆士兰科技大学生物医学技术中心,昆士兰州布里斯班,昆士班,澳大利亚4000,澳大利亚通讯作者:Lachlan T. Strike(L.Strike1@uq.edu.au),我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)数据集(QTAB)数据集和详细的方法论,我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)。 QTAB数据集包含多模式神经影像学,以及在两个会话中收集的青少年双胞胎中收集的认知和心理健康数据(会议1:n = 422,年龄9-14岁;会议2:n = 304,10 - 10 - 6年)。 MRI方案由T1加权(MP2RAGE),T2加权,FLAIR,高分辨率TSE,SWI,静止状态fMRI,DWI和ASL扫描组成。 在第2节中添加了两个fMRI任务:情感冲突任务和一个被动的电影观看任务。 在扫描仪之外,我们使用标准化测试评估了认知功能。昆士兰科技大学生物医学技术中心,昆士兰州布里斯班,昆士班,澳大利亚4000,澳大利亚通讯作者:Lachlan T. Strike(L.Strike1@uq.edu.au),我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)数据集(QTAB)数据集和详细的方法论,我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)。 QTAB数据集包含多模式神经影像学,以及在两个会话中收集的青少年双胞胎中收集的认知和心理健康数据(会议1:n = 422,年龄9-14岁;会议2:n = 304,10 - 10 - 6年)。 MRI方案由T1加权(MP2RAGE),T2加权,FLAIR,高分辨率TSE,SWI,静止状态fMRI,DWI和ASL扫描组成。 在第2节中添加了两个fMRI任务:情感冲突任务和一个被动的电影观看任务。 在扫描仪之外,我们使用标准化测试评估了认知功能。昆士兰科技大学生物医学技术中心,昆士兰州布里斯班,昆士班,澳大利亚4000,澳大利亚通讯作者:Lachlan T. Strike(L.Strike1@uq.edu.au),我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)数据集(QTAB)数据集和详细的方法论,我们描述了Queensland Twin Adbortent Brain(QTAB)。QTAB数据集包含多模式神经影像学,以及在两个会话中收集的青少年双胞胎中收集的认知和心理健康数据(会议1:n = 422,年龄9-14岁;会议2:n = 304,10 - 10 - 6年)。MRI方案由T1加权(MP2RAGE),T2加权,FLAIR,高分辨率TSE,SWI,静止状态fMRI,DWI和ASL扫描组成。在第2节中添加了两个fMRI任务:情感冲突任务和一个被动的电影观看任务。在扫描仪之外,我们使用标准化测试评估了认知功能。我们还获得了焦虑和抑郁,感知压力,嗜睡,青春期发展措施以及风险和保护因素的自我报告。我们还收集了几种生物样品进行基因组和宏基因组分析。建立了QTAB项目,以促进青春期与健康相关的研究。背景和摘要青春期对于理解与抑郁症相关的大脑变化至关重要,因为将近一半的终身诊断开始于14岁开始。经历抑郁症的青少年更有可能是成年人的精神和身体健康,教育水平较低,薪水较低以及更多的关系困难5-7。在青春期,大脑的认知控制,情感和与奖励相关的电路正在经历重大发展8,9 - 受限制睡眠可能损害的发育变化,这在青少年10中很常见。此外,人们认为与青春期发展相关的激素激增和随之而来的身体成熟被认为会影响大脑发育,社会认知和同伴关系的多个方面11。