XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemSwi
2025; 15（8）：3316-3331。 doi：10.7150/thno.100793研究论文PBRM1缺乏效率通过染色体coscectibil
理由：据报道，肿瘤细胞表观遗传学，尤其是染色体可及性，与肿瘤免疫景观和免疫疗法密切相关。但是，确切的机制仍然未知。方法：使用全外活体测序分析13个用PD1免疫疗法治疗的结直肠肿瘤样品。使用测序（ATAC-SEQ）和RNA测序进行转座酶可访问的染色质测定法用于检测肿瘤细胞的染色体可及性状态和筛查调节途径。结果：Polybromo-1（PBRM1）是12个与免疫疗法敏感性相关的体细胞突变频率最高的基因之一。PBRM1/PBRM1结直肠癌的缺乏症促进了体内和体外微环境中CD8 + T和NK细胞的PD-1免疫疗法敏感性以及CD8 + T和NK细胞的趋化性。ATAC测序表明，SWI/SNF复合物的关键成分的缺失增加了肿瘤细胞中染色体可及性的增加，并通过激活NF-κB信号传导途径触发细胞因子的释放，例如CCL5和CXCL10。在BALB/C小鼠或结直肠患者衍生的肿瘤器官（PDTOS）中应用ACBL1（PRM1的ProC抑制剂）显着促进了对PD1抗体免疫疗法的敏感性。结论：我们的研究确定PBRM1/PBRM1缺乏症与结直肠癌的PD1免疫治疗敏感性呈正相关。基本的分子机制涉及调节染色体可及性，NF-κB信号通路的激活以及微环境中的免疫细胞浸润。这些发现确定了潜在的分子靶标，以增强结直肠癌的免疫疗法。
新视野 SWAP 实验测量的行星际冲击波能量功率谱：一维全粒子模拟与观测结果
一维粒子模拟 (PIC) 用于分析新视野号绕冥王星太阳风 (SWAP) 仪器在距离太阳约 34 天文单位处观测到的行星际激波上游区域测得的能谱。使用单个种群模拟不同的太阳风离子 (SWI) 和拾取离子 (PUI) 种群，我们可以清楚地识别出每个种群对全球能谱的贡献。强调了激波前沿倾斜度在沿磁场流回远离前沿的上游区域的 PUI 形成中的重要作用。在本模拟中可以很好地恢复 SWAP 实验测得的能谱。详细分析表明：(1) 能谱的最高部分主要由回流的 PUI-H + 和 PUI-He + 形成； (2) 能谱的中间部分由太阳风 SW-H + 和 SW-He 2+ 入射离子组成，这些离子叠加在 PUI-H + 粒子群上，(3) 低能范围由入射 PUI-H + 组成。使用 PUI-H + 粒子群的初始填充壳分布（而不是零厚度壳），可以提高实验结果与模拟结果之间的一致性，因为这会强烈影响光谱的低能部分。这意味着 PUI-H + 离子在日光层中首次被拾取后，有足够的时间扩散到壳分布并填充壳分布，这表明随后的冷却对全球能谱有重要影响。
Swift：Swin 4D FMRI变压器
从高维数据（例如功能磁共振成像（fMRI））中对时空脑动力学进行建模是神经科学中的一项艰巨任务。现有的fMRI分析方法采用了手工制作的功能，但是功能提取风险在fMRI扫描中失去基本信息的过程。为了应对这一挑战，我们提出了Swift（Swi N 4d F Mri T Ransformer），这是一种Swin Transformer架构，可以直接从fMRI卷中以记忆和计算有效的方式学习大脑动力学。Swift通过实施4D窗口多头自我发项机制和绝对位置嵌入来实现这一目标。我们使用多个大型静止状态FMRI数据集评估SWIFT，包括人类连接群落项目（HCP），青少年脑认知发展（ABCD）和UK Biobank（UKB）数据集，以预测性别，年龄和认知智能。我们的实验结果表明，Swift的表现优于最新的最新模型。此外，通过利用其端到端的学习能力，我们表明，基于对比的基于损失的自我监管的SWIFT预训练可以提高下游任务的性能。补充 - 我们采用可解释的AI方法来识别与性别分类相关的大脑区域。据我们所知，Swift是第一个以端到端方式处理维数时空脑功能数据的Swin Transformer架构。我们的工作在神经科学研究中促进功能性脑成像的可扩展学习方面具有巨大的潜力，通过减少与将变压器模型应用于高维fMRI相关的障碍。项目页面：https：//github.com/transconnectome/swift
2023 年 7 月 18 日 主题：技术提案要求 – 年度提交 – 信息请求 N3220523R4109 附件 (1) 提交说明
2023 年 7 月 18 日 主题：技术提案要求 – 年度提交 – 信息请求 N3220523R4109 附件 (1) 提交说明 附件 (2) 评估因素 附件 (3) MSC SWI 0004、0006、0007、0015、0016 和 0023 附件 (4) MSC 船舶修理设施调查表（MSC 表格 4330/26） 基于业界的新兴趣和军事海运司令部 (MSC) 希望简化船舶修理采购的技术提案要求，可以每年提交以下列出的技术要求，每次提交提案后即可提交。收到的提案有效期至 2024 年 9 月 30 日。请将提案通过电子邮件发送至船舶修理承包总监，地址为 thomas.j.martin15.civ@us.navy.mil。提案将接受审核，如果提案可接受或不可接受，将通知造船厂。提交 MSC 船舶修理采购提案时，请在技术提案中引用适用子因素的已接受提案，并注明“请参阅我们日期为 XX/XX/XXXX 的年度提案”。造船厂负责确保年度提案的准确性。如对提案有任何更改，请立即通知船舶修理承包总监。如果造船厂获得合同授予，但后来确定所提供的信息不准确，政府保留根据招标和合同条款和条件采取适当行动的权利。每年提交文件并不意味着政府丧失选择或更改因素或子因素、参与讨论或要求澄清的权利。如有任何问题，请联系船舶维修承包总监，邮箱地址为 thomas.j.martin15.civ@us.navy.mil。
从旧到新——重新利用药物来靶向癌症中的线粒体能量代谢
许多肿瘤的特征是 OXPHOS 水平低。然而，这种病理的原因在不同的癌症类型中有所不同。一些肿瘤携带线粒体 DNA 编码复合物 I 亚基（例如肾嗜酸细胞瘤）或核编码复合物 II 亚基（例如嗜铬细胞瘤和副神经节瘤）的致病突变；其他肿瘤则显示所有 OXPHOS 复合物减少，线粒体 DNA 拷贝数减少；还有一些肿瘤的线粒体质量较低 [9–13]。在许多情况下，这种下调的遗传原因仍然难以捉摸。许多肿瘤均显示 OXPHOS 水平均匀降低，例如嗜酸细胞瘤、神经母细胞瘤、肾细胞癌和星形细胞脑瘤 [10,11,14]。然而，只有一小部分癌和黑色素瘤缺乏 OXPHOS，其他肿瘤仍保留有功能性 OXPHOS 系统 [15–20]。某些癌症亚型的 OXPHOS 依赖性受基因改变和/或肿瘤微环境的影响。例如，肺癌中 KRAS 驱动的三羧酸 (TCA) 循环中葡萄糖的贡献比正常肺组织高 [21]。此外，肺癌中经常检测到 SWI/SNF 染色质复合物成分（包括 SMARCA4）的改变。SMARCA4 突变的肿瘤以 OXPHOS 和呼吸能力增强为特征，因此对 OXPHOS 抑制敏感 [22]。与磷酸酶和张力蛋白同源物 (PTEN) 野生型前列腺癌细胞相比，PTEN 缺陷细胞的线粒体通过复合物 V 消耗 ATP，而不是产生 ATP，这导致体外对复合物 I 抑制的基因型特异性敏感性 [23]。
热指数用于治疗性低温新生儿脑损伤的早期非侵入性评估：初步报告
围产期窒息 (PA) 是新生儿死亡的第三大原因，也是儿童严重神经系统损伤的最常见原因之一。当前的工具和测量主要基于临床评估分析以及实验室和电生理测试，在进行磁共振成像 (MRI) 评分之前，无法提供一致的数据来预测缺氧缺血性脑病 (HIE) 的严重程度。这项研究的目的是评估新指数——热指数 (TI)——在评估因 PA 导致的治疗性低温 (TH) 过程中新生儿脑损伤程度方面的实用性。这是一项前瞻性、观察性、试点研究，不需要对适用程序进行任何更改。对 2018 年因 PA 在奥波莱大学医院新生儿/儿科 ICU 接受 TH 治疗的六名新生儿进行了分析。根据当前建议，他们都符合 TH 的标准。 TH 结束后，当儿童恢复正常体温时，使用 1.5 T 扫描仪进行脑部 MRI 检查，使用 T1、T2 加权图像、液体衰减反转恢复 (FLAIR)、反转恢复 (IR)、磁敏感加权成像 (SWI) 和弥散加权成像 (DWI)。根据 Weeke 等人提出的评分系统，使用 MRI 评分评估图像。根据本文提出的公式计算评估内源性产热的热指数。在治疗的第一小时内，MRI 评分和 TI 值 (0.98；p = 0.0003) 之间存在高度、统计学上显着的正相关性。与 MRI 评估的高度相关性、测量的非侵入性以及治疗后最初几个小时内即可获得结果，使作者提出将热指数作为早期评估接受 TH 治疗的新生儿脑损伤的工具。需要进一步研究以确认所提出方法的有效性。
cv_silvia barabino btbs unimib -milano -bicocca
近年来，我的研究小组的工作集中在与生理和病理条件下的MRNA剪接和聚腺苷酸化有关的一系列项目上。其中一个项目发现了mRNA输出和组蛋白PREMRNA的哺乳动物3'末端处理因子CF I的新功能。最近，我们表明线粒体应力会影响基因组大规模的替代剪接，因此可能有助于神经退行性疾病的发病机理。目前，我们专注于三个主要研究线。第一个集中在SRPK2上，SRPK2是一种针对SR（丝氨酸/精氨酸富域）剪接因子家族的蛋白激酶。我们目前正在研究DNA损伤通过SRPK2活性的调节影响替代剪接的机制。第二个项目涉及将选择替代外显子选择与转录的机制。具体而言，我们正在研究梵天是哺乳动物SWI/SNF染色质复合物的组成部分，如何通过与聚烯基化机制的组件相互作用来促进替代末端外显子的选择。最近，我们在肌萎缩性侧索硬化症的细胞和小鼠模型中启动了miRNA表达的表征。并行，我们目前正在研究RNA结合蛋白在基因组稳定性和神经变性中的作用。努力和激发年轻研究人员的能力。能够建立新的跨学科方法。简历生于索伦戈（CH），1963年7月9日。为了解决所有这些问题，我们使用了生化和分子方法的组合，例如CRIPR/CAS9基因组编辑，显微镜，体外细胞培养系统（包括IPSCS划分的细胞TYE）和转基因小鼠模型。已在实验室接受了20多名本科生和10名前后研究员的培训，其中许多人从事学术研究中的成功职业。我们一直与意大利和国外的许多研究小组合作。这包括由瑞士国家科学基金会资助的大型跨学科网络项目。1983-1987硕士学位。帕维亚大学
HDAC1 和 PRC2 介导 SPI1/... 中的组合控制
转录调控是一个复杂的过程，涉及特定染色质环境中的一系列蛋白质活动。转录因子 (TF) 是此过程的主要贡献者，它们与伙伴、辅激活因子或表观遗传因子一起发挥作用，其中一些被称为先驱 TF，能够使染色质结构允许辅激活因子和表观遗传因子的作用。表观遗传景观在造血稳态和分化程序中起着重要作用；因此，有可能从染色质动力学构建一个完整的造血模型 ( 1 , 2 )。编码表观遗传修饰因子 (TET2、IDH1 / 2、DNMT3A 和 ASXL1) 的基因突变在急性髓系白血病 (AML) 患者中很常见，进一步表明这种类型的成分在驱动 AML 发展中起着重要作用。 TF SPI1 / PU.1 属于 E26 转化特异性 (ETS) 家族，是造血控制的主要贡献者，在髓系和 B 淋巴系的特化和分化中发挥积极作用 ( 3–5 )。SPI1 最初被描述为一种转录激活因子，被认为是一种先驱 TF，因为它能够结合或接近封闭的核小体构象，并使辅因子能够结合染色质 ( 6–9 )。例如，在巨噬细胞中，SPI1 通过结合封闭的染色质来激活其靶基因的转录，在那里它通过募集表观遗传修饰因子（如 CBP/P300 或 SWI/SNF 复合物）来驱逐核小体 ( 6 、 7 、 10 、 11 )。这一动作指示创建一个新的增强子，使组蛋白 3 的赖氨酸 4 (H3K4me1) 单甲基化，并在增强子位点募集额外的 TF (6,7)。SPI1 通过表观遗传调控控制转录激活的功能在 B 淋巴细胞和破骨细胞分化中也有描述 (12,13)。因此，除了与谱系决定辅因子协同控制基因表达方面发挥众所周知的作用外，SPI1 对转录活性的影响还与表观遗传调节因子协同介导。最近有报道称，SPI1 在正常造血、控制适当的中性粒细胞免疫反应 (14)、早期 T 细胞 (15,16) 和破骨细胞 (12) 中抑制转录。实现更好的
ariD2突变可能会导致皮肤黑色素瘤患者的不同结果
干旱基因编码SWI/SNF染色质重塑复合物的亚基，并经常在人类癌症中突变。我们研究了黑色素瘤患者的干旱突变，分子特征和临床结局之间的相关性。皮肤黑色素瘤样品（n = 1577）。在干旱基因（ARID1A/2/1b/5b）中，通过致病/可能的致病突变对样品进行分层。PD-L1表达。肿瘤突变负担（TMB） - - 定义为≥10个突变/mb。转录组特征可预测对免疫检查点抑制剂的反应 - 牙牙γ和T细胞发炎得分。实际总体生存（OS）信息是从保险索赔数据中获得的，从组织收集时间到上次接触日期，Kaplan-Meier估算得出。Mann – Whitney U，Chi-square和Fisher精确测试在适当的情况下应用，P值调整为多次比较。arid2突变更为普遍（11.0％：n = 451 vs 2.8％：n = 113），并同时使用ARID1A / ARID2突变在1.1％（n = 46）样品中。ARID mutations were associated with a high prevalence of RAS pathway mutations— NF1 ( ARID1A , 52.6%; ARID2 , 48.5%; ARID1A/2 , 63.6%; and ARID-WT, 13.3%; p < 0.0001) and KRAS ( ARID1A , 3.5%; ARID2 , 3.1%; ARID1A/2 , 6.5%; and ARID-WT, 1.0%; p = 0.018）），尽管BRAF突变在干旱熔化的队列中不太常见（ARID1A，31.9％； ARID2，35.6％； ARID1A/2，26.1％；和ARID-WT，50.4％; P <0.0001）。tmb-high在干旱突变的样品中更为常见（ARID1A，80.9％； ARID2，89.9％； ARID1A/2，100％； ARID-WT，49.4％； P <0.0001），而PD-L1阳性相似ARID-WT，44.9％； p = 0.109）。与ARID-WT相比，ARID1A突变患者的DMMR/MSI-H患病率更高（2.7％vs 0.2％，P = 0.030）。与ARID-WT相比，在ARID2突出的样品中，IFN-γ和T细胞特征的中值更高（IFN-γ： - 0.15 vs-0.21，p = 0.0066; t-cell：23.5 vs-18.5，p = 0.041）。ARID2突变患者的生存率提高了。 （HR：1.22（95％CI 1.0-1.5），p = 0.022）。与ARID -WT相比，使用抗PD-1治疗的ARID2突变没有观察到其他OS益处。干旱突变患者的黑色素瘤患者表现出与ICI反应相关的标志物的较高患病率，包括TMB-H和免疫相关的特征。我们的数据还表明，与抗PD1治疗无关，ARID2突变患者的生存结果改善。