微生物和动物具有共生关系,极大地影响了营养吸收和动物健康。可以使用称为合成群落的微生物或syncoms的微生物进行研究。synomcs用于包括农业动物在内的许多不同动物宿主中,以研究与营养物质的微生物相互作用,以及它们如何影响AN-IMAL健康。最常见的宿主聚焦在旁糖中目前是小鼠和人类,从基本的机械研究到转化疾病模型和实时生物治疗产品(LBP)作为治疗方法。我们讨论了基础研究模型中使用的串触,以及对人类和动物健康和营养的结果。讨论了串联的翻译用例,其次是LBP,尤其是在农业的背景下。Syncom仍然面临挑战,例如可重复性和污染风险的标准化。但是,联合性的未来是充满希望的,尤其是在基因组引导的Syncom设计和基于自定义Syncom治疗的领域。
自然生态系统藏有大量的分类学微生物,这对植物生长和健康很重要。土壤微生物及其复杂的相互作用的大量多样性使确定对生命支持功能重要的主要参与者可以为植物提供重要的挑战,包括增强对(a)生物应激因素的耐受性。设计简化的微生物合成群落(Syncoms)有助于降低这种复杂性,从而揭示特定微生物组功能的分子和化学基础和相互作用。尽管已经成功地使用了Syncom来剖析微生物相互作用或再现微生物组相关的表型,但这些社区的组装和重建通常是基于通用的丰度模式或分类的认同,并共同出现的,但仅由功能特征提供了很少的信息。在这里,我们回顾了有关设计功能性阴谋的最新研究,以揭示共同的原理并讨论社区设计的多维方法。我们提出了一种基于与微生物菌株的高通量实验测定和其功能能力的计算基因组分析的集成,以定制功能性触体设计的策略。
自然生态系统藏有大量的分类学微生物,这对植物生长和健康很重要。土壤微生物及其复杂的相互作用的大量多样性使确定对生命支持功能重要的主要参与者可以为植物提供重要的挑战,包括增强对(a)生物应激因素的耐受性。设计简化的微生物合成群落(Syncoms)有助于降低这种复杂性,从而揭示特定微生物组功能的分子和化学基础和相互作用。尽管已经成功地使用了Syncom来剖析微生物相互作用或再现微生物组相关的表型,但这些社区的组装和重建通常是基于通用的丰度模式或分类的认同,并共同出现的,但仅由功能特征提供了很少的信息。在这里,我们回顾了有关设计功能性阴谋的最新研究,以揭示共同的原理并讨论社区设计的多维方法。我们提出了一种基于与微生物菌株的高通量实验测定和其功能能力的计算基因组分析的集成,以定制功能性触体设计的策略。
合成社区的设计和使用,是散布微生物群落内部以及这些社区及其寄主之间复杂相互作用的最有希望的策略之一。与自然社区相比,这些简化的联盟为研究生态相互作用的范围提供了机会,并促进了可重复性并促进跨学科科学。但是,Syncom方法的有效实施需要有关这些模型系统的开发和应用的几个重要考虑因素。在临床,农业或环境环境中设计和部署联合体时,也有新兴的道德考虑。在这里,我们概述了当前在开发,实施和评估不同系统中的触体的最佳实践,包括关注Syncom研究的重要道德考虑。
植物微生物群研究领域已迅速从旨在获得对微生物群组成的描述性理解的努力转变为重点是获取对微生物群功能和装配规则的机械见解。这一进化是由我们建立综合成本构成的植物相关的微生物和toreconstructMeaningfulmicrobial合成群落(Syncoms)的能力所驱动的。我们认为,这种强大的解构 - 重建策略可用于重建日益复杂的合成生态系统(Synecos),并机械地理解高级生物组织。从简单到更高级,完全易处理和可编程的gnotobiotic合成生物的过渡正在进行中,并旨在通过工程来合理地简化自然生态系统。这种重构生态方法代表了弥合生态生物学和功能生物学之间差距以及揭开植物的差距的尚未开发的策略 - 微生物群 - 调节生态系统健康,组装和功能的环境机制。