。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明)是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是制作
SynergyFinder ( https://synergyfinder.ffimm.ffi ) 是一个独立的网络应用程序,用于交互式分析和可视化药物组合筛选数据。自 2017 年首次发布以来,SynergyFinder 已成为一种广泛使用的网络工具,既可用于在临床前模型系统(例如细胞系或患者来源的原代细胞)中发现新的协同药物组合,也可用于更好地了解联合治疗疗效或耐药性的机制。在这里,我们描述了最新版本的 SynergyFinder(版本 2.0),它已通过添加新功能进行了广泛升级,这些新功能特别支持高阶组合数据分析和多药协同模式的探索性可视化,以及自动异常值检测程序、扩展的曲线拟合功能和重复测量的统计分析。根据用户要求,还实施了许多其他改进,包括新的可视化和导出选项、更新的用户界面以及增强的 Web 工具稳定性和性能。凭借这些改进,SynergyFinder 2.0 有望大大扩展其在多药组合筛选和精准医疗等各个领域的潜在应用。
a)全球蛋白质组学表明,PRT3789下调了基础切除修复(BER)和DNA复制特征4。火山图显示log 2(折叠更改与DMSO)蛋白表达和调整后的-LOGP值在Smarca4-Del NCI-H1693细胞中用PRT3789处理48小时。由PRT3789处理下调的关键BER蛋白被标记。b)PRT3789 +吉西他滨联合疗法在7天细胞滴度GLO分析中显示了SMARCA4-DEL H838 NSCLC细胞系的体外协同体外。%的生存能力与DMSO控件。使用SynergyFinder 2.0 2(C)PRT3789 +吉西他滨组合疗法计算得出的拉链得分,在SMARCA4-DEL H838 NSCLC CDX模型中,TGI为89%。*P <0.05 ** P <0.01 *** P <0.001,与车辆(两尾Mann-Whitney测试)。TGI,平均肿瘤生长抑制与车辆。
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年1月13日。 https://doi.org/10.1101/2023.01.12.523677 doi:biorxiv Preprint