抽象背景发现,〜16%的T细胞自然共表达了两个T细胞受体(TCR)clonotypes促使研究双TCR细胞在免疫功能中的作用。使用TCRα-Reporter转基因小鼠的方法,使单个TCR和双TCR细胞明确鉴定,我们测试了双TCR细胞在针对免疫反应性合成性抗肿瘤的抗肿瘤免疫反应中的作用,以抗免疫 - 响应性合成性6727 Sarcoma和免疫抗性的B16F10 B16F10糖浆瘤。结果在这两种模型中肿瘤浸润细胞(TIL)中的双重TCR细胞在肿瘤浸润细胞(TIL)中均明确增加,这表明抗肿瘤反应中的选择性优势。表型和单细胞基因表达分析所鉴定的双TCR在有效的抗肿瘤反应过程中主要是主导,表明TIL室中有选择地增加了激活,并偏向效应子记忆表型。缺乏双重TCR细胞会损害对B16F10的免疫反应,而不是6727,这表明双重TCR细胞对免疫原性肿瘤的反应可能更具影响力。双重TCR细胞在体外表现出识别B16F10衍生的新抗原的优势,为其抗肿瘤反应性提供了机械基础。结论这些结果发现双重TCR细胞在保护性免疫功能中的作用未被识别,并将这些细胞及其TCR鉴定为抗肿瘤免疫疗法的潜在资源。
与HC组相比,AECOPD组的CD3 + HLA-DR + T细胞(P = 0.001),CD8 + HLA-DR + T细胞(P = 0.001),CD4 + HLA-DR + T细胞的比例明显更高。 HLA-DR + T细胞(P = 0.046)。但是,尽管AECOPD组中这些子集的分布高于SCOPD组,但差异在统计学上并不显着(表3和图。2)。在三组中,CD3 + TCRAβ + T细胞的比例也没有显着差异(图S6)。
抽象的收养细胞疗法涉及将工程的免疫细胞注入癌症患者中,以识别和消除肿瘤细胞。在过去的十年中,采用细胞疗法作为一种活力的一种形式,经历了爆炸性的生长。T-细胞受体(TCR)对肿瘤抗原的识别是免疫系统消除肿瘤细胞的自然机制之一。TCR- T细胞疗法涉及将外源性TCR引入患者的T细胞,是一种新型的细胞疗法策略。TCR- T细胞疗法可以靶向癌细胞的整个蛋白质组。用外源性TCR进行工程T细胞来帮助患者打击癌症在临床试验中取得了成功,尤其是在治疗实体瘤方面。在这篇综述中,我们研究了过去五年中TCR -T细胞疗法的进展。这包括发现新的肿瘤抗原,用于TCR的蛋白质工程技术,用于TCR -T细胞疗法的重编程策略,TCR -T细胞疗法的临床研究以及中国TCR -T细胞疗法的进步。我们还提出了多个潜在的方向,以实现TCR - T细胞疗法的未来发展。
热带气旋降雨(TCR)广泛影响沿海社区,主要通过内陆洪水。全球气候变化对TCR的影响是复杂且有争议的。这项研究使用XGBoost机器学习模型,其中具有19年的气象数据和每小时的卫星沉淀观测值,以预测Indimical风暴的TCR。该模型将灰尘光学深度(DOD)识别为明显增强性能的关键预测指标。该模型还发现了撒哈拉粉尘和TCR之间的非线性和飞旋镖形状的关系,TCR峰为0.06 DOD,此后急剧下降。这表明从微观物理增强到高灰尘浓度下的辐射抑制。该模型还突出了TCR与气象因素(如海面温度和风暴核心附近的等效势温度)之间有意义的相关性。这些发现说明了机器学习在预测TCR及其理解其驱动因素和物理机制方面的有效性。
使您能够编辑基因组中的任何位置图 1. 使用 TALXcell 平台敲除 T 细胞受体 (TCR)。使用 Invitrogen ™ Neon ™ 转染系统通过电穿孔将 TALXcell mRNA 递送至原代人类 T 细胞。使用藻红蛋白 (PE) 偶联的 TCR 抗体通过流式细胞术测量 TCR 敲除效率。TALXcell 平台实现了 94.9% 的 TCR 敲除效率,这与在类似实验中使用 CRISPR-Cas9 观察到的效率相似。
1型糖尿病(T1D)是一种T细胞介导的疾病,具有强大的免疫遗传HLA依赖性。HLA等位基因对T细胞受体(TCR)曲目的影响塑造胸腺的选择并控制糖尿病生成克隆的激活,但在T1D中仍未解决。我们对三个横截面同类群(包括T1D患者)以及健康相关和无关的对照组的2250个HLA类型的个体进行了循环的TCRβ链曲目。我们发现HLA风险等位基因在T1D个体中显示出更高的TCR曲目限制。我们利用深度学习来鉴定与T1D相关的TCR子序列基序,这些基序在居住在T1D个体的胰腺淋巴淋巴结中的独立TCR同类中也观察到。总体而言,我们的数据证明了基于遗传风险的T1D相关的TCR基序富集,为自动反应性提供了潜在的指标,以及基于TCR的诊断和治疗剂的基础。
摘要:T 细胞在控制 SARS-CoV-2 感染中的重要性已得到广泛证实,但由于技术挑战,对这些反应质量的了解仍然有限。事实上,了解多克隆抗原特异性群体的 T 细胞受体 (TCR) 库的功能仍然需要繁琐的 T 细胞克隆或 TCR 重新表达和随后的表征工作。在这项工作中,我们表明,可以根据最近肽刺激引起的 T 细胞活化的基因特征区分高功能性和旁观者 TCR。先前通过肽再刺激和随后的单细胞 RNA 测序后细胞因子释放识别的 SARS-CoV-2 特异性 TCR 通过 CRISPR-Cas9 介导的基因编辑重新表达到适用于高通量筛选的基于 Jurkat 的报告细胞系系统中。我们可以观察到 SARS-CoV-2 表位识别的差异以及广泛的功能亲和力。通过将这些体外 TCR 工程功能数据与相应的表达 TCR 的亲本 T 细胞的转录组谱相关联,我们可以验证近期 T 细胞激活的基因特征是否准确识别和预测真正的 SARS-CoV-2 特异性 TCR。总之,这项工作为其他方法铺平了道路,这些方法可用于以大大提高通量的方式对全局抗原特异性 TCR 库进行功能分析。
T细胞受体(TCR)曲目测序已成为理解宿主免疫系统中T细胞多样性和功能的强大工具。然而,尽管鸡在农业中的重要性和作为免疫学模型,但由于对TCR基因群的不完整基因组注释,鸡肉TCR曲目仍然很少理解。在这里,我们通过使用5'互补DNA末端(5'种族)TCR曲目测序的5'快速放大来解决这个关键问题。同时,我们增强了TCR变量(V)的基因组注释,多样性(D,仅存在于B和D基因座中),并在鸡基因组中加入(J)基因。为提高TCR注释的效率,我们开发了VJ-Gene-Finder,这是一种算法,旨在从脱氧核糖核酸(DNA)序列中提取VJ基因候选物。使用此工具,我们完成了所有已知鸡TCR基因座的全面注释,包括染色体上的A / D基因座。< / div>。进化分析表明,每个基因座通过长长同源单元的重复分别演变。为了定义健康鸡的基线TCR多样性并证明了该方法的可行性,我们表征了脾脏A / B / G / D TCR库。对曲目的分析揭示了在所有链中特异性V和J组合的优先用法,而总体特征是无偏曲线的特征。但是,B和D曲目主要是每只鸟的独特之处。我们观察到了A和G链曲目内的单个鸟类中的中等水平的共享互补性区域3(CDR3)clonotypes,包括最常见的clonotypes。总的来说,我们的TCR曲目分析使我们能够破译鸡T细胞的组成,多样性和功能。这项工作不仅代表了理解禽类T细胞生物学的重要一步,而且还将阐明宿主病原体相互作用,疫苗发育和鸟类免疫学的进化史。
摘要 PTPN22 基因中的遗传变异 (R620W, rs2476601) 与多种自身免疫性疾病风险增加密切相关,并与 TCR 调节和 T 细胞活化改变有关。在这里,我们利用 Crispr/Cas9 基因编辑和供体 DNA 修复模板在人类脐带血衍生的幼稚 T 细胞中生成来自同一供体的 PTPN22 风险编辑 (620W)、非风险编辑 (620R) 或敲除 T 细胞。PTPN22 风险编辑细胞在非特异性 TCR 参与后表现出活化标志物表达增加,这些发现模仿了 PTPN22 KO 细胞。接下来,使用慢病毒递送 T1D 患者衍生的针对胰腺自身抗原胰岛特异性葡萄糖-6 磷酸酶催化亚基相关蛋白 (IGRP) 的 TCR,我们证明 PTPN22 功能的丧失导致表达较低亲和力自反应性 TCR 而非高亲和力 TCR 的 T 细胞信号传导增强。在这种情况下,PTPN22 的丧失介导了增强的增殖和 Th1 偏斜。重要的是,与较低亲和力 TCR 相关的风险变异的表达也增加了相对于 PTPN22 非风险 T 细胞的增殖。总之,这些发现表明,在原代人类 T 细胞中,PTPN22 rs2476601 通过允许增加轻度自反应性 T 细胞中的 TCR 信号传导和激活来增加自身免疫风险,从而可能扩大自反应性 T 细胞池并使该群体偏向炎症表型。