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关于TDP1抑制剂的案例研究摘要INT
本文提出了一种计算方法，该方法可以根据其对给定案例研究的重要性生成IUPAC宣传的官能团的降序。因此，可以从从中成功启动药物发现的功能组列表。使用针对TDP1抑制剂的Pubchem生物测定法证明了适用于任何具有足够数据的研究案例的方法。Scikit学习了对随机森林分类器（RFC）算法的解释。机器学习（ML）型号RFC获得了70.9％的精度，73.1％的精度，66.1％的召回率，69.4％F1和70.8％的接收器操作特征（ROC）。除了主要研究外，还开发了CID_SID ML模型，该模型仅使用PubChem化合物和物质标识符（CID和SIDS）数据，可以以85.2％的精度预测，94.2％精度为94.2％，75％精度，F1的F1，83.5％F1和85.2％ROC的F1和85.2％ROC是否具有化合物是否具有化合物。
TDP-43聚合播种会损害自动调节并导致TDP-43功能障碍
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月12日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637743 doi：Biorxiv Preprint
pyr1生物传感器驱动的全基因组CRISPR筛选，用于改善Kluyveromyces Marxianus的单甲苯样产生
Fructose-2,6-bisphosphate restores TDP-43 pathology-driven genome repair deficiency in motor neuron diseases Anirban Chakraborty a# , Joy Mitra b# , Vikas H. Maloji Rao b , Manohar Kodavati b , Santi M. Mandal d , Satkarjeet K. Gill e , Sravan Gopalkrishnashetty Sreenivasmurthy E，Velmarini Vasquez B，Mikita Mankevich D，Balaji Krishnan E，Gourisankar Ghosh D，Muralidhar L. Hegde B，C，C，*，Tapas hazra a，*。美国德克萨斯州加尔维斯顿大学医学部内科系，美国b 77555，b美国卫生间研究所神经病变研究中心，休斯敦卫理公会研究所，美国德克萨斯州休斯敦市神经外科部，美国纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市纽约市，纽约州纽约市纽约市，美国纽约市纽约州纽约市，纽约州纽约州纽约市，美国纽约州纽约市，美国纽约州纽约市，迭戈，拉霍亚，加利福尼亚州92093，美国E神经病学系，米切尔神经退行性疾病中心，德克萨斯大学医学分公司，加尔维斯顿，德克萨斯州77555，美国，美国＃同样贡献 *相应作者的地址：
TDP-43作为神经退行性疾病的潜在视网膜生物标志物
TDP-43蛋白质病是由TDP-43蛋白质的病理细胞质聚集的特征的神经退行性疾病（NDDS）。这些包括肌萎缩性侧索硬化症（ALS），额颞叶变性（FTLD），阿尔茨海默氏病（AD），慢性创伤性脑病（CTE）等。TDP-43在眼中显示出作为这些NDD的生物标志物的希望。 使用免疫组织化学，几项研究鉴定了具有ALS，FTLD，AD，CTE和其他条件的供体的视网膜层中的细胞质TDP-43包含物。 我们的发现表明，人类视网膜中TDP-43的病理聚集体在FTLD-TDP，ALS和CTE中最为普遍，这表明这些疾病可能为研究TDP-43作为视网膜生物标志物的潜力提供了最可靠的背景。 动物模型研究在探索TDP-43在视网膜中的作用方面一直是关键的，包括其核和细胞质定位，RNA结合特性以及与其他蛋白质的相互作用。 尽管有这些进展，但仍需要更多的研究来制定治疗策略。 人类尸检研究的主要局限性是缺乏相应的脑病理评估来确认TDP-43蛋白质病诊断和分期。 其他局限性包括小样本量，缺乏原质子眼病理学和临床历史以及多个NDD的比较有限。 TDP-43作为NDD的视网膜生物标志物的未来方向包括视网膜示踪剂，高光谱成像，动眼和机器学习开发。TDP-43在眼中显示出作为这些NDD的生物标志物的希望。使用免疫组织化学，几项研究鉴定了具有ALS，FTLD，AD，CTE和其他条件的供体的视网膜层中的细胞质TDP-43包含物。我们的发现表明，人类视网膜中TDP-43的病理聚集体在FTLD-TDP，ALS和CTE中最为普遍，这表明这些疾病可能为研究TDP-43作为视网膜生物标志物的潜力提供了最可靠的背景。动物模型研究在探索TDP-43在视网膜中的作用方面一直是关键的，包括其核和细胞质定位，RNA结合特性以及与其他蛋白质的相互作用。尽管有这些进展，但仍需要更多的研究来制定治疗策略。人类尸检研究的主要局限性是缺乏相应的脑病理评估来确认TDP-43蛋白质病诊断和分期。其他局限性包括小样本量，缺乏原质子眼病理学和临床历史以及多个NDD的比较有限。TDP-43作为NDD的视网膜生物标志物的未来方向包括视网膜示踪剂，高光谱成像，动眼和机器学习开发。
TDP-43作为神经退行性疾病的潜在视网膜生物标志物
TDP-43蛋白质病是由TDP-43蛋白质的病理细胞质聚集的特征的神经退行性疾病（NDDS）。这些包括肌萎缩性侧索硬化症（ALS），额颞叶变性（FTLD），阿尔茨海默氏病（AD），慢性创伤性脑病（CTE）等。TDP-43在眼中显示出作为这些NDD的生物标志物的希望。 使用免疫组织化学，几项研究鉴定了具有ALS，FTLD，AD，CTE和其他条件的供体的视网膜层中的细胞质TDP-43包含物。 我们的发现表明，人类视网膜中TDP-43的病理聚集体在FTLD-TDP，ALS和CTE中最为普遍，这表明这些疾病可能为研究TDP-43作为视网膜生物标志物的潜力提供了最可靠的背景。 动物模型研究在探索TDP-43在视网膜中的作用方面一直是关键的，包括其核和细胞质定位，RNA结合特性以及与其他蛋白质的相互作用。 尽管有这些进展，但仍需要更多的研究来制定治疗策略。 人类尸检研究的主要局限性是缺乏相应的脑病理评估来确认TDP-43蛋白质病诊断和分期。 其他局限性包括小样本量，缺乏原质子眼病理学和临床历史以及多个NDD的比较有限。 TDP-43作为NDD的视网膜生物标志物的未来方向包括视网膜示踪剂，高光谱成像，动眼和机器学习开发。TDP-43在眼中显示出作为这些NDD的生物标志物的希望。使用免疫组织化学，几项研究鉴定了具有ALS，FTLD，AD，CTE和其他条件的供体的视网膜层中的细胞质TDP-43包含物。我们的发现表明，人类视网膜中TDP-43的病理聚集体在FTLD-TDP，ALS和CTE中最为普遍，这表明这些疾病可能为研究TDP-43作为视网膜生物标志物的潜力提供了最可靠的背景。动物模型研究在探索TDP-43在视网膜中的作用方面一直是关键的，包括其核和细胞质定位，RNA结合特性以及与其他蛋白质的相互作用。尽管有这些进展，但仍需要更多的研究来制定治疗策略。人类尸检研究的主要局限性是缺乏相应的脑病理评估来确认TDP-43蛋白质病诊断和分期。其他局限性包括小样本量，缺乏原质子眼病理学和临床历史以及多个NDD的比较有限。TDP-43作为NDD的视网膜生物标志物的未来方向包括视网膜示踪剂，高光谱成像，动眼和机器学习开发。
短RNA伴侣促进抗聚合的TDP ...
隶属关系：1生物化学和生物物理学系，宾夕法尼亚大学Perelman医学院2个神经科学研究生组；宾夕法尼亚州费城。美国3匹兹堡大学医学院神经生物学系；宾夕法尼亚州匹兹堡。 U.S.A. 4匹兹堡大学医学院匹兹堡脑研究所的Lou ALS研究中心类似Lou Center。宾夕法尼亚州匹兹堡。美国匹兹堡大学医学院匹兹堡大学神经科学中心5；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国6美国布朗大学生物学，工程和医学研究所；普罗维登斯，RI。美国7杰斐逊·温伯格ALS中心，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国8 Vickie和Jack Farber神经科学研究所，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国9西德尼·金梅尔医学院，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国10 U. K.痴呆研究所的伦敦国王学院；英国伦敦11弗朗西斯·克里克学院；英国伦敦12号牛津 - GSK分子与计算医学研究所，牛津大学纳菲尔德医学系人类遗传学中心；牛津，英国13托马斯·杰斐逊大学神经科学系；宾夕法尼亚州费城。美国14 Confluence Therapeutics，旧金山；大约 美国15分子生物学系，细胞生物学与生物化学，布朗大学；普罗维登斯，RI。 美国16匹兹堡大学医学院蛋白质构象中心；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国17匹兹堡神经退行性研究所，匹兹堡大学医学院；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国 *通讯作者。 电子邮件：jshorter@pennmedicine.upenn.edu美国7杰斐逊·温伯格ALS中心，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国8 Vickie和Jack Farber神经科学研究所，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国9西德尼·金梅尔医学院，托马斯·杰斐逊大学；宾夕法尼亚州费城。美国10 U. K.痴呆研究所的伦敦国王学院；英国伦敦11弗朗西斯·克里克学院；英国伦敦12号牛津 - GSK分子与计算医学研究所，牛津大学纳菲尔德医学系人类遗传学中心；牛津，英国13托马斯·杰斐逊大学神经科学系；宾夕法尼亚州费城。美国14 Confluence Therapeutics，旧金山；大约美国15分子生物学系，细胞生物学与生物化学，布朗大学；普罗维登斯，RI。 美国16匹兹堡大学医学院蛋白质构象中心；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国17匹兹堡神经退行性研究所，匹兹堡大学医学院；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国 *通讯作者。 电子邮件：jshorter@pennmedicine.upenn.edu美国15分子生物学系，细胞生物学与生物化学，布朗大学；普罗维登斯，RI。美国16匹兹堡大学医学院蛋白质构象中心；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国17匹兹堡神经退行性研究所，匹兹堡大学医学院；宾夕法尼亚州匹兹堡。美国 *通讯作者。电子邮件：jshorter@pennmedicine.upenn.edu
具有赫布和反赫布抑制 STDP 的神经网络中模块化的出现和维持 Rapha¨el Bergoin 1,2,3,4*、Alessandro Torcin
1 ETIS，UMR 8051，ENSEA，CY 塞尔吉巴黎大学，CNRS，6 Av. du Ponceau，95000 塞尔吉-蓬图瓦兹，法国。 2 庞培法布拉大学大脑与认知中心，Ram´on Trias Fargas 25-27，08005 巴塞罗那，西班牙。 3 庞贝法布拉大学信息与通信技术系，Roc Boronat 138，巴塞罗那 08018，西班牙。 4 德国汉堡-埃彭多夫大学医学中心（UKE）神经信息处理研究所、分子神经生物学中心（ZMNH），20251汉堡。 5 理论物理和建模实验室，UMR 8089，CY Cergy Paris 大学，CNRS，2 Av. Adolphe Chauvin，95032 Cergy-Pontoise，法国。 6 加泰罗尼亚高等研究院（ICREA），Passeig Lluis Companys 23，08010 巴塞罗那，西班牙。 7 IPAL，CNRS，1 Fusionopolis Way #21-01 Connexis（南塔），新加坡 138632，新加坡。
人类TDP-43的保守区域在结构上类似于膜结合蛋白FARP1和蛋白质伴侣Bag6和Cyp33
1a人类TDP-43（HSTDP-43）的示意图：NTD-氨基末端结构域，NLS-核定位信号，RRM-RNA识别基序，LCR-low复杂性区域；在RRM1中类似PIASE的序列和假定的聚集和RRM2中的纤维化启动序列被证明，并以粉红色显示顺式P225。1B HSTDP-43 NTD结构域与斑马鱼Farp1的Ferm结构域以及Dali产生的人类Bag6的泛素样域。1C的HSTDP-43残基的溶解倾向为绘制的TDP-43序列绘制的脂质结合区域无序；预测的脂质结合区域无序表示为黑色矩形，并根据HSTDP-43氨基酸序列编号。重组的1d噻铁黄素T荧光在37°C或65°C下在胆固醇（C）和磷脂酰胆碱（PC）的情况下在生理温度下或在65°C下在生理温度下或65°C下在生理温度下或65°C下在生理温度下孵育的HSTDP-43构建体和对照样品；误差线表示来自一式三份实验的平均值的标准误差。1E HSTDP-43 RRM1和小鼠TDP-43 RRM2主题达利生成的叠加到HSCYP33 RRM域的3D模型； MMTDP43 RRM2顺式Proline P225标有粉红色的星号。1f欧米茄生成的人，小鼠，鸡肉和鱼Farp1和TDP-43的多个序列比对，以及Zebra Fish Ferm域的二级结构元素相对于多个序列对齐信息的二级结构元素的二级结构元素；白色和黑色钻石分别代表了TDP-43和FARP1中的假定或实验确认的脂质结合残基。1G人和小鼠CYP33 RRM和PPIASE结构域的多个序列对齐，以及人和小鼠TDP-43 RRM1和RRM2基序； HSTDP-43 RRM1或HSCYP33 PPIASE域的二级结构元素的ESPRIPT生成的渲染相对于多个序列比对信息； TDP-43 rrm2中的顺式脯氨酸用粉红色的星号表示，并且在所有排列序列中，粉红色矩形突出显示了该位置。 CYP33参与底物结合的残基用白色球表示，其中一些与肽基prolyl prolyl cis-Trans异构化的HSCYP33残基由黑色球体表示，而催化HSCYP33 S239不包括由于空间限制而包括。
技术，数字化和平台（TDP）
董事会于2024年10月2日通过了技术，数字化和平台委员会（“委员会”）修订的参考条款。委员会应协助董事会审查，评估和监视所有信息技术，网络安全和数字化相关事项，包括识别和缓解相关风险，实施相关信息技术和网络安全框架，政策，流程和程序的建议。1。会员/成分