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由AMP，ASCO，CAP和M.D.- 2024年6月6日 - 全球全球分子诊断专业社会的分子病理学协会（AMP）今天发表了一系列基于证据的建议，用于对肿瘤突变负担（TMB）测试作为潜在预测性生物标记物的分析验证和报告，用于免疫检查点侵入点（ICI）的潜在预测生物标志物。这些建议包括TMB分析的分析前，分析和分析后因素，并强调出版物中全面的方法论描述的重要性以允许分析之间的可比性。手稿，“肿瘤突变负担分析验证和报告的建议：分子病理协会，美国病理学家学院和癌症免疫疗法协会的共同共识建议”，在《分子诊断杂志》发表之前在线发布。ICI疗法已转化了患有多种癌症患者的一部分患者护理。结果，对预测性生物标志物（例如TMB）仍然具有重大兴趣，这些生物标志物可以识别患者从这些治疗中受益更可能受益。但是，TMB的计算，报告和解释可能在不同的实验室之间有所不同。建立了AMP TMB工作组，以评估现有的实验室实践，并为临床TMB测试的分析验证和报告制定基于证据的标准。我们的成员是这些建议旨在作为基于科学文献，观察性调查数据以及工作组主题专家的专业经验的参考指南。“虽然TMB已成为ICI治疗的潜在预测生物标志物，计算和报告TMB的多种方法，以及关于临床测定验证的全面方法论描述，对采用构成了重大挑战，” Larissa V. Furtado，AMP TMB TMB TMB Working Groups和Morecull Pathist in St. jude at Set. judet。LarissaV. Furtado说。“这份新报告不仅总结了与TMB测试相关的现有知识和挑战，而且还提供了有关如何在临床环境中最好地验证和报告这些测定法的共识建议。” “AMP is committed to helping laboratories overcome challenges and improve current test and interpretation practices,” said Susan Hsiao, MD, PhD, Chair of the 2024 AMP Clinical Practice Committee, Member of the AMP TMB Working Group, and Associate Professor of Pathology and Cell Biology at Columbia University Vagelos College of Physicians and Surgeons.“与我们所有基于证据的指南一样，随着新的技术和科学进步的可用，AMP临床实践委员会将继续重新评估和修改这些TMB建议。”要阅读完整的手稿，请访问https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2024.05.002。关于AMP，分子病理协会（AMP）成立于1995年，为分子诊断的新兴领域提供结构和领导。AMP的2,900多名成员练习分子诊断的各种学科，包括生物信息学，传染病，遗传病和肿瘤学。AMP的2,900多名成员练习分子诊断的各种学科，包括生物信息学，传染病，遗传病和肿瘤学。
PD-L1 表达的流行率和预后价值...
目的：评估未接受免疫疗法治疗的晚期宫颈癌患者中程序性死亡配体 1 (PD-L1) 表达和肿瘤突变负荷 (TMB) 的患病率和预后作用。方法：回顾性收集韩国峨山医疗中心 2008 年 1 月 1 日至 2016 年 12 月 31 日的医疗记录中的临床资料；对存档的肿瘤样本进行 PD-L1 表达 (综合阳性评分 [CPS] ≥1) 和 TMB (≥175 个突变/外显子组) 评估。总生存期 (OS) 定义为从晚期诊断或开始一线或二线全身治疗到死亡/最后一次随访的时间。使用对数秩检验和调整协变量的 Cox 比例风险模型分析 OS 与 PD-L1 表达和 TMB 的关联。结果：267 例患者中，76.0% 为鳞状细胞癌 (SCC)，24.0% 为腺癌 (AC)/腺鳞癌 (ASC)，64.4% 为 PD-L1 CPS ≥1，32.6% 为 TMB ≥175 突变/外显子组。PD-L1 CPS ≥1 和 TMB ≥175 突变/外显子组在 SCC 中比在 AC/ASC 中更普遍（73.9% 和 37.2% vs. 34.4% 和 17.7%）。OS 与 PD-L1 表达之间无相关性（CPS ≥1 vs. <1：从晚期诊断开始的调整风险比 [HR]=1.14；95% 置信区间 [CI]=0.84–1.53）； TMB ≥175 突变/外显子组亚组的 OS 趋势比 <175 突变/外显子组亚组的 OS 趋势更短（调整后的 HR=1.29；95% CI=0.95–1.75）。结论：对未接受免疫疗法治疗的晚期宫颈癌患者的回顾性分析表明，SCC 中 PD-L1 CPS ≥1 和 TMB ≥175 突变/外显子组的患病率高于 AC/ASC。PD-L1 CPS ≥1 与 OS 无关；TMB ≥175 突变/外显子组显示出 OS 更短的趋势。需要进一步研究来证实这些发现。
抗菌个人保护服：开发非织造聚丙烯纤维的可见光激活抗菌涂层
在COVID-19大流行期间，基于聚丙烯基的个人保护设备（PPE）的使用显着增加到超过一千万吨。通常，一次使用后，大多数PPE都会被丢弃，以防止用户自感染和传播剂的传播。但是，为了在不损害PPE保护性能的情况下最小化塑料废物，探索新的可重复使用或寿命更长的材料至关重要。在这里，提出了PPE的可见光可见抗菌光动力染料涂层。在这种情况下，发现通过引入两个硫酚单元衍生而来的硫酚甲基甲基蓝（TMB）涂层，发现显示出较高的抗菌活性。TMB被整合到旋转印刷悬浮液中，这是一种基于硝酸盐的商业印刷矩阵。优化了粘合剂中TMB的浓度，并发现5％TMB适用于涂层PPE，可在白光光辐照6小时后将革兰氏阳性和阴性细菌的数量降低99.99％。根据EN 14683测试的细菌效果效率和透气性，证实了TMB涂层不会影响过滤器的性能。因此，这种抗菌光动力染料涂层技术为PPE的更安全，更扩展的使用以及PPE产生的塑料废物的减少提供了有希望的解决方案。
精准肿瘤学的进展与挑战 - ijrpr
肿瘤学领域以识别和靶向生物标志物为基础。精准医疗的大部分内容是针对靶向治疗，如果没有生物标志物识别，靶向治疗是不可能的。用于预测检查点抑制剂反应性的众多生物标志物包括肿瘤突变负荷 (TMB)、错配修复基因缺陷、微卫星不稳定性 (MSI)、PBRM1 分子改变和 PD-L1 扩增等。除了错配修复基因缺陷和高微卫星不稳定性外，高 TMB（尤其是 ≥20 个突变/mb）在准确预测检查点抑制剂的益处方面显示出希望。当 TMB 水平升高时，接受免疫治疗的患者的总体生存率会提高。然而，一些研究对 TMB 作为生物标志物的精确度提出了质疑，因为 MSI-H 正在取代它。
微卫星不稳定性与肿瘤突变负担测试 AHS - M2178
肿瘤突变负担 (TMB) 是肿瘤组织内非遗传突变的遗传特征，通常报告为每百万个碱基 (兆碱基) 的 DNA 突变总数。原始研究根据全外显子组测序计算 TMB，并将 TMB 报告为外显子组中存在的突变数。然而，TMB 测试已扩展到不覆盖整个外显子的靶向基因测序面板。TMB 可作为生物标志物来识别可能对免疫疗法产生良好反应的患者，因为高 TMB 水平与几种不同癌症类型的免疫疗法客观反应率相关 (Ritterhouse, 2019; C.Willis 等人，2019)。微卫星是短而重复的 DNA 片段，极易发生突变。肿瘤 DNA 中的微卫星不稳定性 (MSI) 被定义为存在相应种系 DNA 中不存在的可变大小的重复 DNA 序列 (Nojadeh, et al., 2018)。具有高微卫星不稳定性 (MSI-H) 的肿瘤具有更强的免疫原性，因此可能对激活免疫系统的药物产生反应。相关政策：AHS-G2054 液体活检 AHS-M2004 林奇综合征 AHS-M2026 结直肠癌管理检测 AHS-M2030 非小细胞肺癌靶向治疗检测 AHS-M2065 不明原发性癌症的分子分析 AHS-M2146 一般基因检测、躯体疾病 AHS-M2168 癌症患者的蛋白质组学检测 AHS-M2171 食管病理学检测 ***注意：本医疗政策复杂且技术性强。如对技术语言和/或具体临床指征有疑问，请咨询您的医生。政策
肿瘤突变负担对不同种族检查点抑制剂药物适用性和疗效的影响
摘要 FDA 批准免疫检查点抑制剂用于治疗肿瘤突变负担 (TMB) 至少为 10 mut/Mb 的癌症，旨在通过广泛扩大治疗资格来减少医疗保健差距。在一组 39,400 名具有基因组和种族数据的患者中，根据目前批准的临界值，黑人和亚裔患者在多种类型的恶性肿瘤中患 TMB 高癌症的可能性较小。降低 TMB 阈值优先增加了少数族裔患者使用免疫检查点抑制剂的资格，同时保留了接受免疫检查点抑制剂治疗的患者群体的治疗益处的预测值。这项研究强调了不同种族群体中 TMB 高癌症的不同分布，并为制定更合理的免疫检查点抑制剂资格标准提供了指导。
非小型
抽象背景肿瘤突变负担（TMB）是最近提出的实体瘤免疫疗法的预测生物标志物，包括非小细胞肺癌（NSCLC）。可用的TMB确定测定方法在水平覆盖率，基因含量和算法上有所不同，从而导致结果差异，从而影响患者的选择。迫切需要对NSCLC患者队列中TMB评估的协调研究。方法我们评估了使用两个销售的下一代测序面板获得的TMB评估：Trusight Oncology 500（TSO500）和96 NSCLC样品中的参考分析（Foundation One，FO）与参考分析（FOSTION ONE，FO）相比。此外，我们研究了三种方法与肿瘤中PD-L1表达的一致性水平，检查了不同免疫浸润与TMB的水平，并进行了实验室间可重复性研究。最后，确定了调整后的截止值。结果两个面板都与FO相一致，一致性相关系数（CCC）为0.933（95％CI 0.908至0.959），用于OTML的0.933（95％CI 0.908至0.959）和0.881（95％CI 0.840至0.922）。相应的CCC为0.951（TSO500-FO）和0.919（OTML-FO），在具有PD-L1的细胞<1％（PD-L1 <1％; N = 55）和0.861（TSO500-FO）和0.722（OTML-FO）的肿瘤中，pD-L1（pd-L1 <1％; n = 55）和0.722（otml-fo）（otml-fo）（otml-fo）（otml-fo）（otml-fo）（otml-fo），带有PD-L1％（n = 41％）（n = 41％）。实验室间的可重复性分析显示，TSO500的可重复性更高。在免疫浸润与TMB方面没有发现显着差异。结论两个面板在TMB评估中均表现出强大的分析性能，并且更强调整后的截止值对应于10个MUTS/MB的FO需要降低到7.847 MUTS/MB（TSO500）和8.380 MUTS/MB（OTML），以确保灵敏度> 88％。随着这些临界值的阳性预测值为78.57％（95％CI 67.82至89.32），负预测值为87.50％（95％CI 77.25至97.75）的TSO500，而OTML则为OTML，而OTML为73.33％（95％CI 62.142.14至84.52）和84.52）至84.52）至84.52）至84.52）至84.52）至84.52）至84.52）至84.52）（84.52）至84.52）分别为74.81至97.41）。
不匹配修复缺乏不足以引起肿瘤免疫原性
DNA不匹配修复缺乏（MMRD）与高肿瘤突变负担（TMB）以及对免疫检查点阻滞（ICB）治疗的敏感性有关。尽管如此，大多数MMRD肿瘤对ICB的反应不持久，并且有关这些肿瘤中免疫监视和TMB的关键问题仍然存在。在本研究中，我们开发了MMRD肺和结肠癌的自围小鼠模型。令人惊讶的是，这些模型没有显示出T细胞浸润或ICB响应增加，我们证明这是突变的大量肿瘤内异质性的结果。此外，我们发现免疫监视塑造了克隆建筑，而不是新抗原的整体负担，并且针对亚克隆新抗原的T细胞反应被钝化。最后，我们证明了克隆人但没有下克隆的新抗原负担预测了MMRD胃癌和结直肠癌的临床试验中的ICB反应。这些结果为理解高TMB的癌症的免疫逃避提供了重要背景，并对旨在增加TMB的疗法具有重大影响。
加速亚洲患者获得精准肿瘤治疗的机会-...
综合基因组分析 (CGP)：综合基因组分析是一种下一代测序方法，能够检测新的和已知的变异，包括所有类别的基因组改变（碱基替换、插入和缺失、拷贝数改变和重排）和基因组特征（如肿瘤突变负担 [TMB] 或血液 TMB、微卫星不稳定性和杂合性缺失），以提供预后、诊断和预测见解，为所有癌症类型的个体患者提供治疗决策信息。