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利用血小板进行抗肿瘤药物输送和调节肿瘤免疫微环境
血小板是血液成分，传统上认为在血管止血和血栓形成中起着重要作用。近年来，血小板因其在肿瘤发生和发展中的作用而受到新的关注。一方面，血小板被各种肿瘤主动招募，是肿瘤微环境 (TME) 的重要组成部分，从而激发了血小板用于肿瘤靶向药物输送的用途。为此，已经提出了各种基于血小板的装置，例如天然血小板、工程血小板、血小板膜和血小板衍生的微粒。另一方面，血小板通过引导和/或协助各种肿瘤相关免疫细胞参与肿瘤免疫抑制机制。然而，在炎症和自身免疫性疾病的背景下，血小板可以通过促进免疫细胞动员和活化来增强免疫反应，从而加剧组织损伤。因此，人们对使用肿瘤相关血小板作为治疗调节 TME 和增强抗肿瘤免疫反应的靶点的兴趣日益浓厚。在这篇综述中，我们总结了利用血小板进行抗肿瘤药物输送和TME免疫调节的最新进展。
药物基因组学和表观基因组学方法解开肿瘤学中 IL-10 阻断之谜
在许多恶性肿瘤中，宿主免疫系统状态仍是一个未解之谜。癌细胞的免疫功能低下状态或智能免疫监视策略是癌症侵袭和转移的主要原因。仔细观察肿瘤免疫微环境，可以发现浸润免疫细胞和癌细胞之间存在复杂的网络和串扰，这些网络和串扰由细胞因子、趋化因子、外泌体介质和脱落配体介导。白细胞介素等细胞因子可以影响肿瘤微环境 (TME) 的所有成分，从而根据其分泌来源促进或抑制肿瘤侵袭。白细胞介素 10 (IL-10) 是一种互锁细胞因子，与多种类型的恶性肿瘤有关，并被证明具有矛盾的作用。IL-10 对 TME 内的细胞和非细胞成分具有多种功能。在本综述中，作者阐明了 IL-10 在几种恶性肿瘤 TME 中的调节作用。此外，作者还介绍并讨论了调节 IL-10 的详细表观基因组学和药物基因组学方法。
与癌症相关的成纤维细胞和前列腺癌干细胞
前列腺癌发育和耐药性的主要驱动因素的前列腺癌干细胞（PCSC）的功能异质性和生态位吸引了大量研究的关注。与癌症相关的纤维细胞（CAF），它们是肿瘤微环境（TME）的关键组成部分（TME），其主要影响PCSC茎。此外，CAFS通过释放信号分子并修改周围环境来促进PCSC的生长和存活。相反，PCSC可以通过产生各种分子来影响CAF的特征和行为。这种串扰机制对于前列腺癌的进展和治疗耐药性的发展至关重要。使用类器官建模TME可以对CAF-PCSC相互作用进行深入研究，从而提供了一种有价值的临床前工具，以准确评估潜在的靶基因并设计针对前列腺癌的新型治疗策略。这篇综述的目的是讨论有关CAF-PCSC相互作用和串扰的多层次和多坐骑调节机制的当前研究，旨在为治疗方法提供解决前列腺癌治疗挑战的治疗方法。
肿瘤微环境中调节性T细胞的代谢谱
癌细胞的抽象代谢重编程会产生以营养限制，缺氧，酸度和氧化应激为特征的肿瘤微环境（TME）。尽管这些条件不利于浸润效应T细胞，但积累的证据表明，调节性T细胞（Tregs）继续在TME内发挥其免疫抑制功能。TME内的Treg的优势源于它们的代谢概况。tregs依靠氧化磷酸化来用于其功能，这些功能可以由多种底物促进。即使Tregs是增加抗肿瘤免疫反应的有吸引力的目标，但要专门针对肿瘤内Treg仍然是一个挑战。我们对在肿瘤内的流行条件下对Treg代谢调节涉及的不同机械联系和途径进行了全面综述。我们还描述了这些Treg与外围的Treg以及肿瘤中的常规T细胞有何不同。靶向负责适应肿瘤微环境中Treg的途径可改善临床前模型中的抗肿瘤免疫力。这可以提供旨在减少肿瘤免疫抑制的替代疗法。
针对Foxp3的翻译后修饰
健康的免疫系统对于宿主抵抗外部病原体和维持体内平衡至关重要。然而，免疫抑制性肿瘤微环境（TME）会损害抗肿瘤免疫，并促进肿瘤的进展，侵袭和转移。最近，许多研究发现FOXP3+调节性T（Treg）细胞是主要的免疫抑制细胞，通过促进各种肿瘤相关细胞的发展并抑制效应免疫细胞的活性来促进TME的形成。考虑到Treg在肿瘤进展中的作用，鉴定新的治疗药物以靶向和耗尽肿瘤中的Treg是关键的。尽管有几项研究开发了针对Treg的靶向缺失，以减少TME并支持肿瘤中效应T细胞的积累，但Treg靶向的治疗系统会系统地影响Treg人群，并可能导致自身免疫性疾病的发展。众所周知，在疾病条件下，FOXP3经历了几种定义的转化后修饰（PTMS），包括乙酰化，糖基化，磷酸化，泛素化，泛素化和甲基化。这些PTM不仅提升或减轻FOXP3的转录活性，还会影响Tregs的稳定性和免疫抑制功能。各种研究表明，参与PTM的酶的药理靶向可以显着影响Foxp3的PTM。因此，它可能会影响癌症和/或自身免疫性疾病的进展。总体而言，这项综述将帮助研究人员了解Tregs免疫抑制机制，FOXP3的翻译后法规以及对TME中Tregs靶向TREG的潜在治疗靶标和策略的进步，以改善抗肿瘤的免疫力。
meti：通过整合细胞形态和空间转录组学的深度分析肿瘤生态系统
空间转录组学（ST）技术的最新进展为肿瘤微环境（TME）内细胞相互作用提供了宝贵的见解。但是，大多数分析工具都缺乏对组织学特征的考虑，并且依赖于匹配的单细胞RNA测序数据，从而限制了它们在TME研究中的有效性。为了解决这个问题，我们介绍了形态增强的空间转录组分析集成仪（Meti），这是一个端到端框架，绘制癌细胞和TME成分，层状细胞类型和状态，并分析细胞的共同定位。通过整合空间转录组学，细胞形态和策划的基因特征，可以增强我们对组织内部骨骼景观和细胞相互作用的理解。我们评估了从各种肿瘤组织产生的ST数据（包括胃，肺和膀胱癌）以及前态组织中产生的ST数据的性能。我们还对现有的聚类和细胞反卷积工具进行了定量比较，证明了Meti的稳健性和一致的性能。
可解释的人工智能揭示了与乳腺癌患者更好预后相关的肿瘤微环境条件的新见解
我们使用可解释人工智能 (XAI) 模型研究了肿瘤微环境 (TME) 中的特征与三阴性乳腺癌 (TNBC) 和非三阴性乳腺癌 (NTNBC) 患者的总体和 5 年生存率之间的数据驱动关系。我们使用了 Cancer Genome Atlas 中浸润性乳腺癌患者的临床信息以及 cbioPortal 的两项研究、PanCanAtlas 项目和 GDAC Firehose 研究。在这项研究中，我们使用了来自 UCSC Xena 数据集的 1,015 名乳腺癌患者（活着或已故）的标准化 RNA 测序数据驱动队列，并使用 EPIC 方法进行集成反卷积，以估计来自 RNA 测序数据中的七种不同免疫和基质细胞的百分比。从我们的 XAI 模型中获得的新见解表明，CD4+ T 细胞和 B 细胞比其他 TME 特征对 TNBC 和 NTNBC 患者的预后改善更为关键。我们的 XAI 模型揭示了 CD4+ T 细胞和 B 细胞的临界拐点（即阈值分数），高于或低于该拐点，5 年生存率就会提高。随后，我们确定了从拐点推断出的特定条件下 TNBC 和 NTNBC 患者 ≥5 年生存的条件概率。特别是，XAI 模型显示，TME 中 B 细胞分数超过 0.018 可确保 NTNBC 患者 100% 的 5 年生存率。这项研究的结果可以带来更准确的临床预测和增强的免疫疗法，以及设计创新策略来重新编程乳腺癌患者的 TME。
分析代谢对肿瘤微环境中免疫细胞的影响以促进免疫疗法的发展
肿瘤代谢和肿瘤免疫力密不可分。靶向肿瘤的代谢是值得研究的肿瘤免疫疗法的点。最近，肿瘤和免疫细胞代谢对肿瘤的发生，增殖，转移和预后的影响引起了更多的关注。肿瘤组织形成特定的肿瘤微环境（TME）。除了肿瘤细胞外，TME中还有免疫细胞，基质细胞和其他细胞。为了适应环境，肿瘤细胞经过各种物质的代谢重编程。肿瘤细胞的代谢重编程可能会进一步影响肿瘤微环境的形成以及多种细胞（尤其是免疫细胞）的功能，最终促进了肿瘤的发展。因此，有必要研究肿瘤细胞的代谢及其对免疫细胞的影响，以引导肿瘤免疫疗法。抑制肿瘤代谢可能会恢复免疫平衡并促进肿瘤中的免疫反应。 本文将描述肿瘤中的葡萄糖代谢，脂质代谢，氨基酸代谢和免疫细胞。 此外，还讨论了代谢对TME免疫细胞的影响，以分析和探索肿瘤免疫疗法。抑制肿瘤代谢可能会恢复免疫平衡并促进肿瘤中的免疫反应。本文将描述肿瘤中的葡萄糖代谢，脂质代谢，氨基酸代谢和免疫细胞。此外，还讨论了代谢对TME免疫细胞的影响，以分析和探索肿瘤免疫疗法。
探索癌症的促肿瘤特性
肿瘤微环境 (TME) 高度促进肿瘤上皮细胞的发展和化学抗性，而肿瘤微环境主要由癌症基质组成。这有多种原因。其中，癌症相关成纤维细胞 (CAF) 尤为突出，因为它对肿瘤的促进至关重要。尽管特定的基质改变仍有待商榷，但了解单个肿瘤内的成纤维细胞群体却变得更加困难，因为肿瘤内部存在不可否认的异质性。肿瘤释放的大量化学信号改善了异型成纤维细胞和 CAF 之间的联系，促进了癌症的扩散。彻底了解这种复杂的微环境对于有效预防实体瘤生长至关重要。最近的研究揭示了有关 CAF 在 TME 中的作用的重要新见解。本综述的目的是仔细研究肿瘤中的 CAF 与植物次生代谢产物之间的关系，重点是百里香醌 (TQ)。在 PubMed 和 Google Scholar 中搜索了 2010 年至 2023 年期间发表的文献，关键词包括 TQ、TME、癌症相关成纤维细胞、作用机制和黄酮类化合物。结果显示，大量数据证实了植物次生代谢物的活性，特别是 TQ 参与阻断 CAF 运作。经过仔细研究，还阐明了黄酮类化合物对癌症相关途径的更广泛影响。本研究强调了 TME 的复杂动态，并强调了 CAF 的关键作用。它还研究了植物中发现的次生代谢物可能提供的干预措施，根据最近的文献，TQ 在调节 CAF 功能方面发挥着至关重要的作用。