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预先索引组装的TN5转座体53152
每个井都包含4 µL的8 µm预组装TN5转身。该浓度是索引底漆对和TN5（8 µM TN5 + 4 µM寡核A + 4 µm寡核B）的组合。使用50,000个细胞在ATAC-SEQ中验证了预先索引的组装TN5转座体。测试了所有I5和I7指数组合，以确保在生物学相关的标记反应中效率。i5和i7索引组合被鉴定出来产生较少的测序读数，用索引N709代替，并在重新测试后产生正常的测序读数，以确认它们产生最佳结果。井，其中N709更换了该行中其他井的索引，并在上面的板映射中用红色N709*突出显示，以轻松查看板的逻辑布局的变化。
辐射杂种的汇总分析确定了哺乳动物细胞生长和药物作用的基因座
TN5转座子标记双链DNA和RNA/DNA杂交产生的核酸，这些核酸准备被放大以进行高通量测序。必须探索TN5转座子的核酸底物以增加TN5的应用。在这里，我们发现TN5转座子可以将寡核酸转置超过140个核苷酸的单链DNA的5'端。基于TN5的此属性，我们开发了一种基于标记和启用连接的单链DNA测序方法，称为Table-Seq。通过一系列反应温度，时间和酶浓度测试，我们将表格seq应用于链特异性的RNA测序，从总RNA的30 pg开始。此外，与传统的基于DUTP特异性的RNA测序相比，该方法检测到更多的基因，具有较高的链特异性，并且在基因之间显示出更均匀分布的读数。一起，我们的结果提供了有关TN5转座子特性的见解，并扩展了TN5在尖端测序技术中的应用。
TN5标记并将寡核酸转移到单链DNA中，以进行链特异性RNA测序
哺乳动物细胞中的遗传筛选通常专注于功能丧失方法。为了评估额外基因拷贝的表型后果，我们使用了辐射杂种（RH）细胞的大量分离分析（BSA）。，我们构建了六个RH细胞池，每个池由约2500个独立克隆组成，并将池放置在带有或没有紫杉醇的培养基中。低通序测序鉴定859个生长基因座，38个紫杉醇基因座，62个相互作用基因座和3个基因座，用于跨基因组的明显限度，用于线粒体丰度。分辨率被测量为约30 kb，接近单基因。差异性特性，反驳了平衡假设。此外，在RH池中，人类丝粒的保留增强表明，这些染色体元素的功能解剖方法是一种新的方法。对RH细胞的合并分析显示出高功率和分辨率，应该是哺乳动物遗传工具包的有用补充。
Tagify™ i5 UMI 适配器加载转座酶 24/96 ...
简介 seqWell 的 Tagify™ i5 UMI 适配器负载转座酶试剂旨在催化通过 Tn5 转座酶用寡核苷酸有效载荷片段化和标记 DNA 的反应。具体而言，这些试剂可提供由全长、与 Illumina 兼容的 P5/i5/UMI/R1 引发序列组成的寡核苷酸，这些序列还包含 10 个碱基的条形码和 10 个碱基的唯一分子标识符 (UMI) 区域。这些试剂可作为靶向测序检测的一部分加入，例如 UDiTaS 1 或 RGen-Seq 2 应用、CRISPR QC 以及细胞和基因工程 QC。该产品以 24 种或 96 种不同的条形码 UMI 试剂形式提供。本用户指南介绍了试剂的一般用途，并非旨在作为特定文库制备方法的完整协议。建议个人用户查看其应用程序 3 并根据需要进行修改。
泰米尔纳德邦政府公报
细菌中的性过程：转化，转导和缀合基因转移：现象机制和应用。重组：模型，机制和控制。基因作为表达单位。基因和聚 - 肽的结合性。阐明遗传密码，摇摆假设。基因表达的调节。额外的染色体遗传：发现质粒的生物学，F，RTF，Col-Factor和Ti质粒的类型和结构，复制和分配。不兼容和拷贝数控制，自然和人造质粒转移及其应用。可转座的遗传元件 - 转置的鉴定 - 是元素，复合座盆，TN3，TN5，TN9，TN9，TN10和MU噬菌体。换位机理。真核生物中的可替代元素：玉米 - AC＆DS，SPM＆DSPM，果蝇 - P元素。复古转座子。真核生物的遗传学：基因链接和染色体映射。交叉 - 有点交叉，四分法分析。染色体的组织，专门的染色体，染色体异常，定量遗传，种群遗传学。使用果蝇作为模型系统的遗传学发展。
用子...
昆虫学采样和存储条件通常会优先考虑效率，实用性和形态特征的保守性，因此可能是DNA保存的次优。这种做法可能会影响下游分子应用，例如高通量基因组文库的结构，这通常需要大量的DNA输入量。在这里，我们使用了实用的TN5转座酶标记的基于基于96孔板的库制备方法，并从昆虫腿的低屈服DNA提取物中进行了优化，这些昆虫的DNA提取物是在亚最佳条件下存储的DNA保存的。将样品在野外车辆中长时间保存，然后在冰箱中的乙醇中长期存储或在室温下干燥。通过将DNA输入减少到6ng，可以处理更多具有亚最佳DNA产量的样品。我们将这种低DNA输入与市售标记酶的6倍稀释匹配，从而大大降低了库制备成本。通过直接放大后单个图书馆汇集的成本和工作量进一步抑制。我们生成了90个样本中88个中等覆盖范围（> 3倍）基因组，平均覆盖率约为10倍。与储存在乙醇中的样品相比，与储存的样品相比，DNA的DNA明显较少，但这些样品具有较高的测序统计量，其测序读数较长，内源性DNA的速率更高。此外，我们发现基于标记的库制剂的效率可以通过彻底的放大后珠子清理来提高，该珠子可以选择不针对短和大的DNA片段。通过打开使用亚最佳保存的低产量DNA提取物的机会，我们扩大了昆虫标本的整个基因组研究的范围。因此，我们期望这些结果和该协议对于昆虫学领域的一系列应用都有价值。