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机器学习在人类细菌 MALDI-TOF 质谱分析中的应用：系统评价
摘要 — 细菌鉴定、抗生素耐药性预测和菌株分型是临床微生物学中的关键任务，对于指导患者治疗和控制传染病的传播至关重要。虽然机器学习 (ML) 和深度学习 (DL) 在增强 MALDI-TOF 质谱应用方面显示出巨大的前景，但仍然缺乏从技术角度进行的全面审查。为了弥补这一差距，我们系统地回顾了 2004 年至 2024 年期间发表的 93 项研究，重点关注关键的 ML/DL 方面，例如数据大小和平衡、预处理流程、峰值选择方法、算法、评估技术以及开源数据和代码的可用性。我们的分析强调了随机森林和支持向量机等经典 ML 模型的主要用途，以及人们对使用 DL 方法处理复杂高维数据的兴趣。尽管取得了重大进展，但预处理工作流程不一致、依赖黑盒模型、外部验证有限以及开源资源不足等挑战仍然存在，阻碍了透明度、可重复性和更广泛的采用。通过解决这些关键差距，本综述提供了可行的见解，以弥合微生物学和技术视角之间的鸿沟，为诊断微生物学中更强大、可扩展和可解释的解决方案铺平了道路。
采用无离子对反相法和 TOF LC/MS 进行寡核苷酸分析
评估了三种流动相改性剂，以确定其对寡核苷酸 LC/MS 分离和灵敏度的影响（图 1）。本研究评估的流动相缓冲液包括碳酸氢铵、醋酸铵和甲酸铵，流动相 A 中的浓度均为 20 mM。醋酸铵和甲酸铵缓冲液用氢氧化铵调节至 pH 8.5，而碳酸氢铵缓冲液未调节 pH。LC/UV 结果表明，14、17、20 和 21 碱基 RNA 样品在 RP 柱上的分离效果相似，20 碱基和 21 碱基 RNA 之间的平均分离度为 R = 1.47。这表明进一步的梯度优化可以实现 n-1 杂质的基线分离（R = 1.5），而生物制药中经常监测这些杂质。
使用配备高分辨率 LC/Q-TOF 的 LC 筛选工具进行毒理药物筛选
本应用报告详细介绍了在复杂生物基质中进行毒理药物筛选的方法。该方法是在 Agilent Revident 液相色谱/四极杆飞行时间质谱仪 (LC/Q-TOF MS) 上开发的，配有 Agilent ChemVista 光谱库管理器和 Agilent MassHunter 定量分析软件 12.1 版。嵌入在 MassHunter 定量分析软件中的 LC Screener 工具用于快速查看数据独立采集 (DIA) 方法的结果，该方法适用于典型的大浓度范围内的多种目标分析物。本应用报告描述了完整的筛选工作流程，包括样品制备、可疑药物筛选和数据分析结果，用于在相关生物基质中筛选毒理药物。
使用具有高分辨率LC/Q-TOF
本申请说明详细介绍了复杂生物矩阵中毒理药物筛查的方法。该方法是在具有敏捷的ChemVista Spectral Spectral Library库Manager和Agilent MassHunter定量分析软件的Agilent速度液相色谱/四极型飞行时间质谱仪（LC/Q-TOF MS）上开发的。版本12.1。嵌入在MassHunter定量分析软件中的LC筛选器工具用于快速回顾典型的大浓度范围内的广泛目标分析物的数据独立于数据的采集（DIA）方法。本申请说明描述了一个完整的筛选工作流程，包括样品制备，可疑筛查和数据分析结果，用于筛查相关生物矩阵中毒理学药物。
草稿指导线 - 临床开发中的中型产品...
5-ASA 5-aminosalicylic acid Ab antibody ASCVD atherosclerotic cardiovascular disease ADR adverse drug reaction AE adverse event AIDS acquired immunodeficiency syndrome ALC absolute lymphocyte count ALT alanine aminotransferase ANC absolute neutrophil count aRMM additional risk minimisation measure ART 20 Article 20 procedure ARTIS Anti-rheumatic Therapies in Sweden AS （浓度时间）曲线平均每日剂量在（浓度时间）平均每日剂量蝙蝠棕色脂肪组织BCC基础细胞癌BCR乳腺癌抗癌蛋白BDMARD生物学疾病调节抗rheumaumatic Bibis in Die（Twice Demakic in Demand）pede rean Inde Bikikeric inde Bikikeric inde bikiakic， BIOBADASER Registro Español De Acontecimientos Adversos De Terapias Biológicas En Enfermedades Reumáticas BMI body mass index BSRBR British Society for Rheumatology Biologics Register CARRA Childhood Arthritis and Rheumatology Research Alliance CHF congestive heart failure CI confidence interval Cmax peak plasma concentration CNS central nervous system CrCl creatinine clearance csDMARDs conventional synthetic disease-modifying anti-rheumatic drug CTC Common Terminology Criteria CV cardiovascular CVD cardiovascular disease CYP cytochrome P450 DHPC Direct Healthcare Professional Communication DILI drug-induced liver injury DLP data lock point DMARD disease-modifying anti-rheumatic drug DNA deoxyribonucleic acid DUS drug utilisation study DVT深静脉血栓形成EBV EBV EBV EBV EBV病毒EEA EEA EEA EEA EEA EEF EFD EFD胚胎 - 纤维 - 纤维化EHR电子保健记录EM广泛代谢EMA EMA EMA欧洲药物局Eneida estudio eneeida estudio nacional nacional nacional enfermedAd infamatoria infamatoria infamatoria Intestinal sobre sobre sobre sobre sobre sabientans ygenéticosygenéticosygenéticientesygenéticientementailesy/divales
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3. 被选中的候选人将有权享受室内治疗，仅适用于正式员工，不适用于任何受抚养人，但若工作时间为 1（一年），则每年最高限额为 50,000 卢比，若工作时间为 6（六个月），则最高限额为 25,000 卢比。但是，受 WBHS~2008、CGHS 或类似其他计划覆盖的人员无权享受此项福利。州政府退休人员即使未受 WBHS-2008 覆盖，也将无权享受任何医疗报销设施。
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对正常读数ASIC的性能评估，重点是TOF-PET中的Cherenkov排放
抽象目标。诸如Cherenkov发射（Cherenkov发射）的有效用法对于下一代，具有成本效益和超高敏感性的效果时间的启发时间引起了极大的兴趣。使用自定义，高功率消耗，读出电子设备和快速数字化，已经显示了与宠物大小的BGO晶体低于300 PS FWHM的前景。但是，这些结果无法扩展到由数千个检测器元素组成的完整系统。方法。为了铺平通往全型TOF-PET扫描仪的道路，我们使用Cherenkov发射闪光灯（BGO）研究了及时的ASIC的性能，以及基于FBK的金属沟通的最新SIPM探测器的开发之一。castic是一个高度可辨认的ASIC，具有8个输入通道，12 MW CH -1的功耗和能量测量的极好线性。为了将FASTIC的定时性能置于透视上，进行了比较测量与高功率消耗读数电子设备的比较测量值。主要结果。，对于2×2×3 mm 3和490 ps的最佳CTR FWHM，对于2×2×20 mm 3的Bgo晶体，及其可及时的2×2×3 mm和490 ps。此外，使用20毫米长LSO：CE：CA晶体，已经用castic测量了129 ps fwhm的CTR值，仅与离散HF电子设备获得的95 ps的最新ps略差。明显的能力。在第一次，已经评估了具有可伸缩性ASIC的BGO的定时能力。发现强调了宇宙ASIC在具有出色时机特征的成本效益TOF-PET扫描仪的发展中的潜力。
使用 LA-ICP-TOF-MS 对 CM 球粒陨石进行定量元素映射：一种先进的外星物质筛选工具
简介：元素丰度在陨石的组成矿物之间会进行分馏，即使是化学性质非常相似的稀土元素 (REE) 也是如此。先前的研究表明，亲石元素，特别是难熔亲石元素，在其母体的热变质过程中从原生相重新分布到次生相 [1-3]。然而，由于矿物颗粒尺寸相对较小（< 50 μm）且矿物中夹杂物（< 10 μm），因此，对于在母体中经历了水蚀变的碳质球粒陨石 (CC)，这种重新动员（包括它们的元素分布，尤其是微量元素）的了解甚少 [4]。因此，我们开发了使用激光剥蚀电感耦合等离子体飞行时间质谱 (LA-ICP-TOF-MS) 进行定量元素映射的分析方法，不仅可以提供主要元素图，还可以提供具有大表面积 (cm × cm)、高空间分辨率 (5×5 μm/像素) 的微量元素图，并且对后续分析的表面影响可以忽略不计 [5]。这种元素映射已被证明是一种确定 H 球粒陨石中元素分布的有效工具，然后应该适用于由带有包裹体的小矿物颗粒组成的 CC。因此，在本研究中，我们旨在将 LA-ICP-TOF-MS 映射应用于 CM 球粒陨石 (CM)，这是最丰富的 CC，显示出从几乎 3 型到 1 型的各种变质程度，以确定 (i) 组成矿物中的元素丰度，(ii) 最富含特定元素的相，以及 (iii) 组成矿物之间的元素分布，这可能揭示母体水蚀变过程中元素的重新动员，并有助于限制水蚀变的物理化学条件。