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抗疫苗接种参与者的交流资源动员1 top1在黑色素瘤进展和...
Sylva 8的Felius，编辑Marcia Lopes Concolor 9，Meenhard Herlyn 4，Patricia Possik 3，6
TDP1 和 TOP1 作为 NSCLC 抗癌治疗的靶点
目的：拓扑异构酶 1 (TOP1) 是用于治疗各种癌症的药物靶点。酪氨酰 DNA 磷酸二酯酶 1 (TDP1) 的酶活性可以抵消 TOP1 药物的作用。因此，为了阐明将 TDP1 和 TOP1 结合作为 NSCLC 抗癌治疗药物靶点的相关性，首次在大量 NSCLC 患者的正常和肿瘤组织配对中量化 TDP1 和 TOP1，并将两种酶的数据与临床数据相关联。材料和方法：使用 TDP1 和 TOP1 特异性生物传感器和 ELISA 测量 150 名 NSCLC 患者的正常和肿瘤组织配对中的 TDP1 和 TOP1 活性和蛋白质浓度。将 TDP1 和 TOP1 活性和蛋白质浓度与临床数据相关联。结果：在个体患者中，TDP1 和 TOP1 活性和蛋白质浓度从正常组织到肿瘤组织显著上调，但与任何临床数据均无相关性。TDP1 和 TOP1 活性分别在 89.3% 和 82.7% 的患者中上调，并且在正常组织和肿瘤组织中均具有相关性。蛋白质浓度也呈现出相同趋势，分别在 73.0% 和 84.4% 的患者中 TDP1 和 TOP1 上调。TDP1 和 TOP1 的活性和蛋白质浓度在正常组织和肿瘤组织中均具有相关性。结论：TDP1 和 TOP1 从正常组织到肿瘤组织的上调，结合 TDP1 和 TOP1 与任何临床数据均无相关性的观察结果，表明这两种蛋白质对于 NSCLC 中肿瘤细胞的发展或维持都很重要。TDP1 和 TOP1 之间的相关性表明酶之间存在生物依赖性和潜在的共同调节作用。这些观察结果对于使用 TOP1 和 TDP1 作为 NSCLC 抗癌治疗的靶点具有鼓舞作用。
Exatecan 的 TOP1-DNA 捕获以及与 ATR 抑制剂的联合治疗
Exatecan 和 deruxtecan 是抗肿瘤喜树碱衍生物，正在开发中作为肿瘤靶向递送弹头，配方包括肽、脂质体、聚乙二醇 (PEG) 纳米颗粒和抗体-药物偶联物 (ADC)。在这里，我们报告了 exatecan 与临床批准的拓扑异构酶 I (TOP1) 抑制剂的分子药理学以及用于验证生物标志物和 exatecan 与 ATR 抑制剂组合的临床前模型的比较。在 TOP1 裂解复合物界面处对 exatecan 结合进行建模表明，除了喜树碱与 TOP1 残基 R364、D533 和 N722 的三种已知相互作用外，还表明与侧翼 DNA 碱基和 TOP1 残基 N352 存在两种新的分子相互作用。因此，与临床上使用的传统 TOP1 抑制剂相比，依沙替康表现出更强的 TOP1 捕获能力、更高的 DNA 损伤和细胞凋亡。我们证明了 SLFN11 表达和同源重组 (HR) 缺陷 (HRD) 作为依沙替康反应的预测生物标志物的价值。我们还表明，依沙替康与临床 ATR 抑制剂 ceralasertib (AZD6738) 协同杀死癌细胞。为了确定这种组合的转化潜力，我们测试了 CBX-12，这是一种临床开发的 pH 敏感肽-依沙替康缀合物，可选择性靶向癌细胞，目前正在进行临床试验。CBX-12 与 ceralasertib 的组合显着抑制了小鼠异种移植中的肿瘤生长。总的来说，我们的结果表明
对 TOP-1 抑制剂的耐药性：老药新用仍能给我们带来惊喜
摘要：伊立替康 (SN-38) 是一种强效广谱抗癌药物，靶向 DNA 拓扑异构酶 I (Top1)。它通过与 Top1-DNA 复合物结合并阻止 DNA 链重新连接，从而导致致命的 DNA 断裂形成，发挥细胞毒性作用。在对伊立替康产生初始反应后，会相对较快地产生继发性耐药性，从而影响其疗效。有几种机制导致耐药性，这些机制会影响伊立替康代谢或靶蛋白。此外，我们已经证明了一种主要的耐药机制，与 DNA 上数十万个 Top1 结合位点的消除有关，这些位点可能是由于修复先前的 Top1 依赖性 DNA 裂解而产生的。在这里，我们概述了伊立替康耐药性的主要机制，并重点介绍了该领域的最新进展。我们讨论了耐药机制对临床结果的影响以及克服伊立替康耐药性的潜在策略。阐明伊立替康耐药的潜在机制可以为制定有效的治疗策略提供有价值的见解。
topoisomerase 1抑制MYC驱动的癌症会促进异常的R环积累，以诱导合成致死性
摘要MYC是基因转录的中心调节剂，在人类癌症中经常失调。直接靶向MYC是挑战，另一种策略是识别MYC作为有效的癌症驱动器所需的特定蛋白质或过程，该癌症驱动器可以针对导致合成的致死性。为了识别MYC驱动的癌症中的潜在靶标，我们使用一对乳腺癌细胞系进行了基因组宽CRISPR敲除筛查，其中MYC失调是从良性转变为转化的肿瘤生长的转变。调节R环的蛋白质被鉴定为一类潜在的合成致命靶标。失调的MYC升高全球转录和一致的R环累积。拓扑异构酶1（TOP1）是DNA拓扑的R-loops的调节剂，已被验证为MYC活性较高的细胞中的脆弱性。与对照细胞相比
IDE161 是一种潜在的首创临床候选 PARG 抑制剂，选择性靶向具有复制压力和 DNA 修复脆弱性的实体肿瘤
A) 描绘了对 TOP1 和 PARG 双重抑制的拟议 MOA 的模型。B) 对 PRISM 化合物和 PARGi 的反应的 Spearman 相关图；橙色表示 TOP1 抑制剂，黑色表示其他。（插图）按 MOA 分组的顶级相关化合物的 Swarmplot（未显示少于 2 种化合物的 MOA）。拓扑异构酶抑制剂 (TOP)、法呢基转移酶 (FT)、微管蛋白聚合 (TP)、极光激酶 (AK)、胸苷酸合酶 (TS)。C) 使用 PAR MSD 测定法评估 PAR 链积累。值绘制为相对于 DMSO 对照的平均值 ± SD。使用 Student's t 检验进行统计分析；ns（不显著）、**（<0.01）、***（<0.001）。D）（左）使用基于抗 TOP1cc 抗体的免疫荧光测定法在指示时间点测量 TOP1-DNA 裂解复合物 (TOP1cc)。根据单个细胞中的 TOP1cc 平均强度值进行群体分箱和非线性曲线拟合。使用 Kruskal-Wallis 检验进行统计分析；****(<0.0001)。（右）使用基于抗 γ -H2AX 抗体的免疫荧光测定法检测核 γ -H2AX。值（平均值 ± SD）绘制为 γ -H2AX 平均强度范围的百分比群体。E）从 CldU 标记的 DNA 纤维测量结果显示，IDE161 和 CPT 介导的复制叉减慢。框表示中位数和 IQR。使用 Mann-Whitney U 检验进行统计分析；*(<0.05)，**** (<0.0001)。
以 DNA 拓扑异构酶 I 为靶点，对中药化合物进行计算筛选和分子对接，设计潜在的抗癌药物
每年，全球有成千上万的人因癌症发病率和死亡率上升而受苦。此外，癌症患者的治疗选择也很昂贵，而且抗癌药物往往疗效较低且副作用较大。DNA拓扑异构酶可以作为已确定的癌症靶点，因为人类拓扑异构酶（Top1）在有丝分裂后阶段调节基因转录，并在复制和修复过程中在DNA超螺旋中起关键作用。因此，在药物治疗过程中，阻断Top1可能对抑制癌细胞增殖至关重要。这里，通过虚拟筛选对中药化合物进行了筛选。中药库的虚拟筛选过程使得能够根据结合能（-7.1至-9.3Kcal/mol）将化合物列表缩小到29种化合物，而在Lipniski过滤之后，使用MM/PB（GB）SA过滤来筛选剩下的22种化合物，并根据结合自由能选出前四种化合物。这里，这四种化合物； CID-65752（T2972：吴茱萸次碱）、CID-5271805（T4S2126：银杏黄素）、CID-9817839（T2S2335：脱氢吴茱萸碱）和CID-51106（T3054：达伍里索林）在分子对接过程中的结合能分别为-8.2、-8.5、-8.3和-8.2，高于其他化合物。在这四个化合物中，ADMET筛选未发现两个筛选化合物CID-5271805和CID-9817839的毒性特征。此外，药物-蛋白质复合物的SASA（溶剂可及表面积）、Rg（回转半径）、RMSD（均方根偏差）和RMSF（均方根波动）轮廓在分子动力学模拟研究中揭示了化合物的稳定性和刚性。然而，这些研究需要通过实验方法进行验证，以开发更有效的抗癌药物。
CBX-12 (alphalex
目的：确定与未结合的依沙替康相比，TOP1 抑制剂依沙替康与 pH 敏感肽 (CBX-12) 联合对肿瘤进行抗原非依赖性靶向治疗是否能产生更好的免疫疗法协同作用。材料和方法：通过 FACS 和 ELISA 测定进行体外和离体功能测定。在同源 CT26 模型中评估体内疗效。结果：CBX-12 与抗 PD-1 或抗 CTLA4 联合使用可延迟肿瘤生长和完全缓解，治愈动物表现出长期抗肿瘤免疫力。CBX-12 刺激 MHC 1 和 PD-L1 的表达，是免疫原性细胞死亡的诱导剂，产生对肿瘤细胞的长期免疫识别并产生抗肿瘤免疫力。结论：作者的数据为在临床试验中探索与 CBX-12 联合使用免疫疗法提供了理论依据。
认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1