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计算机分子靶点预测揭示甲苯咪唑是一种有效的 MAPK14 抑制剂
法国马赛 ‡ 目前地址：艾克斯马赛大学，CNRS UMR 7257，生物大分子结构与功能，163 avenue de Luminy，13288，马赛，法国。# 通信地址：eddy.pasquier@inserm.fr 分类 大分类：生物科学 小分类：药理学 关键词 癌症；药物靶标预测；胶质母细胞瘤；多药理学；甲苯咪唑；MAPK14 作者贡献 EP 构思了这项研究，分析了数据并撰写了手稿。JAB 进行了大部分实验，分析了数据并起草了部分手稿。KC 纯化了 MAPK14 蛋白并与 SB 一起进行了 TSA 和 ITC 实验。MLG 进行了转录组分析，LH 进行了分子建模工作。他们都撰写了部分手稿。 MF 进行了 ABL1 和 PT 的 TSA 实验，而 FD 进行了 nanoDSF 实验。YC 和 XM 参与了数据分析和手稿准备。PB 进行了计算机模拟目标预测。所有作者都阅读了手稿并提出了改进意见。此 PDF 文件包括：正文 图 1 至 7 表 1 和 2 补充图 1 至 4 补充表 1 和 2
美国EPA -ATMP QC -02-08-对机载污染物实验室的监视
12.3标识和a。对来自SDA板的TSA确认和乳糖 - 苯酚棉蓝色（LPCB）染色的代表性菌落进行了克染色。污染物b。通过对一般和/或选择性培养基进行条纹隔离来进行推定识别。如果试图识别出更挑剔的微生物的存在，请使用特定的生长培养基和孵化条件。
工程原理 2 - YouScience
● 按照既定惯例创建和使用工程笔记本。 ● 展示技术与工程专业工作场所技能的实践。 ● 参加一项重要的活动，该活动为每个学生提供为他人提供服务、运用领导技能或展示他们通过本课程学到的技能的机会，最好是通过参加职业和技术学生组织 (CTSO)，例如技术学生协会 (TSA)。
乳腺癌 CAR-T 细胞疗法和抗体-药物偶联物的细胞表面靶点的鉴定
背景：肿瘤学中两种有前景的治疗策略是嵌合抗原受体-T 细胞 (CAR-T) 疗法和抗体药物偶联物 (ADC)。为了有效和安全，这些免疫疗法需要表面抗原在肿瘤中充分表达，而在正常组织中表达较少或不表达。为了确定专门针对乳腺癌 (BC) 分子和病理亚型的 ADC 和 CAR-T 的新靶点，我们基于多个公开可用的数据集提出了一种新颖的计算机模拟策略，并全面解释了进一步实施的工作流程。方法：我们对 Cancer Genome Atlas BC RNA 测序数据进行了差异基因表达分析，以识别 BC 亚型特异性上调基因。为了充分解释所提出的靶点发现方法，作为概念验证，我们为每种亚型选择了 200 个上调最多的基因，并通过几个公开的数据库对它们在 BC 和正常组织中的蛋白质表达进行了全面分析，以确定可能最安全和可行的靶点。结果：我们确定了 36 种潜在适用且亚型特异性的肿瘤表面抗原 (TSA)，包括成纤维细胞生长因子受体 4 (FGFR4)、癌胚抗原相关细胞粘附分子 6 (CEACAM6)、GDNF 家族受体 α 1 (GFRA1)、整合素 β-6 (ITGB6) 和外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶 1 (ENPP1)。我们还确定了 63 对可能适合共同靶向策略的潜在 TSA 对。最后，我们在一组患者、多种 BC 细胞系和 METABRIC 数据库中验证了亚型特异性。结论：总体而言，我们的计算机模拟分析提供了一个框架，用于识别新的 CAR-T 和 BC 抗体疗法的开发所需的新型和特异性 TSA。关键词：差异基因表达、乳腺癌、内在亚型、CAR-T、抗体 e 药物偶联物、肿瘤表面抗原
在计算机分析中揭示了推定的Mitovires的新型进化谱系
抽象的Mitoviruses（Mitoviridae家族）是在真菌和植物的线粒体中代表的小无衣壳RNA病毒。迄今为止，唯一的真实的动物米托病毒被鉴定为Lutzomyia longipalpis mitovirus 1（Lulmv1）。来自几种动物的转录组研究的公共数据库可能是识别经常错过的Mitovires的好来源。因此，在NCBI转录组shot弹枪组装（TSA）库中搜索类似于Mitovirus的转录本，以及对先前在NCBI非冗余（NR）蛋白质序列库中记录的Mito-病毒的搜索，以识别与动物相关的类似Mitovirus序列。在TSA数据库中总共确定了10个新的推定中病毒，在NR Pro-te-te-te-Te-Te-Teperin数据库中总共确定了5个推定的Mitovires。据我们所知，这些结果代表了与Poriferan，Cnidarians，echinoderms，Crustaceans，Myriapods和Arachnids相关的推定线病毒的第一个证据。根据使用最大似然法的不同系统发育推论，这18种推定的线索病毒与LULMV1（唯一已知的动物感染线虫病毒）形成了强大的单系谱系。基于计算机程序中的这些发现，证明了与动物相关的一系列推定的mitovirus的有力证据，这些枝条被临时命名为“ kvinmitovirus”。
神经精神SLE中的焦虑和抑郁严重程度与灌注和功能连通性变化有关，额叶神经回路的变化：静息状态F（非精神）MRI研究
抽象的目的是检验以下假设：与情绪处理有关的大脑区域中的灌注和功能连通性干扰与神经精神病学SLE（NPSLE）的情绪相关症状有关。进行了静止状态fMRI（RS-FMRI），并评估了32例NPSLE和18个健康对照患者（HC）的焦虑和/或抑郁症状。全脑班时移分析（TSA）图，素的全局连接性（通过固有连通性对比度（ICC）评估）和网络内连接性估计并提交给一个样本t检验。 使用独立样本t检验评估亚组差异（高焦虑症和高抑郁症状）。 在整个组中，还评估了焦虑症（控制抑郁症）或抑郁症状（控制焦虑）与区域TSA或ICC指标之间的关联。 NPSLE患者的焦虑症状升高与右杏仁核中相对更快的血液动力学反应（血液动力学铅）明显相关，轨道DLPFC的内在连接相对较低，并且与dlPFC和VMPFC之间的双向连通性相对较低，并且相对较低。 NPSLE患者的抑郁症状升高与两个半球的VMPFC区域的血流动力学铅（外侧和内侧轨道额皮层）结合在一起，与右侧轨道额内侧右基皮质相对较低的内在连接性相对较低。 这些措施无法解释HC组的自我评估，温和的抑郁症状。全脑班时移分析（TSA）图，素的全局连接性（通过固有连通性对比度（ICC）评估）和网络内连接性估计并提交给一个样本t检验。亚组差异（高焦虑症和高抑郁症状）。在整个组中，还评估了焦虑症（控制抑郁症）或抑郁症状（控制焦虑）与区域TSA或ICC指标之间的关联。NPSLE患者的焦虑症状升高与右杏仁核中相对更快的血液动力学反应（血液动力学铅）明显相关，轨道DLPFC的内在连接相对较低，并且与dlPFC和VMPFC之间的双向连通性相对较低，并且相对较低。NPSLE患者的抑郁症状升高与两个半球的VMPFC区域的血流动力学铅（外侧和内侧轨道额皮层）结合在一起，与右侧轨道额内侧右基皮质相对较低的内在连接性相对较低。这些措施无法解释HC组的自我评估，温和的抑郁症状。通过使用RS-FMRI结论，在具有严重焦虑和抑郁症状的NPSLE患者的边缘和额叶脑区域中发现了灌注动力学的改变和功能连通性。尽管这些变化不能直接归因于NPSLE病理学，但结果为狼疮患者的心理情绪症状学的病理生理底物提供了新的见解，这可能有助于其临床诊断和治疗。
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