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可编程的zwittionic液滴作为生物分子分类器和膜细胞器的模型
越来越多的证据表明，细胞可以通过产生具有明确定义的介观性能的无膜室来调节时间和空间的生化功能。该控制的基础基础的一种重要机制是由编码多价相互作用的联想无序蛋白驱动的简单共凝作。受这些观察结果的启发，基于对响应式合成聚合物的简单共凝聚的可编程液滴，这些聚合物模仿了生物无序蛋白的“贴纸和间隔者”结构。zwitterionic聚合物，并形成液滴，这些液滴明显地排除了大多数分子。从该参考材料开始，Zwitterionic聚合物中的不同函数组可以从添加添加，以编码越来越多的不同分子间相互作用。这种策略允许独立控制液滴的多个新兴特性，例如刺激反应性，极性，选择性吸收客户分子，融合时间和混杂性。通过利用这种高的可编程性，重现了细胞隔室的模型，并产生能够限制空间中不同分子而没有物理屏障的液滴。此外，这些生物分子分类器也被证明能够定位，分离和使靶分子在复杂的混合物中，在生物序列化和诊断方面开放了吸引力的应用。
自杀念头的行为和社会预测指标以及青少年和年轻人的尝试
多宿主病原体犀牛Equi是一种巨噬细胞的寄生虫，可防止吞噬体的成熟，从而创造了一个热情好客的环境，支持细胞内生长。有毒r。equi分别是宿主特异性的毒力质粒，PVAPA，PVAPB和PVAPN，它们编码了属于七个单属进化枝的17个VAP蛋白的家族。我们检查了所有17种VAP蛋白，以补充A R的细胞内生长的能力。equiδVAPA菌株，并显示仅VAPK1，VAPK2和VAPN支持该菌株的鼠巨噬细胞的生长。我们表明，只有进化枝-1蛋白vapa，vapk1，vapk2和vapn位于r上。Equi细胞表面。PVAPB质粒编码三个进化枝-1蛋白：VAPK1，VAPK2和VAPB。后者无法支持细胞内生长，并且不在细胞表面。我们先前表明，无序的N末端VAPA序列与VAPA的细胞表面定位有关。我们在这里表明，尽管17个VAP蛋白的无序N末端的长度和序列高度可变，但它在进化枝内是保守的，这与我们的观察到，即进化枝-1 VAP蛋白的N末端在细胞表面定位中起作用。
心肌病中的RNA结合蛋白
摘要：基因表达的转录后调节在心脏发育和疾病中起重要作用。心脏特异性替代剪接，协调对心肌细胞组织和收缩至关重要的蛋白质的同工型切换。RNA结合蛋白的功能障碍会损害心脏发育并引起心肌病的主要类型，这代表了一个异常的异常群体，严重影响心脏的结构和功能。尤其是RBM20和RBFOX2的突变与扩张的心肌病，肥厚性心肌病或低塑性左心脏综合征有关。在不同动物模型中的功能分析还提出了其他RNA结合蛋白在心肌病中的可能作用，因为它们参与了组织心脏基因编程。最近的研究为RNA结合蛋白与心血管疾病之间的因果关系提供了重大见解。它们还显示了纠正RNA结合蛋白中致病突变以营救心肌病或促进心脏再生的潜力。因此，RNA结合蛋白已成为心脏疾病功能障碍治疗干预措施的有希望的靶标。挑战仍然是破译它们如何协同调节靶基因的时间和空间表达以确保心脏功能和稳态。本综述讨论了了解心肌病中几种良好表征的RNA结合蛋白的含义的最新进展，目的是确定研究差距以促进该领域的进一步研究。
amala：通过退火突变近似景观对定向进化实验的分析
摘要：基因表达的转录后调节在心脏发育和疾病中起重要作用。心脏特异性替代剪接，协调对心肌细胞组织和收缩至关重要的蛋白质的同工型切换。RNA结合蛋白的功能障碍会损害心脏发育并引起心肌病的主要类型，这代表了一个异常的异常群体，严重影响心脏的结构和功能。尤其是RBM20和RBFOX2的突变与扩张的心肌病，肥厚性心肌病或低塑性左心脏综合征有关。在不同动物模型中的功能分析还提出了其他RNA结合蛋白在心肌病中的可能作用，因为它们参与了组织心脏基因编程。最近的研究为RNA结合蛋白与心血管疾病之间的因果关系提供了重大见解。它们还显示了纠正RNA结合蛋白中致病突变以营救心肌病或促进心脏再生的潜力。因此，RNA结合蛋白已成为心脏疾病功能障碍治疗干预措施的有希望的靶标。挑战仍然是破译它们如何协同调节靶基因的时间和空间表达以确保心脏功能和稳态。本综述讨论了了解心肌病中几种良好表征的RNA结合蛋白的含义的最新进展，目的是确定研究差距以促进该领域的进一步研究。
生命代码：具有多词序列统一的中央教条建模
如分子生物学的中心教条所示，DNA，RNA和蛋白之间的相互作用是生物过程的基础。现代生物学预训练的模型在分析这些大分子方面取得了巨大的成功，但它们的感染性质仍未得到探索。在本文中，我们遵循Central Dogma的指导来重新设计数据和模型管道，并提供一个全面的框架，即生命代码，这些框架涵盖了不同的生物功能。至于数据流，我们提出了一条统一的管道来通过将RNA转录并反向翻译为基于核苷酸的序列来整合多词数据。至于模型，我们设计了一个密码子令牌和混合长期架构，以用遮罩的建模预训练编码编码和非编码区域的相互作用。通过编码序列对翻译和折叠过程进行建模，生命代码通过从现成的蛋白质语言模型中的知识分离来学习相应的氨基酸的蛋白质结构。这样的设计使生命代码能够在遗传序列中捕获复杂的相互作用，从而更全面地了解了与中央教条的多摩学。广泛的实验表明，生命代码在三个OMIC的各种任务上实现了状态绩效，突出了其进步多摩学分析和解释的潜力。
鉴定元素组对EH CRISPR -CAS9系统及其在基因组工程中的应用
抽象的非编码RNA（CRRNA）是由定期间隔短的短膜重复序列（CRISPR）基因座（CRISPR）基因座和与CRISPR相关的（CAS）的（CAS）的蛋白形成的，形成了crispr-CAS系统形成的复合物，这些复合物形成了与CAS-CataLe creeavage crre creage creeavage crrecry crrecry creeaveage crecrecry crrecry creeavage物质相互作用的相互作用的相互作用的creve criss cospectes。这些核糖蛋白启用的核酸易于编程的靶向促进了基于CRISPR的分子生物学工具的实施，用于体内和DNA和RNA靶标的体外修饰。尽管到目前为止鉴定出靶向DNA的Cas核酸酶的多样性，但在Pyogenes链球菌SPCAS9的天然和工程衍生物是基因组工程中最广泛使用的，至少部分是由于它们的CATA-LECALLYTIC稳健性以及一个异常短的图案（5''-ngg-ngg-3'''Pam）farnk sequence。但是，SPCAS9变体的大尺寸会损害该工具向真核细胞的传递，并且需要较小的替代品。在这里，我们在元基因组中识别与较小的CAS9蛋白（EHCAS9）相关的新的CRISPR-CAS9系统，该系统靶向以5'-NGG-3'PAM为两侧的DNA序列。我们开发了一种简化的EHCAS9工具，该工具专门切割DNA靶标，可用于原核生物和真核细胞中的基因组编辑应用。
Har Gobind Khorana
Har Gobind Khorana是分子生物学史上的高耸人物，可以说是20世纪最著名的化学家之一。先驱对阐明遗传密码和具有定义序列的DNA和RNA的合成的贡献是该遗产的一部分。他是合成生物学的父亲，首先是用于化学合成指定序列的短DNA片段，并使用DNA聚合酶复制这些序列，然后将此DNA模板与RNA聚体转录为RNA中的RNA将RNA转录为RNA，以在蛋白质合成1中使用，第二，第二，第二种序列，并将其连接到Spart Pynthety DNA segments中。2这本科学为许多开创性发现和生物技术行业的发展奠定了基础。后来，他对七个跨膜螺旋螺旋的开创性工作也为几代膜生物学家遵循并引起了他所谓的“整体膜蛋白质黄金时代”的途径。 1970年实现了一个基因的第一个化学合成，用于tRNA的编码，并在1979年完成了具有所有必要序列的所有必要序列的完全活性tRNA基因。3,4这种科学本质上是化学的，是由分子生物学中新兴概念驱动的，在化学中至关重要的是生物学领域，并创造了1970年代中期重组DNA革命的重要组成部分。这些非凡的成就掩盖了印度一个小村庄的谦虚起源的生活故事，在英国和德国进行培训
麦卢卡和三叶草蜂蜜蛋白质组与皇家果冻的定量比较
皇家果冻和蜂蜜是工人蜜蜂种姓连续生产的两种物质。现代蛋白质组学方法已被用来独立探索每种物质的蛋白质成分，但迄今为止，直接比较了蜂蜜和皇家果冻的蛋白质谱。使用所有理论片段 - 离子光谱质谱法（Swath-MS）的顺序窗口采集来比较Mānuka和Clover Honey中的蜜蜂起源的蛋白质量与皇家果冻。两种分析技术总共确定了76种蛋白。肽强度的31个蛋白质的子集，这些蛋白质具有很高的置信度，并且在每种蜂蜜类型和皇家果冻之间蛋白质丰度的相对变化。主要的皇家果冻蛋白（MRJP）在两个蜂蜜中都具有相似的曲线，除了MRJP6，在蜂蜜蜂蜜中的含量明显更高。涉及花蜜代谢的蛋白质在蜂蜜中比预期的皇家果冻更丰富。然而，这种趋势揭示了MRJP6在三叶草蜂蜜中具有潜在的催化作用，而未表征的蛋白质LOC408608在三叶草或蜂蜜特异性的作用中起着潜在的催化作用。Mānuka蜂蜜中MRJP6的丰度等同于皇家果冻表明花蜜类型对这种蛋白质表达的潜在影响。可通过proteo-mexchange获得标识符PXD038889的数据。
受控释放杂志 - -ORCA - 卡迪夫大学
视网膜疾病是导致失明的主要原因，会导致视网膜神经元不可逆的退化和死亡。视网膜神经节细胞 (RGC) 就是这样一种细胞类型，它通过构成视神经的轴突将视网膜与大脑的其他部分连接起来，也是青光眼和外伤性视神经病变中主要的致死细胞。迄今为止，人们已经研究了不同的治疗策略来保护 RGC 免于死亡并保留视力，但目前可用的策略仅限于通过降低眼压来治疗神经元的丢失。这些研究发现，药物向 RGC 的递送是一个主要障碍，这在很大程度上是由于药物稳定性、靶向作用时间短、递送效率低以及不良的脱靶效应。因此，需要一种能够解决这些问题的递送系统，以确保候选治疗材料的最大效益。细胞外囊泡 (EV) 是一种由所有细胞释放的纳米载体，是一种包裹 RNA、蛋白质和脂质的脂质膜。由于这些囊泡能够自然地在细胞间运送这些封装的化合物，从而实现信息传递，因此它们或许具有应用价值，并为克服视网膜药物输送中的障碍（包括药物稳定性、药物分子量、视网膜屏障以及药物不良反应）提供机会。本文，我们总结了囊泡药物输送系统的潜力，探讨了其优势以及靶向视网膜神经节细胞（RGC）的潜在应用。
集群学习辅助定向进化
其中 x 是序列，f(x) 是未知的序列到适应度图。DE 是一种黑盒优化问题，它按顺序查询序列进行实验筛选。贪婪搜索能够有效地用最少的实验找到改进的序列，但由于适应度景观中普遍存在的上位性，它通常仅限于探索局部最优 2 – 4 。另一方面，通过多位点饱和诱变进行随机探索不可避免地会产生庞大的组合文库，这往往会超出筛选能力 5 。一种以最小的实验负担搜索上位性景观的有效策略是十分可取的。过去十年，生物数据的机器学习 (ML)（包括深度学习，DL）算法得到了快速发展 6 – 10 。监督模型可以学习蛋白质与适应度之间的关系，并提供酶活性和选择性3、蛋白质热稳定性11、蛋白质折叠能12、13、蛋白质溶解度14、蛋白质-配体结合亲和力15和蛋白质-蛋白质结合亲和力16的定量预测。由于获取监督标签的成本高昂，自监督蛋白质嵌入已成为蛋白质建模的重要范例。通过对自然进化产生的大量未标记序列数据进行训练，自监督蛋白质嵌入可以捕获序列中大量潜在的生物信息，并将信息传递给下游的监督任务17、18。许多模型架构（如变分