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紫檀芪可导致乳腺癌细胞中 DNMT3B 介导的 DNA 甲基化和 OCT1 靶向致癌基因的沉默
转录因子 (TF) 介导的基因调控通常在致癌过程中被破坏。TF 结合位点的 DNA 甲基化状态可能决定相应基因的转录活性。研究表明，芪类多酚，如紫檀芪 (PTS)，可通过重塑 DNA 甲基化和基因表达发挥抗癌作用。然而，这些影响背后的机制仍不清楚。本文探讨了 PTS 处理的 MCF10CA1a 侵袭性乳腺癌细胞中致癌 TF OCT1 结合与从头 DNA 甲基转移酶 DNMT3B 结合之间的动态关系。使用染色质免疫沉淀 (ChIP) 和下一代测序，我们确定了 47 个基因调控区，这些区域在 PTS 作用下 OCT1 结合减少，DNMT3B 结合丰富。大多数这些基因被发现具有致癌功能。我们选择了三个候选基因 PRKCA、TNNT2 和 DANT2，以进一步研究机制，同时考虑 PRKCA
LAFL种子发育和相变的因素
开发是一种链反应，其中一个事件导致另一个事件直到完成生命周期。相变是生命周期中的里程碑事件。叶状cotyledon1（Lec1），ABA nosistive3（ABI3），FUSCA3（FUS3）和LEC2蛋白（同时称为LAFL）是调节种子和其他发育过程的主转录因子（TFS）。自从LAFL基因的最初表征以来，超过三十年的积极研究产生了有关这些TF的大量知识，这些TF在种子降低和发芽中的作用已得到了全面审查。使用遗传和基因组工具的细胞生物学的最新进展允许以较高的参考物种和农作物的较高吞吐量和分辨率在先前具有挑战性的组织中表征LAFL调节网络。在这篇综述中，我们通过整合表观遗传，转录，转录后和蛋白质水平的进步来提供整体观点，以扩大拟南芥种子发育和相变的LAFL网络的时空调节，并简要讨论这些TF网络的进化。
单细胞多...
动机：细胞的分子身份是由于异质分子层之间的复杂相互作用而产生的。单细胞测序技术的最新进展已经开放了测量这种调节分子层的可能性。结果：在这里，我们提出了鹰嘴豆泥，这是一种从单细胞多摩管数据中推断监管机制的新方法。与最先进的鹰嘴豆泥不同，鹰嘴豆泥捕获了生物学大分子之间的合作，并且可以轻松地包括分子调节的其他层。我们在配对和未配对的多摩尼斯数据集上的最先进的鹰嘴豆泥基准了鹰嘴豆泥。我们的结果证明了鹰嘴豆泥在转录因子（TF）目标，TF结合基序和调节区域预测方面提供的改进。最后，一旦应用于小鼠脑皮层的SNMC-Seq，SCATAC-SEQ和SCRNA-SEQ数据，Hummus启用了鹰嘴豆泥，可以准确地群集SCRNA轮廓并识别潜在的驱动程序TF。
航空航天磁力齿轮领域的进展...
3. Tallerico, TF 等人，在 AIAA/IEEE 电动飞机技术研讨会论文集，2019 年。https://ntrs.nasa.gov/citations/20190030679
合成和基因组调控元件揭示顺式
摘要 在胚胎干细胞 (ESC) 中，核心转录因子 (TF) 网络建立了多能性所必需的基因表达程序。为了解决四种关键 TF 之间的相互作用如何促进小鼠 ESC 中的顺式调控，我们分析了两个由 SOX2、POU5F1 (OCT4)、KLF4 和 ESRRB 的结合位点组成的大规模并行报告分析 (MPRA) 文库。合成的顺式调控元件与具有可比结合位点配置的基因组序列之间的比较揭示了调控语法的某些方面。合成元件的表达受结合位点的数量和排列的影响。这种语法对基因组序列的作用很小，因为基因组序列的相对活性最好通过预测的结合位点占用率来解释，而与结合位点身份和定位无关。我们的结果表明，转录因子结合位点 (TFBS) 的影响受位点顺序和方向的影响，但在基因组中，TF 的整体占用率是活性的主要决定因素。
无标题 - 佛罗里达州军事事务部
2021 年 11 月下旬，特遣队 Gator 抵达乌克兰亚沃里夫，承担 JMTG-U 任务。他们的任务是开展多国合作和咨询行动，以协助 AFU 将亚沃里夫的战斗训练中心发展成为一个自给自足的旅级战斗训练中心，类似于美国自己的联合战备训练中心和国家训练中心。该任务的主要重点是开发战斗训练中心-亚沃里夫 (CTC-Y) 的基础设施、能力和培训师，以训练致命的 AFU 旅。在任务的头几个月里，TF Gator 将其工作分为两条主要工作路线。TF Gator 的下属部门 CTC 分支机构由中校 John Sargeant 领导，专注于 CTC-Y 的发展和即将在 1 月底接受训练的即将到来的轮换 AFU 旅。特遣队总部与另一个名为训练指挥部咨询小组的部门一起，致力于与国防部长、国防部长和陆军司令部（类似于美国训练与条令司令部）就机构和战略改革进行接触，这将进一步增强 AFU 的能力。在同一时期，有报道称该地区通常高度紧张的局势已变得越来越脆弱。
无标题 - 佛罗里达州军事事务部
2021 年 11 月下旬，特遣队 Gator 抵达乌克兰亚沃里夫，承担 JMTG-U 任务。他们的任务是开展多国合作和咨询行动，以协助 AFU 将亚沃里夫的战斗训练中心发展成为一个自给自足的旅级战斗训练中心，类似于美国自己的联合战备训练中心和国家训练中心。该任务的主要重点是开发战斗训练中心-亚沃里夫 (CTC-Y) 的基础设施、能力和培训师，以训练致命的 AFU 旅。在任务的头几个月里，TF Gator 将其工作分为两条主要工作路线。TF Gator 的下属部门 CTC 分支机构由中校 John Sargeant 领导，专注于 CTC-Y 的发展和即将在 1 月底接受训练的即将到来的轮换 AFU 旅。特遣队总部与另一个名为训练指挥部咨询小组的部门一起，致力于与国防部长、国防部长和陆军司令部（类似于美国训练与条令司令部）就机构和战略改革进行接触，这将进一步增强 AFU 的能力。在同一时期，有报道称该地区通常高度紧张的局势已变得越来越脆弱。
无标题 - 佛罗里达州军事事务部
2021 年 11 月下旬，特遣队 Gator 抵达乌克兰亚沃里夫，承担 JMTG-U 任务。他们的任务是开展多国合作和咨询行动，以协助 AFU 将亚沃里夫的战斗训练中心发展成为一个自给自足的旅级战斗训练中心，类似于美国自己的联合战备训练中心和国家训练中心。该任务的主要重点是开发战斗训练中心-亚沃里夫 (CTC-Y) 的基础设施、能力和培训师，以训练致命的 AFU 旅。在任务的头几个月里，TF Gator 将其工作分为两条主要工作路线。TF Gator 的下属部门 CTC 分支机构由中校 John Sargeant 领导，专注于 CTC-Y 的发展和即将在 1 月底接受训练的即将到来的轮换 AFU 旅。特遣队总部与另一个名为训练指挥部咨询小组的部门一起，致力于与国防部长、国防部长和陆军司令部（类似于美国训练与条令司令部）就机构和战略改革进行接触，这将进一步增强 AFU 的能力。在同一时期，有报道称该地区通常高度紧张的局势已变得越来越脆弱。
HDAC1 和 PRC2 介导 SPI1/... 中的组合控制
转录调控是一个复杂的过程，涉及特定染色质环境中的一系列蛋白质活动。转录因子 (TF) 是此过程的主要贡献者，它们与伙伴、辅激活因子或表观遗传因子一起发挥作用，其中一些被称为先驱 TF，能够使染色质结构允许辅激活因子和表观遗传因子的作用。表观遗传景观在造血稳态和分化程序中起着重要作用；因此，有可能从染色质动力学构建一个完整的造血模型 ( 1 , 2 )。编码表观遗传修饰因子 (TET2、IDH1 / 2、DNMT3A 和 ASXL1) 的基因突变在急性髓系白血病 (AML) 患者中很常见，进一步表明这种类型的成分在驱动 AML 发展中起着重要作用。 TF SPI1 / PU.1 属于 E26 转化特异性 (ETS) 家族，是造血控制的主要贡献者，在髓系和 B 淋巴系的特化和分化中发挥积极作用 ( 3–5 )。SPI1 最初被描述为一种转录激活因子，被认为是一种先驱 TF，因为它能够结合或接近封闭的核小体构象，并使辅因子能够结合染色质 ( 6–9 )。例如，在巨噬细胞中，SPI1 通过结合封闭的染色质来激活其靶基因的转录，在那里它通过募集表观遗传修饰因子（如 CBP/P300 或 SWI/SNF 复合物）来驱逐核小体 ( 6 、 7 、 10 、 11 )。这一动作指示创建一个新的增强子，使组蛋白 3 的赖氨酸 4 (H3K4me1) 单甲基化，并在增强子位点募集额外的 TF (6,7)。SPI1 通过表观遗传调控控制转录激活的功能在 B 淋巴细胞和破骨细胞分化中也有描述 (12,13)。因此，除了与谱系决定辅因子协同控制基因表达方面发挥众所周知的作用外，SPI1 对转录活性的影响还与表观遗传调节因子协同介导。最近有报道称，SPI1 在正常造血、控制适当的中性粒细胞免疫反应 (14)、早期 T 细胞 (15,16) 和破骨细胞 (12) 中抑制转录。实现更好的
附近闪烁频率下的稳态视觉诱发电位之间的局部相互作用
稳态视觉诱发电位 (SSVEP) 被广泛用于指示人类脑电图 (EEG) 研究中自上而下的认知处理。通常，会呈现两个以不同时间频率 (TF) 闪烁的刺激，每个刺激都会在其闪烁频率下在 EEG 中产生不同的反应。然而，在存在竞争性闪烁刺激的情况下，EEG 中的 SSVEP 反应如何仅由于感觉相互作用而受到调节尚不清楚。我们之前已经在从清醒猴子记录的局部场电位 (LFP) 中表明，当两个重叠的全屏光栅以不同的 TF 反相时，存在不对称的 SSVEP 反应抑制，较低 TF 的抑制更大，这进一步取决于光栅的相对方向（平行光栅的抑制和不对称性比正交光栅更强）。在这里，我们首先在男性和女性人类 EEG 记录中证实了这些影响。然后，我们在比之前研究更广的范围内绘制了一个刺激（目标）对竞争刺激（掩码）的反应抑制。令人惊讶的是，我们发现抑制在低频下通常并不强，而是根据目标 TF 系统地变化，表明两个竞争刺激之间存在局部相互作用。这些结果在人类 EEG 和猴子 LFP 和皮层电图 (ECoG) 数据中都得到了证实。我们的结果表明，多个 SSVEP 之间的感官相互作用比以前显示的更复杂，并且受到局部和全局因素的影响，强调需要谨慎解释涉及 SSVEP 范式的研究结果。