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数千名人工智能作者探讨人工智能的未来
在这项规模最大的同类调查中，我们调查了 2,778 名曾在顶级人工智能 (AI) 领域发表过论文的研究人员，询问他们对 AI 进步速度以及高级 AI 系统的性质和影响的预测。总体预测显示，到 2028 年，AI 系统实现几个里程碑的可能性至少为 50%，包括从头开始自主构建支付处理网站、创作一首与流行音乐家的新歌难以区分的歌曲，以及自主下载和微调大型语言模型。如果科学继续不受干扰地发展，到 2027 年，无人辅助的机器在所有可能的任务中胜过人类的可能性估计为 10%，到 2047 年为 50%。后者的估计比我们一年前进行的类似调查得出的结果早了 13 年 [Grace et al., 2022]。然而，预计到 2037 年，所有人类职业完全自动化的可能性将达到 10%，到 2116 年将达到 50%（而 2022 年的调查结果为 2164 年）。大多数受访者对人工智能进步的长期价值表示了很大的不确定性：虽然 68.3% 的人认为超人类人工智能带来好结果的可能性大于坏结果，但在这些净乐观主义者中，48% 的人认为出现人类灭绝等极坏结果的可能性至少为 5%，而 59% 的净悲观主义者认为出现极好结果的可能性为 5% 或更高。37.8% 至 51.4% 的受访者认为高级人工智能导致人类灭绝等糟糕结果的可能性至少为 10%。关于人工智能进步更快还是更慢对人类未来更有利，存在分歧。超过一半的人认为，有必要对六种不同的人工智能相关情景表示“极大”或“极度”担忧，包括虚假信息的传播、独裁人口控制和不平等加剧。然而，人们普遍认为，旨在最大限度地降低人工智能系统潜在风险的研究应该得到优先考虑。
数十万人在伊斯坦布尔集会支持……
加沙（快讯）——据 An adolu 报道，加沙地带民防局周三表示，在过去两天里，强降雨淹没了 1,542 多个安置流离失所平民的帐篷。在犹太复国主义政权对加沙地带发动的种族灭绝战争中，数百顶帐篷被淹，水位超过 30 厘米。”该机构在一份声明中表示。“据报道，许多人都冻得瑟瑟发抖，因为他们的财物被雨水损坏了。”它还补充道。民防局表示，暴雨冲走了加沙市 497 顶帐篷，中部加沙地区代尔巴拉赫 210 顶，拉法赫 170 顶，南部加沙汗尤尼斯 665 顶。自周日以来，加沙地带遭受寒潮和暴雨袭击，给该地区 230 万人口带来了更多苦难。
一个基因组还是数千个基因组？群体基因组学和脱靶风险
使用 SpCas9 核酸酶进行 ONE-seq 脱靶分析的结果 a，群图显示五个先前分析的 SpCas9 gRNA 的 ONE-seq 核酸酶分数。每个圆圈代表一个单独的 ONE-seq 文库成员。彩色圆圈代表先前确认的真正脱靶位点。未显示 ONE-seq 核酸酶分数低于 0.001 的位点。n/a，未在先前发表的 CIRCLE-seq 研究中进行验证。b，维恩图比较了 ONE-seq、CIRCLE-seq 和 Digenome-seq（空心彩色圆圈）提名先前由 GUIDE-seq（实心紫色圆圈）验证的真正脱靶位点的能力。所有被视为由 ONE-seq 验证的位点的 ONE-seq 核酸酶分数均 >0.01。
MultiCrispr：用于数千个目标的主要编辑和平行定位的GRNA设计
针对编码基因组通过CRISPR/ CAS9技术引入核苷酸缺失/插入已成为一种标准程序。它迅速产生了多种方法，例如素数编辑，顶点接近标记或同源性修复，但是，支持生物信息学工具的支持落后于此。新的CRISPR/CAS9应用程序通常会重新征询特定的GRNA设计功能，并且通常缺少一种通用工具。在这里，我们介绍了R/生物导体工具MulticRispr，旨在设计单个grnas和复杂的grna libraries。包装易于使用；在效率和特定的效率上，检测，分数和锻炼;每个目标或CRISPR/CAS9序列可视化和聚集结果；最后返回GRNA的范围和序列。是通用的，多晶状体定义的，并实现了基因组算术框架，作为便利适应最近引入的技术的基础，例如素数编辑或尚未出现。其性能和设计构想（例如目标集） - 特定过滤渲染多晶层在处理类似筛选的方法时选择的工具。
针对数千种人类致病变异的 CRISPR 主编辑器的自动设计
1. 纽约基因组中心，纽约州纽约市，美国。2. 纽约大学生物学系，纽约州纽约市，美国。† 这些作者贡献相同。 * 电子邮件：neville@sanjanalab.org 关键词：Prime 编辑、CRISPR、致病变异、ClinVar、人类遗传变异
multicrispr：用于主要编辑和数千个目标的并行定位的 gRNA 设计
近年来，通过 Crispr/Cas9 技术靶向编码基因组引入单核苷酸缺失/插入已成为一种标准程序。它迅速催生了多种方法，例如 Prime Editing、Crispr/Cas9 辅助 APEX 邻近标记蛋白质或同源定向修复 (HDR)，但支持这些方法的生物信息学工具却落后了。新应用通常需要特定的向导 RNA (gRNA) 设计功能，而通用的 gRNA 设计工具却严重缺失。在这里，我们回顾了 gRNA 设计软件并介绍了 multicrispr，这是一种基于 R 的工具，旨在设计单个 gRNA 以及并行靶向许多基因组位点的 gRNA 库。该软件包易于使用，可检测、评分和过滤 gRNA 的效率和特异性，可视化和汇总每个目标或 Crispr/Cas9 序列的结果，最后返回基因组范围以及首选的、无脱靶 gRNA 序列。为了通用，multicrispr 定义并实施了一个基因组算法框架，作为轻松适应尚未出现的技术的基础。其性能和新的 gRNA 设计概念（例如针对 gRNA 库的目标集特定过滤）使 multicrispr 成为处理类似筛选方法时的首选工具。
超柔性电极阵列可对啮齿动物体内数千个神经元进行长达数月的高密度电生理映射
✉ 通信和材料索取请发送至 Lan Luan 或 Chong Xie。lan.luan@rice.edu；chongxie@rice.edu。作者贡献 CX 构思并组织了整个研究；ZZ、HZ、XL、LL 和 CX 设计了实验，所有作者均参与其中；ZZ 和 XL 在 CX 的监督下设计和制作了 NET 设备；DFL、JEC 和 LF 与 SpikeGadgets LLC 合作设计了堆叠头戴式记录系统；ZZ 和 XL 在 JEC 和 DFL 的帮助以及 CX 和 LF 的监督下设计了 NET 探头与头戴式记录系统的集成；ZZ 和 XL 在 CX 的监督下开发并执行了手术程序；ZZ、XL 和 HZ 在 LS 和 FH 的帮助以及 CX 和 LL 的监督下进行了动物神经记录实验； HZ 和 ZZ 开发并实施了数据预处理，由 CX 监督，并得到了 JEC 和 LF 的意见；ZZ 和 HZ 执行了数据后分析，由 LL 和 CX 监督，并得到了 LF 的意见；ZZ 执行了组织学研究，由 CX 监督；ZZ、LL 和 CX 撰写并修改了手稿，得到了所有作者的意见。
基因1表达在野生西红柿2
现在可以理解，渗入可以充当强大的进化力，提供了31种遗传变异，可以影响性状进化的过程。渗入还引起了共有的32个进化史，该历史不会被物种系统发育所捕获，可能会使使用物种树的33个进化分析复杂化。这种分析通常是对跨物种的基因34表达数据进行的，其中数千个性状值的测量允许35个强大的推论，同时控制共享的系统发育。在这里，我们提出了一个布朗36运动模型，用于在多种族网络联合37框架下进行定量性状演化，这表明当数千种定量性状平均时，渗入可以产生38个进化的明显收敛模式。我们使用来自野生番茄属40茄的胚珠中的全转录组表达数据来测试我们的理论39预测。检查两个子层都有两者都有特种后渗入的证据，即41，但在其幅度上有很大差异，我们发现进化模式是一致的42，与胚珠基因表达的符号和幅度的渗入历史保持一致。43此外，在渗入速率较高的子层中，我们观察到局部基因树拓扑与表达相似性之间的相关性44，这暗示了渗入45个CIS调节性变化在产生这些宽尺度模式中的作用。48我们的结果揭示了一般作用46在数千种定量性状47的变化模式中渗入的一般作用46，并使用简单的模型信息预测为这些效果提供了一个框架。
我们能解释数千种分子鉴定的小鼠神经元类型吗？从知道到理解
脑计划细胞普查网络 (BICCN) 于 2023 年 12 月 13 日在《自然》杂志上发布了《全鼠脑图谱》出版包（https://www.nature.com/collections/fgihbeccbd，2024 年 5 月 5 日访问）。这项单细胞转录组、表观基因组和空间转录组综合工作将小鼠脑中存在的不同神经元细胞类型的数量更新为惊人的总数，略多于 5300 种，揭示了它们的分子多样性与它们的相对位置一致。我们在此提出的问题是：我们能否解释如此多不同类型的细胞是如何产生和定位的？这个问题与另一个问题相关：我们是否有形态模型允许在相对位置和神经元类型规范方面将这种程度的多样性相关联？令人惊讶的是，答案是可能的，而且几乎是肯定的。 BICCN 出版物隐含地使用了 Herrick 的传统柱状脑模型（[ 1 ]；图 1 a-d），可能是 Swanson 的修改版（[ 2 , 3 ]；图 1 e），或 Dong [ 4 ] 在 Allen 研究所的成年小鼠大脑图谱 [mouse.brain-map.org] 中使用的模型。该模型将端脑、间脑、中脑、后脑和脊髓视为主要分区（五个喙尾小泡；图 1 a）。在该模型中，Herrick 的最小单位由四个功能实体表示（脑干和脊髓中定义的躯体运动、内脏运动、内脏感觉和躯体感觉柱：Sm、Vm、Vs、Ss；图 1 a、d）。本文作者将它们外推到前脑（即间脑的 Eth、Dth、Vth、Hth；端脑的 Hi、Pir、Str、Se；图 1 a-c 中统一颜色的代码）。请注意，前脑柱可能执行与后脑不同的功能，尽管间脑在功能上被解释为脑干的延续。总的来说，这就构成了 5 个囊泡 × 4 个柱 = 20 个柱状单元，它们应该产生最近发现的 5300 种神经元类型（平均每柱 265 种细胞类型）。