T4 sun Y 基因是已鉴定出的含有自剪接 I 组内含子的 4 个噬菌体基因之一(7、12、30、32)。4 个含内含子的噬菌体基因中,3 个的功能是已知的。噬菌体 T4 的 td 基因(编码胸苷酸合酶)和 nrdB 基因(编码核糖核苷二磷酸还原酶的小亚基)均参与 DNA 前体的合成,噬菌体 SPOI 中鉴定出的内含子位于编码 DNA 聚合酶的基因 31 中。然而,sun Y 基因的功能尚不清楚。据我们所知,sun Y 基因并非必需基因,因为干扰噬菌体发育的突变尚未定位到该基因座上。作为表征 sun Y 基因功能的第一步,我们鉴定了 sun Y 蛋白并确定了其合成的时间进程。虽然我们尚未确定太阳 Y 基因的功能,但我们做出了一个奇怪的观察:它的表达涉及蛋白质以及 RNA 基因产物 (gp) 的处理。
摘要:为了设计出在进一步优化阶段有较高成功率的先导化合物,应解决药物-靶标相互作用、细胞内化和靶标参与问题。因此,我们设计了叶酸与抗癌肽的结合物,它能够结合人胸苷酸合酶 (hTS) 并通过几种癌细胞高表达的叶酸受体 α (FR α ) 进入癌细胞。机制分析和分子建模模拟表明,这些结合物与 hTS 单体-单体界面的结合力比酶活性位点大 20 倍以上。在几种癌细胞模型上测试时,这些结合物在纳摩尔浓度下表现出 FR α 选择性。当结合物与抗癌剂以协同或附加组合方式递送时,观察到类似的选择性。与 5-氟尿嘧啶和其他靶向 hTS 催化口袋的抗癌药物不同,这些结合物不会诱导该蛋白质的过度表达,因此可以帮助对抗与高 hTS 水平相关的耐药性。■ 简介
rouridine);阿拉伯核苷,例如阿拉伯派(Cytarabine,araC)[4],吉西他滨或2',2'-二氟 - Ro-2'-脱氧胞丁胺[5](图1)和几种嘌呤[6]和氟达拉滨[7]。它们的作用机理涉及核苷-5'-单磷酸盐作为主要活性化合物的形成。核苷单磷酸可以转化为相应的核苷-5'-T-二磷酸,然后通过DNA或RNA聚合酶将其掺入DNA或RNA中,并明显地[8]。一方面,修饰的DNA或RNA产生突变产生非功能基因组[9]。另一方面,核苷-5'-单磷酸可以直接与涉及核苷酸代谢的酶相互作用,从而导致核苷酸池的修饰。这反过来将散发突变的DNA和RNA的量。对于Exmape,Floxuridine单磷酸盐与胸苷酸合酶的辅助中心反应,从而产生不可恢复的共价键[10,11]。这种自杀的共价反应抑制了这种酶,从而减少了核苷酸池中胸苷磷酸盐。这种还原引入了无胸腺氨酸的细胞死亡[12,13]。另外,FDU,ARAC和吉西他滨修饰DNA,并可以吸收DNA拓扑异构酶[14]。
A) 描绘了对 TOP1 和 PARG 双重抑制的拟议 MOA 的模型。B) 对 PRISM 化合物和 PARGi 的反应的 Spearman 相关图;橙色表示 TOP1 抑制剂,黑色表示其他。(插图)按 MOA 分组的顶级相关化合物的 Swarmplot(未显示少于 2 种化合物的 MOA)。拓扑异构酶抑制剂 (TOP)、法呢基转移酶 (FT)、微管蛋白聚合 (TP)、极光激酶 (AK)、胸苷酸合酶 (TS)。C) 使用 PAR MSD 测定法评估 PAR 链积累。值绘制为相对于 DMSO 对照的平均值 ± SD。使用 Student's t 检验进行统计分析;ns(不显著)、**(<0.01)、***(<0.001)。D)(左)使用基于抗 TOP1cc 抗体的免疫荧光测定法在指示时间点测量 TOP1-DNA 裂解复合物 (TOP1cc)。根据单个细胞中的 TOP1cc 平均强度值进行群体分箱和非线性曲线拟合。使用 Kruskal-Wallis 检验进行统计分析;****(<0.0001)。(右)使用基于抗 γ -H2AX 抗体的免疫荧光测定法检测核 γ -H2AX。值(平均值 ± SD)绘制为 γ -H2AX 平均强度范围的百分比群体。E)从 CldU 标记的 DNA 纤维测量结果显示,IDE161 和 CPT 介导的复制叉减慢。框表示中位数和 IQR。使用 Mann-Whitney U 检验进行统计分析;*(<0.05),**** (<0.0001)。
胸苷酸合酶 (TS) 已在多种生物体中得到鉴定,并且是癌症化疗中已证实的靶点 (25)。TS 应该是白色念珠菌(一种常见的真菌病原体)的良好化疗靶点,因为该酶的产物 dTMP 只能在酵母中从头合成;酵母缺乏胸苷激酶,并且胸腺嘧啶、胸苷和 dTMP 无法渗透 (6)。有效抑制酵母中的 TS 会导致死亡,因为这些生物体无法产生自己的 dTMP 或从环境中获取它。5-氟胞嘧啶可在体外和体内抑制白色念珠菌和几种其他真菌 (3)。此外,用 5-氟胞嘧啶 (9) 处理白色念珠菌会导致 5-氟-dUMP 积累并抑制 TS,因此表明该酶是真菌的化疗靶点。从体外靶酶表征中获得的信息有助于设计新的潜在化疗剂。大量纯酶的可用性促进了此类研究。由于白色念珠菌培养物中存在低水平的 TS,因此在大肠杆菌中克隆和过表达了白色念珠菌 TS。我们报告了通过功能补充缺乏 TS 的酿酒酵母菌株分离白色念珠菌 TS 基因。该基因的序列包括基因 5' 端约 400 个碱基对 (bp) 的 DNA 和一段较短的 3' 侧翼区,并使用 T7 表达载体在大肠杆菌中表达。制备了来自白色念珠菌和大肠杆菌的纯化酶,并检查了其特性,以确保在大肠杆菌中表达的克隆 TS 酶与白色念珠菌的天然 TS 酶相同。
该测试符合通过科学,透明,同行评审的过程评估的基因检测的证据标准,并确定通过CPIC指南a或b1来证明临床决策中的可行性;或在FDA表中列出了已知基因 - 毒物相互作用的表,其中数据支持治疗建议或对安全或响应或FDA标签的潜在影响; https://www.fda.gov/drugs/science-and-research-drugs/table-pharmacogenomic-biomarkers-drug-lug-lug-labeling; https://www.fda.gov/medical-devices/precision-medicine/table-pharmacostocenotic-associations。tpmt(硫嘌呤S-甲基转移酶)基于TPMT基因型测试的结果,CPIC指南建议调整硫嘌呤的起始剂量(类):胃嘌呤,硫硫代硫酸盐,硫唑嘌呤,硫代氨酸(硫代氨酸A:CPIC水平A:测试建议)。tpmt包含在FDA的药物基因组关联表中,数据支持治疗建议或对安全或反应的潜在影响。未覆盖的指示基因检测,尚未确定分析有效性,临床有效性或临床效用的基因检测被认为是不合理和必要的。CYP1A2(细胞色素P450家族1,亚家族A,成员2)CYP1A2基因型多态性对鲁卡巴里布的药代动力学没有临床意义。CYP3A4(CytoChrome P450家族3,亚家族A成员4)由于证据不足以支持临床实施(CPIC C级C:无建议),因此没有提供给毒素毒素的建议。comt(Catechol-O-甲基转移酶)没有针对基于COMT基因型给药阿片类药物的治疗建议(CPIC级别C:无建议)。基金会PI SM尿型生物标志物实验室对慢性疼痛的测试是不合理的,并且是必要的。htr2a(5-羟基胺受体2a)和HTR2C(5-羟基丙氨酸受体2C)未提供基于HTR2A属性的血清素再摄取抑制剂抗抑郁药的临床建议,因为支持的证据与/或不充分的级别clitive and/clastical clitive and Clasitication and Cpic and Cpic and Cpics:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC:CPIC)。没有为HTR2C提供建议(CPIC临时级别C:无建议)。Psych HealthPGX面板和Genomind®专业PGX Express™核心这些面板由于功效的证据不足而对药物基因组学测试是不合理的,并且是必需的。TYMS(胸苷酸合成酶)未提供有关卡皮替滨和氟尿嘧啶的建议(CPIC临时水平D:不建议)。适用的代码仅供参考,以下程序和/或诊断代码提供了以下列表,并且可能不包含在内。在本政策中列出代码并不意味着代码所描述的服务是涵盖或未覆盖的卫生服务;但是,可以在下面的列表中包含语言,以指示是否未覆盖代码。卫生服务的福利覆盖范围由成员特定的福利计划文件和可能需要特定服务覆盖的适用法律确定。纳入代码并不意味着要偿还或保证索赔付款的任何权利。其他政策和准则可能适用。