作者:L Song · 2023 · 被引用 27 次 — 原核蓝藻的防御机制之一与一系列次生代谢产物(包括蓝藻毒素)的产生有关。(表...
摘要:基因表达模式的变化会导致形态特征的变化。这种现象在最近的进化事件(例如农作物驯化和对环境压力的反应)中尤为明显,在这种情况下,表达水平的改变会产生驯养的综合症和适应性表型。大米(Oryza sativa L.)是世界上最关键的谷物作物之一,包括两个在形态上不同的亚种,Indica和Japonica。为了研究这两个水稻亚种之间的形态差异,本研究在相同的培养条件下,总共种植了Indica和Japonica的315个Landrace个体。在这项研究中测得的16个定量性状中,有12个在亚种之间表现出显着差异。为了在整个基因组序列水平上确定Indica和Japonica之间的遗传差异,我们使用包含95个水稻Landrace配件的重新方便的数据集构建了系统发育树。样品形成了两个主要组,它们整齐地对应于两个亚种Indica和Japonica。此外,基于跨五个不同组织的有效表达基因(EEG)的表达量,将12个代表性样本分为两个与两个亚种对齐的主要进化枝。这些结果表明,全基因组表达水平的差异在非压力条件下进行稳定选择,表达水平的进化趋势反映了序列变化水平。这项研究进一步支持了全基因组表达调节变化在两个水稻亚种的差异中的关键作用。
本研究评估了13个本地南瓜种群的定量和定性性状。该实验是在随机块设计中进行的,具有3个复制(2019年至2020年)。在这项研究中考虑了以下特征:水果的数量,体重,长度,宽度和长度/宽度比,种子产量,种子产量/果实产量比,1000个种子体重,空种子的百分比,种子长度,种子宽度,种子仁/全种子/种子比和种子油百分比。此外,还进行了质量测试,包括使皮肤与内核的易于分离,味道质量以及种子形状和大小的可取性,从消费者的角度来看。方差分析显示大多数研究性状的显着差异。基于特征的平均比较结果,在Ghalami-Kalaleh#1和Mashhady-Azadshahr,然后是Mashhady-Khoy种群中观察到最高的种子产量。从消费者的角度来看,最高的口味质量属于Goushti-Kalaleh人口。结果代表了种子产量和果实之间的正相关和高度显着的相关性。在种子产量和其他相关性状之间未观察到没有显着相关性。建议在选择程序和修改高收益人群时考虑水果数字特征。
1分子遗传学科学实验室,拉脱维亚的LV-1007 Riga,RéJaStradin,Š大学; linda.gailite@rsu.lv(l.g。); madara.auzenbaha@rsu.lv(M.A。)2保守牙科和口腔健康部,拉特维亚LV-1007 Riga,拉维亚3号拉脱维亚生物医学研究与研究中心,拉维亚LV-1067 Riga,拉脱维亚; dita.gudra@biomed.lu.lv(d.g.)4生物学和微生物学系,RéjaStradin,Š大学,LV-1007 Riga,拉脱维亚5号LATCINOGION,LAV-1004 LATVIA RIGA的儿童临床大学医院内分泌学系; una.lauga.tunina@rsu.lv 6医学遗传学和产前诊断诊所,LATVIA LV-1004儿童临床大学医院,拉脱维亚7欧洲原始代谢疾病参考网络,儿童临床大学医院,LV-1004 RIGA,LATVIA,LATVIA,LATVIA *通讯:ABOLA.IVETA.IVETA.IVETA@abola.iveta equarty.com†这些工作。4生物学和微生物学系,RéjaStradin,Š大学,LV-1007 Riga,拉脱维亚5号LATCINOGION,LAV-1004 LATVIA RIGA的儿童临床大学医院内分泌学系; una.lauga.tunina@rsu.lv 6医学遗传学和产前诊断诊所,LATVIA LV-1004儿童临床大学医院,拉脱维亚7欧洲原始代谢疾病参考网络,儿童临床大学医院,LV-1004 RIGA,LATVIA,LATVIA,LATVIA *通讯:ABOLA.IVETA.IVETA.IVETA@abola.iveta equarty.com†这些工作。
决定天然鸡的生产力的重要方面是遗传因素。可以通过涉及交配线的选择和布置的繁殖计划来提高鸡的遗传质量。该研究项目的目的是找到有关祖先定性和定量性状的基本信息,以产生新的印尼本地鸡衬里菌株。用作遗传来源的祖先是四种本地鸡系:白色,Lurik,Wareng和Ranupane(男性和女性)。定性性状,并使用两级嵌套分类的ANOVA分析定量数据,然后进行最小显着差异测试。结果显示每条鸡系中的羽毛和小腿颜色差异。在公鸡中,体重,机翼长度,尾部长,头围和前体宽度存在差异(p <0.05)。母鸡线之间的高度,身体圆周,小腿长度和喙长(p <0.05)。定性特征(羽毛和柄颜色)可用作本地鸡系的标记。它们可以根据繁殖计划的目标作为选择。身体构象(体重和身高)可以用作祖先(雄性和女性)的选择标准,以产生新的生物母鸡的新菌株。
摘要:了解害虫的生物学知识对于制定可持续的管理计划至关重要。蝽科昆虫具有半变态生命周期,包括卵、若虫和成虫生命阶段,这些生命阶段在形态、生态和行为特征上有所不同。其中一些特征,如交配行为、信息素(警报和聚集信息素)和肠道共生体的获得,可以作为害虫管理策略的目标。在这里,我们回顾了有关蝽科昆虫这些生活史特征的现有文献,这些特征可能在管理计划中使用。信息素介导的聚集和共生体获得的中断是蝽科昆虫控制的两个重要目标。其他特征,如使用警报信息素来增强天敌和使用基质振动来干扰交配,值得进一步考虑。尽管色觉和飞行能力对臭虫管理具有潜在重要性,但对其的研究仍然很少。
摘要:谷物产量是玉米中最关键和最复杂的定量性状。内核长度(KL),内核宽度(kW),内核厚度(KT)和与核大小相关的数百 - 内核重量(HKW)是玉米中与产量相关性状的必不可少的组成部分。通过广泛使用定量性状基因座(QTL)映射和全基因组关联研究(GWAS)分析,已经发现了数千个QTL和定量性状核苷酸(QTN)来控制这些性状。但是,只有其中一些被克隆并成功地用于育种计划。在这项研究中,我们详尽地收集了与四个性状相关的基因,QTL和QTN,进行了QTL和QTN的聚类识别,然后将QTL和QTN簇合并以检测共识热点区域。总共确定了与内核大小相关性状的31个热点。他们的候选基因被预测与调节内核发展过程的众所周知的途径有关。可以进一步探索识别的热点,以进行细化和候选基因验证。最后,我们提供了高产和优质玉米的策略。这项研究不仅会促进因果基因的克隆,还可以指导玉米的繁殖实践。
摘要:在候选神经退行性/神经精神上的风险预测生物标志物中,血小板计数,平均血小板体积和血小板分布宽度与重大抑郁症(MDD),阿尔茨海默氏病(AD)和帕金森氏病(PD)和基因学研究的风险有关。我们使用上述所有特征的全基因组关联研究(GWASS)的公开摘要统计数据来利用这些统治进行多特征关联分析。进行了基于基因的富集测试,以及对显着富集基因的网络分析。我们分析了分析的GWASS中共有的4,540,326个单核苷酸多态性,观察到149个全基因组的多特征LD独立关联(P <5×10-8)的AD,PD的PD和139的MDD。在其中,AD检测到27个新型关联,PD检测到34个,MDD检测到40个。在±10 kb以内的带注释变体的18,781个基因中,有62个基因富含与AD的关联,70与PD和125个与MDD的关联(P <2.7×10-6)。,七个基因是AD(EPPK1,TTLL1,PACSIN2,TPM4,PIF1,PIF1,ZNF689,AZGP1P1)的新敏感性基因座,PD(SLC26A1,EFNA3)和两个用于MDD(HSPH1,TRMTMT6611A)。所得网络显示出显着的相互作用过量(富集p = 1.0×10-16)。被鉴定出的新基因参与了细胞骨架结构的组织(EPPK1,TTLL1,PACSIN2,TPM4),端粒缩短(PIF1),调节细胞老化,“ ZNF689,ZNF689,AZGP1P1)和NEUREDISTION INSINGE INSTIST INSTIST INSIGTION(eFREDINES INSTIDER INSIGTION(EFRESITION)(EFRESITCTIONT(EFRESITION)(EFLENNA3),EFLENNA3),EFRESIGHT(EFRESIGHT),EFRESIGHT(EFLENA3),,eflyna3)疾病和血小板参数。
人工智能或深度学习技术在解决医学成像任务方面已越来越普遍。在本次演讲中,我们首先回顾医学图像的特征,例如多模态、异构和孤立数据、稀疏和嘈杂的标签、不平衡的样本。然后,我们指出从“小任务,大数据”到“大任务,小数据”范式转变的必要性。最后,我们说明了人工智能技术在医学成像中的趋势,并提出了多种试图解决“大任务,小数据”各个方面的算法:• 注释高效的方法,无需大量标记实例即可处理医学图像分析,包括一次性或无标签推理方法。• 通用模型,学习多领域任务的“通用 + 特定”特征表示,以释放“池化大数据”的潜力,这些数据是通过将与感兴趣的任务相关的多个数据集集成到一个用途中而形成的。 • “深度学习+知识建模”方法,将机器学习与领域知识相结合,使医学图像重建、识别、分割和解析等许多任务能够达到最先进的性能。
摘要:水稻B型反应调节蛋白含有一个保守的接收结构域,随后是一个GARP DNA结合结构域和较长的C末端,其中RR21、RR22和RR23等B型反应调节蛋白参与水稻叶片、根、花和毛状体的发育。为评估B型反应调节蛋白在水稻遗传改良中的应用潜力,本研究利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术分别敲除水稻13个B型反应调节基因,在敲除载体上同时表达两个引导RNA(gRNA)以突变一个基因。利用特异性引物通过PCR筛选T 0 转化植株,筛选出大片段DNA缺失的植株。在T 1 代用Cas9特异性引物检测CRISPR/Cas9基因编辑突变体,筛选出不含Cas9的纯合突变体,并测序确认其靶区域。获得了除RR24外的12个OsRR突变体材料,初步表型观察发现不同突变体材料中株高、分蘖数、分蘖角度、抽穗期、穗长和产量等重要性状发生了变异。