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与血红蛋白病相关的 C2H2 锌指转录因子
在人类中，β-珠蛋白的特异性畸变会导致镰状细胞病和β-地中海贫血，而这些疾病的症状可以通过增加胎儿珠蛋白 (HbF) 的表达来改善。最近进行的两次 CRISPR-Cas9 筛选以 ~1500 种带注释的序列特异性 DNA 结合蛋白为中心，在表达成人血红蛋白的人类红系细胞中进行，发现了四组 HbF 基因表达的候选调节因子。它们是 (1) 已知可用于控制 HbF 的核小体重塑和去乙酰化酶 (NuRD) 复合蛋白的成员；(2) 七种 C2H2 锌指 (ZF) 蛋白，其中一些 (ZBTB7A 和 BCL11A) 已知可直接沉默成人人类红系细胞中的胎儿 γ-珠蛋白基因；(3) 一些其他不同结构类别的转录因子，它们可能间接影响 HbF 基因表达； （4）DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 维持 DNA 甲基化标记，这些标记将 MBD2 相关的 NuRD 复合物吸引到 DNA 上，以及相关的组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化。本文我们简要讨论了这些调节剂（特别是 C2H2 ZF）在诱导 HbF 表达以治疗 β 血红蛋白疾病方面的作用，以及开发安全有效的小分子疗法以调节这种高度保守的血红蛋白转换的最新进展。
增强的TP53重新激活破坏了MYC转录程序，并克服了急性髓样白血病中的Venetoclax耐药性
肿瘤抑制剂TP53经常在癌症中以突变的方式灭活，并通过抑制其阴性调节剂来重新激活。我们在这里cotarget MDM2和核出口XPO1至p53的最大转录活性。MDM2/XPO1抑制积累了核p53，并引起其转录靶标25至60倍。TP53调节MYC，MDM2/XPO1抑制作用破坏了C- MYC调节的转录组，从而导致急性髓样白血病（AML）的凋亡的协同诱导。出乎意料的是，耐Venetoclax的AML表达高水平的C-MYC，并且容易受到MDM2/ XPO1抑制体内的抑制作用。然而，MDM2/XPO1抑制后持续存在的AML细胞表现出静止和应激反应 - 相关表型。venetoclax克服了这种抗性，如单细胞质量旋转术所示。MDM2，XPO1和BCl2的三重抑制作用非常有效，对抗Venetoclax的AML体内。我们的结果提出了一种新型的，高度可翻译的治疗方法，利用p53重新激活以过度反应，反应适应压力的静脉抗体耐药性。
生长因子，细胞受体，细胞内激酶和与注意力缺陷多动障碍（ADHD）相关的转录因子
3。LindströmK，Lindblad F，Hjerna。早产和注意力缺陷/多动障碍。儿科。2011; 127：858-865。4。ertürkE，işıkü，sirin fb。ADHD中血清VEGF，IGF-1和HIF-1α水平的分析。 J Atten Disord。 2023; 28：58-65。 5。 Swanson JM，Kinsbourne M，Nigg JT等。 注意缺陷/多动症脑成像，分子遗传和环境因素以及多巴胺假说的病因学亚型。 Neuropsychol Rev. 2007; 17：39-59。 6。 Halperin JM，BédardAV，Curchack-Lichtin J. ADHD的预防性干预措施神经发育的观点。 神经疗法。 2012; 9：531-541。 7。 Galvez-Contreras A，Campos-OrdoñezT，González-CastañedaR等。 自闭症和注意力缺陷/多动症障碍中生长因子的改变。 前部精神病学。 2017; 8：126。 8。 Arnsten AF，Pliszka Sr。儿茶酚胺对与注意力缺陷/多动障碍和相关疾病的治疗相关的前额叶皮质功能的影响。 Pharmacol Biochem行为。 2011; 99：211-216。 9。 Wilens TE，Faraone SV，Biederman J.成人的注意力缺陷/多动症。 JAMA。 2004; 292：619。 10。 Huang X，Wang M，Zhang Q等。 谷氨酸的作用ADHD中血清VEGF，IGF-1和HIF-1α水平的分析。J Atten Disord。2023; 28：58-65。5。Swanson JM，Kinsbourne M，Nigg JT等。病因学亚型。Neuropsychol Rev.2007; 17：39-59。 6。 Halperin JM，BédardAV，Curchack-Lichtin J. ADHD的预防性干预措施神经发育的观点。 神经疗法。 2012; 9：531-541。 7。 Galvez-Contreras A，Campos-OrdoñezT，González-CastañedaR等。 自闭症和注意力缺陷/多动症障碍中生长因子的改变。 前部精神病学。 2017; 8：126。 8。 Arnsten AF，Pliszka Sr。儿茶酚胺对与注意力缺陷/多动障碍和相关疾病的治疗相关的前额叶皮质功能的影响。 Pharmacol Biochem行为。 2011; 99：211-216。 9。 Wilens TE，Faraone SV，Biederman J.成人的注意力缺陷/多动症。 JAMA。 2004; 292：619。 10。 Huang X，Wang M，Zhang Q等。 谷氨酸的作用2007; 17：39-59。6。Halperin JM，BédardAV，Curchack-Lichtin J.ADHD的预防性干预措施神经发育的观点。神经疗法。2012; 9：531-541。7。Galvez-Contreras A，Campos-OrdoñezT，González-CastañedaR等。自闭症和注意力缺陷/多动症障碍中生长因子的改变。前部精神病学。2017; 8：126。8。Arnsten AF，Pliszka Sr。儿茶酚胺对与注意力缺陷/多动障碍和相关疾病的治疗相关的前额叶皮质功能的影响。 Pharmacol Biochem行为。 2011; 99：211-216。 9。 Wilens TE，Faraone SV，Biederman J.成人的注意力缺陷/多动症。 JAMA。 2004; 292：619。 10。 Huang X，Wang M，Zhang Q等。 谷氨酸的作用Arnsten AF，Pliszka Sr。儿茶酚胺对与注意力缺陷/多动障碍和相关疾病的治疗相关的前额叶皮质功能的影响。Pharmacol Biochem行为。2011; 99：211-216。9。Wilens TE，Faraone SV，Biederman J.成人的注意力缺陷/多动症。JAMA。 2004; 292：619。 10。 Huang X，Wang M，Zhang Q等。 谷氨酸的作用JAMA。2004; 292：619。10。Huang X，Wang M，Zhang Q等。 谷氨酸的作用Huang X，Wang M，Zhang Q等。谷氨酸的作用
通过LM98对CYR61和CTGF的转录调节：一种合成YAP-TEAD抑制剂，靶向胶质母细胞瘤细胞中含量性血管生成模拟
胶质母细胞瘤（GBM）是中枢神经系统的高度血管生成恶性肿瘤，抗拒标准的抗血管生成疗法，部分原因是称为血管生成的替代过程称为血管生成。与GBM杂乱无章的联系，河马信号通路的失调导致YAP/ TEAD的过表达，以及涉及治疗耐药性的几个下游效应子。对GBM化学耐药表型中的血管生成模拟和河马途径是否相交知之甚少。本研究旨在研究临床注释的GBM样品中河马途径调节剂的表达模式，研究其在体外参与有关血管生成模拟的介入。此外，它旨在评估该途径的药理靶向的潜力。对河马信号构件YAP1，TEAD1，AXL，NF2，CTGF和CYR61转录水平在低度GBM和GBM肿瘤组织中的转录水平。通过人U87，U118，U138和U251脑癌细胞系以及临床注释的脑肿瘤cDNA阵列中的实时定量PCR分析基因表达。使用特定的小干扰RNA进行瞬时基因沉默。血管生成模仿，三维
DNA转座子通过富集转录因子结合基序
从基因组的非编码区域通过突变依次出现。除其他外，此类突变分析转录并创建一个新的开放阅读框（ORF）。尽管ORF出现的机制有充分的文献证明，但对实现新转录事件的机制知之甚少。然而，在许多物种中，已经报道了基因组所有区域的缺乏和非常突出的转录之间的连续体。在这项研究中，我们使用新组装的基因组和七个果蝇的近交系列的转录组和转录组搜索了从头转录本，该基因组和一个来自六个欧洲和一个非洲人口的近交系列。此设置使我们能够检测Sam ple特定的从头转录本，并将其与其他样品中的同源非转录区以及遗传和基因间控制序列进行比较。我们研究了与转换元件（TES）的关联，并富集了从头开始出现的转录本上游的转录因子基序，并将其与调节元素进行了比较。我们发现，从头的成绩单与TES重叠的频率比偶然性的频率更高。新转录本的出现cor与高鸟嘌呤 - 环蛋白含量和TE表达的区域有关。此外，从头转录本的上游区域高度丰富了调节基序。这种基序在与TES（尤其是DNA TES）重叠的新转录物中更丰富，并且比上游的“非转录同源物”更保守上游。总体而言，我们的研究表明，TE插入对于转录本的出现很重要，部分是通过引入DNA te家族的新调节图案。
Quantinova®逆转录套件手册
缓冲液优化用于用Quantinova逆转录酶进行逆转录的缓冲液；包含寡-DT和随机引物的优化组合，其中包括Mg 2+和DNTP。它允许从所有RNA转录物的所有区域，即使是从5'区域产生的。
WRKY转录因子反应和对植物中非生物应力的耐受性
摘要：植物在整个发育期都会承受非生物胁迫。非生物应力包括干旱，盐，热，冷，重金属，营养元素和氧化应激。改善植物对各种环境压力的反应对于植物的生存和实用性至关重要。WRKY转录因子具有特殊的结构（WRKY结构域），这使得WRKY转录因子具有不同的转录调节函数。WRKY转录因子不仅可以通过调节植物激素信号通路来调节非生物应激反应以及植物的生长和发育，而且还可以通过与W-Box [Tgacca/Tgacct]结合在其靶基因的启动子中通过与W-Box [TGACCA/TGACCT]结合来促进或抑制下游基因的表达。此外，WRKY转录因子不仅与其他转录因子家族相互作用，以调节植物防御对非生物胁迫的反应，而且还通过识别和与W-box的结合来自我调节，以调节其对非生物胁迫的防御反应。然而，近年来，关于高等植物中WRKY转录因子的调节作用的研究评论稀缺。在这篇综述中，我们着重于WRKY转录因子的结构和分类，以及鉴定其下游目标基因和参与对非生物压力的反应的分子机制，这可以提高植物在非生物压力下的耐受能力，我们还期待着未来的研究指导，并提供了对属性的影响，并提供了属性的影响。
机器学习揭示了生产宿主链霉菌Albidoflavus
链霉菌Albidoflavus是一种流行且遗传上的平台菌株，用于通过异源生物合成基因簇（BGC）的表达进行自然产物发现和生产。然而，其转录调节网络（TRN）及其对继发代谢的影响尚不清楚。在这里，我们通过将独立的组件分析应用于来自内部和公共资源的218个高质量RNA-SEQ转录组的纲要，通过将独立的组件分析应用于88个独特的增长条件，来表征其TRN。我们获得了78个独立调制的基因集（imodulons），这些基因（imodulons）在定量地描述了跨不同条件的TRN及其活性状态。Through analyses of condition-dependent TRN activity states, we (i) describe how the TRN adapts to different growth conditions, (ii) conduct a cross-species iModulon comparison, uncovering shared features and unique characteristics of the TRN across lineages, (iii) detail the transcriptional activation of several endogenous BGCs, including surugamide, minimycin and paulomycin, and (iv) infer potential functions of 40% albidoflavus基因组中未表征的基因。我们的发现提供了对Albidoflavus的TRN的全面和定量的理解，为进一步的探索和实验验证提供了知识库。
人线粒体DNA的复制和转录
哺乳动物线粒体DNA（mtDNA）通过噬菌体样DNA和RNA聚合酶进行了复制和转录，并且在过去的几十年中，我们对这些过程的理解取得了大幅度的发展。分子机制已通过生物化学和结构生物学阐明，并且由细胞生物学和小鼠遗传学确立的体内角色必不可少。Single molecules of mtDNA are packaged by mitochondrial transcription factor A into mitochondrial nucleoids, and their level of compaction influ- ences the initiation of both replication and transcription.Mutations affecting the molecular machineries replicating and transcribing mtDNA are impor- tant causes of human mitochondrial disease, reflecting the critical role of the genome in oxidative磷酸化系统生物发生。仍然需要澄清蒙德纳复制和转录的机制，并且该领域的未来研究可能会为治疗线粒体功能障碍的新型治疗可能性开放。
致癌转录因子β-catenin
摘要：β -catenin（CTNNB1）是一种致癌转录因子，在细胞 - 细胞粘附和细胞增殖和存活基因的转录中很重要，可驱动许多不同类型的癌症的发病机理。但是，CTNNB1的直接药理靶向仍然具有挑战性。在这里，我们进行了一个带有半胱氨酸反应性共价配体库的屏幕，以识别以泛素蛋白依赖性依赖性依赖性方式耗尽CTNNB1的单价降解器EN83。我们表明，EN83直接靶向CTNNB1三个半胱氨酸C466，C520和C619，导致CTNNB1的稳定和降解。通过结构优化，我们生成了一个高度有效且相对选择性的不稳定降解器，该降解器通过仅在CTNNB1上的C619靶向起作用。我们的结果表明，化学蛋白质组学方法可用于共价靶向和降解具有不稳定介导的降解（例如CTNNB1）（例如CTNNB1）的具有挑战性的转录因子。■简介