Chromosome-scale genome assembly of bread wheat's wild relative Triticum timopheevii 1 2 Surbhi Grewal 1 , Cai-yun Yang 1 , Duncan Scholefield 1 , Stephen Ashling 1 , Sreya Ghosh 2 , David 3 Swarbreck 2 , Joanna Collins 3 , Eric Yao 4,5 , Taner Z. Sen 4,5 , Michael Wilson 6 , Levi Yant 6 , Ian P. King 1和4 Julie King 1 5 6 1。麦片研究中心,植物与作物科学系,生物科学学院,诺丁汉大学7号大学,拉夫堡,LE12 5rd,英国8 2。伯爵研究所,诺里奇研究公园,诺里奇NR4 7UZ,英国9 3。基因组参考信息学团队,惠康桑格学院,惠康信托基因组10校园,欣克斯顿,CB10 1RQ,英国11 4。加利福尼亚大学加利福尼亚大学,加利福尼亚州伯克利生物工程系,美国94720,美国12 5。 美国农业部 - 农业研究服务局,西部地区13研究中心,农作物改善与遗传学研究部门,布坎南街800 诺丁汉大学,大学公园,诺丁汉,NG7 2rd 16通讯作者:Surbhi Grewal(surbhi.grewal@nottingham.ac.uk)17 18摘要19 20 20小麦(Triticum aestivum)是最重要的食物作物之一,迫切需要增加生产的生产,以养活生长的世界。 triticum timopheevii(2n = 4x = 28)是一种同种二磷酸22小麦野生物种,其中包含在许多23个先前的小麦改善育种计划中利用的A T和G基因组。 在这项研究中,我们报告了基于PACBIO 25 HIFI读取和染色体构象捕获(HI-C)的24个染色体尺度参考基因组组装PI 94760。 ex asch。加利福尼亚大学加利福尼亚大学,加利福尼亚州伯克利生物工程系,美国94720,美国12 5。美国农业部 - 农业研究服务局,西部地区13研究中心,农作物改善与遗传学研究部门,布坎南街800诺丁汉大学,大学公园,诺丁汉,NG7 2rd 16通讯作者:Surbhi Grewal(surbhi.grewal@nottingham.ac.uk)17 18摘要19 20 20小麦(Triticum aestivum)是最重要的食物作物之一,迫切需要增加生产的生产,以养活生长的世界。 triticum timopheevii(2n = 4x = 28)是一种同种二磷酸22小麦野生物种,其中包含在许多23个先前的小麦改善育种计划中利用的A T和G基因组。 在这项研究中,我们报告了基于PACBIO 25 HIFI读取和染色体构象捕获(HI-C)的24个染色体尺度参考基因组组装PI 94760。 ex asch。诺丁汉大学,大学公园,诺丁汉,NG7 2rd 16通讯作者:Surbhi Grewal(surbhi.grewal@nottingham.ac.uk)17 18摘要19 20 20小麦(Triticum aestivum)是最重要的食物作物之一,迫切需要增加生产的生产,以养活生长的世界。triticum timopheevii(2n = 4x = 28)是一种同种二磷酸22小麦野生物种,其中包含在许多23个先前的小麦改善育种计划中利用的A T和G基因组。在这项研究中,我们报告了基于PACBIO 25 HIFI读取和染色体构象捕获(HI-C)的24个染色体尺度参考基因组组装PI 94760。ex asch。组件的总尺寸为26 9.35 GB,具有42.4 Mb的重叠元素N50和166,325个预测的基因模型。DNA甲基化27分析表明,G基因组的平均甲基化碱基比A T基因组更多。28 g基因组也与aegilops speltoides的S基因组更紧密相关,而不是与六倍体或四倍体小麦的B 29基因组。总而言之,T。timopheevii基因组组装为30发现了对食品31安全性的农艺重要基因的基因组发现的宝贵资源。32 33背景和摘要34 35人物属包括许多野生和栽培的小麦种类,包括二倍体,四倍体36和六倍体形式。多倍体物种起源于甲状腺素和37个相邻的Aegilops属(山羊草)之间的杂交。四倍体物种,毛triticum triticum tricum torgidum(2n = 4x = 28,38 aabb),也称为emmer小麦,三质体timopheevii(2n = 4x = 4x = 28,a t a t gg)是39多态的。triticum urartu thum。ex gandil(2n = 2x = 14,aa)是这两个物种1的基因组供体1,而B和G基因组与Aegilops 41 Speltoides 2的S基因组密切相关。两种四倍体物种均具有野生和驯化的形式,即T. turgidum L. ssp。42 dicoccoides(Körn。&graebn。)Thell。和SSP。dicoccum(schrankexschübl。)thell。,分别为43,T。Timopheevii(Zhuk。)Zhuk。 ssp。 armeniacum(jakubz。) slageren和ssp。 分别为44 timopheevii。 durum(desf。) 45 HUSN。Zhuk。ssp。armeniacum(jakubz。)slageren和ssp。分别为44 timopheevii。durum(desf。)45 HUSN。45 HUSN。此外,四倍体硬质小麦T. turgidum L. ssp。(2n = 4x = 28,AABB),用于意大利面的生产,六倍层面包小麦triticum aestivum aestivum 46 L.(2n = 6x = 42,aabbdd)从驯养的emmer小麦中进化而成,后者与aegilops tauschii(d tauschii donore hybridations the the the the the bentertiationally the tauschii donore(d genuschii donor)(d donore)6,000,000,000,000,000,000。十六世纪48个Triticum Zhukovskyi(Aagga M a M)源自培养的Timopheevii杂交和49个培养的Einkorn triticum单球菌3(2n = 2x = 2x = 14,A M A M)。50 51
摘要:五十年前,苏苏姆·ohno(Susumu Ohno)提出了著名的C值悖论,该悖论指出,基因组的物理大小,即DNA的量与生物体的复杂性之间没有相关性,并突出了基因组降低的问题。DNA已被描述为“垃圾或selfer dNA”。垃圾DNA的有争议的概念仍然可行。rye是对该概念的正确性和科学意义的另一个测试的便捷主题。栽培黑麦的基因组,塞莱·瓦雷·L。被认为是部落小毛虫的物种中最大的一部分之一,因此它是平均被子植物的基因组及其最接近进化邻居的基因组,例如大麦,荷尔德人,荷尔德人(大约30-35%)和二型麦田(Triticum),triticum,triticum,triticum,triticum,triticum of triticum of triticum,triticum,and triticum of diplitium of triticum,and。审查提供了对黑麦染色体各个区域的结构组织的分析,并描述了有助于其在进化过程中大小增加的分子机制以及这些过程中涉及的DNA序列的类别。是真核基因组冗余概念发展的历史,并讨论了此问题的当前状态。
phytophthora Infestans是全球马铃薯最严重的病原体。病原体具有多种有问题的特征,例如混合的繁殖系统,多环境和高遗传可塑性,它容易适应新情况,e。 g。通过发展对杀菌剂的抗性。以前已经报道了杀菌剂,例如金属酰胺类,丙酰果,曼陀酰胺(MPD)和oxathiapoprolin(OTP)。这项研究调查了2023年期间在瑞典领域收集的Infestans分离物,以抵抗MPD和OTP,这是瑞典以前在瑞典没有发现的耐药性。将两种杀菌剂浓度序列的浮叶盘分析用于表型分离株。将任何在先前的研究中引起抗性的SNP连接起来,对MPD的靶基因PICESA3和OTP的ORP1进行了sanger测序。此外,将一些分离株发送给苏格兰的詹姆斯·赫顿研究所进行微卫星基因分型,以研究是否可以将抗性连接到炎症假单胞菌的特定SSR基因型。
摘要:一个重组的近交系数量,包括371条线,由每个尖峰(KNP)基因型T1208和低KNPS基因型Chuannong18(CN18)开发。由小麦55k SNP阵列构建的遗传连锁图由11,583个标记组成。在三年内检测到与KNP有关的定量性状基因座(QTL)。分别使用ICIM-BIP,ICIM-MET和ICIM-EPI方法来识别八个,二十七个和四个QTL。一个QKTL,QKNPS.SAU-2D.1,在染色体2D上映射,可以平均解释18.10%的表型变化(PVE),并被视为KNP的主要稳定QTL。此QTL位于2D染色体上的0.89 MB间隔,并由标记物AX-109283238和AX-111606890倾斜。此外,设计了与qknps.sau-2d.1紧密相关的Kompetive Primentififififif PCR(KASP)标记的KASP-AX-111462389。QKNPS.SAU-2D.1对KNP的遗传作用成功地确认了两个RIL种群。结果还表明,KNPS和1000个内核重量(TKW)的显着增加是由QKNPS.SAU-2D.1引起的,这是由于尖峰数量(SN)的减少而克服了劣势,并最终导致晶粒产量的显着增加。此外,在QKNPS.SAU-2D.1位于中国春季参考基因组中的间隔内,仅发现了十五个基因,并且两个可能与KNP相关的基因都被鉴定出来。qknps.sau-2d.1可能会为未来的高产小麦育种提供新的资源。
保护农业(CA)稻麦系统通过提高生产效率和更好的环境质量提高了整体生产率和盈利能力。在CA下,保留残留物至关重要,但是在多大程度上?- 仍然没有得到答复。有机会在西孟加拉邦的亚马拉亚平原上保留了稻米残留物,以更精确的方式管理营养。将它们保持在背景下,在2021-2022和2022-2023的阴茎季节进行了实地实验,在保护农业街区,北阿兰卡·克里希(Uttar Banga Krishi Viswavidyalaya),西孟加拉邦,北方·邦加·克里希(Uttar banga Krishi viswavidyalaya),以评估稻米居民重新保留和营养管理方案的影响,以评估各种成长和产量的份额。实验被布置在分裂图设计中,具有各种水稻残留高度的四个主要情节处理(稻草在收获后保持在各种高度,即在地面上,即在地面上,即0 cm,r 1-15 cm,r 1-15 cm,r 2-30 cm和r 3-45 cm和r 3-45 cm)和五个营养的管理选项,作为n 2- n 2- n 2-- n 2 - 2--2-2-2 3-营养专家®(NE),N 4 -RDF + BIO和N 5 -NE + BIO),每个复制三次。实验中使用的小麦品种为DBW 187。结果表明,水稻残留物保留对总体生长参数,屈服属性和小麦作物产量没有任何显着影响。然而,在将稻草保持在30 cm高度的治疗r 2下,获得了较高的谷物产量(4.48和4.16 T HA -1)。营养管理方案对所有生长参数,产量属性和小麦产量都有重大影响。结果强调,在Ne®指导下以平衡的方式管理养分,并用生物肥料接种(n 5)显着改善了Spike No。M -2(277和268),填充谷物尖峰-1(43.40和46.73),尖峰长度(11.13和11.70 cm),1000粒重量(40.70和40.70和40.67 g)相比,谷物的收益率更高(5.27和4.64 T HA -1)与其他处理相比。在没有保留上述地面残基(r 0)且没有任何施肥剂(n 1)的处理下获得了较低的生长值,产量属性。可以得出结论,在30 cm高度(R 2)和NE®指导的营养管理下,残留物以及氮杂杆菌和PSB的种子接种可能会提高该区域下的零耕作小麦的生产率。
15 Givanna Teixeira Sandoval Moreira 博士 植物病理学 通过基因编辑 EIF4E 来增强小麦对小麦条纹花叶病毒和小麦花叶病毒的抗性 16 Akshitha Reddy Bynegeri 硕士 农学 CYP 和 HPPD 基因在三酮耐受转基因小麦中的表达
摘要。白粉病(Blumeria graminis f. sp. Tritici,(Bgt))是一种世界范围内重要的小麦(Triticum aestivum)真菌叶面病害,造成严重的产量损失。因此,开发抗性基因和解剖抗性机制将有利于小麦育种。Bgt 抗性基因 PmAS846 被转移到来自 Triticum dicoccoides 的六倍体小麦品系 N9134 中,它仍然是最有效的抗性基因之一。在这里,通过 RNA 测序,我们与模拟感染植物相比,在小麦 -Bgt 相互作用中使用成对比较和加权基因共表达网络分析鉴定了三个共表达的基因模块。应激特异性模块的中心基因显著富集在剪接体、吞噬体、mRNA 监视途径、内质网中的蛋白质加工和内吞作用中。选取位于5BL染色体上的诱导模块基因构建蛋白质相互作用网络,预测其中关键的枢纽节点蛋白包括Hsp70、DEAD/DEAH盒RNA解旋酶PRH75、延长因子EF-2、细胞分裂周期5、ARF鸟嘌呤核苷酸交换因子GNOM-like、蛋白磷酸酶2C 70蛋白,并与RLP37、RPP13、RPS2类似物等多个抗病蛋白发生相互作用。基因本体富集结果表明,小麦在Bgt胁迫下可以通过mRNA转录机制激活结合功能基因。其中,GNOM-like、PP2C isoform X1和跨膜9超家族成员9被定位到距离为4.8 Mb的PmAS846基因片段上。该研究为深入理解抗病机制及克隆抗病基因PmAS846奠定了基础。
文章标题抑制了鼠伤寒沙门氏菌生物膜形成,粘附和乳清饮料的侵袭,并补充了甲滴虫(FARRO)酶的酶运行标题(10个单词)的拮抗作用(在10个单词中),对Farro酶 - 烯烃 - 烯烃含有乳清饮料的拮抗作用。Typhimurium作者Jihyeon Baek 1,Jinho Lee 1,Yong Jin Jeong 2,3 2,3,Shin Young OH 2,Seok-Seong Kang 1,*隶属关系1食品科学与生物技术系,DongGuk University,Dongguk University,Goyang 10326,Goyang 10326,Republic of Korea 2 Kmf Co. Co.,ltd.,ltd.,daeg.ltd.,daegu,41,daegu,4105。和技术,Keimyung University,Daegu 42601,大韩民国特别言论 - 如果作者还有其他信息来通知编辑办公室
小麦(Triticum aestivum)是全球重要的粮食作物,含有碳水化合物以及其他重要营养成分,如蛋白质、少量脂质、维生素、矿物质以及植物化学物质[1]。膳食纤维是碳水化合物低聚物和聚合物,它们不易被人体小肠消化吸收,从而导致在人体大肠中部分或完全发酵[2]。全麦谷物含有9%到20%的膳食纤维,膳食纤维的主要成分是细胞壁多糖,主要是阿拉伯木聚糖和(1,3;1,4)-β-D-葡聚糖(β-葡聚糖),分别占总膳食纤维的约70%和20%[3]。此外,小麦粒中的膳食纤维还含有抗性淀粉,这种淀粉在小肠中不被消化,能够相对不变地到达大肠和结肠[4]。
图2在单场试验中生长的覆盖作物物种的表型性状评估。(a)植物表型特征的主要成分分析由植物质量分数和杂草严重程度的家族聚集,这是对PC1和总生物量的最大贡献者,对PC2的贡献最大。(b - g)箱形图显示了每个覆盖作物物种的单个表型特征评分。苜蓿(Medicago sativa),Dundale Pea(trifolium incarnatum),Milkvetch(Astragalus spp。),深红色三叶草(Pisum sativum),毛茸茸的vetch(vicia villosa),芥末酱(Brassica juncea),大麦(大麦(Hordeum vulgare)),小麦(triticum aestivum),冬季rye(secale cereale)(secale cereale)和diliticale(x triticosecale)[×Triticosecale)[