• Ubiquitin signalling • Ubiquitination, Deubiquitination & Ub-like modifications • Proteostasis & protein degradation pathways • Structure & function of UPS • UPS role in Human health & diseases • UPS in cancer & neurodegeneration • Autophagy/ Mitophagy & ERAD pathways • Unfolded Protein Responses & ER stress • Big Data Analytics in Proteomics &蛋白质的•蛋白质生物标志物和治疗靶标•UPS中的Protacs&Drug Discovery•合成生物学与蛋白质工程
总结泛素蛋白水解系统在一系列基本的细胞过程中起重要作用。是细胞周期的调节,免疫反应和炎症反应的调节,信号转导途径的控制,发育和分化。这些复杂过程通过单个或子集的蛋白质的特异性降解来控制。deg含量涉及两个连续的步骤,共轭泛素的多种部分以及26S蛋白酶体对标记蛋白的降解。一个重要的问题涉及基于系统特异性的机制的身份。底物识别受一个大型家族泛素连接酶的控制,该连接酶可以认识底物,结合它们并催化/促进它们与泛素的相互作用。生物评估22:442±451,2000。β2000 John Wiley&Sons,Inc。
Biomarkers Two plasma biomarkers, glial fibrillary acidic protein (GFAP) and ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L1 (UCH-L1), are FDA approved as highly sensitive for an abnormal CT scan following mTBI and can be measured with the i-STAT handheld Alinity System.目前不能只用血浆进行全血。9指在潜在的脑震荡事件临床实践指南之后,使用创伤性脑损伤血浆生物标志物以获取更多信息。
生物医学研究所2025-01-06奖学金宣布 - 博士后同学项目标题:泛素蛋白 - 依比Quitasin sigase huwe1在免疫项目持续时间和日期中的作用和机制:6个月,01.03.2025-31.08.08.2025应用程序申请书: Anetta.hartlova@gu.se项目摘要:背景天生免疫系统要求严格的法规以确保对病原体的有效防御而不会引起自我伤害。泛素化是一种关键的翻译后修饰,它控制了包括先天免疫信号通路在内的差异细胞过程。泛素化涉及通过E3泛素连接酶将泛素肽偶联到靶蛋白上。尚未完全了解参与先天免疫调节的E3泛素连接酶。最近,我们确定E3连接酶Huwe1是先天免疫的基本调节剂,并且这种酶在小鼠中的消融导致保护与年龄相关的炎症。目的该项目的目的是研究E3连接酶在调节不同先天免疫途径及其对年龄相关炎症和生理功能下降的影响中的作用和机制。方法我们将区分骨髓巨噬细胞和小鼠胚胎成纤维细胞与WildType和Huwe1敲除小鼠,并将在应激挑战时进行比较其细胞因子反应,包括特定先天免疫途径的定义配体。申请应通过电子邮件发送至:anetta.hartlova@gu.se申请应包括:
方式。然后将活化的泛素部分通过转化反应转移到泛素结合酶(E2)中。接下来,E2酶与多种泛素连接酶(E3)合作,将泛素转移至底物蛋白上的赖氨酸残基。多泛素化的底物蛋白被某些蛋白质识别,展开和降解。蛋白质降解器是小分子化合物,通过劫持细胞内UPS诱导靶蛋白的选择性降解。这种靶向蛋白质降解策略极大地扩展了可药物靶蛋白的光谱,并被认为是药物开发的一种新的有希望的方式,因为它不需要在靶蛋白上明确的活性位点。沙利度胺衍生物,例如列纳奈度胺和pomali-Di-Dimide,统称为免疫调节性伊酰亚胺药物(IMIDS),主要用于治疗血液性恶性肿瘤,例如多发性骨髓瘤(图2)。多发性骨髓瘤是一种疾病,其中骨髓中的浆细胞变为癌。 IMID和其他药物的开发
许多基本的生物过程都通过接近度调节,从膜受体信号传导到转录活性。泛素蛋白酶体系统以泛素连接酶为限制步骤来控制蛋白质降解。泛素连接酶通常在底物募集水平上受到控制,因此是通过接近度控制的。有天然和合成的小分子也通过诱导的接近性起作用。例如,沙利度胺可有效治疗多发性骨髓瘤,并作为一种分子胶,可稳定泛素蛋白连接酶和连接酶其他未针对的蛋白质之间的新型蛋白质 - 蛋白质相互作用,从而导致新的底物降解。关于新降级分子的新兴数据具有不同的机制,不同于分子胶,这些机制通常反映了控制自然界中底物 - 岩酶接近性的调节机制。在这篇综述中,我们总结了我们目前对蛋白质降解的生物学和合成调节的理解,并分享了我们对这些多样化机制如何启发新的治疗方向的看法。
泛素 - 蛋白酶体系统(UPS)可用于异常或冗余蛋白质的降解和转化。UPS调节细胞的增殖,分化和代谢,神经网络形成,自动噬菌体以及其他生理或病理过程[1]。UPS受到严格控制,系统通常由泛素(UB),26S蛋白酶体,去泛酶的酶(DUBS),泛素激活酶(E1),Ubiq ubiq uitin uitin-conjugating酶(E2)和ubiquitin ligiigasase(E1)(E1)(E1)(E1)(E1)(E1)(E2)(E2)(E3)(E3)。APC是一种巨大的多sub单位蛋白质复合物,至少13个亚基可以通过泛素化控制细胞周期的关键底物。APC将它们定位在26S蛋白酶体中,启动后期,并通过进一步的降解[3]导致有丝分裂戒断。两个结构同源的辅助亚基CDC20和CDC20同源物1(CDH1)通常被视为“ APC coacti vators”。CDC20和CDH1负责扎带底物并激活APC的泛素连接酶活性,形成了两种不同的E3泛素连接酶配合物,APC CDC20和APC CDH1 [4]。cdc20主要在分区和早期G1阶段起抑制作用,通过降解securin和有丝分裂周期来阻碍分裂
作为治疗方法的靶向蛋白质降解已经看到了惊人的发展和巨大的投资[1]。蛋白水解 - 靶向嵌合体(protac)和诱导靶向蛋白质降解的相关分子具有很大的价值,主要是因为与常规目标占用驱动抑制剂相比,对于给药,安全性,有效性,选择性和调节“不可用的”目标[2] [2]。这些异常小分子具有三个化学特征:与靶蛋白的部分结合,另一种与E3泛素连接酶结合,以及与这两个元素结合的接头[3]。除了protac,还有某些称为分子胶地的非晶状体小分子蛋白蛋白二聚体,它们还结合了泛素E3连接酶和募集蛋白质以降解,类似于带有靶向蛋白质降解的Protacs [4]。
背景 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)代表了一类有前途的新型药物,可选择性地降解细胞中的目标蛋白质。PROTAC 是具有两个功能端的小分子,一个小分子端与目标蛋白质结合,另一端与 E3 泛素连接酶结合。PROTAC 成分将泛素连接酶募集到目标蛋白质,导致其泛素化并随后被蛋白酶体降解。PROTAC 已被开发用于多种癌症靶标,包括致癌激酶、表观遗传靶标和最近的 KRAS G12C 蛋白,其中几种目前正在临床试验中针对各种癌症进行测试。在临床前癌症模型中已报告对 PROTAC 的获得性耐药性,这表明 PROTAC 疗法对癌症的长期益处可能有限。因此,需要一种能够克服对 PROTAC 的耐药性并提供持久药物反应的治疗方法。发明概述
背景 生长素诱导降解 (AID) 技术可通过化学遗传学控制蛋白水解 [ 1 ]。为了应用 AID,需要通过基因工程将不稳定肽或“降解决定子”标记到目标蛋白上。生长素受体(如 Os TIR1)在相同细胞中外源表达,作为 Skp1-Cullin1-TIR1 (SCF TIR1 ) 泛素连接酶复合物的底物识别亚基发挥作用。生长素(如吲哚-3-乙酸,IAA)作为化学胶水连接 SCF TIR1 泛素连接酶和降解决定子标记蛋白,导致降解决定子标记蛋白快速多泛素化和蛋白酶体降解 [ 1 , 2 ]。 AID 能够快速高效地降解靶蛋白,避免长期沉默或 CRISPR 敲除过程中出现的副作用,并为理解动态生物过程中不同靶蛋白的功能提供了重要的机制见解 [ 3 – 7 ]。然而,一些障碍限制了我们充分发挥 AID 潜力的能力。