SHAPE 软件可以量化化学 3D 结构与理想几何结构或用户选定结构的偏差。7 在我们的案例中,我们用它来比较文献中先前描述的含 LBT 肽的形状(见表 S1)。SHAPE 软件确定一个连续形状参数 (SP),该参数的数学定义与系统大小无关。根据定义,当金属位点(问题结构,P)的实际坐标恰好显示出所需的理想形状时,SP 的结果值为零,并且随着结构的扭曲程度而增加。低于 0.1 的值表示结构中化学上无关紧要的扭曲。大于 3 的值表示重要的扭曲,通常遇到的最高值在 40 的数量级。
1俄勒冈州立大学土木与建筑工程学院助理教授(高级研究),俄勒冈州立大学101号,科尔瓦利斯SW校园之路1491号,俄勒冈州科瓦利斯。电子邮件:erzhuo.che@oregonstate.edu 2俄勒冈州立大学民用与建筑工程学院教授,101 Kearney Hall,1491 SW Campus Way,Corvallis,Corvallis,97331。电子邮件:michael.olsen@oregonstate.edu
图 1. APPEAL 克隆。A、从载体 pYJA5 中去除氨苄青霉素抗性基因 (AmpR)。sgRNA1-4 和甲氧苄啶抗性基因 (TmpR) 与三个不同的 PCR 扩增子融合。所有元件均经过 Gibson 组装以形成 4sgRNA-pYJA5 质粒,并用甲氧苄啶筛选转化子。描绘了 4sgRNA-pYJA5 全质粒和 4sgRNA 盒的详细结构。LTR,长末端重复;Ψ,包装信号序列;PB,piggyBac 转座子元件;PuroR,嘌呤霉素抗性元件;hU6、mU6、hH1 和 h7SK 是普遍表达的 RNA 聚合酶 III 启动子;sg,sgRNA。 B、转化大肠杆菌并进行甲氧苄啶筛选后,代表性 pYJA5 限制性片段、3 片段 PCR 和 APPEAL 克隆产物的单菌落 PCR。Bbs I 消化 pYJA5 产生约 1 千碱基 (kb) 的 AmpR 元件条带和约 7.6 kb 的线性化载体条带(左)。使用相应的 sgRNA 引物进行 PCR 后,三个扩增子在琼脂糖凝胶上分别显示预期的 761、360 和 422 bp 大小(中)。使用转化细菌平板中 APPEAL 克隆产物 4sgRNA 盒两侧的引物进行单菌落 PCR 始终产生预期大小(2.2 kb,右)。 C ,8 个具有不同 4sgRNA 序列的独立 APPEAL 实验中正确、重组和突变 4sgRNA 质粒的百分比(每个实验测试 ≥22 个菌落)。D ,四个 APPEAL 实验中正确、重组和突变 4sgRNA 质粒的百分比。每个点代表一个由八个菌落组成的独立生物复制品(n=24;平均值 ± SEM)。E ,高通量格式的 APPEAL 克隆时间线(h:小时;d:天)。
硕士工程师 Mirko Tischer Tischer 先生自 1997 年起在 Vector Informatik GmbH 从事产品开发和产品管理工作。作为集团负责人,他负责开发航空航天领域通信网络的分析、模拟和测试工具。
摘要 许多增材制造 (AM) 技术依赖于粉末原料,粉末原料通过熔化或化学结合随后烧结形成最终部件。在这两种情况下,工艺稳定性和最终部件质量都取决于粉末颗粒和流体相(即熔融金属或液体粘合剂)之间的动态相互作用。本研究提出了一种通用的计算建模框架,用于模拟涉及热毛细管流和可逆相变的耦合微流体-粉末动力学问题。具体而言,液相和气相与由基材和移动粉末颗粒组成的固相相互作用,同时考虑温度相关的表面张力和润湿效应。在激光-金属相互作用的情况下,通过额外的机械和热界面通量来整合快速蒸发的影响。所有相域都使用光滑粒子流体动力学进行空间离散化。该方法的拉格朗日性质在由于相变和耦合的微流体-粉末动力学而动态变化的界面拓扑背景下是有益的。在制定相变时要特别小心,这对于计算方案的稳健性至关重要。虽然底层模型方程具有非常通用的性质,但所提出的框架特别适用于各种 AM 过程的中尺度建模。为此,通过几个应用驱动的示例证明了计算建模框架的通用性和稳健性,这些示例代表了特定的 AM 过程,即粘合剂喷射、材料喷射、定向能量沉积和粉末床熔合。除其他外,它还展示了粘合剂喷射中液滴的动态影响或粉末床熔合中蒸发引起的反冲压力如何导致粉末运动、粉末堆积结构的扭曲和粉末颗粒的喷射。
心血管疾病仍然是全球范围内导致死亡的主要原因,其中血浆低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 水平高(或称高胆固醇血症)和血浆甘油三酯水平高(或称高脂血症)是风险的主要决定因素。[1,2] 降低胆固醇是一个有吸引力的治疗目标,LDL-C 降低 30-40% 与心血管疾病风险同时降低相关。[3] 他汀类药物是目前的标准治疗方法,由于不耐受和增加剂量的副作用,10-20% 的高危患者群体被忽视,这促使人们从遗传学角度寻找替代品。 [3,4] 当前蛋白转化酶枯草溶菌素/kexin 9 型 (PCSK9) 的功能获得性突变被确定为常染色体显性高胆固醇血症的病因,导致患者的 LDL-C 水平升高和早期冠心病 (CHD) 时,人们发现了第一个心脏保护基因靶点。[5] PCSK9 的功能丧失序列变异导致 LDL-C 水平显著降低 (40%) 和 CHD 降低 88%。[6] PCSK9 是一种在肝脏中表达的 LDL 受体 (LDLR) 拮抗剂,因此过表达会导致 LDL 受体减少,并降低血浆中的 LDL-C 清除率。[7] 针对 PCSK9 的单克隆抗体被认为是解决他汀类药物尚未满足的重大需求的潜在解决方案。 [8] 然而,PCSK9 抗体(例如 alirocumab)在临床试验中表现出不良反应,包括注射部位反应、神经认知事件、眼科事件和抗药抗体产生。[9] 小干扰 RNA(siRNA),例如 inclisiran,已被开发用于提供与抗体疗法类似的心脏保护作用。[10] 虽然这些 siRNA 能够显著下调 PCSK9,但与这种基因操作方式相关的高脱靶效应仍然令人担忧。CRISPR/Cas9 介导的基因破坏为更高精度、更低频率的治疗提供了一种替代方案。[11]
,例如青霉素,sterptymycin和risthomycin。淹没发酵用于生产各种酶,用于生产各种酶,例如淀粉酶,纤维素和蛋白酶。有机酸,例如柠檬酸,乳酸和乙酸。淹没发酵是一种工业生物技术中广泛使用的过程,用于生产各种生物产品,例如抗生素,酶,有机酸和生物燃料。此过程由于其对生长条件和可伸缩性的精确控制而提供了所需产品的高收益。但是,它也有一些缺点,例如高设备成本和污染风险,必须考虑在内。尽管存在这些挑战,但淹没的发酵仍有许多应用,预计将来将在工业生物技术中发挥越来越重要的作用。
丝氨酸蛋白酶抑制剂是参与重要途径和过程的大型蛋白质,例如炎症反应和血液凝结。大多数以精确的作用方式为特征,从而靶向狭窄的蛋白酶底物。然而,丝氨酸 - 聚糖抑制剂Ecotin能够抑制广泛的丝氨酸蛋白酶,这些丝氨酸蛋白酶显示出广泛的特异性。这种特异性是由特殊的结构特征驱动的,这些特征允许在与目标结合时独特的灵活性。尽管在许多人/动物相关的细菌中经常观察到,但在植物相关的分类单元和环境物种中也可以发现Ecotin同源物。本综述的目的是提供有关生物学重要性,在宿主 - 微生物相互作用中的作用以及从整个生命树中的真核和原核物种分离的生态蛋白直系同源物之间的进化关系。
在设计药物输送系统时,研究人员主要专注于在目标部位提供准确的药物。这样,通过使用现代纳米技术来利用许多方法,这在其方式上被证明是最好的。1纳米技术是科学的一个分支,在纳米级使用纳米材料来创建具有先进特征和改进特性的纳米工程产品,尺寸范围为1至100 nm。十亿分之一是纳米。纳米材料是物理化合物,至少在1至100 nm的范围内。2这些NP在多种不同的形状中观察到,包括聚合物纳米颗粒,硬磷脂纳米颗粒,纳米乳液,树枝状聚合物,纳米体,脂质体,脂质体,碳纳米管,胶束系统等3在这方面,纳米技术在医学领域中的使用正在通过更精确的药理药物治疗或“智能药物”过渡到“活跃结构”,或者是通过将某些配体耦合到纳米载体或适当性的“智能药物”。可以将多种药物(如抗真菌,抗病毒,抗癌,挥发性油,气体,蛋白质和肽)固定在称为纳米杂物的胶体纳米含量结构中。