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JRSEEK：人工智能符合病毒中的果冻roll折叠分类
jrseek：人工智能在病毒中遇到果冻卷折叠分类，杰森·E·桑切斯（Jason E. Sanchez）1，温汉·朱2（Wenhan Guo 2），丘奇安格李3，林李3 *，chuan xiao 2 * 1计算科学系，德克萨斯大学El Paso，El Paso，El Paso，El Paso，TX 2德克萨斯大学埃尔帕索分校的物理学，德克萨斯州埃尔帕索 *通信：电子邮件：lli5@utep.edu; cxiao@utep.edu关键字病毒；人工智能;机器学习；果冻卷；病毒结构摘要果冻卷（JR）折叠是病毒的衣壳和核蛋白质中发现的最常见的结构基序。其在许多不同病毒家族的动机中的普遍性开发了一种工具来预测其从序列中的存在。在当前的工作中，在六个不同的大语模型（LLM）嵌入训练的逻辑回归（LR）模型在将JR与非JR序列区分开时表现出超过95％的精度。用于训练和测试的数据集包括来自单个JR病毒，非JR病毒和非病毒免疫球蛋白样β-三明治（IGLBS）蛋白的序列，这些蛋白与JR结构上非常相似。鉴于病毒家族之间的低序列相似性和数据集的平衡性质，高精度尤其显着。同样，模型的准确性与LLM嵌入无关，这表明预测病毒JR折叠的峰精度更多地取决于数据质量和数量，而不是使用所使用的特定数学模型。鉴于许多病毒式衣壳和核素结构尚未解决，因此使用基于序列的LLMS是一种有前途的策略，可以轻松地应用于可用数据。Bert-U100嵌入的主成分分析表明，大多数IGLBS序列和JR和非JR序列的一个子集甚至在应用LR模型之前也可以区分，但是LR模型对于区分更歧义序列的子集是必要的。应用于双JR折叠时，BERT-U100模型能够为某些病毒家族分配JR图案，从而提供了该模型可推广性的证据。对于其他家庭而言，没有观察到这种概括性，激发了未来开发以双JR折叠告知的其他模型的需求。最后，BERT-U100模型还能够预测未分类病毒数据集中的序列是否产生JR倍数。给出了两个示例，JR预测由AlphaFold3证实。总的来说，这项工作表明JR折叠可以从其序列中预测。
AI辅助基因型分析肝炎病毒
4美国默瑟大学5埃及大学摘要背景：丙型肝炎病毒以及全球丙型肝炎病毒是由于慢性肝病，肝硬化和肝细胞癌引起的发病率和死亡率的主要原因。随着直接作用抗病毒药（DAAS）和核苷类似物的进化，适当的基因分型对于设计个性化治疗方法的设计至关重要。传统的基因分型方法不适合目的，因为它们不能缩放或应对新兴抗性的问题。这些是具有机器和深度学习能力的人工智能（AI）的一些客观问题。方法：根据Prisma 2020指南进行了系统的审查。作者使用结构化搜索字符串在PubMed和Google Scholar中搜索了相关研究。根据纳入标准，总共筛选了1200篇论文，其中包括30篇论文。开发的数据收集表包含有关目的，治疗结果指标和实践的信息。以这种方式，研究了研究以确定AI在肝炎基因分型和个性化医学前景中的作用。结果：当涉及到现有，尤其是HCV Genotype-8（基于AI的新型基因型）的基因分型肝炎病毒时，基于AI的模型可以在准确性和测量的可扩展性方面表现更好。机器学习技术（如随机森林和支持向量机器）的准确率超过90％。to但是，捕获基因组序列的复杂基因组成像，例如基于深度学习模型的卷积神经网络或长期短期记忆网络，它超越了成像。更快的诊断，改善了与抗性相关突变的检测以及由于AI方法的增强。结论：与经典方法相比，由于AI在此过程中采用了AI，因此在肝炎基因分型方面取得了进步，这些方法伴随着局限性，无法提供如此准确，可靠和及时的诊断。因此，它有助于为患者计划治疗策略，有助于实时应用，甚至支持有关全球健康状况的政策。尽管如此，诸如患者数据保护，集聚训练数据中的相对偏见以及可解释性等因素尚待解决。
如何引用本文：AS Ahmadi，Z. Zand。“溶瘤病毒作为靶向癌症治疗候选药物的介绍”，Advanced Therapies Jo
摘要 鉴于对各种癌症的理解不断进步，以及随后寻求治疗方法，以及癌症患者存活率的提高，发现一种可以有效对抗这种疾病侵袭性机制的治疗方法至关重要。溶瘤病毒 (OV) 已被证明在癌症治疗中非常有利，因为它们能够通过多种机制诱导抗肿瘤作用。病毒可用于感染癌细胞，特别是与正常细胞相比，引入肿瘤相关抗原，触发“危险信号”以产生免疫耐受性较低的肿瘤微环境，并充当释放炎症和免疫调节细胞因子的载体。这些经过修改的 OV 被设计为具有更好的肿瘤靶向能力、更高的溶瘤活性或产生强大的抗肿瘤免疫反应的潜力，在临床前测试和涉及癌症患者的临床试验中在动物模型中进行评估。OV 已被公认为癌症免疫治疗的主要药物之一，因为它们能够通过多种机制靶向肿瘤。然而，鉴于免疫疗法和细胞疗法等创新抗癌疗法的疗效有限，评估使用 OV 进行联合治疗的潜力势在必行。本研究旨在介绍溶瘤病毒，并回顾其诱导抗肿瘤反应的能力、挑战和局限性。
在共生和致病病毒和细菌存在的情况下昆虫脂质代谢
与大多数动物一样，昆虫与微生物有着密切的相互作用，这些微生物可能影响昆虫宿主的脂质代谢。在本章中，我们描述了迄今为止有关原核生物微生物在昆虫脂质代谢中起的作用的知名度。我们开始探索以内共生体为重点的微生物 - 脂质相互作用，并更具体地探索了在果蝇中不存在研究的肠道微生物群。然后，我们继续概述在常见且研究充分的wolbachia pipientis上所做的工作，这也与其他微生物有关。采用一个略有不同的角度，然后研究人类病原体（包括登革热和其他病毒）对蚊子载体脂质的影响。我们扩展了有关人类病原体的工作，并包括与内共生膜的相互作用
通过超滤对病毒的浓度和纯化
摘要本简短的评论总结了不同研究应用的各种病毒的集中和纯化步骤。讨论的方法已用于医学研究，监测海洋环境中的水生病毒以及对饮用水和食物质量的分析。此外，具有流行病和流行潜力的病原体构成的持续威胁（尤其是近年来）带来了诸如埃博拉病毒（例如EBOV），冠状病毒（例如MERS-COV，SARS-COV-1和SARS-COV-2）和痘病毒（例如mpxv）进入聚光灯。在这些情况下，超滤具有广泛的适用性，从一般研究到新型疫苗和治疗开发以及疾病监测。我们重点介绍了许多示例，其中vivaspin®和vivaflow®超滤设备已在这些研究领域中使用，并包括针对选择最佳设备和分子量临界值（MWCO）的指导。
CDC 对呼吸道病毒的建议
• CDC 对呼吸道病毒的建议 • 护士助理调查 • 面向熟练护理机构人员的免费虚拟课程 CDC 对呼吸道病毒的建议 CDC 已更新了今年秋冬季接种呼吸道病毒疫苗的建议：COVID-19、流感和 RSV。 • COVID-19 – 所有 6 个月及以上的人都应在这些疫苗上市时接种更新的 2024-2025 COVID-19 疫苗。2024-2025 疫苗旨在预防目前传播的 COVID-19 变种。 • 流感 – 所有 6 个月及以上的人，除极少数例外，都应接种更新的 2024-2025 流感疫苗。更新的 2024-2025 流感疫苗将是三价的，可预防 H1N1、H3N2 和 B/Victoria 谱系病毒。尽管 CDC 建议只要流感病毒还在传播就接种流感疫苗，但 9 月和 10 月仍然是大多数人接种疫苗的最佳时间。• 呼吸道合胞病毒 – 对于尚未接种 RSV 疫苗且年龄在 60 岁或以上的人，CDC 现在建议接种一剂 RSV 疫苗，如下所示：
细菌，病毒和其他病原体
威斯康星州的致病微生物没有特定的地下水质量标准，但目前CH中有地下水标准。nR 140用于总大肠菌菌和大肠杆菌细菌，这是可能的微生物病原体污染的指标。a ch。nr 140指标参数预防作用极限（PAL）已针对总大肠菌菌和A CH建立。nr 140公共卫生PAL和执法标准已为大肠杆菌细菌建立。ch。nR 140 PAL的总大肠菌菌是测试样品和CH中存在的0大肠菌菌。nR 140 PAL和E菌细菌的ES是测试样品中存在的0个大肠杆菌细菌。定期监测公共饮用水系统的总大肠菌菌（Wi NR 809.31-809.329），并测试这些系统的大肠杆菌，以及可能存在大肠肠菌细菌，可能存在肠球菌或肠肠球菌等其他粪便指标。