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** 2021 年 12 月亚洲哨兵项目办公室新闻 **
MBRSC 的增值产品 (2) 印度尼西亚火山爆发 (GLIDE 编号：VO-2021-000194-IDN) 2021 年 12 月 4 日，印度尼西亚塞梅鲁火山爆发，产生热云雪崩，伴有火山物质和大量火山灰。据 ReliefWeb 报道，印度尼西亚国家灾害管理局 (BNPB) 报告称，死亡人数已增至 15 人，27 人失踪，169 人受伤。19 个难民站有 1,700 多人流离失所，5,205 人和 2,970 栋房屋受到影响。(https://reliefweb.int/disaster/vo-2021-000194-idn/) 日本国际协力机构 (JICA) 于 12 月 7 日向 Sentinel Asia 发出 EOR。此 EOR 已升级为《国际灾害宪章》。亚洲理工学院 (AIT) 担任此宪章启动的项目经理。在数据提供者节点 (DPN) 中，日本宇宙航空研究开发机构 (JAXA)、印度空间研究组织 (ISRO) 和国家应用研究实验室 (NARL) 提供了数据。在 DAN 中，新加坡地球观测站 (EOS)、山口大学和 MBRSC 提供了 VAP。有关 Sentinel Asia 最新响应的信息可在以下链接中找到：https://sentinel-asia.org/EO/2021/article20211123PH.html
我们可以检测到弱重力场的量子性质吗？
图2 PSEN1 A246E神经元中的RNA-SEQ鉴定了疾病内型。（a）PSEN1 A246E IPSC衍生的神经元相对于NDC的差异表达基因（DEG）的RNA-seq火山图，具有错误的发现率（FDR）调整后的P值<.05。（B-C）通过（b）ISMARA基序分析（基于Z得分，TF-GENE PEARSON相关性和平均基因目标表达变化）和（C）Dorothea TF-GENE目标分析（基于标准化的富集量），通过（c）基因目标表达变化）（基于Z得分，平均基因目标表达变化），通过（B）ISMARA基序分析（基于Z得分，TF-GENE PEARSON相关性）预测具有显着活性变化的转录因子（TFS）。ISMARA平均靶基因表达变化由UP（相对于NDC的增加）或向下（相对于NDC）箭头指示。（D-E）使用（d）CODODE-CHEA共识TF数据库或（e）通过FGSEA多层次富集测试（e）定义的神经元相关TF-GENE目标列表的PSEN1 A246E神经元中排名的TF-TARGET富集。（F-G）使用（F）标志性数据库和（G）基因本体生物学过程（GOBP）对PSEN1 A246E神经元基因表达签名进行排名的富集分析。
过敏反应中细胞外囊泡的蛋白质组织及其在血管通透性中的作用
fi g u r e 1表征，蛋白质组学分析以及对ANEV和BEV的差分分析。（a）来自代表性循环BEV和ANEV的透射电子显微镜图像。比例尺：200 nm。图像描绘了来自两个样本的代表性电动汽车。（b）通过NTA分析了每个实验条件的七种不同的EV制剂。代表性的NTA直方图显示BEV和ANEVS的平均粒径为200 nm。（c）Anevs的特征是Western blot。面板显示三名代表性患者的免疫印迹。真正的EV标记，例如CD63，TSG101，Syntenin-1和CD9。（d）通过基于质谱的定量蛋白质组学获得的蛮数据的维恩图代表了BEV和ANEVS中检测到的蛋白质之间的相交。（e）火山图显示了所有鉴定的蛋白质。在ANEVS（右侧）和BEVS（左侧）中的统计学上显着差异（p> .05）以蓝色出现。访问数字（uniprot）显示了感兴趣的蛋白质（cdc42，ficolin-2，s100a9）。主成分分析（F）和血浆衍生EV的无监督分层聚类（G）
引用本文：Sajad Goudarzi、Mohamad Vosough Ghanbari、Jalil Rohani、Razieh Ghodsi 和 Fatemeh B. Rassouli（2024 年 10 月 7 日）：开发新药
摘要成人 T 细胞白血病/淋巴瘤 (ATL) 存活率低，这凸显了对创新治疗药物的迫切需求。虽然已经记录了 HDACis 在几种血液系统肿瘤中的药代动力学，但关于其对抗 ATL 的活性的研究仍存在明显差距。鉴于缺氧会对淋巴瘤细胞产生不可预测的影响，本研究旨在首次评估 MS-275 和新型类似物在缺氧条件下对 ATL 细胞的毒性作用。进行了蛋白质-蛋白质相互作用和基因集富集分析，评估了 HIF1A 和下游靶标的表达，并对 MS-275 和新型类似物与 HIF-1 a 进行了分子对接。对于体外研究，首先合成 MS-275 的苯甲酰胺类似物，然后评估缺氧条件下 MT-2 细胞的活力。富集分析证实了 HIF-1 信号通路中枢基因的参与，火山图显示 HIF1A、GAL3ST1 和 CD274 过度表达。分子对接表明 MS-275 和 HIF-1 a PAS-B 结构域的类似物之间存在有利的相互作用。alamarBlue 测定结果表明 MS-275 和类似物显著 (p < 0.001) 降低了缺氧条件下 MT-2 细胞的活力。本研究结果有望开发针对缺氧引起的 ATL 变化的新药。
系统生物学 xOmicsShiny：用于跨组学数据分析和通路映射的 R Shiny 应用程序
摘要摘要：我们开发了 xOmicsShiny，这是一款功能丰富的 R Shiny 应用程序，它使生物学家能够全面探索跨实验和数据类型的组学数据集，重点是在通路层面揭示生物学见解。数据合并功能可确保灵活探索跨组学数据，例如转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学。通路映射功能涵盖广泛的数据库，包括 WikiPathways、Reactome 和 KEGG 通路。此外，xOmicsShiny 为日常组学数据分析提供了多种可视化选项和分析任务，即 PCA、火山图、维恩图、热图、WGCNA 和高级聚类分析。该应用程序使用可定制的模块来执行各种任务，生成交互式图表和可发布的图表。这种动态模块化设计克服了 R Shiny 工具加载缓慢的问题，并允许研究和开发人员社区轻松扩展它。可用性和实施：R Shiny 应用程序公开发布于：http://xOmicsShiny.bxgenomics.com 。研究人员可以将自己的数据上传到服务器或使用预加载的演示数据集。源代码在 MIT 许可下提供于 https://github.com/interactivereport/xOmicsShiny 以供本地安装。该应用程序的完整教程可在 https://interactivereport.github.io/xOmicsShiny/tutorial/docs/index.html 获得。联系方式：yuhenry.sun@biogen.com 或 baohong.zhang@biogen.com 补充数据：补充数据可在 bioRxiv 在线获得。
总统航空航天报告
在标题页上，从左上角开始顺时针方向：1.2021 年 5 月 18 日，在一次多国演习中，两架美国空军 F-35A Lightning II 飞机和两架法国阵风飞机在法国上空飞行时打破队形。图片来源：空军中士。亚历山大·库克。2.这张 2022 年 7 月 12 日曝光的图像由美国宇航局的詹姆斯·韦伯太空望远镜在红外光下拍摄，显示了船底座星云中附近年轻的恒星形成区域 NGC 3324，揭示了之前被遮蔽的恒星诞生区域。图片来源：NASA、ESA、CSA 和 STScI。3.一架 UAS 飞入 Pebble Hill 地点 Block B/Unit C2 的烟雾柱中，Tall Timbers 研究站。图片来源：USGS/Todd Hoefen。4.2022 年 1 月 31 日，猎鹰 9 号火箭从佛罗里达州卡纳维拉尔角太空军基地发射。 图片来源：Joshua Conti，太空部队。5.GOES-17 卫星捕捉到了这张由 Hunga Tonga-Hunga Ha'apai 火山于 2022 年 1 月 15 日水下喷发产生的巨大云层图像。 图片来源：NASA 地球观测站，Joshua Stevens 使用 NOAA 和 NESDIS 提供的 GOES 图像拍摄。6.这张照片由火星 2020 号航天器下降级上的摄像机拍摄，显示了美国宇航局的毅力号火星车于 2021 年 2 月 18 日着陆火星之前的样子。图片来源：NASA/JPL-Caltech。
火山喷发，El Chich´on
1982年3月29日，4月3日至4月4日，墨西哥南部的El Chich'On火山爆发，注入了约700万吨二氧化硫（SO 2）和2000万吨颗粒物材料的总计。火山气体和碎屑的云向西行进，在三周内绕地球盘旋。4月4日的喷发是这三者中最大的一次，其云云又在夏威夷延伸几天后，允许Mauna Loa天文台的仪器进行详细的观察。云迅速发展为从赤道延伸到30°N的频段，持续了六个多月，然后逐渐扩大。这是20世纪最大的火山喷发之一，仅在1991年山pinatubo爆发。喷发是在没有警告的情况下进行的，在火山附近的城镇中杀死了许多人。el Chich'on从未在历史时期爆发过。爆发发生在迄今为止本世纪最大的厄尔尼（El Ni'no）开始。（实际上，平流层中的火山云欺骗了卫星传感器，这些传感器监测海洋温度以认为海洋温度正常，而它们已经大大变暖。因此，科学家直到开始几个月才意识到El Ni〜（请参阅El Ni〜no，第1卷）。热带美食中浮标的密集网络现在可以防止
合作多型火山口探索：拱形模拟任务的概念和结果
摘要 - 进入极端地形，例如洞穴或陨石坑，是未来行星探索机器人的关键挑战。许多实验机器人系统要么使用创新的运动概念或精心制作的任务设计来探索更具挑战地形。但是，这需要高度专业的任务特定机器人设计，从而限制了机器人一般应用的范围。我们通过使现有的漫游者系统团队将轨迹探索作为额外的机会任务任务来调查另一种方法。Rovers在一个束缚的Abseiling操作中进行了合作，从而增强了机器人团队一名成员的运动能力。我们使用我们的两个行星漫游原型在一般多功能多机器人月亮模拟任务的范围内进行火山口探索。在本文中，我们首先概述了对流动站系统的设计和修改，并描述了实验的一般部分自治设置，包括用于挂接系绳的机器人合作，并将其挂入火山口。第二，我们在火山Mt.ETNA，意大利，2022年。 在现场，流浪者成功地进入了甲壳虫小火山口，这是宽度约150 m，深度约为30 m，其陡峭的侧面部分紧凑，部分宽松且部分松散的火山土壤。 该实验表明协作操纵对束缚两个流浪者的可行性。 还显示出由于绞车而显示出增强的漫游动力，从而实现了安全的火山口探索。ETNA，意大利，2022年。在现场，流浪者成功地进入了甲壳虫小火山口，这是宽度约150 m，深度约为30 m，其陡峭的侧面部分紧凑，部分宽松且部分松散的火山土壤。该实验表明协作操纵对束缚两个流浪者的可行性。还显示出由于绞车而显示出增强的漫游动力，从而实现了安全的火山口探索。我们终于讨论了从该实验中学到的经验教训以及其余的实施步骤，以实现当地自主的火山口探索。
总统的航空航天报告
在标题页上，从左上角开始顺时针方向：1. 2021 年 5 月 18 日，在一次多国演习中，两架美国空军 F-35A Lightning II 飞机和两架法国阵风飞机在法国上空飞行时打破队形。来源：空军中士亚历山大·库克。2. 这张 2022 年 7 月 12 日曝光的图像由美国宇航局的詹姆斯·韦伯太空望远镜在红外光下拍摄，显示了船底座星云中附近年轻的恒星形成区域 NGC 3324，揭示了之前被遮蔽的恒星诞生区域。来源：NASA、ESA、CSA 和 STScI。3. 一架 UAS 飞入 Pebble Hill 位置 Block B/Unit C2 的烟柱中，Tall Timbers 研究站。来源：USGS/Todd Hoefen。 4. 2022 年 1 月 31 日，猎鹰 9 号火箭从佛罗里达州卡纳维拉尔角太空军基地发射。图片来源：太空军 Joshua Conti。5. GOES-17 卫星捕捉到了这幅由 Hunga Tonga-Hunga Ha'apai 火山水下喷发产生的巨大云层的图像，拍摄于 2022 年 1 月 15 日。图片来源：NASA 地球观测站，图片由 Joshua Stevens 使用 NOAA 和 NESDIS 提供的 GOES 图像拍摄。6. 这张照片由火星 2020 号航天器下降级上的相机拍摄，显示了 NASA 的毅力号火星车在 2021 年 2 月 18 日着陆火星之前的样子。图片来源：NASA/JPL-Caltech。